INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 881627 G/A 1 60 66 126 27.8683632085694 35.3448004705737 -7.4764372620043 A:G G A 10 0.535527279857177 0.210985587750633 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 900397 C/T 1 22 14 36 10.2183998431421 7.49738191800048 2.72101792514163 T:C C T 10 0.535527279857177 0.406259189848113 ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_900343_901095:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_900343_901095:KLHL17 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 949608 G/A 1 4135 3538 7673 1920.59469779057 1894.69551613469 25.8991816558812 A:T:C:G G A 10 0.535527279857177 0.55942941907275 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 981931 A/G 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_981777_982115:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_981777_982115:AGRN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 984302 T/C 1 22 12 34 10.2183998431421 6.42632735828612 3.79207248485598 T:C T C 10 0.535527279857177 0.229683306688434 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_984247_984439:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_984247_984439:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000492947:exon_983909_984439:AGRN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 1139202 T/C 1 39 54 93 18.1144360855701 28.9184731122876 -10.8040370267175 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0286399023908499 ENSG00000186891:ENST00000328596:exon_1138888_1139340:TNFRSF18;ENSG00000186891:ENST00000379268:exon_1138891_1139348:TNFRSF18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 1153113 G/A 1 7 1 8 3.25130904099976 0.535527279857177 2.71578176114258 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0758484261005442 ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1152311_1153184:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1152311_1153184:SDF4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 1178245 C/T 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 T:C C T 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000184163:ENST00000462849:exon_1178215_1178293:FAM132A;ENSG00000184163:ENST00000478606:exon_1178215_1178538:FAM132A;ENSG00000184163:ENST00000330388:exon_1178215_1178293:FAM132A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 1245176 C/T 1 11 15 26 5.10919992157105 8.03290919785765 -2.9237092762866 T:C C T 10 0.535527279857177 0.325768302416207 ENSG00000169972:ENST00000379031:exon_1245061_1245231:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000470520:exon_1245086_1245231:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000463758:exon_1244466_1245220:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000467712:exon_1245061_1245231:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000493657:exon_1244834_1245194:PUSL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 1247494 T/C 1 122 126 248 56.6656718574244 67.4764372620043 -10.8107654045799 T:C T C 10 0.535527279857177 0.181250942101555 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000497304:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1247460_1247527:CPSF3L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 1249187 G/A 1 84 77 161 39.0157084919971 41.2356005490026 -2.21989205700549 A:G G A 10 0.535527279857177 0.752260078501975 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1249112_1250550:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1249112_1249485:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1249112_1249205:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531377:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527383:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531292:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000467408:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1249125_1249301:CPSF3L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 57 58 115 26.4749450481409 31.0605822317163 -4.58563718357535 C:G C G 10 0.535527279857177 0.401459868949623 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 1262276 C/T 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262216_1262412:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000488011:exon_1262216_1262412:GLTPD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 1322607 C/T 1 57 63 120 26.4749450481409 33.7382186310021 -7.26327358286123 T:C C T 10 0.535527279857177 0.200263421101536 ENSG00000221978:ENST00000480479:exon_1321091_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000482621:exon_1321862_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000463260:exon_1321875_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000400809:exon_1321875_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000496007:exon_1321879_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000400810:exon_1321879_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000482365:exon_1321882_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000481223:exon_1322088_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000408952:exon_1322088_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000418865:exon_1322093_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000505849:exon_1322502_1322962:CCNL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 1342612 G/C 1 384 421 805 178.357524534844 225.456984819872 -47.0994602850274 C:G G C 10 0.535527279857177 0.000890878413309492 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 1390875 C/T 0 10 0 10 4.64472720142823 0 4.64472720142823 C C 10 0.535527279857177 0.00240737050809797 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000475091:exon_1390840_1390899:ATAD3C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 135 119 254 62.7038172192811 63.7277463030041 -1.02392908372295 A:G A G 10 0.535527279857177 0.90006716756498 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 50 42 92 23.2236360071412 22.4921457540014 0.731490253139722 T:C C T 10 0.535527279857177 0.916995638594558 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 2441358 T/C 1 15 14 29 6.96709080214235 7.49738191800048 -0.530291115858132 T:C T C 10 0.535527279857177 0.854578961351753 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2441232_2441369:PANK4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 95 96 191 44.1249084135682 51.410618866289 -7.2857104527208 A:G A G 10 0.535527279857177 0.310008615032235 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 3697700 G/A 1 60 50 110 27.8683632085694 26.7763639928588 1.09199921571053 A:G G A 10 0.535527279857177 0.849029619367528 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3696784_3697900:LRRC47;ENSG00000130764:ENST00000462356:exon_3697699_3697900:LRRC47 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 3807388 G/A 1 28 18 46 13.005236163999 9.63949103742918 3.36574512656986 A:G G A 10 0.535527279857177 0.375864743530014 ENSG00000198912:ENST00000361605:exon_3807133_3807621:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000474140:exon_3807133_3809560:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000486765:exon_3807133_3807621:C1orf174 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 6142308 T/C 1 12 14 26 5.57367264171388 7.49738191800048 -1.9237092762866 T:C T C 10 0.535527279857177 0.556227414642032 ENSG00000069424:ENST00000378111:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000428161:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000389632:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000458166:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378087:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000435937:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000472700:exon_6142255_6142334:KCNAB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 62 60 122 28.797308648855 32.1316367914306 -3.33432814257559 A:G A G 10 0.535527279857177 0.586321950392286 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 6278414 A/G 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 A:G A G 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6278349_6278429:RNF207 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 36 38 74 16.7210179251416 20.3500366345727 -3.62901870943109 A:G A G 10 0.535527279857177 0.416274176682209 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 6694574 G/A 1 50 60 110 23.2236360071412 32.1316367914306 -8.90800078428946 A:G G A 10 0.535527279857177 0.103774191417319 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 6705874 G/C 1 16 16 32 7.43156352228517 8.56843647771483 -1.13687295542966 C:G G C 10 0.535527279857177 0.725380877409574 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 8418644 C/A 1 21 15 36 9.75392712299928 8.03290919785765 1.72101792514163 A:C C A 10 0.535527279857177 0.61869297554355 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 8418650 T/C 1 20 14 34 9.28945440285646 7.49738191800048 1.79207248485598 T:C T C 10 0.535527279857177 0.607875644967397 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 8421092 C/T 1 13 10 23 6.0381453618567 5.35527279857177 0.68287256328493 T:C C T 10 0.535527279857177 0.836716139403488 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8420172_8421550:RERE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 8421203 T/C 1 10 8 18 4.64472720142823 4.28421823885742 0.360508962570814 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8420172_8421550:RERE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 9416346 C/T 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000171621:ENST00000328089:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000450402:exon_9415802_9416556:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000357898:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000377399:exon_9415766_9416644:SPSB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 9776575 A/G 1 27 22 49 12.5407634438562 11.7816001568579 0.759163286998328 A:G A G 10 0.535527279857177 0.886656178938017 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9776498_9776677:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9776498_9776677:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9776498_9776677:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000479223:exon_9776334_9776677:PIK3CD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 9784423 C/T 1 40 36 76 18.5789088057129 19.2789820748584 -0.700073269145449 T:C C T 10 0.535527279857177 0.9087113674794 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9784334_9784479:PIK3CD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 9804693 C/T 1 23 29 52 10.6828725632849 15.5302911158581 -4.8474185525732 T:C C T 10 0.535527279857177 0.210751256176834 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9804453_9804701:CLSTN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 9811541 A/G 1 23 23 46 10.6828725632849 12.3171274367151 -1.63425487343014 A:G A G 10 0.535527279857177 0.659437095497773 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9811531_9811639:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9811531_9811739:CLSTN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 10218439 T/C 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:C T C 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000130939:ENST00000253251:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000377157:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000343090:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000414346:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000488228:exon_10218412_10218540:UBE4B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 10511544 C/T 1 11 2 13 5.10919992157105 1.07105455971435 4.0381453618567 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0267444160327934 ENSG00000175279:ENST00000320498:exon_10511434_10512210:APITD1;ENSG00000175279:ENST00000336114:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000400900:exon_10511434_10512210:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000470413:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000465026:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000241563:ENST00000377049:exon_10511434_10511959:CORT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 10713765 T/C 1 13 10 23 6.0381453618567 5.35527279857177 0.68287256328493 T:C T C 10 0.535527279857177 0.836716139403488 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10713041_10714275:CASZ1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 11708736 T/C 1 5 12 17 2.32236360071412 6.42632735828612 -4.10396375757201 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0531197569251145 ENSG00000116661:ENST00000354287:exon_11708424_11708885:FBXO2;ENSG00000116661:ENST00000376779:exon_11708450_11708885:FBXO2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 39 19 58 18.1144360855701 10.1750183172864 7.93941776828374 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0473792996295736 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 11907603 G/A 1 14 2 16 6.50261808199952 1.07105455971435 5.43156352228517 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00967875735976586 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 25 24 49 11.6118180035706 12.8526547165722 -1.24083671300167 A:G A G 10 0.535527279857177 0.775333587260506 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 12164437 C/T 1 24 16 40 11.1473452834278 8.56843647771483 2.57890880571292 T:C C T 10 0.535527279857177 0.433029573000097 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12164436_12164588:TNFRSF8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 15755248 C/T 1 158 132 290 73.386689782566 70.6896009411474 2.69708884141868 T:C C T 10 0.535527279857177 0.768722409049053 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 15844615 A/G 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000132906:ENST00000333868:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000348549:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375890:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375874:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000400777:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000447522:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000474305:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000440484:exon_15844605_15844890:CASP9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 15904318 C/T 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 T:C C T 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15904180_15904359:AGMAT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 15909850 C/G 1 4 13 17 1.85789088057129 6.9618546381433 -5.10396375757201 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0147694647888842 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 15986547 T/C 1 5 10 15 2.32236360071412 5.35527279857177 -3.03290919785765 T:C T C 10 0.535527279857177 0.128132638231981 ENSG00000197312:ENST00000480945:exon_15986332_15995539:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000320153:exon_15986332_15987552:DDI2;ENSG00000215695:ENST00000345034:exon_15986364_15988217:RSC1A1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 16271260 G/A 1 17 29 46 7.89603624242799 15.5302911158581 -7.63425487343014 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.0265184006509825 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16271192_16271334:ZBTB17 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 16272250 A/G 1 17 13 30 7.89603624242799 6.9618546381433 0.934181604284691 A:G A G 10 0.535527279857177 0.855262631313688 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 16577908 G/C 1 40 33 73 18.5789088057129 17.6724002352868 0.90650857042608 C:G G C 10 0.535527279857177 0.906739313226354 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 16641899 C/T 1 11 9 20 5.10919992157105 4.81974551871459 0.289454402856461 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16641664_16641930:FBXO42 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 19583636 C/T 1 95 90 185 44.1249084135682 48.1974551871459 -4.07254677357774 T:C C T 10 0.535527279857177 0.5562020939331 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583558_19583639:MRTO4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 19652063 G/A 1 7 11 18 3.25130904099976 5.89080007842895 -2.63949103742919 A:G G A 10 0.535527279857177 0.242667099484109 ENSG00000040487:ENST00000234646:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000430100:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375155:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375153:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000469076:exon_19652020_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000400548:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000497827:exon_19652020_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000432465:exon_19651989_19652076:PQLC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 20009737 G/A 1 7 17 24 3.25130904099976 9.10396375757201 -5.85265471657225 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0226472816470973 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20008706_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20008735_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20008754_20009937:TMCO4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 20827216 C/T 1 16 16 32 7.43156352228517 8.56843647771483 -1.13687295542966 T:C C T 10 0.535527279857177 0.725380877409574 ENSG00000090432:ENST00000264198:exon_20825943_20827912:MUL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 20977221 A/T 1 11 6 17 5.10919992157105 3.21316367914306 1.89603624242799 A:T A T 10 0.535527279857177 0.467819685510286 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 20978832 T/C 1 378 300 678 175.570688213987 160.658183957153 14.912504256834 T:C T C 10 0.535527279857177 0.264183082980252 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20978270_20979021:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20978685_20979021:DDOST HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 23885498 T/C 1 48 34 82 22.2946905668555 18.207927515144 4.08676305171149 T:C T C 10 0.535527279857177 0.378137062253079 ENSG00000117318:ENST00000374561:exon_23885426_23885510:ID3;ENSG00000117318:ENST00000463312:exon_23885426_23885566:ID3;ENSG00000117318:ENST00000486541:exon_23884936_23885510:ID3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 72 68 140 33.4420358502833 36.415855030288 -2.97381918000477 T:C C T 10 0.535527279857177 0.612583560670548 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 24134721 T/C 1 17 25 42 7.89603624242799 13.3881819964294 -5.49214575400143 T:C T C 10 0.535527279857177 0.120826780230311 ENSG00000117305:ENST00000374490:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000436439:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000374487:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000235958:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000496907:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000374483:exon_24134625_24134813:HMGCL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 24180962 T/C 1 12 9 21 5.57367264171388 4.81974551871459 0.753927122999285 T:C T C 10 0.535527279857177 0.828752253980847 ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24180850_24181050:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24180850_24181050:FUCA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 24201162 G/A 1 24 20 44 11.1473452834278 10.7105455971435 0.436799686284214 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 24795618 C/T 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 T:C C T 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000001461:ENST00000374399:exon_24795476_24795797:NIPAL3;ENSG00000001461:ENST00000003912:exon_24795476_24799466:NIPAL3;ENSG00000001461:ENST00000389490:exon_24795476_24795675:NIPAL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 25549737 A/G 1 149 165 314 69.2064353012806 88.3620011764342 -19.1555658751536 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0315420724062906 ENSG00000117614:ENST00000236273:exon_25549170_25549922:SYF2;ENSG00000117614:ENST00000354361:exon_25549456_25549922:SYF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 25570081 T/C 1 100 111 211 46.4472720142823 59.4435280641466 -12.9962560498643 T:C T C 10 0.535527279857177 0.084202946724223 ENSG00000117616:ENST00000498238:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000243189:exon_25570041_25570124:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000473314:exon_25570041_25570715:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000417642:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000475766:exon_25570041_25570124:C1orf63 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 25883696 G/A 1 4 8 12 1.85789088057129 4.28421823885742 -2.42632735828612 A:G G A 10 0.535527279857177 0.24635656157035 ENSG00000157978:ENST00000374338:exon_25883644_25883758:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000488127:exon_25883644_25883758:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000462394:exon_25883644_25883920:LDLRAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 26227504 A/G 1 786 756 1542 365.075558032259 404.858623572026 -39.7830655397669 A:T:C:G A G 10 0.535527279857177 0.04368529092392 ENSG00000117632:ENST00000455785:exon_26226593_26227578:STMN1;ENSG00000117632:ENST00000399728:exon_26226609_26227578:STMN1;ENSG00000117632:ENST00000465604:exon_26227059_26227578:STMN1;ENSG00000117632:ENST00000399727:exon_26227059_26227578:STMN1;ENSG00000117632:ENST00000357865:exon_26227086_26227578:STMN1;ENSG00000117632:ENST00000374291:exon_26227232_26227578:STMN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 50 45 95 23.2236360071412 24.098727593573 -0.875091586431811 T:C T C 10 0.535527279857177 0.91815995256655 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 27102188 A/G 1 29 18 47 13.4697088841419 9.63949103742918 3.83021784671268 A:G A G 10 0.535527279857177 0.306737331204143 ENSG00000117713:ENST00000324856:exon_27102068_27102198:ARID1A;ENSG00000117713:ENST00000457599:exon_27102068_27102198:ARID1A;ENSG00000117713:ENST00000374152:exon_27102068_27102198:ARID1A;ENSG00000117713:ENST00000430799:exon_27102068_27102198:ARID1A;ENSG00000117713:ENST00000466382:exon_27102068_27102198:ARID1A;ENSG00000117713:ENST00000532781:exon_27102068_27102198:ARID1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 27679797 A/G 1 18 25 43 8.36050896257082 13.3881819964294 -5.02767303385861 A:G A G 10 0.535527279857177 0.129143787362084 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 60 35 95 27.8683632085694 18.7434547950012 9.12490841356819 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0643051913442498 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 27874631 G/A 1 10 4 14 4.64472720142823 2.14210911942871 2.50261808199952 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.283628757254846 ENSG00000126705:ENST00000247087:exon_27873772_27878700:AHDC1;ENSG00000126705:ENST00000374011:exon_27873772_27878700:AHDC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 60 41 101 27.8683632085694 21.9566184741443 5.91174473442512 A:G A G 10 0.535527279857177 0.27253311215397 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 50 35 85 23.2236360071412 18.7434547950012 4.48018121213996 T:C T C 10 0.535527279857177 0.384478625775787 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 49 34 83 22.7591632869983 18.207927515144 4.55123577185431 A:G A G 10 0.535527279857177 0.324603970430618 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 28241179 A/G 1 1 13 14 0.464472720142823 6.9618546381433 -6.49738191800048 A:G A G 10 0.535527279857177 0.000532384850092265 ENSG00000117748:ENST00000373912:exon_28240945_28241254:RPA2;ENSG00000117748:ENST00000373909:exon_28241138_28241257:RPA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 28241183 C/A 1 1 13 14 0.464472720142823 6.9618546381433 -6.49738191800048 A:C C A 10 0.535527279857177 0.000532384850092265 ENSG00000117748:ENST00000373912:exon_28240945_28241254:RPA2;ENSG00000117748:ENST00000373909:exon_28241138_28241257:RPA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 28562676 A/G 1 505 462 967 234.558723672126 247.413603294016 -12.8548796218901 A:G A G 10 0.535527279857177 0.42027913292466 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28562620_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000417632:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000335514:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000468425:exon_28562653_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562665_28562781:ATPIF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 28564252 A/G 1 32 9 41 14.8631270445703 4.81974551871459 10.0433815258557 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00152528206691476 ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 28564279 A/G 1 55 12 67 25.5459996078553 6.42632735828612 19.1196722495691 A:G A G 10 0.535527279857177 1.68163024435563e-06 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28564272_28564616:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 28887860 G/A 1 49 36 85 22.7591632869983 19.2789820748584 3.48018121213996 A:G G A 10 0.535527279857177 0.514377500252793 ENSG00000180098:ENST00000373830:exon_28887858_28887910:TRNAU1AP;ENSG00000180098:ENST00000495995:exon_28887858_28887910:TRNAU1AP;ENSG00000180098:ENST00000480930:exon_28887858_28887910:TRNAU1AP;ENSG00000180098:ENST00000491577:exon_28887145_28887910:TRNAU1AP;ENSG00000180098:ENST00000495215:exon_28887858_28887910:TRNAU1AP;ENSG00000180098:ENST00000464093:exon_28887145_28887910:TRNAU1AP;ENSG00000180098:ENST00000484775:exon_28887858_28887910:TRNAU1AP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 160 158 318 74.3156352228517 84.613310217434 -10.2976749945823 T:G T G 10 0.535527279857177 0.260913037007149 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 29529699 T/C 1 12 15 27 5.57367264171388 8.03290919785765 -2.45923655614378 T:C T C 10 0.535527279857177 0.440881434887102 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475773:exon_29529643_29529713:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463412:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000453185:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29529654_29529745:MECR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 29542637 A/G 1 21 14 35 9.75392712299928 7.49738191800048 2.25654520499881 A:G A G 10 0.535527279857177 0.500276662521839 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29542513_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29542549_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29542605_29542648:MECR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 31426815 A/G 1 24 26 50 11.1473452834278 13.9237092762866 -2.77636399285885 A:G A G 10 0.535527279857177 0.479414132257426 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 31842320 T/C 1 20 15 35 9.28945440285646 8.03290919785765 1.25654520499881 T:C T C 10 0.535527279857177 0.736332608702484 ENSG00000121769:ENST00000373713:exon_31842232_31842404:FABP3;ENSG00000121769:ENST00000497275:exon_31842232_31842437:FABP3;ENSG00000121769:ENST00000498148:exon_31842232_31842404:FABP3;ENSG00000121769:ENST00000482018:exon_31842232_31842404:FABP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 36752152 C/T 1 74 75 149 34.3709812905689 40.1645459892883 -5.79356469871936 T:C C T 10 0.535527279857177 0.366548786136631 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 36787888 G/A 1 23 16 39 10.6828725632849 8.56843647771483 2.1144360855701 A:G G A 10 0.535527279857177 0.524992506529540 ENSG00000142694:ENST00000270824:exon_36787632_36788326:FAM176B;ENSG00000142694:ENST00000490466:exon_36787882_36788326:FAM176B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 36807481 C/T 1 29 23 52 13.4697088841419 12.3171274367151 1.1525814474268 T:C C T 10 0.535527279857177 0.782476703275923 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36805225_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36805225_36807574:STK40 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 18 15 33 8.36050896257082 8.03290919785765 0.327599764713161 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 39908506 G/A 1 15 11 26 6.96709080214235 5.89080007842895 1.0762907237134 A:G G A 10 0.535527279857177 0.69952867420128 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39908386_39908583:MACF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 18 22 40 8.36050896257082 11.7816001568579 -3.42109119428708 C:G G C 10 0.535527279857177 0.341735714745905 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 40349131 G/A 1 8 3 11 3.71578176114258 1.60658183957153 2.10919992157105 A:G G A 10 0.535527279857177 0.23951309450586 ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40348990_40349145:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40348990_40349176:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40348990_40349183:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000491865:exon_40348990_40349152:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40348990_40349153:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40348990_40349147:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40348990_40349168:TRIT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 40705726 A/T 1 12 22 34 5.57367264171388 11.7816001568579 -6.20792751514402 A:T A T 10 0.535527279857177 0.0385943086550436 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 40758148 G/A 1 14 17 31 6.50261808199952 9.10396375757201 -2.60134567557249 A:G G A 10 0.535527279857177 0.372478400047806 ENSG00000084073:ENST00000372759:exon_40758117_40759856:ZMPSTE24;ENSG00000084073:ENST00000474142:exon_40758117_40758293:ZMPSTE24 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 40961449 T/C 1 14 13 27 6.50261808199952 6.9618546381433 -0.459236556143778 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000187815:ENST00000372706:exon_40960593_40962015:ZNF642;ENSG00000187815:ENST00000372705:exon_40960593_40961960:ZNF642 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 40980559 G/A 1 11 4 15 5.10919992157105 2.14210911942871 2.96709080214235 A:G G A 10 0.535527279857177 0.194136764216528 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000415550:exon_40980187_40980699:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 40981230 G/A 1 15 14 29 6.96709080214235 7.49738191800048 -0.530291115858132 A:G G A 10 0.535527279857177 0.854578961351753 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 11 12 23 5.10919992157105 6.42632735828612 -1.31712743671507 T:C C T 10 0.535527279857177 0.677416798105031 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 10 12 22 4.64472720142823 6.42632735828612 -1.78160015685789 T:C T C 10 0.535527279857177 0.523672568666477 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 43212869 A/T 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 A:T A T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43212046_43213083:LEPRE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 43630156 A/C 1 385 400 785 178.821997254987 214.210911942871 -35.3889146878839 A:C:G A C 10 0.535527279857177 0.0122101994985962 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43629855_43630164:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000431635:exon_43629993_43630164:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43630017_43630164:EBNA1BP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 44133647 A/G 1 15 9 24 6.96709080214235 4.81974551871459 2.14734528342775 A:G A G 10 0.535527279857177 0.419204092334723 ENSG00000066135:ENST00000439179:exon_44133443_44133690:KDM4A;ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44133443_44133690:KDM4A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 44137291 G/A 1 12 16 28 5.57367264171388 8.56843647771483 -2.99476383600095 A:G G A 10 0.535527279857177 0.263198055324704 ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44137176_44137546:KDM4A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 45101859 T/G 1 8 3 11 3.71578176114258 1.60658183957153 2.10919992157105 T:G T G 10 0.535527279857177 0.23951309450586 ENSG00000187147:ENST00000488865:exon_45101702_45102038:RNF220;ENSG00000126106:ENST00000372243:exon_45100910_45102129:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000372244:exon_45100910_45102129:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000372242:exon_45100910_45102129:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000495630:exon_45101720_45102129:TMEM53 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 45110404 C/T 1 56 33 89 26.0104723279981 17.6724002352868 8.33807209271125 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0886925673659307 ENSG00000187147:ENST00000355387:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000416840:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000361799:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000453887:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000372247:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000443020:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000372248:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000440132:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000335497:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000474064:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000471494:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000444372:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000497469:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000475378:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000484745:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000474394:exon_45110370_45110466:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000480686:exon_45108804_45110466:RNF220 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 45205598 T/C 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 T:C T C 10 0.535527279857177 0.782354473542065 ENSG00000142945:ENST00000452259:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000493027:exon_45205497_45205674:KIF2C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 45218895 A/T 1 29 19 48 13.4697088841419 10.1750183172864 3.29469056685551 A:T A T 10 0.535527279857177 0.386549728291418 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000455186:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45218804_45218926:KIF2C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 45479709 A/G 1 71 54 125 32.9775631301404 28.9184731122876 4.05909001785288 A:G A G 10 0.535527279857177 0.474862814530896 ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 45808659 C/T 1 18 18 36 8.36050896257082 9.63949103742918 -1.27898207485837 T:C C T 10 0.535527279857177 0.739253657716502 ENSG00000132773:ENST00000372090:exon_45808515_45808674:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000495703:exon_45808407_45808674:TOE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 45809220 C/T 1 47 45 92 21.8302178467127 24.098727593573 -2.26850974686028 T:C C T 10 0.535527279857177 0.676371026857823 ENSG00000132773:ENST00000372090:exon_45808754_45809647:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000495703:exon_45808754_45809636:TOE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 45973928 G/A 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 A:G G A 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000132763:ENST00000401061:exon_45973884_45974036:MMACHC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 46034329 G/A 1 205 441 646 95.2169076292787 236.167530417015 -140.950622787736 A:G G A 10 0.535527279857177 7.37362532715798e-29 ENSG00000117448:ENST00000372070:exon_46034157_46034356:AKR1A1;ENSG00000117448:ENST00000351829:exon_46034157_46034356:AKR1A1;ENSG00000117448:ENST00000419874:exon_46034157_46034356:AKR1A1;ENSG00000117448:ENST00000487654:exon_46034157_46034356:AKR1A1;ENSG00000117448:ENST00000475919:exon_46034286_46034671:AKR1A1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 10 17 27 4.64472720142823 9.10396375757201 -4.45923655614378 A:G G A 10 0.535527279857177 0.121116362653133 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 46496709 A/G 1 8 8 16 3.71578176114258 4.28421823885742 -0.568436477714831 A:G A G 10 0.535527279857177 0.806722234902998 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 46521517 G/A 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:G G A 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 46751647 A/G 1 37 37 74 17.1854906452845 19.8145093547155 -2.62901870943109 A:G A G 10 0.535527279857177 0.56159467731511 ENSG00000132128:ENST00000343304:exon_46751034_46752171:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000371972:exon_46751034_46752171:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000472710:exon_46751034_46752171:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000254454:exon_46751034_46752171:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000498402:exon_46750675_46752171:LRRC41 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 47842431 G/A 1 41 35 76 19.0433815258557 18.7434547950012 0.299926730854548 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47842376_47844511:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47842376_47844510:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47842376_47842882:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47842376_47842795:CMPK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 51912760 T/G 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 T:G T G 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000085832:ENST00000371730:exon_51912632_51912777:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51912632_51912777:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51912632_51912777:EPS15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 52264064 A/G 1 88 91 179 40.8735993725684 48.7329824670031 -7.85938309443468 A:G A G 10 0.535527279857177 0.261030223800774 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52263921_52264083:NRD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 52266242 G/A 1 87 86 173 40.4091266524256 46.0553460677172 -5.64621941529161 A:G G A 10 0.535527279857177 0.402432747404223 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52266228_52266355:NRD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 52290984 T/G 1 26 22 48 12.0762907237134 11.7816001568579 0.294690566855506 T:C:G T G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000473805:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000475715:exon_52290969_52291054:NRD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 52498370 C/T 1 24 24 48 11.1473452834278 12.8526547165722 -1.70530943314449 T:C C T 10 0.535527279857177 0.66554394655081 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 52498570 C/T 1 28 34 62 13.005236163999 18.207927515144 -5.20269135114497 T:C C T 10 0.535527279857177 0.203710761147296 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 52498861 A/T 1 31 26 57 14.3986543244275 13.9237092762866 0.474945048140913 A:T A T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 52499362 C/G 1 23 15 38 10.6828725632849 8.03290919785765 2.64996336542728 C:G C G 10 0.535527279857177 0.419972689363019 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 52823515 G/C 1 18 20 38 8.36050896257082 10.7105455971435 -2.35003663457272 C:G G C 10 0.535527279857177 0.516206535659463 ENSG00000154222:ENST00000441197:exon_52823453_52823570:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000371586:exon_52823453_52823588:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000491136:exon_52823453_52824133:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000284376:exon_52823453_52823570:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000438021:exon_52823453_52823570:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000460261:exon_52823453_52823570:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000371573:exon_52823453_52823570:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000450942:exon_52823453_52823570:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000438831:exon_52823453_52823588:CC2D1B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 52882406 A/G 1 115 109 224 53.4143628164246 58.3724735044323 -4.95811068800764 A:G A G 10 0.535527279857177 0.546693939083014 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52882320_52883992:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52882320_52882694:PRPF38A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 52991387 G/A 1 2 10 12 0.928945440285646 5.35527279857177 -4.42632735828612 A:G G A 10 0.535527279857177 0.016688085548077 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371541:exon_52991235_52991602:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 52991638 C/T 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 53387379 G/C 1 10 6 16 4.64472720142823 3.21316367914306 1.43156352228517 C:G G C 10 0.535527279857177 0.618134679686612 ENSG00000121310:ENST00000460612:exon_53387225_53387434:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000358358:exon_53387225_53387398:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000476477:exon_53387225_53387446:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000467988:exon_53387225_53387390:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000495920:exon_53387225_53387386:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000474789:exon_53387225_53387393:ECHDC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 53516383 C/A 1 104 104 208 48.3051628948536 55.6948371051464 -7.38967421029281 A:C:G C A 10 0.535527279857177 0.330502677336361 ENSG00000116171:ENST00000371514:exon_53516281_53517375:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000478631:exon_53516281_53517073:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528311:exon_53516281_53516575:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371509:exon_53516281_53516642:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000407246:exon_53516281_53516932:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000430330:exon_53516281_53516798:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000484100:exon_53516281_53516690:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000533119:exon_53516281_53516734:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000435345:exon_53516281_53516785:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000488965:exon_53513530_53517282:SCP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 53676448 G/A 1 39 36 75 18.1144360855701 19.2789820748584 -1.16454598928827 A:G G A 10 0.535527279857177 0.817525647529149 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 53712727 C/T 1 12 16 28 5.57367264171388 8.56843647771483 -2.99476383600095 T:C C T 10 0.535527279857177 0.263198055324704 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53711217_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53712628_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53712225_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53712240_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53712240_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53712630_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53712690_53712728:LRP8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 53716416 G/A 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 A:G G A 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53716362_53716534:LRP8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 53732315 G/T 1 11 10 21 5.10919992157105 5.35527279857177 -0.246072877000716 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000459674:exon_53732145_53734270:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000475501:exon_53732145_53732319:LRP8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 54417796 A/G 1 30 21 51 13.9341816042847 11.2460728770007 2.68810872728397 A:G A G 10 0.535527279857177 0.48509708860321 ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54417659_54418145:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000371368:exon_54417659_54418145:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54417659_54418145:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000444987:exon_54417659_54418145:LRRC42 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 111 121 232 51.5564719358534 64.7988008627184 -13.242328926865 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0869824078477668 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 269 208 477 124.943161718419 111.389674210293 13.5534875081266 A:C:G C G 10 0.535527279857177 0.215576840855248 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 54683925 G/A 1 129 107 236 59.9169808984242 57.3014189447179 2.61556195370623 A:G G A 10 0.535527279857177 0.744643677529332 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 62579907 C/T 1 11 10 21 5.10919992157105 5.35527279857177 -0.246072877000716 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 63881552 C/T 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C C T 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000088035:ENST00000371108:exon_63881544_63881628:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000431147:exon_63881544_63881628:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000405765:exon_63881544_63881628:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000263440:exon_63881544_63881628:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000465969:exon_63881544_63881628:ALG6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 64095111 A/G 1 29 22 51 13.4697088841419 11.7816001568579 1.68810872728397 A:G A G 10 0.535527279857177 0.675491184125504 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64095096_64095258:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64095096_64095258:PGM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 64097432 C/T 1 24 27 51 11.1473452834278 14.4592365561438 -3.31189127271603 T:C C T 10 0.535527279857177 0.400324885410726 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64097328_64097453:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64097328_64097453:PGM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 76205685 T/G 1 41 54 95 19.0433815258557 28.9184731122876 -9.87509158643181 T:G T G 10 0.535527279857177 0.0501734638439054 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000532509:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000530953:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000534334:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526930:exon_76205665_76205795:ACADM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 76227022 A/G 1 135 144 279 62.7038172192811 77.1159282994335 -14.4121110801524 A:T:G A G 10 0.535527279857177 0.0926839361067669 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76226807_76227300:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000481374:exon_76226807_76227055:ACADM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 78184325 A/G 1 7 6 13 3.25130904099976 3.21316367914306 0.0381453618566998 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000498328:exon_78184281_78184397:USP33;ENSG00000077254:ENST00000461986:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000531637:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000462192:exon_78184281_78184326:USP33 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 78408536 C/G 1 16 8 24 7.43156352228517 4.28421823885742 3.14734528342775 C:G C G 10 0.535527279857177 0.224038257851187 ENSG00000162614:ENST00000330010:exon_78408146_78409576:NEXN;ENSG00000162614:ENST00000294624:exon_78408146_78409576:NEXN;ENSG00000162614:ENST00000334785:exon_78408146_78408909:NEXN;ENSG00000162614:ENST00000480732:exon_78408146_78408884:NEXN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 85039955 G/A 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:G G A 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85039922_85040163:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85039922_85040147:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85039599_85040104:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85039599_85040113:CTBS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 85040070 C/A 1 9 6 15 4.18025448128541 3.21316367914306 0.967090802142346 A:C C A 10 0.535527279857177 0.796987479524744 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85039922_85040163:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85039922_85040147:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85039599_85040104:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85039599_85040113:CTBS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 85113229 A/G 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 A:G A G 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85109390_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85109599_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85113022_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85113024_85113290:SSX2IP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 85724328 C/T 1 17 19 36 7.89603624242799 10.1750183172864 -2.27898207485837 T:C C T 10 0.535527279857177 0.505320305259396 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 86173943 C/T 1 12 15 27 5.57367264171388 8.03290919785765 -2.45923655614378 T:C C T 10 0.535527279857177 0.440881434887102 ENSG00000117174:ENST00000370574:exon_86173312_86174101:ZNHIT6;ENSG00000117174:ENST00000431532:exon_86173737_86173967:ZNHIT6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 15 8 23 6.96709080214235 4.28421823885742 2.68287256328493 T:C T C 10 0.535527279857177 0.300673562790689 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 18 12 30 8.36050896257082 6.42632735828612 1.93418160428469 T:C C T 10 0.535527279857177 0.583930457533564 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 86838158 C/T 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 T:C C T 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000524695:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000496592:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000479890:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000486557:exon_86838114_86838264:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86838114_86838223:ODF2L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 89426902 G/A 1 24 13 37 11.1473452834278 6.9618546381433 4.18549064528445 A:G G A 10 0.535527279857177 0.189208139895819 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 89524657 C/G 1 16 30 46 7.43156352228517 16.0658183957153 -8.63425487343014 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0117532725642772 ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89524524_89524726:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000459831:exon_89524024_89524726:GBP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 89579941 T/C 1 74 99 173 34.3709812905689 53.0172007058605 -18.6462194152916 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00474034391525986 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89579699_89579979:GBP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 89582690 G/C 1 49 52 101 22.7591632869983 27.8474185525732 -5.08825526557487 C:G G C 10 0.535527279857177 0.319935597784898 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 89655783 T/C 1 10 3 13 4.64472720142823 1.60658183957153 3.0381453618567 T:C T C 10 0.535527279857177 0.102869269884982 ENSG00000162654:ENST00000355754:exon_89655721_89656001:GBP4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 89655994 C/T 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 T:C C T 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000162654:ENST00000355754:exon_89655721_89656001:GBP4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 93306317 G/A 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 A:G G A 10 0.535527279857177 1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 16 23 39 7.43156352228517 12.3171274367151 -4.8855639144299 A:G G A 10 0.535527279857177 0.147779940421866 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 93672723 A/C 1 6 12 18 2.78683632085694 6.42632735828612 -3.63949103742918 A:C A C 10 0.535527279857177 0.100224935165788 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 94930345 G/A 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000117528:ENST00000454898:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000394233:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000370214:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000315713:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000468860:exon_94930331_94930429:ABCD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 94941244 T/C 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 T:C T C 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000117528:ENST00000454898:exon_94941170_94941293:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000394233:exon_94941170_94941293:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000370214:exon_94941170_94941293:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000315713:exon_94941170_94941293:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000468860:exon_94941170_94941250:ABCD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 95709939 T/G 1 12 8 20 5.57367264171388 4.28421823885742 1.28945440285646 T:G T G 10 0.535527279857177 0.656931290438306 ENSG00000122481:ENST00000370202:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000263893:exon_95709767_95710271:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000429514:exon_95709767_95710207:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000492639:exon_95709767_95709967:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000495272:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000419345:exon_95709767_95710271:RWDD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 13 16 29 6.0381453618567 8.56843647771483 -2.53029111585813 C:G G C 10 0.535527279857177 0.358645434102516 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 109351501 A/G 1 14 15 29 6.50261808199952 8.03290919785765 -1.53029111585813 A:G A G 10 0.535527279857177 0.582218305374425 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109351405_109352148:STXBP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 109440215 G/A 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000121957:ENST00000406462:exon_109440114_109440249:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000435987:exon_109440114_109440249:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000264126:exon_109440114_109440249:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000369987:exon_109440114_109440249:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000431112:exon_109440114_109440249:GPSM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 109461341 C/T 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 T:C C T 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000121957:ENST00000406462:exon_109461235_109461411:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000264126:exon_109461235_109461411:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000369987:exon_109461235_109461411:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000431112:exon_109461235_109461411:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000441735:exon_109461235_109461411:GPSM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 109824250 G/A 1 8 10 18 3.71578176114258 5.35527279857177 -1.63949103742919 A:G G A 10 0.535527279857177 0.484703765251006 ENSG00000134222:ENST00000369909:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000369904:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000409267:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000369907:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000438534:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000492431:exon_109824241_109825041:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000409138:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000369903:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000429031:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000418914:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000474126:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000459765:exon_109824026_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000471740:exon_109824241_109824682:PSRC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 110091282 C/T 1 29 32 61 13.4697088841419 17.1368729554297 -3.66716407128779 T:C C T 10 0.535527279857177 0.370503287166573 ENSG00000065135:ENST00000369851:exon_110091233_110091460:GNAI3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 110170896 T/C 1 11 14 25 5.10919992157105 7.49738191800048 -2.38818199642942 T:C T C 10 0.535527279857177 0.423396273780819 ENSG00000116337:ENST00000526301:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000529299:exon_110170705_110171157:AMPD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 110883569 A/T 1 7 13 20 3.25130904099976 6.9618546381433 -3.71054559714354 A:T A T 10 0.535527279857177 0.117313042346182 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 110888948 G/A 1 50 31 81 23.2236360071412 16.6013456755725 6.62229033156867 A:G G A 10 0.535527279857177 0.148644106952749 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110888930_110889299:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110888930_110889299:RBM15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 857 708 1565 398.053121162399 379.153314138881 18.8998070235181 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.348433342749744 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 111730901 C/T 1 27 19 46 12.5407634438562 10.1750183172864 2.36574512656986 T:C C T 10 0.535527279857177 0.555291123828446 ENSG00000162777:ENST00000468692:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111730753_111730992:DENND2D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/A 1 277 4 281 128.658943479562 2.14210911942871 126.516834360133 A:T:C C A 10 0.535527279857177 1.54836548472413e-68 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 111957245 G/A 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 A:G G A 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 111992095 C/T 1 15 11 26 6.96709080214235 5.89080007842895 1.0762907237134 T:C C T 10 0.535527279857177 0.69952867420128 ENSG00000116459:ENST00000493119:exon_111991817_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369722:exon_111991558_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369721:exon_111992087_111992203:ATP5F1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 112991698 T/C 1 7 1 8 3.25130904099976 0.535527279857177 2.71578176114258 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0758484261005442 ENSG00000143079:ENST00000271277:exon_112991564_112991794:CTTNBP2NL;ENSG00000143079:ENST00000441739:exon_112991564_112991794:CTTNBP2NL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 115260738 G/C 1 322 345 667 149.560215885989 184.756911550726 -35.196695664737 A:T:C:G G C 10 0.535527279857177 0.00655922449360375 ENSG00000009307:ENST00000339438:exon_115259534_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000438362:exon_115259537_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000358528:exon_115259538_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369533:exon_115259538_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000261443:exon_115259916_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000530886:exon_115259926_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369530:exon_115259933_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000483407:exon_115260423_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000534699:exon_115260578_115260837:CSDE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 117617705 A/G 1 15 20 35 6.96709080214235 10.7105455971435 -3.74345479500119 A:G A G 10 0.535527279857177 0.236600445119263 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 117618067 C/T 1 40 35 75 18.5789088057129 18.7434547950012 -0.164545989288275 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 117619362 G/A 1 7 7 14 3.25130904099976 3.74869095900024 -0.497381918000477 A:G G A 10 0.535527279857177 0.796028545675074 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117619263_117619445:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117619263_117619445:TTF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 118165691 C/T 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 T:C C T 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000183508:ENST00000369448:exon_118165464_118170994:FAM46C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 119584949 G/A 1 13 12 25 6.0381453618567 6.42632735828612 -0.388181996429424 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000116874:ENST00000369426:exon_119584887_119584972:WARS2;ENSG00000116874:ENST00000235521:exon_119584887_119584972:WARS2;ENSG00000116874:ENST00000497402:exon_119584887_119584972:WARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 144909956 G/A 0 0 21 21 0 11.2460728770007 -11.2460728770007 A G A 10 0.535527279857177 1.01429537515521e-07 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144909869_144909960:PDE4DIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 1 14 1 15 6.50261808199952 0.535527279857177 5.96709080214235 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00138197945877313 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 144916676 C/T 0 9 0 9 4.18025448128541 0 4.18025448128541 C C 10 0.535527279857177 0.00462881858371194 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 144916748 C/G 0 9 0 9 4.18025448128541 0 4.18025448128541 C C 10 0.535527279857177 0.00462881858371194 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144916705_144916749:PDE4DIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 144917546 A/G 0 9 0 9 4.18025448128541 0 4.18025448128541 A A 10 0.535527279857177 0.00462881858371194 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144917499_144917636:PDE4DIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 144918957 T/A 0 11 0 11 5.10919992157105 0 5.10919992157105 T T 10 0.535527279857177 0.00125600829965403 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000525886:exon_144918833_144919011:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144918833_144918991:PDE4DIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 144922523 C/T 1 14 1 15 6.50261808199952 0.535527279857177 5.96709080214235 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00138197945877313 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144922519_144922638:PDE4DIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 144922583 G/A 0 9 0 9 4.18025448128541 0 4.18025448128541 G G 10 0.535527279857177 0.00462881858371194 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144922519_144922638:PDE4DIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 144930940 T/C 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 T:C T C 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 85 85 0 45.51981878786 -45.51981878786 C T C 10 0.535527279857177 4.91606925865855e-29 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 50 50 0 26.7763639928588 -26.7763639928588 T G T 10 0.535527279857177 2.22848945782338e-17 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 45 45 0 24.098727593573 -24.098727593573 A C A 10 0.535527279857177 1.03088335056503e-15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 131 0 131 60.8459263387098 0 60.8459263387098 G G 10 0.535527279857177 3.45472662621329e-36 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 75 75 0 40.1645459892883 -40.1645459892883 C T C 10 0.535527279857177 1.05200032964862e-25 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 108 108 0 57.8369462245751 -57.8369462245751 T C T 10 0.535527279857177 1.07572896187890e-36 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 146714392 G/C 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 C:G G C 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146714334_146714480:CHD1L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 150445819 A/G 1 27 27 54 12.5407634438562 14.4592365561438 -1.91847311228756 A:G A G 10 0.535527279857177 0.682745837825282 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 150471504 C/A 1 36 41 77 16.7210179251416 21.9566184741443 -5.23560054900263 A:C C A 10 0.535527279857177 0.253824262879907 ENSG00000143374:ENST00000369054:exon_150471373_150471510:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369064:exon_150471373_150471510:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000438568:exon_150471373_150471510:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369052:exon_150471373_150471510:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369051:exon_150471373_150471510:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000467982:exon_150471373_150471510:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000480070:exon_150471373_150471510:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000463555:exon_150471373_150471510:TARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 150940625 T/G 1 18 9 27 8.36050896257082 4.81974551871459 3.54076344385622 T:G T G 10 0.535527279857177 0.183001936277486 ENSG00000143418:ENST00000368954:exon_150940559_150940677:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000271688:exon_150940559_150940677:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000345896:exon_150940559_150940677:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000460664:exon_150940559_150940648:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368949:exon_150940559_150940677:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000361419:exon_150940559_150940677:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000421609:exon_150940559_150940677:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000457392:exon_150940583_150940677:LASS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 498 449 947 231.307414631126 240.451748655872 -9.14433402474657 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.557714227456242 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 151259543 G/A 1 15 8 23 6.96709080214235 4.28421823885742 2.68287256328493 A:G G A 10 0.535527279857177 0.300673562790689 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 151260673 G/A 1 21 10 31 9.75392712299928 5.35527279857177 4.39865432442751 A:G G A 10 0.535527279857177 0.148880735534832 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000426871:exon_151259960_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000459919:exon_151260667_151260882:ZNF687 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 18 24 42 8.36050896257082 12.8526547165722 -4.49214575400143 A:G G A 10 0.535527279857177 0.168005416485685 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 152777574 G/A 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:G G A 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000197084:ENST00000368768:exon_152777311_152777974:LCE1C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 153615820 G/A 1 68 60 128 31.584144969712 32.1316367914306 -0.547491821718648 A:G G A 10 0.535527279857177 0.929625989228675 ENSG00000160679:ENST00000368694:exon_153615703_153615840:C1orf77;ENSG00000160679:ENST00000392618:exon_153615703_153615840:C1orf77;ENSG00000160679:ENST00000368687:exon_153615703_153615840:C1orf77;ENSG00000160679:ENST00000368686:exon_153614719_153616861:C1orf77 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 153631943 G/A 1 53 42 95 24.6170541675696 22.4921457540014 2.12490841356819 A:G G A 10 0.535527279857177 0.682032368083965 ENSG00000143553:ENST00000368685:exon_153631924_153632042:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000474959:exon_153631924_153632042:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000462880:exon_153631924_153632042:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000478558:exon_153631203_153632042:SNAPIN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 153662340 G/A 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 A:G G A 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000169418:ENST00000368680:exon_153662282_153662456:NPR1;ENSG00000169418:ENST00000428723:exon_153662282_153662456:NPR1;ENSG00000169418:ENST00000368677:exon_153662282_153662456:NPR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 154142910 T/C 1 298 373 671 138.412870602561 199.751675386727 -61.3388047841657 T:C T C 10 0.535527279857177 2.22114577058505e-06 ENSG00000143549:ENST00000368533:exon_154142876_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000368545:exon_154142876_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000469717:exon_154142876_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000341485:exon_154142876_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000330188:exon_154142876_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000341372:exon_154142876_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000328159:exon_154142876_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000509409:exon_154142876_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000271850:exon_154142876_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000312970:exon_154142876_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000513769:exon_154142876_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000302206:exon_154142876_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000368531:exon_154142876_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000323144:exon_154142876_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000368530:exon_154142876_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000504663:exon_154142128_154142945:TPM3;ENSG00000143549:ENST00000509601:exon_154142884_154142945:TPM3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 154317153 C/T 1 4 8 12 1.85789088057129 4.28421823885742 -2.42632735828612 T:C C T 10 0.535527279857177 0.24635656157035 ENSG00000143515:ENST00000368489:exon_154317117_154317261:ATP8B2;ENSG00000143515:ENST00000341831:exon_154317117_154317261:ATP8B2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 154561925 C/T 1 29 22 51 13.4697088841419 11.7816001568579 1.68810872728397 T:C C T 10 0.535527279857177 0.675491184125504 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154561845_154561938:ADAR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 154573967 T/C 1 77 74 151 35.7643994509974 39.6290187094311 -3.86461925843372 T:C T C 10 0.535527279857177 0.568131509202332 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000463920:exon_154572653_154574724:ADAR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 25 38 63 11.6118180035706 20.3500366345727 -8.73821863100215 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0313764153687141 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 154744852 A/G 1 24 26 50 11.1473452834278 13.9237092762866 -2.77636399285885 A:G A G 10 0.535527279857177 0.479414132257426 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 154904840 T/C 1 43 54 97 19.9723269661414 28.9184731122876 -8.94614614614617 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0830270910225662 ENSG00000163344:ENST00000368467:exon_154904828_154904891:PMVK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 38 26 64 17.6499633654273 13.9237092762866 3.72625408914067 T:C C T 10 0.535527279857177 0.381854763295335 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 154938235 G/C 1 11 19 30 5.10919992157105 10.1750183172864 -5.06581839571531 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0689406884761131 ENSG00000160691:ENST00000368445:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000448116:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368449:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368453:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368450:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368443:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000532863:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368447:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000490667:exon_154938115_154938238:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000444664:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368441:exon_154938019_154938257:SHC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 154938662 T/C 1 20 18 38 9.28945440285646 9.63949103742918 -0.350036634572724 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000160691:ENST00000368445:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000448116:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368449:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368453:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368450:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368443:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000532863:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368447:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000444664:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368441:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000414115:exon_154938638_154938707:SHC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 154965113 G/T 1 7 6 13 3.25130904099976 3.21316367914306 0.0381453618566998 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000160688:ENST00000368434:exon_154965041_154965138:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000405236:exon_154965041_154965149:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000295530:exon_154965041_154965149:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000477609:exon_154965041_154965149:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000481758:exon_154965065_154965262:FLAD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 155026942 A/C 1 10 14 24 4.64472720142823 7.49738191800048 -2.85265471657225 A:C A C 10 0.535527279857177 0.306793066047406 ENSG00000143537:ENST00000473905:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000480331:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000360674:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368412:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000487956:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000447332:exon_155026790_155026982:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155026790_155026982:ADAM15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 155033308 G/A 1 10 6 16 4.64472720142823 3.21316367914306 1.43156352228517 A:G G A 10 0.535527279857177 0.618134679686612 ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368410:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368413:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000498481:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461234:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000462116:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000468053:exon_155033239_155033308:ADAM15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 156 160 316 72.4577443422804 85.6843647771483 -13.2266204348679 T:C C T 10 0.535527279857177 0.142613292761522 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 155289545 T/G 1 3 32 35 1.39341816042847 17.1368729554297 -15.7434547950012 T:G T G 10 0.535527279857177 3.40511684320674e-08 ENSG00000160752:ENST00000492887:exon_155289402_155289676:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000489324:exon_155289446_155289719:FDPS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 155582257 G/A 1 13 28 41 6.0381453618567 14.994763836001 -8.95661847414426 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00702297290215693 ENSG00000125459:ENST00000460199:exon_155581973_155582269:MSTO1;ENSG00000125459:ENST00000490743:exon_155582209_155582361:MSTO1;ENSG00000125459:ENST00000245564:exon_155582209_155582361:MSTO1;ENSG00000125459:ENST00000368341:exon_155582209_155582361:MSTO1;ENSG00000125459:ENST00000494995:exon_155582209_155582361:MSTO1;ENSG00000125459:ENST00000491308:exon_155582209_155582273:MSTO1;ENSG00000125459:ENST00000483734:exon_155582209_155582361:MSTO1;ENSG00000125459:ENST00000475253:exon_155582257_155582361:MSTO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 155735012 T/C 1 7 25 32 3.25130904099976 13.3881819964294 -10.1368729554297 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00030842597894973 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 155829511 C/T 1 10 6 16 4.64472720142823 3.21316367914306 1.43156352228517 T:C C T 10 0.535527279857177 0.618134679686612 ENSG00000132718:ENST00000368324:exon_155829300_155829586:SYT11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 156233189 C/T 1 10 13 23 4.64472720142823 6.9618546381433 -2.31712743671507 T:C C T 10 0.535527279857177 0.404605690601376 ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156233186_156233361:SMG5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 156263940 T/C 1 18 14 32 8.36050896257082 7.49738191800048 0.863127044570338 T:C T C 10 0.535527279857177 0.859946497231876 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 156264000 G/A 1 17 18 35 7.89603624242799 9.63949103742918 -1.74345479500119 A:G G A 10 0.535527279857177 0.612839258964269 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 156696999 T/C 1 45 51 96 20.901272406427 27.311891272716 -6.41061886628899 T:C T C 10 0.535527279857177 0.219344005515867 ENSG00000143319:ENST00000313146:exon_156696698_156698227:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000368219:exon_156696698_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000496538:exon_156696698_156697178:ISG20L2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 156760887 C/A 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 A:C C A 10 0.535527279857177 0.782354473542065 ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156760859_156760954:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000454659:exon_156760859_156760954:PRCC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 156907081 T/C 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 T:C T C 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000132694:ENST00000368194:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000413909:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000487682:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000361409:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000315174:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000492592:exon_156907041_156907288:ARHGEF11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 157504466 T/C 1 34 48 82 15.792072484856 25.7053094331445 -9.91323694828851 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0348180425278572 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157501754_157504682:FCRL5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 157517127 C/T 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:C C T 10 0.535527279857177 0.732042892054444 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 35 47 82 16.2565452049988 25.1697821532873 -8.91323694828851 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0592053571950173 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 18 8 26 8.36050896257082 4.28421823885742 4.0762907237134 A:G G A 10 0.535527279857177 0.119286633346569 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 160648875 C/T 1 2496 2325 4821 1159.32390947649 1245.10092566794 -85.7770161914502 A:T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.0135422526381755 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160648536_160648921:CD48 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 160654758 C/G 1 1397 1135 2532 648.868390039524 607.823462637896 41.0449274016279 T:C:G C G 10 0.535527279857177 0.102353137158730 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 1491 813 2304 692.528825732949 435.383678523885 257.145147209064 A:C:G G A 10 0.535527279857177 2.17735449441825e-27 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 160990875 T/C 0 11 0 11 5.10919992157105 0 5.10919992157105 T T 10 0.535527279857177 0.00125600829965403 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 160990876 C/A 0 12 0 12 5.57367264171388 0 5.57367264171388 C C 10 0.535527279857177 0.000657204225867289 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 160990878 C/T 0 12 0 12 5.57367264171388 0 5.57367264171388 C C 10 0.535527279857177 0.000657204225867289 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 161017556 C/T 1 117 149 266 54.3433082567103 79.7935646987194 -25.4502564420091 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00206048140852892 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161016738_161018145:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 161094036 G/A 1 19 32 51 8.82498168271364 17.1368729554297 -8.31189127271603 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0239813802221626 ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161093931_161095235:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000479728:exon_161093931_161094601:NIT1;ENSG00000158796:ENST00000368006:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000392188:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000368005:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000464113:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000490843:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000463227:exon_161093928_161094316:DEDD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 161183516 C/T 1 104 73 177 48.3051628948536 39.0934914295739 9.21167146527968 T:C C T 10 0.535527279857177 0.175247318850705 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161183439_161184086:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000492153:exon_161183439_161183522:NDUFS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 165648709 C/T 1 23 27 50 10.6828725632849 14.4592365561438 -3.77636399285885 T:C C T 10 0.535527279857177 0.321757996238217 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165648679_165648819:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000491436:exon_165648679_165648819:ALDH9A1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 165652273 A/G 1 11 12 23 5.10919992157105 6.42632735828612 -1.31712743671507 A:G A G 10 0.535527279857177 0.677416798105031 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000461664:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000471457:exon_165652062_165652347:ALDH9A1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 166826773 C/T 1 14 6 20 6.50261808199952 3.21316367914306 3.28945440285646 T:C C T 10 0.535527279857177 0.179412444802184 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166825747_166826956:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166825747_166826956:TADA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 168511331 C/T 1 10 12 22 4.64472720142823 6.42632735828612 -1.78160015685789 T:C C T 10 0.535527279857177 0.523672568666477 ENSG00000143185:ENST00000367819:exon_168511231_168511345:XCL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 169660939 T/C 1 222 485 707 103.112943871707 259.730730730731 -156.617786859024 T:C T C 10 0.535527279857177 2.13784219233663e-32 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169659808_169660943:SELL;ENSG00000188404:ENST00000497295:exon_169660822_169660943:SELL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 169676486 A/G 1 184 82 266 85.4629805062794 43.9132369482885 41.5497435579909 A:C:G A G 10 0.535527279857177 2.71152155094792e-07 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169676483_169676590:SELL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 169762807 T/G 1 10 26 36 4.64472720142823 13.9237092762866 -9.27898207485837 T:G T G 10 0.535527279857177 0.00226633432046924 ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000454472:exon_169762283_169763038:C1orf156 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 169823660 C/T 1 16 7 23 7.43156352228517 3.74869095900024 3.68287256328493 T:C C T 10 0.535527279857177 0.145529269824070 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 169951997 C/T 1 16 15 31 7.43156352228517 8.03290919785765 -0.601345675572485 T:C C T 10 0.535527279857177 0.858656759427397 ENSG00000075945:ENST00000361580:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367765:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367767:exon_169951843_169952008:KIFAP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 39 47 86 18.1144360855701 25.1697821532873 -7.05534606771722 A:G G A 10 0.535527279857177 0.131379700298173 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 172411768 T/C 1 22 29 51 10.2183998431421 15.5302911158581 -5.31189127271603 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.160205987359261 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 79 69 148 36.693344891283 36.9513823101452 -0.258037418862195 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 179310262 C/T 1 11 12 23 5.10919992157105 6.42632735828612 -1.31712743671507 T:C C T 10 0.535527279857177 0.677416798105031 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 179852074 T/C 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000143337:ENST00000528443:exon_179851177_179852112:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000398836:exon_179851177_179852112:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000325993:exon_179851420_179852112:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000367610:exon_179851420_179852112:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000271583:exon_179851432_179852112:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000435319:exon_179851447_179852112:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000531630:exon_179851929_179852112:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000527391:exon_179852024_179852127:TOR1AIP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 180257531 C/G 1 69 54 123 32.0486176898548 28.9184731122876 3.13014457756723 C:G C G 10 0.535527279857177 0.588719267694203 ENSG00000135847:ENST00000496993:exon_180257405_180257652:ACBD6;ENSG00000135847:ENST00000475338:exon_180257405_180257652:ACBD6;ENSG00000135847:ENST00000367595:exon_180257365_180257652:ACBD6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 181058191 G/T 1 48 37 85 22.2946905668555 19.8145093547155 2.48018121213996 T:G G T 10 0.535527279857177 0.663862208450161 ENSG00000162783:ENST00000367577:exon_181057638_181059977:IER5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 182827882 T/G 1 19 25 44 8.82498168271364 13.3881819964294 -4.56320031371579 T:G T G 10 0.535527279857177 0.176574758782132 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182827868_182828029:DHX9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 183542387 T/C 1 31 31 62 14.3986543244275 16.6013456755725 -2.20269135114497 T:C T C 10 0.535527279857177 0.611708253284812 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183542320_183542427:NCF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 183895435 A/C 1 10 6 16 4.64472720142823 3.21316367914306 1.43156352228517 A:C A C 10 0.535527279857177 0.618134679686612 ENSG00000143344:ENST00000304685:exon_183895239_183897666:RGL1;ENSG00000143344:ENST00000367531:exon_183895239_183897665:RGL1;ENSG00000143344:ENST00000360851:exon_183895239_183897665:RGL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 186321242 C/T 1 36 29 65 16.7210179251416 15.5302911158581 1.1907268092835 T:C C T 10 0.535527279857177 0.804522746497878 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186321108_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000491783:exon_186321108_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000469463:exon_186321084_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000474852:exon_186321147_186321242:TPR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 197061086 A/C 1 26 32 58 12.0762907237134 17.1368729554297 -5.06058223171626 A:C A C 10 0.535527279857177 0.190325190080046 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197061037_197061186:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000294732:exon_197061037_197061186:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197061037_197061186:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367408:exon_197061037_197061186:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197061037_197061186:ASPM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 197070442 G/T 1 6 11 17 2.78683632085694 5.89080007842895 -3.10396375757201 T:G G T 10 0.535527279857177 0.149487157554358 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197069561_197070645:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 197070697 T/C 1 13 13 26 6.0381453618567 6.9618546381433 -0.923709276286601 T:C T C 10 0.535527279857177 0.844640207112493 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 197070707 G/A 1 13 13 26 6.0381453618567 6.9618546381433 -0.923709276286601 A:G G A 10 0.535527279857177 0.844640207112493 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 197070776 C/T 1 12 9 21 5.57367264171388 4.81974551871459 0.753927122999285 T:C C T 10 0.535527279857177 0.828752253980847 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 197112850 T/C 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 T:C T C 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197111461_197112940:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000294732:exon_197111461_197112940:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197112821_197112940:ASPM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 200818980 C/G 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 C:G C G 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000118200:ENST00000358823:exon_200817160_200819362:CAMSAP1L1;ENSG00000118200:ENST00000413307:exon_200817160_200819362:CAMSAP1L1;ENSG00000118200:ENST00000236925:exon_200817160_200819362:CAMSAP1L1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 28 23 51 13.005236163999 12.3171274367151 0.688108727283975 A:T A T 10 0.535527279857177 0.889055740816392 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 202300958 G/A 1 14 28 42 6.50261808199952 14.994763836001 -8.49214575400143 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0123645457708417 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202300785_202301088:UBE2T HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 206239574 T/C 1 1 8 9 0.464472720142823 4.28421823885742 -3.81974551871459 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0150689460626302 ENSG00000196533:ENST00000331555:exon_206238872_206239579:C1orf186;ENSG00000196533:ENST00000421280:exon_206238872_206239579:C1orf186 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 206646630 T/A 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 A:T T A 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206646539_206646657:IKBKE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 206776460 G/A 1 46 39 85 21.3657451265699 20.8855639144299 0.480181212139957 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000437518:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000461334:exon_206776437_206776558:LGTN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 206905043 C/T 1 50 44 94 23.2236360071412 23.5632003137158 -0.339564306574633 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000479009:exon_206904633_206905070:MAPKAPK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 207087435 C/T 1 121 101 222 56.2011991372816 54.0882552655749 2.11294387170671 T:C C T 10 0.535527279857177 0.788223223730047 ENSG00000162894:ENST00000420007:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000367091:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000463473:exon_207087207_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000525793:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000529560:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000533312:exon_207086977_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000530505:exon_207087146_207087439:FAIM3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 207646322 G/A 1 22 35 57 10.2183998431421 18.7434547950012 -8.52505495185909 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0243760180172503 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 207646462 G/A 1 11 23 34 5.10919992157105 12.3171274367151 -7.20792751514402 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0154721466561132 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 207653395 C/A 1 19 30 49 8.82498168271364 16.0658183957153 -7.24083671300167 A:C C A 10 0.535527279857177 0.044483369553205 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207653323_207653398:CR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 209933331 A/G 1 27 23 50 12.5407634438562 12.3171274367151 0.223636007141151 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 209933540 A/G 1 44 30 74 20.4367996862842 16.0658183957153 4.37098129056891 A:G A G 10 0.535527279857177 0.351541965645429 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 67 48 115 31.1196722495691 25.7053094331445 5.41436281642465 C:G C G 10 0.535527279857177 0.350000079176462 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 211451467 T/C 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000117625:ENST00000533469:exon_211451459_211451565:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367006:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452325:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000435653:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452621:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000528926:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000419091:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000529572:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367005:exon_211451459_211451583:RCOR3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 24 25 49 11.1473452834278 13.3881819964294 -2.24083671300167 T:C T C 10 0.535527279857177 0.567987817021846 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 211846876 A/G 1 11 12 23 5.10919992157105 6.42632735828612 -1.31712743671507 A:G A G 10 0.535527279857177 0.677416798105031 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 150 128 278 69.6709080214235 68.5474918217187 1.12341619970481 T:C T C 10 0.535527279857177 0.904424615481691 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 214826196 G/A 1 53 56 109 24.6170541675696 29.9895276720019 -5.37247350443229 A:G G A 10 0.535527279857177 0.33704615424571 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000391896:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000467765:exon_214826171_214826332:CENPF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 92 78 170 42.7314902531397 41.7711278288598 0.960362424279914 A:G A G 10 0.535527279857177 0.938743907794707 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 214837110 C/G 1 73 70 143 33.9065085704261 37.4869095900024 -3.58040101957631 C:G C G 10 0.535527279857177 0.558281016927766 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 217604535 T/C 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 T:C T C 10 0.535527279857177 0.782354473542065 ENSG00000092978:ENST00000366935:exon_217600334_217604707:GPATCH2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 220193423 T/C 1 17 21 38 7.89603624242799 11.2460728770007 -3.35003663457272 T:C T C 10 0.535527279857177 0.32962722027678 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220193330_220193563:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220193330_220193563:EPRS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 220321023 A/G 1 118 116 234 54.8077809768531 62.1211644634325 -7.31338348657941 A:G A G 10 0.535527279857177 0.35899709324426 ENSG00000067704:ENST00000366922:exon_220320835_220321380:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000302637:exon_220320835_220321380:IARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 220921945 G/C 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 C:G G C 10 0.535527279857177 0.782354473542065 ENSG00000117791:ENST00000469583:exon_220921567_220922145:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220921611_220922145:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220921676_220922145:MOSC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 220935081 G/A 1 14 3 17 6.50261808199952 1.60658183957153 4.89603624242799 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0256420277318128 ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220935000_220935162:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220935000_220935162:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220935000_220935162:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000496078:exon_220935000_220935106:MOSC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 40 45 85 18.5789088057129 24.098727593573 -5.51981878786004 T:C T C 10 0.535527279857177 0.233785387942857 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 222832102 A/C 1 29 54 83 13.4697088841419 28.9184731122876 -15.4487642281457 A:C:G A C 10 0.535527279857177 0.000855903232489428 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222832064_222832165:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222832064_222832165:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222832064_222832165:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000340535:exon_222832064_222832165:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000284471:exon_222832064_222832165:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000476400:exon_222831984_222832165:MIA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 222832825 A/G 1 20 28 48 9.28945440285646 14.994763836001 -5.70530943314449 A:G A G 10 0.535527279857177 0.111732938444236 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222832795_222832855:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222832795_222832855:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222832795_222832855:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000340535:exon_222832795_222832855:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000284471:exon_222832795_222832855:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000476400:exon_222832795_222832855:MIA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 223900408 C/G 1 7 11 18 3.25130904099976 5.89080007842895 -2.63949103742919 C:G C G 10 0.535527279857177 0.242667099484109 ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223900034_223900579:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000433674:exon_223900119_223900579:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223900119_223900579:CAPN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 223905532 G/A 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 A:G G A 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223905464_223905533:CAPN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 223947081 A/G 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 A:G A G 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223946972_223947183:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000433674:exon_223946972_223947183:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223946972_223947183:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000474026:exon_223945326_223947183:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000487223:exon_223945928_223947183:CAPN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 223980207 G/C 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 C:G G C 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000143514:ENST00000391879:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000447749:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000391878:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000343537:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000360391:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000483398:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000498843:exon_223980091_223980224:TP53BP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 224488315 T/C 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000143748:ENST00000281701:exon_224488264_224488365:NVL;ENSG00000143748:ENST00000391875:exon_224488264_224488365:NVL;ENSG00000143748:ENST00000469968:exon_224488264_224488365:NVL;ENSG00000143748:ENST00000340871:exon_224488264_224488365:NVL;ENSG00000143748:ENST00000361463:exon_224488264_224488365:NVL;ENSG00000143748:ENST00000469075:exon_224488264_224488365:NVL;ENSG00000143748:ENST00000482491:exon_224488264_224488365:NVL;ENSG00000143748:ENST00000467882:exon_224488264_224488365:NVL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 224492746 C/T 1 6 9 15 2.78683632085694 4.81974551871459 -2.03290919785765 T:C C T 10 0.535527279857177 0.312914646957404 ENSG00000143748:ENST00000281701:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000391875:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000469968:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000340871:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000361463:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000469075:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000482491:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000467882:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000492281:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000488718:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000436927:exon_224492736_224492868:NVL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 224495852 C/T 1 12 12 24 5.57367264171388 6.42632735828612 -0.852654716572246 T:C C T 10 0.535527279857177 0.838566839920317 ENSG00000143748:ENST00000281701:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000391875:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000361463:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000467882:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000492281:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000436927:exon_224495693_224495919:NVL;ENSG00000143748:ENST00000470903:exon_224495688_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000461466:exon_224495695_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000498767:exon_224495710_224495965:NVL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 226108200 C/T 1 125 111 236 58.0590900178529 59.4435280641466 -1.38443804629376 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.896196926345653 ENSG00000143811:ENST00000343818:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000478402:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316940:exon_226107608_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316918:exon_226108155_226108313:PYCR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 226923938 A/C 1 7 6 13 3.25130904099976 3.21316367914306 0.0381453618566998 A:C A C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 226924595 T/C 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 T:C T C 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 226924642 C/T 1 3 9 12 1.39341816042847 4.81974551871459 -3.42632735828612 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0783062467016812 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 227069737 C/T 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000495488:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227069589_227069749:PSEN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 227069740 T/A 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 A:T T A 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000495488:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227069589_227069749:PSEN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 227076671 T/C 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 T:C T C 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227076530_227076750:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227076530_227076750:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227076530_227076750:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000460775:exon_227076530_227076750:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227076530_227076750:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227076530_227076750:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227076530_227076750:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000472139:exon_227076530_227076750:PSEN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 227152778 T/G 1 8 7 15 3.71578176114258 3.74869095900024 -0.0329091978576543 T:G T G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227152701_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227152701_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227152701_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000489044:exon_227152701_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227152701_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227152701_227153111:ADCK3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 227174210 T/C 1 16 12 28 7.43156352228517 6.42632735828612 1.00523616399905 T:C T C 10 0.535527279857177 0.850180746708856 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 227182659 G/A 0 10 0 10 4.64472720142823 0 4.64472720142823 G G 10 0.535527279857177 0.00240737050809797 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227182524_227182681:CDC42BPA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 227920061 T/G 1 41 31 72 19.0433815258557 16.6013456755725 2.44203585028326 T:G T G 10 0.535527279857177 0.636879777740236 ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 227922452 T/A 1 26 18 44 12.0762907237134 9.63949103742918 2.43679968628421 A:T T A 10 0.535527279857177 0.546133050382075 ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227922352_227922517:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227922352_227922517:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000480590:exon_227922352_227922517:JMJD4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 227935762 G/A 1 21 18 39 9.75392712299928 9.63949103742918 0.1144360855701 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 228335125 C/T 1 324 319 643 150.489161326275 170.833202274439 -20.3440409481648 T:C C T 10 0.535527279857177 0.113730533275007 ENSG00000143774:ENST00000366730:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000462807:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485838:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000312726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000492871:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366728:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366727:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000453943:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366723:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366729:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000391865:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366722:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498092:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000435153:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366721:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000460224:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000472939:exon_228335107_228335146:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000412265:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366719:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366720:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366718:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366715:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470040:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366716:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485168:exon_228335107_228335188:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000478725:exon_228335107_228335260:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000420445:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000495999:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000486668:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000464858:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470155:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000481341:exon_228335111_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498115:exon_228335107_228335400:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470740:exon_228335107_228335239:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000465025:exon_228335125_228335245:GUK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 228362682 G/A 1 4 11 15 1.85789088057129 5.89080007842895 -4.03290919785765 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0409545616380073 ENSG00000181873:ENST00000366711:exon_228362393_228362730:C1orf69;ENSG00000181873:ENST00000484749:exon_228362393_228362730:C1orf69 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 228471379 G/C 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 C:G G C 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000154358:ENST00000284548:exon_228471204_228471470:OBSCN;ENSG00000154358:ENST00000422127:exon_228471204_228471470:OBSCN;ENSG00000154358:ENST00000359599:exon_228471204_228471470:OBSCN;ENSG00000154358:ENST00000366707:exon_228471204_228471470:OBSCN;ENSG00000154358:ENST00000366709:exon_228471204_228471470:OBSCN;ENSG00000154358:ENST00000366706:exon_228471204_228471905:OBSCN;ENSG00000154358:ENST00000366704:exon_228471204_228472692:OBSCN;ENSG00000154358:ENST00000483539:exon_228471204_228471470:OBSCN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 228588680 A/C 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 A:C A C 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228588665_228588895:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228588640_228588892:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000366699:exon_228588665_228588895:TRIM11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 229461024 C/T 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000154429:ENST00000366687:exon_229456758_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000284617:exon_229456763_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000366686:exon_229457262_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000483092:exon_229459286_229461158:C1orf96 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 229622236 G/A 1 12 8 20 5.57367264171388 4.28421823885742 1.28945440285646 A:G G A 10 0.535527279857177 0.656931290438306 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229622118_229622275:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229622118_229622275:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229622118_229622275:NUP133 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 229631734 T/C 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 T:C T C 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229631639_229631794:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229631639_229631794:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229631639_229631794:NUP133 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 229636561 C/T 1 5 9 14 2.32236360071412 4.81974551871459 -2.49738191800048 T:C C T 10 0.535527279857177 0.193244891590877 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229636503_229636610:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229636503_229636610:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229636503_229636610:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366678:exon_229636503_229636610:NUP133 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 229738170 T/G 1 17 15 32 7.89603624242799 8.03290919785765 -0.136872955429662 T:G T G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 229738236 G/A 1 14 12 26 6.50261808199952 6.42632735828612 0.0762907237133996 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 229771833 C/T 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 229772693 T/G 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 T:G T G 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 229783328 G/C 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 C:G G C 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229783257_229783499:URB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 229787055 G/A 1 12 6 18 5.57367264171388 3.21316367914306 2.36050896257082 A:G G A 10 0.535527279857177 0.346375041233422 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229786982_229787069:URB2;ENSG00000135763:ENST00000434387:exon_229786594_229787069:URB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 229790048 A/G 1 9 4 13 4.18025448128541 2.14210911942871 2.0381453618567 A:G A G 10 0.535527279857177 0.282589464001187 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229789996_229790135:URB2;ENSG00000135763:ENST00000434387:exon_229789996_229790135:URB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 13 11 24 6.0381453618567 5.89080007842895 0.147345283427753 A:T T A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 231374856 G/A 1 26 27 53 12.0762907237134 14.4592365561438 -2.38294583243038 A:G G A 10 0.535527279857177 0.582266160295617 ENSG00000143633:ENST00000366649:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000318906:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000366651:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000366648:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000451322:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000421623:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000471936:exon_231372442_231374934:C1orf131 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 231408091 A/G 1 20 26 46 9.28945440285646 13.9237092762866 -4.63425487343014 A:G A G 10 0.535527279857177 0.185148183729362 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231408058_231408137:GNPAT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 233091463 T/A 1 15 2 17 6.96709080214235 1.07105455971435 5.89603624242799 A:T T A 10 0.535527279857177 0.00560333285628438 ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000479125:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000487953:exon_233091404_233091465:C1orf57 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 24 44 68 11.1473452834278 23.5632003137158 -12.415855030288 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00323992321826263 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 27 41 68 12.5407634438562 21.9566184741443 -9.41585503028804 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0279418683527776 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236413230 T/A 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 A:T T A 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236413185_236413267:ERO1LB;ENSG00000086619:ENST00000366589:exon_236413185_236413267:ERO1LB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 42 20 62 19.5078542459986 10.7105455971435 8.79730864885503 A:T T A 10 0.535527279857177 0.0297684673940766 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 23 7 30 10.6828725632849 3.74869095900024 6.93418160428469 T:C T C 10 0.535527279857177 0.015842552923206 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 16 2 18 7.43156352228517 1.07105455971435 6.36050896257081 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00322241683558313 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236702209 C/T 1 18 11 29 8.36050896257082 5.89080007842895 2.46970888414187 T:C C T 10 0.535527279857177 0.457199191884996 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236702210 A/G 1 19 11 30 8.82498168271364 5.89080007842895 2.93418160428469 A:G A G 10 0.535527279857177 0.360614188179226 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 19 16 35 8.82498168271364 8.56843647771483 0.256545204998806 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 29 48 77 13.4697088841419 25.7053094331445 -12.2356005490026 T:C:G G C 10 0.535527279857177 0.00587710363722577 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 55 66 121 25.5459996078553 35.3448004705737 -9.79880086271841 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0831118746514358 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 27 29 56 12.5407634438562 15.5302911158581 -2.98952767200191 T:C C T 10 0.535527279857177 0.425589241139246 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 54 39 93 25.0815268877124 20.8855639144299 4.19596297328254 T:C T C 10 0.535527279857177 0.406836722536534 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 58 55 113 26.9394177682837 29.4540003921447 -2.514582623861 T:C T C 10 0.535527279857177 0.638654433384685 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236719135 T/C 1 60 41 101 27.8683632085694 21.9566184741443 5.91174473442512 T:C T C 10 0.535527279857177 0.27253311215397 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 56 43 99 26.0104723279981 23.0276730338586 2.98279929413948 A:G A G 10 0.535527279857177 0.614645724973235 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 56 38 94 26.0104723279981 20.3500366345727 5.66043569342537 A:G G A 10 0.535527279857177 0.256541845374393 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 36 19 55 16.7210179251416 10.1750183172864 6.54599960785527 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0801583934644271 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236729956 T/C 1 13 20 33 6.0381453618567 10.7105455971435 -4.67240023528684 T:C T C 10 0.535527279857177 0.117195366512713 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236729946_236730176:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236729946_236730176:HEATR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236734896 T/C 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.809233970242324 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236734868_236734986:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236734868_236734986:HEATR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 236767330 A/G 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 A:G A G 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366579:exon_236767254_236767427:HEATR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 241755348 C/T 1 12 17 29 5.57367264171388 9.10396375757201 -3.53029111585813 T:C C T 10 0.535527279857177 0.197981940147675 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241755255_241755590:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366555:exon_241755255_241755451:KMO;ENSG00000054277:ENST00000462265:exon_241755312_241755422:OPN3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 242035438 G/A 1 10 2 12 4.64472720142823 1.07105455971435 3.57367264171388 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0443116899986832 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242035334_242035580:EXO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 242042301 G/A 1 13 19 32 6.0381453618567 10.1750183172864 -4.13687295542966 A:G G A 10 0.535527279857177 0.158370597920366 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 1 243579112 G/A 1 12 7 19 5.57367264171388 3.74869095900024 1.82498168271364 A:G G A 10 0.535527279857177 0.493201262474126 ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000493334:exon_243579004_243579131:SDCCAG8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 1065458 C/T 1 29 13 42 13.4697088841419 6.9618546381433 6.50785424599857 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0453854047870488 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4;ENSG00000148377:ENST00000277517:exon_1064847_1065774:IDI2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 38 45 83 17.6499633654273 24.098727593573 -6.44876422814569 A:G A G 10 0.535527279857177 0.186342679187468 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 3172121 C/T 1 108 131 239 50.1630537754249 70.1540736612902 -19.9910198858653 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0112807259753033 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 3172145 C/T 1 120 156 276 55.7367264171388 83.5422556577196 -27.8055292405808 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.00087734231404805 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 3178814 T/A 1 389 360 749 180.679888135558 192.789820748584 -12.1099326130255 A:T T A 10 0.535527279857177 0.379492877536615 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 98 94 192 45.5183265739967 50.3395643065746 -4.82123773257798 T:C T C 10 0.535527279857177 0.515138845174998 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 53 43 96 24.6170541675696 23.0276730338586 1.58938113371101 T:C T C 10 0.535527279857177 0.760015621477939 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 3191823 C/T 1 18 22 40 8.36050896257082 11.7816001568579 -3.42109119428708 T:C C T 10 0.535527279857177 0.341735714745905 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3191813_3191945:PITRM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 5 9 14 2.32236360071412 4.81974551871459 -2.49738191800048 A:G G A 10 0.535527279857177 0.193244891590877 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 3202065 T/C 1 24 31 55 11.1473452834278 16.6013456755725 -5.45400039214473 T:C T C 10 0.535527279857177 0.175898785826033 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 3206027 A/G 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 A:G A G 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 3207632 A/G 1 6 16 22 2.78683632085694 8.56843647771483 -5.78160015685789 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0172835260309455 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3207605_3207719:PITRM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 5496260 T/C 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 T:C T C 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5496228_5496485:NET1;ENSG00000173848:ENST00000449083:exon_5496228_5496485:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5496228_5496485:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5496228_5496485:NET1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 5920121 T/C 1 8 3 11 3.71578176114258 1.60658183957153 2.10919992157105 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.23951309450586 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5920060_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5920025_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5920050_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5920053_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5920085_5920250:ANKRD16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 5920244 T/C 1 10 12 22 4.64472720142823 6.42632735828612 -1.78160015685789 T:C T C 10 0.535527279857177 0.523672568666477 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5920060_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5920025_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5920050_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5920053_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5920085_5920250:ANKRD16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 5995050 C/T 1 31 29 60 14.3986543244275 15.5302911158581 -1.13163679143062 T:C C T 10 0.535527279857177 0.79674171013507 ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_5994756_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_5994784_5995289:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_5994861_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_5995008_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_5995014_5995169:IL15RA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 6067969 C/T 1 19 9 28 8.82498168271364 4.81974551871459 4.00523616399905 T:C C T 10 0.535527279857177 0.183778612379164 ENSG00000134460:ENST00000379959:exon_6067797_6067988:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000397240:exon_6067797_6067988:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000379954:exon_6067797_6067988:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000256876:exon_6067797_6067988:IL2RA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 A:T A T 10 0.535527279857177 0.809233970242324 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 15 4 19 6.96709080214235 2.14210911942871 4.82498168271364 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0360610529704875 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 11504686 C/T 1 7 16 23 3.25130904099976 8.56843647771483 -5.31712743671507 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0348627972253583 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 11505175 A/G 1 11 3 14 5.10919992157105 1.60658183957153 3.50261808199952 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0660528570991714 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 11505386 G/T 1 11 9 20 5.10919992157105 4.81974551871459 0.289454402856461 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 11505387 C/G 1 10 9 19 4.64472720142823 4.81974551871459 -0.175018317286362 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 11805357 G/A 0 8 0 8 3.71578176114258 0 3.71578176114258 G G 10 0.535527279857177 0.00893088209752 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 92 141 233 42.7314902531397 75.5093464598619 -32.7778562067222 A:G G A 10 0.535527279857177 1.78675263630979e-05 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 12131081 T/G 1 4 9 13 1.85789088057129 4.81974551871459 -2.9618546381433 T:G T G 10 0.535527279857177 0.162035560448580 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 105 99 204 48.7696356149964 53.0172007058605 -4.2475650908641 T:C T C 10 0.535527279857177 0.574723056961638 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 13151224 G/A 1 78 69 147 36.2288721711402 36.9513823101452 -0.722510139005017 A:G G A 10 0.535527279857177 0.934188888658719 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000487935:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13151097_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13151112_13151288:OPTN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 13228228 C/G 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000065328:ENST00000378714:exon_13228164_13228280:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000484800:exon_13228164_13228280:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000361282:exon_13228164_13228280:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000448399:exon_13228164_13228280:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000378694:exon_13228164_13228280:MCM10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 13239651 A/G 1 16 14 30 7.43156352228517 7.49738191800048 -0.0658183957153087 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000065328:ENST00000378714:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000484800:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000361282:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000448399:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000378694:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000481292:exon_13239623_13239767:MCM10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 18 17 35 8.36050896257082 9.10396375757201 -0.743454795001194 T:C T C 10 0.535527279857177 0.866114915546985 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 13380798 C/T 1 32 62 94 14.8631270445703 33.202691351145 -18.3395643065746 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.000169772041649519 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13380705_13380808:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13380705_13380808:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13380705_13380808:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13380705_13380808:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13380705_13380808:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000494329:exon_13380716_13380808:SEPHS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 14941654 C/T 1 8 17 25 3.71578176114258 9.10396375757201 -5.38818199642942 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0429883484536373 ENSG00000152455:ENST00000378331:exon_14941538_14941684:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000433779:exon_14941538_14941684:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000378325:exon_14941538_14941684:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000354919:exon_14941538_14941684:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000313519:exon_14941538_14941684:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000358298:exon_14941538_14941684:SUV39H2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 14943176 C/G 1 19 7 26 8.82498168271364 3.74869095900024 5.0762907237134 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0502051990490533 ENSG00000152455:ENST00000378331:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000433779:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000378325:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000354919:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000313519:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000358298:exon_14943132_14943261:SUV39H2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 15145855 C/G 1 97 89 186 45.0538538538538 47.6619279072887 -2.60807405343491 C:G C G 10 0.535527279857177 0.713693689076674 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 15146020 T/C 1 76 77 153 35.2999267308546 41.2356005490026 -5.93567381814808 T:C T C 10 0.535527279857177 0.372692647804555 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 15177280 T/C 1 11 15 26 5.10919992157105 8.03290919785765 -2.9237092762866 T:C T C 10 0.535527279857177 0.325768302416207 ENSG00000152465:ENST00000441445:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378165:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378150:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378143:exon_15177273_15177419:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000478580:exon_15177273_15177417:NMT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 16547058 A/G 1 19 19 38 8.82498168271364 10.1750183172864 -1.35003663457272 A:G A G 10 0.535527279857177 0.745641957711129 ENSG00000165983:ENST00000343656:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000378000:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000298942:exon_16547019_16547159:PTER HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 22608826 T/C 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 T:C T C 10 0.535527279857177 0.529514337684375 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 23408278 C/T 1 23 18 41 10.6828725632849 9.63949103742918 1.04338152585574 T:C C T 10 0.535527279857177 0.757371028370851 ENSG00000148450:ENST00000376510:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000277598:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000376513:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000472663:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000468633:exon_23408073_23408380:MSRB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 17 7 24 7.89603624242799 3.74869095900024 4.14734528342775 T:C C T 10 0.535527279857177 0.103284160119401 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 26800759 C/T 1 71 67 138 32.9775631301404 35.8803277504309 -2.90276462029042 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.669762782614002 ENSG00000077420:ENST00000445780:exon_26800676_26800835:APBB1IP;ENSG00000077420:ENST00000335513:exon_26800676_26800835:APBB1IP;ENSG00000077420:ENST00000376236:exon_26800676_26800835:APBB1IP;ENSG00000077420:ENST00000490118:exon_26800676_26800835:APBB1IP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 26856281 C/T 1 61 58 119 28.3328359287122 31.0605822317163 -2.72774630300406 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.646364374248492 ENSG00000077420:ENST00000445780:exon_26856228_26856494:APBB1IP;ENSG00000077420:ENST00000376236:exon_26855890_26856732:APBB1IP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 22 21 43 10.2183998431421 11.2460728770007 -1.02767303385861 T:C T C 10 0.535527279857177 0.762236365418988 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 28878715 A/G 1 18 9 27 8.36050896257082 4.81974551871459 3.54076344385622 A:G A G 10 0.535527279857177 0.183001936277486 ENSG00000095787:ENST00000375664:exon_28878665_28878780:WAC;ENSG00000095787:ENST00000375646:exon_28878665_28878780:WAC;ENSG00000095787:ENST00000347934:exon_28878665_28878780:WAC;ENSG00000095787:ENST00000354911:exon_28878665_28878780:WAC;ENSG00000095787:ENST00000428935:exon_28878665_28878780:WAC;ENSG00000095787:ENST00000420266:exon_28878665_28878780:WAC;ENSG00000095787:ENST00000424454:exon_28878665_28878780:WAC;ENSG00000095787:ENST00000442148:exon_28878665_28878780:WAC;ENSG00000095787:ENST00000414108:exon_28878665_28878780:WAC;ENSG00000095787:ENST00000424883:exon_28878665_28878728:WAC;ENSG00000095787:ENST00000439676:exon_28878665_28878780:WAC;ENSG00000095787:ENST00000345541:exon_28878665_28878780:WAC;ENSG00000095787:ENST00000472862:exon_28877666_28878780:WAC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 30629226 G/A 1 17 19 36 7.89603624242799 10.1750183172864 -2.27898207485837 A:G G A 10 0.535527279857177 0.505320305259396 ENSG00000107951:ENST00000358107:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000263063:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000488290:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000417581:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000421701:exon_30628901_30629379:MTPAP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 32304440 T/C 1 37 40 77 17.1854906452845 21.4210911942871 -4.23560054900263 T:C T C 10 0.535527279857177 0.361512619819572 ENSG00000170759:ENST00000302418:exon_32304437_32304587:KIF5B;ENSG00000170759:ENST00000403329:exon_32304437_32304587:KIF5B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 33214802 A/G 1 10 13 23 4.64472720142823 6.9618546381433 -2.31712743671507 A:G A G 10 0.535527279857177 0.404605690601376 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33214799_33215037:ITGB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 34620220 C/T 1 28 36 64 13.005236163999 19.2789820748584 -6.27374591085932 T:C C T 10 0.535527279857177 0.132561325639626 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000466092:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34620045_34620272:PARD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 43089965 G/A 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 A:G G A 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 43289407 G/A 1 27 34 61 12.5407634438562 18.207927515144 -5.6671640712878 A:G G A 10 0.535527279857177 0.158795735053295 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43289300_43289439:BMS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 43679006 G/A 1 10 9 19 4.64472720142823 4.81974551871459 -0.175018317286362 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000169826:ENST00000374466:exon_43678698_43680756:CSGALNACT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 45478092 A/G 1 4 10 14 1.85789088057129 5.35527279857177 -3.49738191800048 A:G A G 10 0.535527279857177 0.104526436185540 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374417:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374414:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000427758:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000462822:exon_45477973_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000428466:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000472561:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45476487_45478111:RASSF4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 45939617 A/G 1 17 16 33 7.89603624242799 8.56843647771483 -0.672400235286839 A:G A G 10 0.535527279857177 0.862495469151548 ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45939564_45939734:ALOX5;ENSG00000012779:ENST00000481117:exon_45939564_45939680:ALOX5;ENSG00000012779:ENST00000498461:exon_45939176_45939662:ALOX5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 45953767 A/G 1 3 12 15 1.39341816042847 6.42632735828612 -5.03290919785765 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0165864780945403 ENSG00000165406:ENST00000453424:exon_45950035_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000319836:exon_45952817_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000395771:exon_45952817_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000395769:exon_45952954_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000476962:exon_45952959_45953991:MARCH8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 46121704 T/C 1 10 21 31 4.64472720142823 11.2460728770007 -6.60134567557249 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0192056645122655 ENSG00000172671:ENST00000374366:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000344646:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374370:exon_46121399_46122553:ANUBL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 50374930 C/T 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 T:C C T 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000204161:ENST00000374156:exon_50374490_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374151:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374153:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000488276:exon_50374914_50375038:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000474718:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000453436:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374149:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374148:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000470884:exon_50374813_50375054:C10orf128 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 51827763 A/G 1 14 9 23 6.50261808199952 4.81974551871459 1.68287256328493 A:G A G 10 0.535527279857177 0.535797684122808 ENSG00000099290:ENST00000434114:exon_51827684_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000282633:exon_51827721_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000351071:exon_51827721_51827768:FAM21A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 52026532 G/A 0 55 0 55 25.5459996078553 0 25.5459996078553 G G 10 0.535527279857177 2.19259591789567e-15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 53458047 A/G 1 51 50 101 23.688108727284 26.7763639928588 -3.08825526557487 A:G A G 10 0.535527279857177 0.55083367732549 ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 58120988 C/A 1 50 46 96 23.2236360071412 24.6342548734301 -1.41061886628899 A:C C A 10 0.535527279857177 0.83799428017881 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58120957_58121036:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58120957_58121020:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58120957_58121034:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58120957_58121023:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58120957_58121003:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58120957_58121027:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58120957_58121018:ZWINT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 61552692 G/T 1 8 12 20 3.71578176114258 6.42632735828612 -2.71054559714354 T:G G T 10 0.535527279857177 0.265322195681750 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552607_61552732:CCDC6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 61552774 C/T 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 T:C C T 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552735_61552869:CCDC6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 62553763 A/G 1 10 3 13 4.64472720142823 1.60658183957153 3.0381453618567 A:G A G 10 0.535527279857177 0.102869269884982 ENSG00000170312:ENST00000395284:exon_62553635_62554610:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000316629:exon_62553635_62554601:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000448257:exon_62553635_62554586:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000373809:exon_62553635_62554610:CDK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 64565011 G/A 1 8 7 15 3.71578176114258 3.74869095900024 -0.0329091978576543 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000181915:ENST00000373783:exon_64564516_64568238:ADO HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 65380587 A/G 1 66 72 138 30.6551995294263 38.5579641497167 -7.90276462029042 A:G A G 10 0.535527279857177 0.200366864359611 ENSG00000165476:ENST00000373758:exon_65380573_65381969:REEP3;ENSG00000165476:ENST00000298249:exon_65380573_65384881:REEP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 69773841 G/A 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69773783_69773943:HERC4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 70502288 G/A 1 33 35 68 15.3275997647132 18.7434547950012 -3.41585503028804 A:G G A 10 0.535527279857177 0.46602050355787 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70502133_70502326:CCAR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 70549579 G/A 1 20 29 49 9.28945440285646 15.5302911158581 -6.24083671300167 A:G G A 10 0.535527279857177 0.085485374177318 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70549467_70549672:CCAR1;ENSG00000060339:ENST00000480627:exon_70549467_70549629:CCAR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 70696713 C/T 1 22 25 47 10.2183998431421 13.3881819964294 -3.16978215328732 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.382325834204734 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70696692_70696851:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70696692_70696851:DDX50 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 70700944 A/G 1 51 55 106 23.688108727284 29.4540003921447 -5.76589166486076 A:G A G 10 0.535527279857177 0.284463864866388 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 775 787 1562 359.966358110688 421.459969247598 -61.4936111369104 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.00196085214543081 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 71874048 G/A 1 50 54 104 23.2236360071412 28.9184731122876 -5.69483710514641 A:G G A 10 0.535527279857177 0.280206296234303 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71873901_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71872030_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71872030_71874085:AIFM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 21 17 38 9.75392712299928 9.10396375757201 0.649963365427276 T:C C T 10 0.535527279857177 0.87207052479811 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 72358049 C/T 1 2 8 10 0.928945440285646 4.28421823885742 -3.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0525767166149741 ENSG00000180644:ENST00000373209:exon_72357104_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000441259:exon_72357105_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000318971:exon_72357105_72358937:PRF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 72643671 C/T 1 147 110 257 68.277489860995 58.9080007842895 9.36948907670553 T:C C T 10 0.535527279857177 0.26035260112249 ENSG00000166228:ENST00000299299:exon_72643267_72643805:PCBD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 73520632 A/C 1 9 17 26 4.18025448128541 9.10396375757201 -4.9237092762866 A:C A C 10 0.535527279857177 0.0748738537647927 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73520288_73520681:C10orf54 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 75523634 A/G 1 18 17 35 8.36050896257082 9.10396375757201 -0.743454795001194 A:G A G 10 0.535527279857177 0.866114915546985 ENSG00000176986:ENST00000345254:exon_75523614_75523741:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000465076:exon_75523614_75523741:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000339365:exon_75523614_75523741:SEC24C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 75558867 G/A 1 12 13 25 5.57367264171388 6.9618546381433 -1.38818199642942 A:G G A 10 0.535527279857177 0.689410637065013 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 75562161 C/A 1 19 29 48 8.82498168271364 15.5302911158581 -6.70530943314449 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0597806804505357 ENSG00000166507:ENST00000309979:exon_75561669_75562334:NDST2;ENSG00000166507:ENST00000299641:exon_75561669_75562334:NDST2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 75865065 G/A 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 A:G G A 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000035403:ENST00000372755:exon_75864809_75865111:VCL;ENSG00000035403:ENST00000211998:exon_75864809_75865111:VCL;ENSG00000035403:ENST00000436396:exon_75864809_75865111:VCL;ENSG00000035403:ENST00000472585:exon_75864686_75865111:VCL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 75936611 C/T 1 11 14 25 5.10919992157105 7.49738191800048 -2.38818199642942 T:C C T 10 0.535527279857177 0.423396273780819 ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_75936444_75936644:ADK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 81841692 G/T 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000133678:ENST00000472622:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372281:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000528687:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372277:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372275:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372274:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000411627:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372273:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000467529:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000463029:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000476173:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000483732:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000463209:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000450179:exon_81841597_81841700:C10orf57 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 7 10 17 3.25130904099976 5.35527279857177 -2.10396375757201 T:C T C 10 0.535527279857177 0.338715846297251 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 88277457 C/T 1 13 13 26 6.0381453618567 6.9618546381433 -0.923709276286601 T:C C T 10 0.535527279857177 0.844640207112493 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88277328_88277848:WAPAL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 88730312 T/C 1 29 18 47 13.4697088841419 9.63949103742918 3.83021784671268 T:C T C 10 0.535527279857177 0.306737331204143 ENSG00000148671:ENST00000372013:exon_88730233_88730672:C10orf116;ENSG00000148671:ENST00000372012:exon_88730233_88730487:C10orf116 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 88930249 A/T 1 18 15 33 8.36050896257082 8.03290919785765 0.327599764713161 A:T A T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 90122332 A/G 1 9 13 22 4.18025448128541 6.9618546381433 -2.78160015685789 A:G A G 10 0.535527279857177 0.286672118812446 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90122309_90122482:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90122309_90122482:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90122309_90122482:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90122309_90122482:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90122309_90122482:RNLS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 5 13 18 2.32236360071412 6.9618546381433 -4.63949103742919 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0333546744685474 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 91066460 T/A 1 28 22 50 13.005236163999 11.7816001568579 1.22363600714115 A:T T A 10 0.535527279857177 0.77791766634817 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 91066769 C/A 1 25 20 45 11.6118180035706 10.7105455971435 0.901272406427037 A:C C A 10 0.535527279857177 0.88150907355531 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 91162497 A/G 1 178 156 334 82.6761441854225 83.5422556577196 -0.866111472297106 A:G A G 10 0.535527279857177 0.956266245929232 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 91178000 C/T 1 65 52 117 30.1907268092835 27.8474185525732 2.34330825671029 T:C C T 10 0.535527279857177 0.711172997320647 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 6 12 18 2.78683632085694 6.42632735828612 -3.63949103742918 A:G G A 10 0.535527279857177 0.100224935165788 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 10 14 24 4.64472720142823 7.49738191800048 -2.85265471657225 A:T T A 10 0.535527279857177 0.306793066047406 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 91498127 T/C 1 30 40 70 13.9341816042847 21.4210911942871 -7.48690959000239 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0927123348085725 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 20 19 39 9.28945440285646 10.1750183172864 -0.885563914429902 A:G A G 10 0.535527279857177 0.872767655672926 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 36 43 79 16.7210179251416 23.0276730338586 -6.30665510871698 A:G A G 10 0.535527279857177 0.17585421313868 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 14 15 29 6.50261808199952 8.03290919785765 -1.53029111585813 A:G A G 10 0.535527279857177 0.582218305374425 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 95276742 G/C 1 26 24 50 12.0762907237134 12.8526547165722 -0.776363992858847 C:G G C 10 0.535527279857177 0.887594984848254 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 32 36 68 14.8631270445703 19.2789820748584 -4.41585503028803 A:T A T 10 0.535527279857177 0.330831839992594 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 45 20 65 20.901272406427 10.7105455971435 10.1907268092835 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0124772386658361 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 42 29 71 19.5078542459986 15.5302911158581 3.97756313014044 A:G A G 10 0.535527279857177 0.405128789588303 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 14 3 17 6.50261808199952 1.60658183957153 4.89603624242799 A:C A C 10 0.535527279857177 0.0256420277318128 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 97515955 G/C 1 54 96 150 25.0815268877124 51.410618866289 -26.3290919785765 C:G G C 10 0.535527279857177 1.77505613588044e-05 ENSG00000138185:ENST00000371205:exon_97515714_97516012:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371203:exon_97515916_97516012:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000483213:exon_97515935_97516012:ENTPD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 97987144 C/G 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 C:G C G 10 0.535527279857177 0.732042892054444 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 169 171 340 78.4958897041371 91.5751648555773 -13.0792751514402 A:G A G 10 0.535527279857177 0.157779548419505 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 98031181 G/A 1 78 56 134 36.2288721711402 29.9895276720019 6.23934449913829 A:G G A 10 0.535527279857177 0.29923333026266 ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_98031109_98031297:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_98031109_98031297:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_98031109_98031333:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393898:exon_98031109_98031333:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_98031109_98031265:BLNK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 98469507 C/A 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 A:C C A 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 50 50 100 23.2236360071412 26.7763639928588 -3.55272798571769 T:C C T 10 0.535527279857177 0.484526551422451 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 99141192 C/T 0 21 0 21 9.75392712299928 0 9.75392712299928 C C 10 0.535527279857177 2.11707234978041e-06 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141143_99141240:RRP12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 99141205 A/G 1 8 14 22 3.71578176114258 7.49738191800048 -3.78160015685789 A:G A G 10 0.535527279857177 0.134327485283499 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141143_99141240:RRP12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 99155984 G/A 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99155975_99156058:RRP12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 99205731 A/G 1 21 15 36 9.75392712299928 8.03290919785765 1.72101792514163 A:G A G 10 0.535527279857177 0.61869297554355 ENSG00000171311:ENST00000464440:exon_99205712_99205751:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370902:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370886:exon_99205712_99205743:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370885:exon_99205712_99205750:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370884:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000485122:exon_99205712_99205742:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000476234:exon_99205712_99205763:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000489158:exon_99205712_99205763:EXOSC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 99219987 G/C 1 37 29 66 17.1854906452845 15.5302911158581 1.65519952942632 C:G G C 10 0.535527279857177 0.712718869138349 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 99220707 C/T 1 15 24 39 6.96709080214235 12.8526547165722 -5.8855639144299 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0762505623742275 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 99229412 G/T 1 15 13 28 6.96709080214235 6.9618546381433 0.00523616399904459 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434392:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000437002:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000441194:exon_99229410_99229480:MMS19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 99410790 T/C 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000155252:ENST00000416867:exon_99410698_99410898:PI4K2A;ENSG00000155252:ENST00000370631:exon_99410698_99410898:PI4K2A;ENSG00000249967:ENST00000370649:exon_99410698_99410898:RP11-548K23.11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 99416644 G/A 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000155252:ENST00000416867:exon_99416578_99416731:PI4K2A;ENSG00000155252:ENST00000370631:exon_99416578_99416731:PI4K2A;ENSG00000249967:ENST00000370649:exon_99416578_99416731:RP11-548K23.11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 99498234 G/A 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:G G A 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000155256:ENST00000393677:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370610:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370613:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000337540:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000497994:exon_99498234_99498406:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000356257:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000357540:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000453958:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000359980:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000462887:exon_99498234_99498602:ZFYVE27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 100179851 T/C 1 15 39 54 6.96709080214235 20.8855639144299 -13.9184731122876 T:C T C 10 0.535527279857177 0.000173006595409985 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000462743:exon_100179802_100180126:HPS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 100183570 G/C 1 10 11 21 4.64472720142823 5.89080007842895 -1.24607287700072 C:G G C 10 0.535527279857177 0.664214712035953 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000470095:exon_100183510_100183644:HPS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 100190920 G/A 1 22 14 36 10.2183998431421 7.49738191800048 2.72101792514163 A:G G A 10 0.535527279857177 0.406259189848113 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100190888_100191039:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000414009:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100190888_100191048:HPS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 101473147 A/G 1 30 49 79 13.9341816042847 26.2408367130017 -12.306655108717 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00649812335522167 ENSG00000014919:ENST00000370483:exon_101471601_101473236:COX15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 101486759 C/T 1 18 17 35 8.36050896257082 9.10396375757201 -0.743454795001194 T:C C T 10 0.535527279857177 0.866114915546985 ENSG00000014919:ENST00000370483:exon_101486725_101486911:COX15;ENSG00000014919:ENST00000016171:exon_101486725_101486911:COX15;ENSG00000014919:ENST00000485884:exon_101486725_101486911:COX15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 101639877 A/C 1 7 8 15 3.25130904099976 4.28421823885742 -1.03290919785765 A:C A C 10 0.535527279857177 0.614933682686176 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 101912064 T/C 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 T:C T C 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000107566:ENST00000370410:exon_101909848_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000421367:exon_101909851_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000407654:exon_101911565_101912109:ERLIN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 159 102 261 73.8511625027089 54.6237825454321 19.2273799572768 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0182495628463881 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 102750783 C/A 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:C C A 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000107815:ENST00000476766:exon_102750626_102750811:C10orf2;ENSG00000107815:ENST00000370228:exon_102750626_102750811:C10orf2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 102762256 C/T 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 T:C C T 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000107816:ENST00000426584:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000489526:exon_102762254_102762934:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000429732:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000481129:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102759233_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000454422:exon_102762254_102762703:LZTS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 102766574 A/G 1 13 8 21 6.0381453618567 4.28421823885742 1.75392712299928 A:G A G 10 0.535527279857177 0.515688372849167 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 104184081 G/A 1 136 110 246 63.1682899394239 58.9080007842895 4.26028915513447 A:G G A 10 0.535527279857177 0.609407247304893 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000486762:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104183788_104184151:CUEDC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 104184953 C/G 1 19 14 33 8.82498168271364 7.49738191800048 1.32759976471316 C:G C G 10 0.535527279857177 0.7283277168968 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 57 44 101 26.4749450481409 23.5632003137158 2.91174473442513 A:G G A 10 0.535527279857177 0.618252712204477 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 105164784 A/G 1 10 1 11 4.64472720142823 0.535527279857177 4.10919992157105 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0139209925925373 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105164779_105164940:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000493610:exon_105164779_105164940:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000471061:exon_105164779_105165129:PDCD11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 21 17 38 9.75392712299928 9.10396375757201 0.649963365427276 T:C C T 10 0.535527279857177 0.87207052479811 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 105203785 C/T 1 45 34 79 20.901272406427 18.207927515144 2.69334489128302 T:C C T 10 0.535527279857177 0.574160954822468 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105203672_105203825:PDCD11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 105205302 A/C 1 37 55 92 17.1854906452845 29.4540003921447 -12.2685097468603 A:C A C 10 0.535527279857177 0.0118432962262315 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105205135_105206049:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000478543:exon_105205135_105205481:PDCD11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 38 16 54 17.6499633654273 8.56843647771483 9.08152688771244 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0138232000184465 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 105361911 G/A 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 105362209 T/C 1 1 7 8 0.464472720142823 3.74869095900024 -3.28421823885742 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0289107709309061 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 105362535 C/T 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 105657363 C/G 1 28 33 61 13.005236163999 17.6724002352868 -4.66716407128779 C:G C G 10 0.535527279857177 0.249289478721209 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105657306_105657477:OBFC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 105762591 G/A 1 20 21 41 9.28945440285646 11.2460728770007 -1.95661847414426 A:G G A 10 0.535527279857177 0.639106621472687 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 201 119 320 93.3590167487074 63.7277463030041 29.6312704457034 A:C C A 10 0.535527279857177 0.000920749463903041 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 112058426 T/C 1 40 50 90 18.5789088057129 26.7763639928588 -8.19745518714593 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0909603063643313 ENSG00000119953:ENST00000369603:exon_112058406_112058548:SMNDC1;ENSG00000119953:ENST00000369592:exon_112058406_112058548:SMNDC1;ENSG00000119953:ENST00000460483:exon_112058406_112058548:SMNDC1;ENSG00000119953:ENST00000471297:exon_112058406_112058568:SMNDC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 112266771 C/T 1 96 47 143 44.589381133711 25.1697821532873 19.4195989804237 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00104737667677060 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 115609915 C/G 1 3 8 11 1.39341816042847 4.28421823885742 -2.89080007842895 C:G C G 10 0.535527279857177 0.127667889620419 ENSG00000198924:ENST00000369305:exon_115608739_115610403:DCLRE1A;ENSG00000198924:ENST00000361384:exon_115608739_115610403:DCLRE1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 115910928 G/T 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 T:G G T 10 0.535527279857177 0.809233970242324 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115910851_115910979:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115910851_115910979:C10orf118 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 115922492 C/T 1 8 8 16 3.71578176114258 4.28421823885742 -0.568436477714831 T:C C T 10 0.535527279857177 0.806722234902998 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369286:exon_115921367_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369285:exon_115921367_115923088:C10orf118 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 119133968 G/C 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 C:G G C 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119133867_119134978:PDZD8;ENSG00000165650:ENST00000489491:exon_119133867_119133992:PDZD8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 119134058 T/C 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:C T C 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119133867_119134978:PDZD8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 120446114 A/G 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 A:G A G 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000151893:ENST00000369156:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000369151:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000493518:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000490610:exon_120446110_120446293:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000489169:exon_120446110_120446153:C10orf46 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 120820747 G/T 1 84 90 174 39.0157084919971 48.1974551871459 -9.18174669514879 T:G G T 10 0.535527279857177 0.171577856664211 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120820736_120820840:EIF3A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 120828969 A/G 1 86 77 163 39.9446539322828 41.2356005490026 -1.29094661671984 A:G A G 10 0.535527279857177 0.875313013124152 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120828958_120829166:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120828958_120828985:EIF3A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 120840191 T/C 1 20 19 39 9.28945440285646 10.1750183172864 -0.885563914429902 T:C T C 10 0.535527279857177 0.872767655672926 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120840140_120840316:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000478852:exon_120840140_120840396:EIF3A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 121086097 A/T 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 A:T A T 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000198873:ENST00000369106:exon_121086028_121086123:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121086028_121086123:GRK5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 121336248 T/C 1 138 159 297 64.0972353797096 85.1488374972911 -21.0516021175816 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0145725399789734 ENSG00000151923:ENST00000369093:exon_121336123_121336262:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000463089:exon_121336123_121336262:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000489822:exon_121336123_121336715:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000497671:exon_121336123_121336262:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000470781:exon_121336123_121336715:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000436547:exon_121336123_121336262:TIAL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 121679013 A/G 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121678956_121679108:SEC23IP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 122665459 C/G 1 12 8 20 5.57367264171388 4.28421823885742 1.28945440285646 C:G C G 10 0.535527279857177 0.656931290438306 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122665388_122666367:WDR11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 123549691 T/G 1 10 4 14 4.64472720142823 2.14210911942871 2.50261808199952 T:G T G 10 0.535527279857177 0.283628757254846 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000485281:exon_123549684_123549741:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000470613:exon_123549378_123549804:ATE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 126517989 G/A 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 A:G G A 10 0.535527279857177 0.782354473542065 ENSG00000165660:ENST00000298492:exon_126517962_126518046:FAM175B;ENSG00000165660:ENST00000486933:exon_126517962_126518046:FAM175B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129846064 C/A 1 10 6 16 4.64472720142823 3.21316367914306 1.43156352228517 A:C C A 10 0.535527279857177 0.618134679686612 ENSG00000132334:ENST00000254667:exon_129846028_129846101:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000442830:exon_129846028_129846101:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000419012:exon_129846028_129846101:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000471218:exon_129846028_129846101:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000455661:exon_129846028_129846101:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000467366:exon_129846034_129846101:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000306042:exon_129846028_129846101:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000487428:exon_129845883_129846101:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000495530:exon_129846028_129846101:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000479896:exon_129846028_129846101:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000430713:exon_129846028_129846101:PTPRE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129871690 A/G 1 5 8 13 2.32236360071412 4.28421823885742 -1.9618546381433 A:G A G 10 0.535527279857177 0.405380944075703 ENSG00000132334:ENST00000254667:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000419012:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000439034:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000306042:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000479896:exon_129871601_129871735:PTPRE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129900858 C/T 1 302 237 539 140.270761483133 126.919965326151 13.3507961569816 T:C C T 10 0.535527279857177 0.261579619280852 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129901066 C/A 1 257 291 548 119.369489076706 155.838438438438 -36.468949361733 A:C C A 10 0.535527279857177 0.00201925172530158 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 322 265 587 149.560215885989 141.914729162152 7.64548672383711 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.535049047674703 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129901501 G/C 1 216 247 463 100.32610755085 132.275238124723 -31.9491305738729 C:G G C 10 0.535527279857177 0.00329086289229465 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 207 145 352 96.1458530695644 77.6514555792907 18.4943974902737 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.0481870312564261 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129901747 C/T 1 159 249 408 73.8511625027089 133.346292684437 -59.4951301817282 T:C C T 10 0.535527279857177 3.78069313997900e-09 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 331 262 593 153.740470367274 140.30814732258 13.432323044694 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.284442173149920 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129901946 T/G 1 263 197 460 122.156325397562 105.498874131864 16.6574512656986 T:G T G 10 0.535527279857177 0.123049491202052 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129902158 C/T 1 296 284 580 137.483925162276 152.089747479438 -14.6058223171626 T:C C T 10 0.535527279857177 0.227546445746960 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129902368 T/A 1 301 262 563 139.80628876299 140.30814732258 -0.50185855959063 A:T T A 10 0.535527279857177 0.966328574027301 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129903465 A/G 1 153 158 311 71.0643261818519 84.613310217434 -13.548984035582 A:G A G 10 0.535527279857177 0.125145836580692 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129904477 C/T 1 87 94 181 40.4091266524256 50.3395643065746 -9.93043765414903 T:C C T 10 0.535527279857177 0.156642019070165 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129905896 T/A 1 60 61 121 27.8683632085694 32.6671640712878 -4.79880086271841 A:T:C:G T A 10 0.535527279857177 0.412405521236831 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129906468 C/T 1 38 32 70 17.6499633654273 17.1368729554297 0.513090409997613 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129906980 C/T 1 43 37 80 19.9723269661414 19.8145093547155 0.157817611425845 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 34 22 56 15.792072484856 11.7816001568579 4.01047232799809 C:G G C 10 0.535527279857177 0.348446257407898 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129911856 C/G 1 11 6 17 5.10919992157105 3.21316367914306 1.89603624242799 C:G C G 10 0.535527279857177 0.467819685510286 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129911691_129911866:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 129917560 T/C 1 9 11 20 4.18025448128541 5.89080007842895 -1.71054559714354 T:C T C 10 0.535527279857177 0.505111632691192 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129917517_129917583:MKI67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 133761285 G/A 1 48 56 104 22.2946905668555 29.9895276720019 -7.6948371051464 A:G G A 10 0.535527279857177 0.140609547682812 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000470416:exon_133761034_133761295:PPP2R2D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 133769482 G/C 1 75 71 146 34.8354540107117 38.0224368698596 -3.18698285914783 C:G G C 10 0.535527279857177 0.619135907252142 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 134017295 A/G 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 A:G A G 10 0.535527279857177 0.782354473542065 ENSG00000151640:ENST00000338492:exon_134017266_134017431:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368629:exon_134017266_134017431:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368627:exon_134017266_134017431:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000471544:exon_134017057_134017431:DPYSL4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 134017388 C/G 1 9 2 11 4.18025448128541 1.07105455971435 3.10919992157105 C:G C G 10 0.535527279857177 0.072775715286889 ENSG00000151640:ENST00000338492:exon_134017266_134017431:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368629:exon_134017266_134017431:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368627:exon_134017266_134017431:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000471544:exon_134017057_134017431:DPYSL4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 134036193 A/G 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 A:G A G 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368622:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000298630:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000462160:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368625:exon_134036145_134036276:STK32C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 135083434 G/A 1 31 27 58 14.3986543244275 14.4592365561438 -0.0605822317162641 A:G G A 10 0.535527279857177 1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 135113056 C/T 1 30 21 51 13.9341816042847 11.2460728770007 2.68810872728397 T:C C T 10 0.535527279857177 0.48509708860321 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000487796:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135112939_135113107:TUBGCP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 10 135184110 C/T 1 61 36 97 28.3328359287122 19.2789820748584 9.05385385385384 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0674624944026449 ENSG00000127884:ENST00000368547:exon_135184064_135184261:ECHS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 210660 C/G 1 45 47 92 20.901272406427 25.1697821532873 -4.26850974686028 C:G C G 10 0.535527279857177 0.403609660557576 ENSG00000177963:ENST00000526104:exon_210571_210662:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000325207:exon_210571_210662:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000526982:exon_210575_210662:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527696:exon_210571_210662:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527728:exon_210571_210662:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527039:exon_210571_210662:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000530149:exon_210364_213780:RIC8A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 236091 G/A 1 3 8 11 1.39341816042847 4.28421823885742 -2.89080007842895 A:G G A 10 0.535527279857177 0.127667889620419 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_236048_236431:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_236048_236354:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_236048_236352:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_236048_236330:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525237:exon_236048_236326:SIRT3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 290816 A/G 1 7 6 13 3.25130904099976 3.21316367914306 0.0381453618566998 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 290918 G/A 1 6 10 16 2.78683632085694 5.35527279857177 -2.56843647771483 A:G G A 10 0.535527279857177 0.218648734569296 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 508 677 1185 235.952141832554 362.551968463309 -126.599826630755 A:G A G 10 0.535527279857177 2.17704278372056e-13 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 320836 C/T 1 23 7 30 10.6828725632849 3.74869095900024 6.93418160428469 T:C C T 10 0.535527279857177 0.015842552923206 ENSG00000142089:ENST00000399808:exon_320565_321050:IFITM3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 406954 G/A 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:G G A 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000185187:ENST00000431843:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000397632:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000332725:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000527295:exon_406349_407164:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000527987:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000531205:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000382520:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000534145:exon_406427_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000528209:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000525299:exon_406876_406993:SIGIRR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 420445 G/T 1 13 10 23 6.0381453618567 5.35527279857177 0.68287256328493 T:G G T 10 0.535527279857177 0.836716139403488 ENSG00000185101:ENST00000526142:exon_419582_420615:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_419582_420860:ANO9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 428385 A/G 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 A:G A G 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000185101:ENST00000412024:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000526142:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000534161:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_428358_428394:ANO9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 428489 T/C 1 6 9 15 2.78683632085694 4.81974551871459 -2.03290919785765 T:C T C 10 0.535527279857177 0.312914646957404 ENSG00000185101:ENST00000412024:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000526142:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000534161:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_428475_428639:ANO9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 498911 A/G 1 156 117 273 72.4577443422804 62.6566917432897 9.80105259899069 A:G A G 10 0.535527279857177 0.249089815061216 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_498763_498929:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_498788_498933:RNH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 562311 G/T 1 29 23 52 13.4697088841419 12.3171274367151 1.1525814474268 T:G G T 10 0.535527279857177 0.782476703275923 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 563257 G/A 1 27 21 48 12.5407634438562 11.2460728770007 1.29469056685551 A:G G A 10 0.535527279857177 0.773153219616852 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563189_563478:RASSF7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 563649 C/T 1 29 29 58 13.4697088841419 15.5302911158581 -2.06058223171626 T:C C T 10 0.535527279857177 0.600955767457472 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563558_564018:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563558_564021:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563558_563685:RASSF7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 587452 C/T 1 6 9 15 2.78683632085694 4.81974551871459 -2.03290919785765 T:C C T 10 0.535527279857177 0.312914646957404 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_587259_588497:PHRF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 610277 T/C 1 23 27 50 10.6828725632849 14.4592365561438 -3.77636399285885 T:C T C 10 0.535527279857177 0.321757996238217 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_610196_610347:PHRF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 614864 C/T 1 327 256 583 151.882579486703 137.094983643437 14.7875958432658 T:C C T 10 0.535527279857177 0.228604635025486 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614797_614984:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614797_614952:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532788:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614797_614887:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 654043 G/A 1 15 20 35 6.96709080214235 10.7105455971435 -3.74345479500119 A:G G A 10 0.535527279857177 0.236600445119263 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_653941_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_653962_654051:DEAF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 755962 C/G 1 194 160 354 90.1077077077077 85.6843647771483 4.42334293055936 T:C:G C G 10 0.535527279857177 0.669989135642224 ENSG00000177156:ENST00000319006:exon_755879_756002:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000528070:exon_755879_756002:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000532685:exon_755879_756284:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000528097:exon_755879_756002:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000530440:exon_755879_756002:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000530119:exon_755879_756002:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000533796:exon_755744_756002:TALDO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 763910 C/T 1 203 138 341 94.2879621889931 73.9027646202904 20.3851975687027 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0297430370929035 ENSG00000177156:ENST00000319006:exon_763747_763944:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000528097:exon_763747_763940:TALDO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 800563 C/T 1 15 12 27 6.96709080214235 6.42632735828612 0.540763443856222 T:C C T 10 0.535527279857177 0.850128429900867 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_800543_800666:LRDD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 802315 G/A 1 3 8 11 1.39341816042847 4.28421823885742 -2.89080007842895 A:G G A 10 0.535527279857177 0.127667889620419 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 802379 T/C 1 4 10 14 1.85789088057129 5.35527279857177 -3.49738191800048 T:C T C 10 0.535527279857177 0.104526436185540 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 802749 G/A 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 A:G G A 10 0.535527279857177 0.782354473542065 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802682_803647:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802682_802750:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000528122:exon_802682_803149:LRDD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 803535 G/A 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 A:G G A 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_803174_803647:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802682_803647:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_803174_803587:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_803174_803647:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_803174_803587:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_803174_803587:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_803174_803587:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534649:exon_803376_803647:LRDD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 804212 C/A 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:C C A 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_804094_804675:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_804094_805103:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_804094_804469:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534649:exon_804094_804463:LRDD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 823809 C/G 1 53 35 88 24.6170541675696 18.7434547950012 5.87359937256842 C:G C G 10 0.535527279857177 0.239817238981413 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_823694_823855:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_823527_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_823694_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000526083:exon_823648_823855:PNPLA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 824789 T/C 1 44 30 74 20.4367996862842 16.0658183957153 4.37098129056891 T:C T C 10 0.535527279857177 0.351541965645429 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_824523_825573:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_824523_825219:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_824523_825218:PNPLA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 870467 C/T 1 31 29 60 14.3986543244275 15.5302911158581 -1.13163679143062 T:C C T 10 0.535527279857177 0.79674171013507 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 993907 C/G 1 26 16 42 12.0762907237134 8.56843647771483 3.50785424599857 C:G C G 10 0.535527279857177 0.35347027796099 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528195:exon_993863_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000529125:exon_993754_993985:AP2A2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 1782563 G/A 1 49 32 81 22.7591632869983 17.1368729554297 5.62229033156867 A:G G A 10 0.535527279857177 0.222003842275859 ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1782539_1782770:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1782539_1782698:CTSD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 1972143 G/A 1 46 55 101 21.3657451265699 29.4540003921447 -8.08825526557487 A:G G A 10 0.535527279857177 0.111178737209581 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000486931:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1972140_1972251:MRPL23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 1972205 G/A 1 69 88 157 32.0486176898548 47.1264006274316 -15.0777829375768 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0163910969124794 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000486931:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1972140_1972251:MRPL23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 3028140 G/A 1 104 116 220 48.3051628948536 62.1211644634325 -13.8160015685789 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0678503626307027 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000484484:exon_3028109_3028240:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000466442:exon_3028109_3030127:CARS;ENSG00000110619:ENST00000470221:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3028109_3028189:CARS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 3714489 C/T 1 21 19 40 9.75392712299928 10.1750183172864 -0.421091194287078 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000429801:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000524563:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000530345:exon_3714287_3714605:NUP98 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 3723781 G/C 1 16 27 43 7.43156352228517 14.4592365561438 -7.02767303385861 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0330712554626782 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3723693_3724122:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3723693_3724122:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3723693_3724122:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000529063:exon_3723693_3723881:NUP98 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 3733899 C/T 1 15 21 36 6.96709080214235 11.2460728770007 -4.27898207485837 T:C C T 10 0.535527279857177 0.181555592466634 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3733794_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3733794_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3733794_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000397004:exon_3732783_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000397007:exon_3733065_3733958:NUP98 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 3752727 T/G 1 8 11 19 3.71578176114258 5.89080007842895 -2.17501831728636 T:G T G 10 0.535527279857177 0.362455450147038 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3752621_3752808:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3752621_3752808:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3752621_3752808:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000397004:exon_3752621_3752808:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000397007:exon_3752621_3752808:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000527104:exon_3752621_3752808:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000529379:exon_3752620_3752808:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000397013:exon_3752713_3752806:NUP98 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 4103524 A/G 1 7 8 15 3.25130904099976 4.28421823885742 -1.03290919785765 A:G A G 10 0.535527279857177 0.614933682686176 ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533343:exon_4103435_4103581:STIM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 4411241 C/T 1 66 64 130 30.6551995294263 34.2737459108593 -3.61854638143301 T:C C T 10 0.535527279857177 0.539153317774548 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4411232_4411688:TRIM21 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 5632212 G/A 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:G G A 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000121236:ENST00000278302:exon_5632007_5634182:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000507320:exon_5632007_5632930:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000515469:exon_5632007_5633659:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000380107:exon_5632007_5633653:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000511284:exon_5632007_5632334:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000380109:exon_5632007_5632572:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000380097:exon_5632007_5634182:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000396867:exon_5632007_5634182:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000445329:exon_5632007_5634182:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000515022:exon_5632007_5632575:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000506134:exon_5632007_5632817:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000380090:exon_5632007_5634188:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000469187:exon_5632007_5632509:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000481603:exon_5632007_5634188:TRIM6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 5655036 G/C 1 15 13 28 6.96709080214235 6.9618546381433 0.00523616399904459 C:G G C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5655034_5655129:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5655034_5655129:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5655034_5655129:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5655034_5655129:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5655034_5655129:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5655034_5655129:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000491385:exon_5655034_5655129:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5655034_5655129:TRIM34 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 5688940 C/T 1 8 11 19 3.71578176114258 5.89080007842895 -2.17501831728636 T:C C T 10 0.535527279857177 0.362455450147038 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5688919_5688941:TRIM5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 5699491 T/C 1 13 9 22 6.0381453618567 4.81974551871459 1.21839984314211 T:C T C 10 0.535527279857177 0.672789147896244 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5699434_5699664:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5699434_5699664:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5699434_5699664:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5699434_5699664:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5699434_5699664:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5699434_5699664:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5699434_5699664:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5699434_5699664:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5699434_5699664:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5699434_5699664:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5699434_5699664:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5699434_5699664:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5699176_5699664:TRIM5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 11 9 20 5.10919992157105 4.81974551871459 0.289454402856461 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 5719649 T/C 1 148 116 264 68.7419625811378 62.1211644634325 6.62079811770528 T:C T C 10 0.535527279857177 0.42311668976347 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 165 149 314 76.6379988235658 79.7935646987194 -3.15556587515357 T:C T C 10 0.535527279857177 0.734481116085324 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 209 239 448 97.07479850985 127.991019885865 -30.9162213760153 T:C:G G C 10 0.535527279857177 0.00381582184613443 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 5719777 T/C 1 6 28 34 2.78683632085694 14.994763836001 -12.207927515144 T:C T C 10 0.535527279857177 2.07519135277220e-05 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 6340560 C/A 1 13 8 21 6.0381453618567 4.28421823885742 1.75392712299928 A:C C A 10 0.535527279857177 0.515688372849167 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 93 107 200 43.1959629732825 57.3014189447179 -14.1054559714354 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0472457936954038 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 163 127 290 75.7090533832801 68.0119645418615 7.69708884141868 A:G G A 10 0.535527279857177 0.377588416929597 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 6703334 A/G 1 311 363 674 144.451015964418 194.396402588155 -49.9453866237373 A:T:G A G 10 0.535527279857177 0.000128617463824318 ENSG00000158042:ENST00000288937:exon_6702013_6703633:MRPL17;ENSG00000158042:ENST00000529958:exon_6703182_6703633:MRPL17 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 8486310 C/A 1 4 10 14 1.85789088057129 5.35527279857177 -3.49738191800048 A:C C A 10 0.535527279857177 0.104526436185540 ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8486256_8489201:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396673:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000418597:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000422559:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000457885:exon_8486256_8486369:STK33 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 8707083 G/A 1 20 4 24 9.28945440285646 2.14210911942871 7.14734528342775 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00344783730506492 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 8707147 T/C 1 10 16 26 4.64472720142823 8.56843647771483 -3.9237092762866 T:C T C 10 0.535527279857177 0.167638781651660 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 8707233 C/T 1 1946 1861 3807 903.863913397934 996.616267814206 -92.7523544162727 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.00264444188759273 ENSG00000166441:ENST00000314138:exon_8707225_8711419:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000524496:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000534599:exon_8707225_8707392:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000532359:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530022:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000526562:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000525981:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530913:exon_8707225_8707395:RPL27A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 9304939 T/C 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 T:C T C 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000166471:ENST00000299596:exon_9304918_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000524543:exon_9302201_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000429086:exon_9304918_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000528080:exon_9302218_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000533867:exon_9304686_9305140:TMEM41B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 9549142 G/A 1 22 28 50 10.2183998431421 14.994763836001 -4.77636399285885 A:G G A 10 0.535527279857177 0.2022490876187 ENSG00000166478:ENST00000396604:exon_9549077_9549601:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396602:exon_9549077_9550071:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000530463:exon_9549077_9549160:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396597:exon_9549077_9549193:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000299606:exon_9549077_9549828:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000532305:exon_9549077_9549499:ZNF143 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 9749645 A/C 1 8 18 26 3.71578176114258 9.63949103742918 -5.9237092762866 A:C A C 10 0.535527279857177 0.0286443565268179 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9749600_9749746:SWAP70 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 10786142 C/T 1 13 15 28 6.0381453618567 8.03290919785765 -1.99476383600095 T:C C T 10 0.535527279857177 0.456381948739043 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 10821185 G/A 1 259 210 469 120.298434516991 112.460728770007 7.837705746984 A:G G A 10 0.535527279857177 0.487544616542977 ENSG00000110321:ENST00000429377:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000526148:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000525681:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000532383:exon_10821099_10821895:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000339995:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000396525:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000534272:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000379653:exon_10821099_10821303:EIF4G2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 14913575 G/A 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000186104:ENST00000334636:exon_14913527_14913798:CYP2R1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 17111272 A/G 1 15 10 25 6.96709080214235 5.35527279857177 1.61181800357058 A:G A G 10 0.535527279857177 0.55392591166511 ENSG00000011405:ENST00000265970:exon_17108119_17111467:PIK3C2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 16 12 28 7.43156352228517 6.42632735828612 1.00523616399905 T:C C T 10 0.535527279857177 0.850180746708856 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 18555901 C/G 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 C:G C G 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000151116:ENST00000396197:exon_18555877_18556000:UEVLD;ENSG00000151116:ENST00000379387:exon_18555877_18556000:UEVLD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 20404613 T/G 1 48 54 102 22.2946905668555 28.9184731122876 -6.62378254543205 A:T:G T G 10 0.535527279857177 0.197789125315161 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 20404757 T/C 1 87 87 174 40.4091266524256 46.5908733475744 -6.18174669514879 T:C T C 10 0.535527279857177 0.362265353838028 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 20529892 A/G 1 20 15 35 9.28945440285646 8.03290919785765 1.25654520499881 A:G A G 10 0.535527279857177 0.736332608702484 ENSG00000185238:ENST00000331079:exon_20529850_20530799:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000330796:exon_20529850_20530840:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000437750:exon_20529850_20530254:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000529592:exon_20529850_20530828:PRMT3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 22696451 A/G 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 A:G A G 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000148935:ENST00000528582:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000533092:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000454584:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000533363:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000278187:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000524701:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000534801:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000532398:exon_22696319_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000433790:exon_22696319_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000432939:exon_22696416_22696565:GAS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 22770669 T/C 1 4 8 12 1.85789088057129 4.28421823885742 -2.42632735828612 T:C T C 10 0.535527279857177 0.24635656157035 ENSG00000148935:ENST00000528582:exon_22770666_22770736:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000454584:exon_22770666_22770807:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000278187:exon_22770666_22770807:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000524701:exon_22770666_22770807:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000532398:exon_22770666_22770807:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000433790:exon_22770666_22770807:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000432939:exon_22770666_22770807:GAS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 27362257 T/C 1 47 41 88 21.8302178467127 21.9566184741443 -0.126400627431575 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 27384585 G/A 1 19 28 47 8.82498168271364 14.994763836001 -6.16978215328732 A:G G A 10 0.535527279857177 0.079581118567537 ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27384383_27384678:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27384383_27385415:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000317945:exon_27384383_27384781:CCDC34 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 33076191 T/C 1 14 6 20 6.50261808199952 3.21316367914306 3.28945440285646 T:C T C 10 0.535527279857177 0.179412444802184 ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33076139_33076271:TCP11L1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 33079580 A/G 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33079465_33079685:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33079465_33079685:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33079465_33079685:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33079465_33079642:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33079465_33079685:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33079465_33079685:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33079465_33079685:TCP11L1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 33106616 C/T 1 42 44 86 19.5078542459986 23.5632003137158 -4.05534606771722 T:C C T 10 0.535527279857177 0.389161911173514 ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33106496_33106666:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33106496_33106744:TCP11L1;ENSG00000176102:ENST00000528865:exon_33106578_33106835:CSTF3;ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33106130_33106835:CSTF3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 34378381 G/C 1 7 13 20 3.25130904099976 6.9618546381433 -3.71054559714354 C:G G C 10 0.535527279857177 0.117313042346182 ENSG00000166016:ENST00000435224:exon_34378248_34379555:ABTB2;ENSG00000166016:ENST00000298992:exon_34378248_34378802:ABTB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 34482908 C/T 1 27 27 54 12.5407634438562 14.4592365561438 -1.91847311228756 T:C C T 10 0.535527279857177 0.682745837825282 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34482798_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000530343:exon_34482280_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000525707:exon_34482750_34482936:CAT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 17 29 46 7.89603624242799 15.5302911158581 -7.63425487343014 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0265184006509825 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 34916657 C/T 1 17 11 28 7.89603624242799 5.89080007842895 2.00523616399905 T:C C T 10 0.535527279857177 0.570608245390574 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34916557_34916657:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34916557_34916657:APIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 13 15 28 6.0381453618567 8.03290919785765 -1.99476383600095 A:G G A 10 0.535527279857177 0.456381948739043 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 43702530 A/G 1 35 40 75 16.2565452049988 21.4210911942871 -5.16454598928827 A:G A G 10 0.535527279857177 0.248092333081309 ENSG00000149084:ENST00000531185:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000395700:exon_43702331_43702537:HSD17B12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 43876698 C/T 1 53 38 91 24.6170541675696 20.3500366345727 4.2670175329969 T:C C T 10 0.535527279857177 0.401312488344330 ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 43913604 G/A 1 30 26 56 13.9341816042847 13.9237092762866 0.0104723279980892 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43913591_43913679:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529366:exon_43913591_43913679:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530754:exon_43913591_43913679:ALKBH3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 44104981 C/T 1 7 13 20 3.25130904099976 6.9618546381433 -3.71054559714354 T:C C T 10 0.535527279857177 0.117313042346182 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 45827350 A/G 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 A:G A G 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000181830:ENST00000314134:exon_45825957_45827887:SLC35C1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 46400775 G/A 1 3 20 23 1.39341816042847 10.7105455971435 -9.31712743671507 A:G G A 10 0.535527279857177 7.94685726268415e-05 ENSG00000149091:ENST00000343674:exon_46400753_46400786:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000528615:exon_46400753_46400786:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000524984:exon_46400753_46400786:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000395574:exon_46400753_46400786:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000532868:exon_46400753_46400786:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000456247:exon_46400753_46400786:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000527911:exon_46400753_46400786:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000454345:exon_46400753_46400786:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000318201:exon_46400753_46400786:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000528173:exon_46400753_46401118:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000527211:exon_46400753_46401118:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000529660:exon_46400753_46400786:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000534802:exon_46400753_46400786:DGKZ HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 62284888 G/A 1 13 40 53 6.0381453618567 21.4210911942871 -15.3829458324304 A:G G A 10 0.535527279857177 2.296294952158e-05 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 62334908 G/C 1 1436 625 2061 666.982826125094 334.704549910736 332.278276214358 A:T:C:G G C 10 0.535527279857177 2.88185587376413e-50 ENSG00000254772:ENST00000329251:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000525340:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000378019:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000524420:exon_62334871_62335000:EEF1G HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 62346131 C/T 1 33 38 71 15.3275997647132 20.3500366345727 -5.02243686985956 T:C C T 10 0.535527279857177 0.236675960416332 ENSG00000149016:ENST00000308436:exon_62346033_62346502:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000476907:exon_62346033_62346502:TUT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 62370155 G/A 1 10 3 13 4.64472720142823 1.60658183957153 3.0381453618567 A:G G A 10 0.535527279857177 0.102869269884982 ENSG00000149499:ENST00000439994:exon_62369690_62370251:EML3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 62378660 G/A 1 21 15 36 9.75392712299928 8.03290919785765 1.72101792514163 A:G G A 10 0.535527279857177 0.61869297554355 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 62378801 T/C 1 22 27 49 10.2183998431421 14.4592365561438 -4.24083671300167 T:C T C 10 0.535527279857177 0.252750976974602 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 62397114 T/C 1 35 32 67 16.2565452049988 17.1368729554297 -0.880327750430858 T:C T C 10 0.535527279857177 0.902658912890258 ENSG00000089597:ENST00000532402:exon_62397060_62397156:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000346178:exon_62397060_62397156:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000356638:exon_62397060_62397156:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000534779:exon_62397060_62397156:GANAB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 63585804 C/A 1 72 49 121 33.4420358502833 26.2408367130017 7.20119913728159 A:C C A 10 0.535527279857177 0.202516580886531 ENSG00000168005:ENST00000294244:exon_63585688_63585837:C11orf84 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 64039175 G/A 1 25 26 51 11.6118180035706 13.9237092762866 -2.31189127271603 A:G G A 10 0.535527279857177 0.575230501488791 ENSG00000002330:ENST00000394532:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000309032:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000394531:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000493798:exon_64039085_64039340:BAD;ENSG00000002330:ENST00000492141:exon_64039085_64039275:BAD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 64107735 G/A 1 8 5 13 3.71578176114258 2.67763639928588 1.0381453618567 A:G G A 10 0.535527279857177 0.593586480755975 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64107695_64107798:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64107695_64107798:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64107695_64107798:CCDC88B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 64109118 T/G 1 23 21 44 10.6828725632849 11.2460728770007 -0.563200313715786 T:G T G 10 0.535527279857177 0.880949379207489 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 64117106 C/T 1 40 37 77 18.5789088057129 19.8145093547155 -1.23560054900263 T:C C T 10 0.535527279857177 0.819681621653495 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64117023_64118167:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64117023_64117140:CCDC88B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 64124515 T/C 1 248 225 473 115.18923459542 120.493637967865 -5.3044033724447 T:C T C 10 0.535527279857177 0.64490520100352 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64124511_64125006:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64124511_64124958:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64124511_64124997:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64124511_64125002:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64122666_64125000:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64124511_64124842:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000472524:exon_64124511_64125003:CCDC88B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 64138805 T/C 1 29 21 50 13.4697088841419 11.2460728770007 2.22363600714115 T:C T C 10 0.535527279857177 0.572529840370803 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64138755_64138813:RPS6KA4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 64138905 T/G 1 13 7 20 6.0381453618567 3.74869095900024 2.28945440285646 T:G T G 10 0.535527279857177 0.373042117571353 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 64575505 C/T 1 10 12 22 4.64472720142823 6.42632735828612 -1.78160015685789 T:C C T 10 0.535527279857177 0.523672568666477 ENSG00000133895:ENST00000377316:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64575468_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64575468_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000440873:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000450708:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000413626:exon_64575363_64575571:MEN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 64806270 C/T 1 10 10 20 4.64472720142823 5.35527279857177 -0.71054559714354 T:C C T 10 0.535527279857177 0.824432001736655 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64802992_64806301:SNX15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 64807235 C/T 1 24 12 36 11.1473452834278 6.42632735828612 4.72101792514163 T:C C T 10 0.535527279857177 0.133296399696246 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64807158_64808042:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64807158_64808044:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64807158_64807264:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64807158_64808042:SNX15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 64812857 G/A 1 11 6 17 5.10919992157105 3.21316367914306 1.89603624242799 A:G G A 10 0.535527279857177 0.467819685510286 ENSG00000168060:ENST00000358658:exon_64812295_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355369:exon_64812297_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000339885:exon_64812297_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526799:exon_64812698_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529274:exon_64812708_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528977:exon_64812708_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000340252:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355721:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000356632:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526516:exon_64812776_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000532802:exon_64812785_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530995:exon_64812823_64812929:NAALADL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 64884052 G/A 1 22 16 38 10.2183998431421 8.56843647771483 1.64996336542728 A:G G A 10 0.535527279857177 0.628846587952398 ENSG00000174276:ENST00000310597:exon_64883876_64885170:ZNHIT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 65064690 G/A 1 30 27 57 13.9341816042847 14.4592365561438 -0.525054951859088 A:G G A 10 0.535527279857177 0.895215302544066 ENSG00000014138:ENST00000265465:exon_65064591_65066156:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000527618:exon_65064591_65065087:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000534785:exon_65064591_65065023:POLA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 65088663 C/T 1 3 8 11 1.39341816042847 4.28421823885742 -2.89080007842895 T:C C T 10 0.535527279857177 0.127667889620419 ENSG00000149798:ENST00000279249:exon_65088015_65089900:CDC42EP2;ENSG00000149798:ENST00000533419:exon_65088015_65089092:CDC42EP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 65168281 C/T 1 5 11 16 2.32236360071412 5.89080007842895 -3.56843647771483 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0832488497756866 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65168195_65168338:FRMD8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 65380916 G/A 1 12 20 32 5.57367264171388 10.7105455971435 -5.13687295542966 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0771656531600189 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65380489_65381713:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524856:exon_65380489_65382853:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000527304:exon_65376103_65381707:MAP3K11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 65387378 T/A 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:T T A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65387225_65387403:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000531045:exon_65387329_65387403:PCNXL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 65392695 C/T 1 11 1 12 5.10919992157105 0.535527279857177 4.57367264171388 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00784285311130818 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65392642_65392751:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000530174:exon_65392598_65392751:PCNXL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 65412467 G/A 1 62 64 126 28.797308648855 34.2737459108593 -5.4764372620043 A:G G A 10 0.535527279857177 0.327808349223486 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65412426_65412600:SIPA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 65417434 G/A 1 101 88 189 46.9117447344251 47.1264006274316 -0.214655893006444 A:T:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000531339:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65417421_65417522:SIPA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 65546857 A/C 1 9 5 14 4.18025448128541 2.67763639928588 1.50261808199952 A:C A C 10 0.535527279857177 0.593847726273405 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 65631361 C/T 1 28 17 45 13.005236163999 9.10396375757201 3.90127240642704 T:C C T 10 0.535527279857177 0.29573371832178 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631275_65631372:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631275_65631559:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631275_65631372:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631275_65631372:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631272_65631372:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65631275_65631361:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631275_65631559:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631277_65631372:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631357_65631372:MUS81 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 60 64 124 27.8683632085694 34.2737459108593 -6.40538270228994 A:G G A 10 0.535527279857177 0.279963265205327 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 120 127 247 55.7367264171388 68.0119645418615 -12.2752381247227 T:C C T 10 0.535527279857177 0.125751030821632 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 65735174 G/C 1 102 77 179 47.3762174545679 41.2356005490026 6.14061690556532 C:G G C 10 0.535527279857177 0.369385466655775 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65735150_65735292:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65735150_65735292:SART1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 66033430 C/T 1 25 17 42 11.6118180035706 9.10396375757201 2.50785424599857 T:C C T 10 0.535527279857177 0.536584000504791 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66033325_66033483:KLC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 66109033 T/C 1 65 47 112 30.1907268092835 25.1697821532873 5.02094465599618 T:C T C 10 0.535527279857177 0.393987895903699 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000394043:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000527375:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530756:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000534617:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000525127:exon_66109004_66109094:BRMS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 66206169 C/T 1 54 38 92 25.0815268877124 20.3500366345727 4.73149025313972 T:C C T 10 0.535527279857177 0.347815661412088 ENSG00000174547:ENST00000310999:exon_66206103_66206319:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000534488:exon_66206103_66206297:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000329819:exon_66206103_66206305:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000394025:exon_66206103_66206295:MRPL11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 47 57 104 21.8302178467127 30.5250549518591 -8.69483710514641 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0947835727321077 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 66610645 G/C 1 28 31 59 13.005236163999 16.6013456755725 -3.59610951157344 C:G G C 10 0.535527279857177 0.363344888929878 ENSG00000173715:ENST00000360962:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000346672:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000527634:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000528340:exon_66610640_66610793:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532565:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000525449:exon_66610640_66610795:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532727:exon_66610640_66610763:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000531415:exon_66610640_66610744:C11orf80;ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66610306_66611332:RCE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 66626234 T/C 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 T:C T C 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000173621:ENST00000393952:exon_66625206_66626347:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000309602:exon_66624973_66626564:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000525479:exon_66624996_66626528:LRFN4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 67352256 C/A 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:C C A 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000489040:exon_67352156_67352535:GSTP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 1534 1280 2814 712.501152699091 685.474918217187 27.026234481904 A:T:C:G A G 10 0.535527279857177 0.307555963647289 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 67353844 C/T 1 10 11 21 4.64472720142823 5.89080007842895 -1.24607287700072 T:C C T 10 0.535527279857177 0.664214712035953 ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 67353970 T/C 1 2413 2271 4684 1120.77267370463 1216.18245255565 -95.4097788510169 A:T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.00537742235173369 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 67397251 G/C 1 11 14 25 5.10919992157105 7.49738191800048 -2.38818199642942 C:G G C 10 0.535527279857177 0.423396273780819 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67397189_67397401:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67397189_67397392:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67396390_67397392:NUDT8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 68703959 A/G 1 4 9 13 1.85789088057129 4.81974551871459 -2.9618546381433 A:G A G 10 0.535527279857177 0.162035560448580 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 68704066 T/A 1 11 10 21 5.10919992157105 5.35527279857177 -0.246072877000716 A:T T A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 68704264 C/T 1 13 14 27 6.0381453618567 7.49738191800048 -1.45923655614378 T:C C T 10 0.535527279857177 0.700369496789269 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 68705674 C/A 1 9 3 12 4.18025448128541 1.60658183957153 2.57367264171388 A:C C A 10 0.535527279857177 0.158167791151507 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68705650_68705822:IGHMBP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 68840160 A/G 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000162341:ENST00000294309:exon_68840095_68840176:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000442692:exon_68840095_68840176:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000450354:exon_68840095_68840176:TPCN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 68840412 C/G 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 C:G C G 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000162341:ENST00000294309:exon_68840383_68840469:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000442692:exon_68840383_68840469:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000450354:exon_68840383_68840469:TPCN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 70200529 C/T 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000131626:ENST00000253925:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000389547:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000532504:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526262:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530798:exon_70200428_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526347:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530294:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526074:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000528750:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000533894:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530390:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000527612:exon_70200309_70200558:PPFIA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 70 53 123 32.5130904099976 28.3829458324304 4.13014457756723 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.470872543403793 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 71146691 A/G 1 61 68 129 28.3328359287122 36.415855030288 -8.08301910157583 A:G A G 10 0.535527279857177 0.158654595947722 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 71152461 A/G 1 58 45 103 26.9394177682837 24.098727593573 2.84069017471077 A:G A G 10 0.535527279857177 0.6218289401732 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71152406_71152486:DHCR7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 71155153 A/G 1 36 33 69 16.7210179251416 17.6724002352868 -0.95138231014521 A:G A G 10 0.535527279857177 0.904050149220145 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71155039_71155165:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 71155171 C/T 1 31 27 58 14.3986543244275 14.4592365561438 -0.0605822317162641 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 11 14 25 5.10919992157105 7.49738191800048 -2.38818199642942 C:G G C 10 0.535527279857177 0.423396273780819 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 71185479 T/C 1 16 10 26 7.43156352228517 5.35527279857177 2.0762907237134 T:C T C 10 0.535527279857177 0.439359348031197 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 71185518 T/C 1 14 8 22 6.50261808199952 4.28421823885742 2.21839984314211 T:C T C 10 0.535527279857177 0.397197441912417 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 71727609 G/A 1 7 1 8 3.25130904099976 0.535527279857177 2.71578176114258 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0758484261005442 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 73106185 T/A 1 11 8 19 5.10919992157105 4.28421823885742 0.824981682713638 A:T T A 10 0.535527279857177 0.819687245305986 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73106132_73106330:RELT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 73516094 C/T 1 32 22 54 14.8631270445703 11.7816001568579 3.08152688771244 T:C C T 10 0.535527279857177 0.416709173589489 ENSG00000175581:ENST00000310614:exon_73516072_73516124:MRPL48;ENSG00000175581:ENST00000411840:exon_73516072_73516124:MRPL48 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 9 6 15 4.18025448128541 3.21316367914306 0.967090802142346 T:C T C 10 0.535527279857177 0.796987479524744 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 77412851 A/G 1 27 16 43 12.5407634438562 8.56843647771483 3.97232696614139 A:G A G 10 0.535527279857177 0.284456845395382 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77411766_77414578:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000528095:exon_77412164_77413540:RSF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 17 14 31 7.89603624242799 7.49738191800048 0.398654324427515 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 77583376 G/A 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 A:G G A 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 77825320 T/C 1 12 10 22 5.57367264171388 5.35527279857177 0.218399843142107 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532306:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532440:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000524925:exon_77825312_77825422:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000529139:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525755:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000530454:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525870:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532050:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000527099:exon_77825312_77825438:ALG8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 78147712 C/T 1 43 33 76 19.9723269661414 17.6724002352868 2.29992673085455 T:C C T 10 0.535527279857177 0.646276786449506 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78147007_78147860:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529771:exon_78147235_78147860:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78147269_78147860:NARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 82535963 C/T 1 96 90 186 44.589381133711 48.1974551871459 -3.60807405343491 T:C C T 10 0.535527279857177 0.607473279590466 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82534544_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532767:exon_82535409_82542480:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82535410_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82535415_82536164:PRCP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 49 46 95 22.7591632869983 24.6342548734301 -1.87509158643181 T:C C T 10 0.535527279857177 0.757871426648579 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 17 19 36 7.89603624242799 10.1750183172864 -2.27898207485837 A:C A C 10 0.535527279857177 0.505320305259396 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 87908563 G/A 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 A:G G A 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000123892:ENST00000243662:exon_87908351_87908635:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000531138:exon_87908351_87908601:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000526372:exon_87908406_87908602:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000441495:exon_87908351_87908635:RAB38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 88045583 A/G 1 59 87 146 27.4038904884266 46.5908733475744 -19.1869828591478 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00156448481383867 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88045556_88045722:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000527018:exon_88045556_88045722:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533865:exon_88045556_88045722:CTSC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 26 31 57 12.0762907237134 16.6013456755725 -4.52505495185909 T:G G T 10 0.535527279857177 0.235168947555419 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 93212161 A/G 1 11 25 36 5.10919992157105 13.3881819964294 -8.27898207485837 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00688197734903385 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 93212254 C/T 1 15 31 46 6.96709080214235 16.6013456755725 -9.63425487343014 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00476710473985499 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 93517874 C/G 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 T:C:G C G 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 93517886 G/C 1 10 13 23 4.64472720142823 6.9618546381433 -2.31712743671507 C:G G C 10 0.535527279857177 0.404605690601376 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93517884_93517929:MED17 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 93529655 G/A 1 9 7 16 4.18025448128541 3.74869095900024 0.431563522285169 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000525026:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533367:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000531920:exon_93529576_93529706:MED17 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 15 23 38 6.96709080214235 12.3171274367151 -5.35003663457273 C:G C G 10 0.535527279857177 0.102998501200972 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 94861862 A/G 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 A:G A G 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000149218:ENST00000278505:exon_94861541_94865815:ENDOD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 95512060 A/G 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 A:G A G 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000077458:ENST00000358780:exon_95511986_95512121:FAM76B;ENSG00000077458:ENST00000398187:exon_95511986_95512121:FAM76B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 95555133 A/G 1 41 37 78 19.0433815258557 19.8145093547155 -0.771127828859804 A:C:G A G 10 0.535527279857177 0.909803009191954 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95555035_95555142:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95555035_95555142:CEP57 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 95712897 G/T 1 16 18 34 7.43156352228517 9.63949103742918 -2.20792751514402 T:G G T 10 0.535527279857177 0.493927679842333 ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95709762_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95711440_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95712112_95713127:MAML2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 95713024 G/A 1 8 8 16 3.71578176114258 4.28421823885742 -0.568436477714831 A:G G A 10 0.535527279857177 0.806722234902998 ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95709762_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95711440_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95712112_95713127:MAML2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 95825755 G/C 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 C:G G C 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95825056_95826681:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95825056_95826684:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95825056_95826681:MAML2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 69 55 124 32.0486176898548 29.4540003921447 2.59461729771006 A:G G A 10 0.535527279857177 0.653779315402514 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 104820433 T/G 1 91 59 150 42.2670175329969 31.5961095115734 10.6709080214235 T:G T G 10 0.535527279857177 0.085728234897156 ENSG00000196954:ENST00000444739:exon_104820270_104820504:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000393150:exon_104820270_104820504:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000529565:exon_104817810_104820504:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000355546:exon_104820270_104820504:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000421898:exon_104820270_104820504:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000533730:exon_104820270_104820504:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000529183:exon_104820270_104820504:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000524843:exon_104820129_104820504:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000531333:exon_104820388_104820504:CASP4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 22 22 44 10.2183998431421 11.7816001568579 -1.56320031371579 C:G G C 10 0.535527279857177 0.653133596031045 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 107299631 G/A 1 23 33 56 10.6828725632849 17.6724002352868 -6.98952767200191 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0806375960975451 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 107992325 T/A 1 23 16 39 10.6828725632849 8.56843647771483 2.1144360855701 A:T T A 10 0.535527279857177 0.524992506529540 ENSG00000075239:ENST00000265838:exon_107992243_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000524833:exon_107992294_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000299355:exon_107992294_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000531813:exon_107992311_107992405:ACAT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 107992346 G/C 1 26 23 49 12.0762907237134 12.3171274367151 -0.240836713001672 C:G G C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000075239:ENST00000265838:exon_107992243_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000524833:exon_107992294_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000299355:exon_107992294_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000531813:exon_107992311_107992405:ACAT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 108040484 G/T 1 12 4 16 5.57367264171388 2.14210911942871 3.43156352228517 T:G G T 10 0.535527279857177 0.130378196506160 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108040471_108040579:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108040471_108040579:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000530859:exon_108040471_108040579:NPAT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 111747297 A/G 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 A:G A G 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527377:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000528274:exon_111747205_111747363:AP001781.3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 45 46 91 20.901272406427 24.6342548734301 -3.7329824670031 A:C A C 10 0.535527279857177 0.462679829953607 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 111958677 A/G 1 8 13 21 3.71578176114258 6.9618546381433 -3.24607287700072 A:G A G 10 0.535527279857177 0.190471702102025 ENSG00000204370:ENST00000375549:exon_111958581_111958697:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000528182:exon_111958581_111958697:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000528048:exon_111958581_111958697:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000528021:exon_111958581_111958697:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000526592:exon_111958581_111958697:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000530923:exon_111958581_111958697:SDHD;ENSG00000255292:ENST00000531744:exon_111958581_111958697:AP002884.2;ENSG00000255292:ENST00000532699:exon_111958581_111958697:AP002884.2;ENSG00000255292:ENST00000525987:exon_111958581_111958697:AP002884.2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 17 13 30 7.89603624242799 6.9618546381433 0.934181604284691 T:C C T 10 0.535527279857177 0.855262631313688 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 117163765 C/A 1 20 12 32 9.28945440285646 6.42632735828612 2.86312704457034 A:C C A 10 0.535527279857177 0.37664187110767 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 117163824 C/G 1 18 5 23 8.36050896257082 2.67763639928588 5.68287256328493 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0203323535113728 ENSG00000186318:ENST00000313005:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000392937:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000528053:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510630:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000428381:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000513780:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000445823:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000292095:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530824:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530844:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510915:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000504995:exon_117163787_117163904:BACE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 117282800 G/T 1 24 19 43 11.1473452834278 10.1750183172864 0.972326966141392 T:G G T 10 0.535527279857177 0.878742494186702 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117282788_117283984:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117282788_117283984:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117282788_117283059:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117282788_117283982:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000528706:exon_117282788_117283055:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533433:exon_117282788_117283546:CEP164 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 118404804 G/A 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000149582:ENST00000411589:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000442938:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000359862:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526465:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000354284:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000532762:exon_118404744_118404835:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526973:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000354064:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000533627:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000533102:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000524522:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000313236:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000524725:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526853:exon_118404744_118404844:TMEM25 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 118769442 A/G 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:G A G 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118766849_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118768455_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000525300:exon_118768459_118769773:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118769124_118769771:BCL9L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 56 59 115 26.0104723279981 31.5961095115734 -5.58563718357535 T:C C T 10 0.535527279857177 0.305049087275898 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 118886656 G/A 1 11 6 17 5.10919992157105 3.21316367914306 1.89603624242799 A:G G A 10 0.535527279857177 0.467819685510286 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 26 32 58 12.0762907237134 17.1368729554297 -5.06058223171626 T:C C T 10 0.535527279857177 0.190325190080046 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 118922200 G/A 1 57 59 116 26.4749450481409 31.5961095115734 -5.12116446343253 A:G G A 10 0.535527279857177 0.353023238229207 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529114:exon_118922150_118922337:HYOU1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 118926028 C/G 1 45 50 95 20.901272406427 26.7763639928588 -5.87509158643181 C:G C G 10 0.535527279857177 0.257858898883964 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526571:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925897_118926130:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532421:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000533381:exon_118925735_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530467:exon_118925867_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000527038:exon_118925896_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529174:exon_118925914_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532752:exon_118926008_118926051:HYOU1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 118949331 C/T 1 19 20 39 8.82498168271364 10.7105455971435 -1.8855639144299 T:C C T 10 0.535527279857177 0.630776619558793 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 70 58 128 32.5130904099976 31.0605822317163 1.45250817828135 A:G A G 10 0.535527279857177 0.859433805084683 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 118955679 C/T 1 29 20 49 13.4697088841419 10.7105455971435 2.75916328699833 T:C C T 10 0.535527279857177 0.475620744012989 ENSG00000149397:ENST00000278715:exon_118955587_118955776:HMBS;ENSG00000149397:ENST00000442944:exon_118955624_118955776:HMBS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 37 46 83 17.1854906452845 24.6342548734301 -7.44876422814569 T:C T C 10 0.535527279857177 0.122905622551441 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 8 7 15 3.71578176114258 3.74869095900024 -0.0329091978576543 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 119205830 A/G 1 6 14 20 2.78683632085694 7.49738191800048 -4.71054559714354 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0428203253096220 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 121475922 T/A 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 A:T T A 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 2330 2674 5004 1082.22143793278 1431.99994633809 -349.778508405313 A:T:C:G A G 10 0.535527279857177 4.43463725902078e-23 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 1815 1893 3708 843.017987059224 1013.75314076964 -170.735153710412 T:C:G T G 10 0.535527279857177 2.12512535103925e-08 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 125351472 A/T 1 6 9 15 2.78683632085694 4.81974551871459 -2.03290919785765 A:T A T 10 0.535527279857177 0.312914646957404 ENSG00000149557:ENST00000527350:exon_125351430_125351493:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000278919:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000392709:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000533294:exon_125351430_125351652:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000532981:exon_125351430_125351529:FEZ1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 44 30 74 20.4367996862842 16.0658183957153 4.37098129056891 A:G A G 10 0.535527279857177 0.351541965645429 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 83 68 151 38.5512357718543 36.415855030288 2.13538074156627 A:G G A 10 0.535527279857177 0.744807527759766 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 74 47 121 34.3709812905689 25.1697821532873 9.20119913728159 C:G C G 10 0.535527279857177 0.101015025217253 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 126073308 G/A 1 34 19 53 15.792072484856 10.1750183172864 5.61705416756962 A:G G A 10 0.535527279857177 0.131274763870144 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126071993_126073552:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126072309_126073552:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126072677_126073552:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000530903:exon_126073217_126073552:RPUSD4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 126073511 C/T 1 18 23 41 8.36050896257082 12.3171274367151 -3.95661847414426 T:C C T 10 0.535527279857177 0.272904314717144 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126071993_126073552:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126072309_126073552:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126072677_126073552:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000530903:exon_126073217_126073552:RPUSD4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 126079508 T/G 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:G T G 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126079416_126079617:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126079416_126079617:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126079386_126079617:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000532674:exon_126079501_126079617:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000534393:exon_126079416_126079617:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000530036:exon_126079416_126079618:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000532800:exon_126078935_126079617:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000525812:exon_126079446_126079617:RPUSD4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 126139100 T/C 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 T:C T C 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000110074:ENST00000533839:exon_126138950_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000263578:exon_126139028_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000534011:exon_126139030_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000442061:exon_126139041_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000529802:exon_126139052_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000526525:exon_126139066_126139310:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525083:exon_126139066_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525770:exon_126139066_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000527004:exon_126139085_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000526366:exon_126139087_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000524751:exon_126139089_126139310:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000532101:exon_126139096_126139186:FOXRED1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 126147003 A/G 1 19 27 46 8.82498168271364 14.4592365561438 -5.63425487343014 A:G A G 10 0.535527279857177 0.104894511948491 ENSG00000110074:ENST00000263578:exon_126146966_126147070:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000534011:exon_126146966_126147070:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525083:exon_126146893_126147070:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525770:exon_126146966_126147070:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000527004:exon_126146966_126147070:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000532125:exon_126146966_126147070:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000534315:exon_126146966_126147070:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000530642:exon_126146966_126147070:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000532590:exon_126146807_126147070:FOXRED1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 126162893 G/A 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000438974:exon_126162372_126163012:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392678:exon_126162372_126163139:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126162372_126162950:TIRAP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 126176578 G/A 1 70 78 148 32.5130904099976 41.7711278288598 -9.25803741886219 A:G G A 10 0.535527279857177 0.138001627971673 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126176465_126176639:DCPS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 126278075 C/T 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 T:C C T 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000110080:ENST00000227495:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000531217:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000444328:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000356132:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000530591:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000534083:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000528605:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000528858:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000392669:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000526756:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000526727:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000449406:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000532243:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000534457:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000530531:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000524860:exon_126277994_126278089:ST3GAL4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 31 32 63 14.3986543244275 17.1368729554297 -2.73821863100215 T:C T C 10 0.535527279857177 0.52871305606863 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 128680466 C/G 1 18 27 45 8.36050896257082 14.4592365561438 -6.09872759357296 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0738179612017673 ENSG00000151702:ENST00000525560:exon_128680354_128681291:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000344954:exon_128680354_128683161:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000429175:exon_128680354_128682311:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000527786:exon_128680354_128681115:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000534087:exon_128680354_128681398:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000281428:exon_128680354_128683161:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000528790:exon_128680354_128682311:FLI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 134047243 T/C 1 23 11 34 10.6828725632849 5.89080007842895 4.79207248485598 T:C T C 10 0.535527279857177 0.121506106853054 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134047114_134047970:NCAPD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 11 134109924 T/C 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 T:C T C 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000151502:ENST00000281187:exon_134109885_134110049:VPS26B;ENSG00000151502:ENST00000525095:exon_134109833_134110049:VPS26B;ENSG00000151502:ENST00000527586:exon_134109885_134110049:VPS26B;ENSG00000151502:ENST00000530402:exon_134109885_134110049:VPS26B;ENSG00000151502:ENST00000525918:exon_134109545_134110049:VPS26B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 406292 G/A 1 17 20 37 7.89603624242799 10.7105455971435 -2.81450935471555 A:G G A 10 0.535527279857177 0.410874358951243 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 427575 A/G 1 13 11 24 6.0381453618567 5.89080007842895 0.147345283427753 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_427272_427627:KDM5A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 1702549 C/G 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000171823:ENST00000339235:exon_1702039_1703331:FBXL14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 74 37 111 34.3709812905689 19.8145093547155 14.5564719358534 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00567555894620907 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 2973495 A/G 1 31 24 55 14.3986543244275 12.8526547165722 1.54599960785527 A:G A G 10 0.535527279857177 0.68800846816394 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 2973615 T/C 1 15 8 23 6.96709080214235 4.28421823885742 2.68287256328493 T:C T C 10 0.535527279857177 0.300673562790689 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 2983636 A/G 1 13 11 24 6.0381453618567 5.89080007842895 0.147345283427753 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2983143_2983691:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2983143_2983691:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2983143_2983691:FOXM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 49 40 89 22.7591632869983 21.4210911942871 1.33807209271125 A:G G A 10 0.535527279857177 0.831980192094596 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 4388084 C/G 1 202 181 383 93.8234894688503 96.930437654149 -3.10694818529878 T:C:G C G 10 0.535527279857177 0.758770199714855 ENSG00000118971:ENST00000261254:exon_4387926_4388085:CCND2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 4614545 A/G 1 6 11 17 2.78683632085694 5.89080007842895 -3.10396375757201 A:G A G 10 0.535527279857177 0.149487157554358 ENSG00000047621:ENST00000261250:exon_4614472_4614546:C12orf4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 4662210 T/C 1 15 12 27 6.96709080214235 6.42632735828612 0.540763443856222 T:C T C 10 0.535527279857177 0.850128429900867 ENSG00000111247:ENST00000321524:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000352618:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000228843:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000442992:exon_4662149_4662313:RAD51AP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 4791451 C/T 1 113 92 205 52.485417376139 49.2685097468603 3.21690762927872 T:C C T 10 0.535527279857177 0.674799390638182 ENSG00000139180:ENST00000266544:exon_4791371_4791466:NDUFA9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 6495275 C/A 0 9 0 9 4.18025448128541 0 4.18025448128541 C C 10 0.535527279857177 0.00462881858371194 ENSG00000111321:ENST00000228918:exon_6495232_6495328:LTBR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 6500105 T/G 1 13 1 14 6.0381453618567 0.535527279857177 5.50261808199952 T:G T G 10 0.535527279857177 0.00246991750770215 ENSG00000111321:ENST00000228918:exon_6499826_6500733:LTBR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 6560573 G/T 1 279 254 533 129.587888919848 136.023929083723 -6.43604016387533 T:G G T 10 0.535527279857177 0.602342393065356 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6560434_6560884:CD27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 6562285 C/T 1 33 46 79 15.3275997647132 24.6342548734301 -9.30665510871698 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0418606038837753 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 6562293 C/T 1 28 40 68 13.005236163999 21.4210911942871 -8.41585503028803 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0509967375161706 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 23 24 47 10.6828725632849 12.8526547165722 -2.16978215328732 A:G A G 10 0.535527279857177 0.560532078191251 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 28 4 32 13.005236163999 2.14210911942871 10.8631270445703 A:G A G 10 0.535527279857177 6.08467093650961e-05 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 6562823 C/T 1 31 10 41 14.3986543244275 5.35527279857177 9.04338152585574 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00453952818267519 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 6562836 G/A 1 32 17 49 14.8631270445703 9.10396375757201 5.75916328699833 A:G G A 10 0.535527279857177 0.11514730140833 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 25 28 53 11.6118180035706 14.994763836001 -3.38294583243038 A:G A G 10 0.535527279857177 0.409038606214609 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 6575044 G/T 1 8 5 13 3.71578176114258 2.67763639928588 1.0381453618567 T:G G T 10 0.535527279857177 0.593586480755975 ENSG00000139190:ENST00000400911:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000355479:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396308:exon_6575008_6575166:VAMP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 6619284 C/G 1 10 13 23 4.64472720142823 6.9618546381433 -2.31712743671507 C:G C G 10 0.535527279857177 0.404605690601376 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6619241_6619299:NCAPD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 6635495 G/A 1 52 63 115 24.1525814474268 33.7382186310021 -9.58563718357535 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0761165331634835 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6635453_6635537:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6635453_6635537:NCAPD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 6787622 C/T 1 8 19 27 3.71578176114258 10.1750183172864 -6.45923655614378 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0188741511761996 ENSG00000126746:ENST00000319770:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000361959:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000396795:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000436774:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000396799:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000417772:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000396801:exon_6787293_6787626:ZNF384 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 6887020 T/C 1 40 42 82 18.5789088057129 22.4921457540014 -3.91323694828851 T:C T C 10 0.535527279857177 0.438573123367378 ENSG00000089692:ENST00000203629:exon_6886957_6887087:LAG3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 7047143 C/A 1 10 12 22 4.64472720142823 6.42632735828612 -1.78160015685789 A:C C A 10 0.535527279857177 0.523672568666477 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7047008_7047230:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7047008_7047230:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000229279:exon_7047008_7047230:ATN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 7053362 A/G 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 A:G A G 10 0.535527279857177 0.298960436382335 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 8074192 G/A 1 14 25 39 6.50261808199952 13.3881819964294 -6.8855639144299 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0356705394998284 ENSG00000059804:ENST00000075120:exon_8071826_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000486749:exon_8071827_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000469295:exon_8073667_8074227:SLC2A3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 9094548 A/G 1 18 8 26 8.36050896257082 4.28421823885742 4.0762907237134 A:G A G 10 0.535527279857177 0.119286633346569 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 9094993 C/T 1 2 9 11 0.928945440285646 4.81974551871459 -3.89080007842895 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0297906587989276 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 9833524 C/G 1 125 110 235 58.0590900178529 58.9080007842895 -0.848910766436582 C:G C G 10 0.535527279857177 0.947881079432871 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 9906067 T/C 1 92 84 176 42.7314902531397 44.9842915080029 -2.25280125486314 T:C T C 10 0.535527279857177 0.762658420271896 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 10999780 C/T 1 9 8 17 4.18025448128541 4.28421823885742 -0.103963757572008 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000111215:ENST00000228811:exon_10999644_10999966:PRR4;ENSG00000111215:ENST00000431566:exon_10999640_10999909:PRR4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 12814818 C/T 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 T:C C T 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000183150:ENST00000332427:exon_12813995_12815404:GPR19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 12871099 T/G 1 51 39 90 23.688108727284 20.8855639144299 2.80254481285407 T:G T G 10 0.535527279857177 0.597907407994128 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 12871129 T/C 1 37 41 78 17.1854906452845 21.9566184741443 -4.7711278288598 T:C T C 10 0.535527279857177 0.307453643033252 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 79 100 179 36.693344891283 53.5527279857177 -16.8593830944347 A:C:G G C 10 0.535527279857177 0.0132158360983205 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 26732987 G/A 1 9 4 13 4.18025448128541 2.14210911942871 2.0381453618567 A:G G A 10 0.535527279857177 0.282589464001187 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26732960_26733088:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26732960_26733088:ITPR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 26733062 T/C 1 9 4 13 4.18025448128541 2.14210911942871 2.0381453618567 T:C T C 10 0.535527279857177 0.282589464001187 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26732960_26733088:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26732960_26733088:ITPR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 27064232 C/T 1 76 82 158 35.2999267308546 43.9132369482885 -8.61331021743396 T:C C T 10 0.535527279857177 0.175706866923332 ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27064111_27064250:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27064111_27064250:C12orf11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 28603112 A/G 1 23 26 49 10.6828725632849 13.9237092762866 -3.24083671300167 A:G A G 10 0.535527279857177 0.391420756130833 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28603094_28603186:CCDC91 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 32134064 A/G 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:G A G 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 32134943 A/G 1 2 7 9 0.928945440285646 3.74869095900024 -2.81974551871459 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0914963800425486 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 32135938 A/G 1 5 14 19 2.32236360071412 7.49738191800048 -5.17501831728636 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0206458730982075 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 32137512 C/G 1 17 21 38 7.89603624242799 11.2460728770007 -3.35003663457272 C:G C G 10 0.535527279857177 0.32962722027678 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 32138410 A/G 1 33 35 68 15.3275997647132 18.7434547950012 -3.41585503028804 A:G A G 10 0.535527279857177 0.46602050355787 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 40742254 G/A 1 5 10 15 2.32236360071412 5.35527279857177 -3.03290919785765 A:G G A 10 0.535527279857177 0.128132638231981 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40742211_40742311:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40742211_40742311:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40742211_40742311:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40742211_40742311:LRRK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 40758652 T/C 1 10 14 24 4.64472720142823 7.49738191800048 -2.85265471657225 T:C T C 10 0.535527279857177 0.306793066047406 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40758644_40763087:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40758644_40758935:LRRK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 42481732 G/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000151233:ENST00000398675:exon_42475650_42481749:GXYLT1;ENSG00000151233:ENST00000280876:exon_42475650_42481749:GXYLT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 44180295 G/A 1 11 10 21 5.10919992157105 5.35527279857177 -0.246072877000716 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000198001:ENST00000448290:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000431837:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000440781:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000356669:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000446056:exon_44180202_44180360:IRAK4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 46321514 A/T 1 24 28 52 11.1473452834278 14.994763836001 -3.8474185525732 A:T A T 10 0.535527279857177 0.330808081937885 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 46322449 C/T 1 20 25 45 9.28945440285646 13.3881819964294 -4.09872759357296 T:C C T 10 0.535527279857177 0.234525337956417 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 48358057 C/T 1 39 40 79 18.1144360855701 21.4210911942871 -3.30665510871698 T:C C T 10 0.535527279857177 0.499088535449408 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48357992_48358206:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48357992_48358098:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48357992_48358206:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000449758:exon_48357992_48358206:TMEM106C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 8 7 15 3.71578176114258 3.74869095900024 -0.0329091978576543 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 48527186 C/T 1 14 11 25 6.50261808199952 5.89080007842895 0.611818003570576 T:C C T 10 0.535527279857177 0.84378896045112 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48527098_48527263:PFKM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 48539482 T/G 1 100 99 199 46.4472720142823 53.0172007058605 -6.56992869157821 T:C:G T G 10 0.535527279857177 0.356368473737793 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000312352:exon_48539347_48539488:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000443538:exon_48539347_48539887:PFKM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 15 18 33 6.96709080214235 9.63949103742918 -2.67240023528684 T:G G T 10 0.535527279857177 0.385781280718001 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 49333799 G/A 1 89 82 171 41.3380720927113 43.9132369482885 -2.57516485557726 A:G G A 10 0.535527279857177 0.702100905280627 ENSG00000134287:ENST00000256682:exon_49333780_49333890:ARF3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 49717533 A/C 1 134 93 227 62.2393444991383 49.8040370267175 12.4353074724208 A:C A C 10 0.535527279857177 0.110080924530281 ENSG00000135451:ENST00000257909:exon_49717387_49717535:TROAP;ENSG00000135451:ENST00000456139:exon_49717387_49717535:TROAP;ENSG00000135451:ENST00000380327:exon_49717387_49717535:TROAP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 50185679 C/T 1 10 6 16 4.64472720142823 3.21316367914306 1.43156352228517 T:C C T 10 0.535527279857177 0.618134679686612 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50184929_50185834:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50184929_50186371:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50184929_50185834:NCKAP5L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 50529736 G/A 1 15 10 25 6.96709080214235 5.35527279857177 1.61181800357058 A:G G A 10 0.535527279857177 0.55392591166511 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50529724_50529852:LASS5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 50537815 A/G 1 6 10 16 2.78683632085694 5.35527279857177 -2.56843647771483 A:G A G 10 0.535527279857177 0.218648734569296 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50537735_50537840:LASS5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 53433486 C/T 1 4 12 16 1.85789088057129 6.42632735828612 -4.56843647771483 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0247698374239015 ENSG00000063046:ENST00000420463:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000416762:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000430205:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000262056:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000438209:exon_53433414_53433486:EIF4B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 53670545 C/A 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53670404_53670643:ESPL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 53682326 G/A 1 15 15 30 6.96709080214235 8.03290919785765 -1.06581839571531 A:G G A 10 0.535527279857177 0.717832749087862 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 53682457 G/A 1 16 17 33 7.43156352228517 9.10396375757201 -1.67240023528684 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.603164691033159 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 54105837 C/T 1 28 28 56 13.005236163999 14.994763836001 -1.98952767200191 T:C C T 10 0.535527279857177 0.59543604715493 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54104902_54105905:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54104902_54105905:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54104902_54105905:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54104902_54105905:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54104902_54105905:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54104903_54105905:CALCOCO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 54767812 G/A 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000161642:ENST00000352268:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000338010:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000394313:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000413859:exon_54767757_54767919:ZNF385A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 54905815 C/G 1 24 19 43 11.1473452834278 10.1750183172864 0.972326966141392 C:G C G 10 0.535527279857177 0.878742494186702 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54905733_54905889:NCKAP1L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 55368245 G/A 1 6 12 18 2.78683632085694 6.42632735828612 -3.63949103742918 A:G G A 10 0.535527279857177 0.100224935165788 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55368184_55368342:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 55368368 G/A 1 15 14 29 6.96709080214235 7.49738191800048 -0.530291115858132 A:G G A 10 0.535527279857177 0.854578961351753 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 56117700 C/G 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000135437:ENST00000257895:exon_56117670_56117833:RDH5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 56398454 G/C 1 5 8 13 2.32236360071412 4.28421823885742 -1.9618546381433 C:G G C 10 0.535527279857177 0.405380944075703 ENSG00000139531:ENST00000266971:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394115:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000356124:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394109:exon_56397402_56399309:SUOX HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 56435929 C/G 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 C:G C G 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 56742997 T/C 1 27 36 63 12.5407634438562 19.2789820748584 -6.73821863100215 T:C T C 10 0.535527279857177 0.100539783358474 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56742947_56743045:STAT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 56822071 G/A 1 10 6 16 4.64472720142823 3.21316367914306 1.43156352228517 A:G G A 10 0.535527279857177 0.618134679686612 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822020_56822189:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822020_56822189:TIMELESS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 56862886 T/C 1 12 9 21 5.57367264171388 4.81974551871459 0.753927122999285 T:C T C 10 0.535527279857177 0.828752253980847 ENSG00000176422:ENST00000338146:exon_56862823_56864763:SPRYD4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 57869582 T/C 1 8 2 10 3.71578176114258 1.07105455971435 2.64472720142823 T:C T C 10 0.535527279857177 0.118249545982972 ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57869559_57869714:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57869559_57869714:ARHGAP9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 57 62 119 26.4749450481409 33.202691351145 -6.72774630300406 A:C A C 10 0.535527279857177 0.232554894245587 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 57911160 G/A 1 36 23 59 16.7210179251416 12.3171274367151 4.40389048842656 A:G G A 10 0.535527279857177 0.296585502645423 ENSG00000175197:ENST00000346473:exon_57911052_57911221:DDIT3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 58010163 A/G 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000240771:ENST00000333972:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000286494:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000471370:exon_58010067_58010278:ARHGEF25 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 336 335 671 156.062833967989 179.401638752154 -23.3388047841657 A:T:G A G 10 0.535527279857177 0.0749688383000763 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 58126234 C/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000135439:ENST00000257897:exon_58126186_58126295:AGAP2;ENSG00000135439:ENST00000328568:exon_58126186_58126295:AGAP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 31 34 65 14.3986543244275 18.207927515144 -3.8092731907165 A:G A G 10 0.535527279857177 0.38459781952499 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 58164904 T/C 1 24 24 48 11.1473452834278 12.8526547165722 -1.70530943314449 T:C T C 10 0.535527279857177 0.66554394655081 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58164877_58165040:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58164877_58165040:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58164877_58165040:METTL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 58176614 T/C 1 26 20 46 12.0762907237134 10.7105455971435 1.36574512656986 T:C T C 10 0.535527279857177 0.76816771206416 ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58176372_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58176559_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000417094:exon_58176564_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000434359:exon_58176586_58176660:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000457189:exon_58176601_58176690:TSFM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 38 34 72 17.6499633654273 18.207927515144 -0.557964149716742 A:G A G 10 0.535527279857177 0.906482162747075 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 68707287 G/A 1 7 7 14 3.25130904099976 3.74869095900024 -0.497381918000477 A:G G A 10 0.535527279857177 0.796028545675074 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68707223_68707332:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68707223_68707332:MDM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 68708761 C/T 1 3 14 17 1.39341816042847 7.49738191800048 -6.10396375757201 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00309616556511941 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68708728_68709045:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68708728_68709045:MDM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 68720627 G/A 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 A:G G A 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68720437_68720801:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68720437_68720801:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000430606:exon_68718787_68720801:MDM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 68724951 G/T 0 0 9 9 0 4.81974551871459 -4.81974551871459 T G T 10 0.535527279857177 0.00100610175162615 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68724887_68725001:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68724887_68725001:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000430606:exon_68724887_68725001:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000393543:exon_68724887_68725001:MDM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 69127245 C/T 1 38 34 72 17.6499633654273 18.207927515144 -0.557964149716742 T:C C T 10 0.535527279857177 0.906482162747075 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69127232_69127392:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69127232_69127392:NUP107 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 69233634 C/T 1 15 21 36 6.96709080214235 11.2460728770007 -4.27898207485837 T:C C T 10 0.535527279857177 0.181555592466634 ENSG00000135679:ENST00000462284:exon_69233054_69239214:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000356290:exon_69233384_69234214:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000311440:exon_69233403_69234214:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000258149:exon_69233406_69234214:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000350057:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393412:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393413:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000358483:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000258148:exon_69233054_69233647:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000311420:exon_69233054_69233647:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393417:exon_69233054_69233636:MDM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 69783937 T/C 1 59 63 122 27.4038904884266 33.7382186310021 -6.33432814257559 T:C T C 10 0.535527279857177 0.276171741420015 ENSG00000127337:ENST00000247843:exon_69783927_69784575:YEATS4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 69986788 A/G 1 117 131 248 54.3433082567103 70.1540736612902 -15.8107654045799 A:C:G A G 10 0.535527279857177 0.0482910811649268 ENSG00000166226:ENST00000299300:exon_69986756_69986883:CCT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 69995039 C/A 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 A:C C A 10 0.535527279857177 1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 72013832 A/G 1 11 9 20 5.10919992157105 4.81974551871459 0.289454402856461 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72013706_72013904:ZFC3H1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 72022708 T/C 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 A:T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72022698_72022817:ZFC3H1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 72179462 G/A 1 51 67 118 23.688108727284 35.8803277504309 -12.1922190231469 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0266198538360667 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72179311_72181150:RAB21 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 72307616 A/G 1 8 5 13 3.71578176114258 2.67763639928588 1.0381453618567 A:G A G 10 0.535527279857177 0.593586480755975 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 75902186 T/C 1 20 19 39 9.28945440285646 10.1750183172864 -0.885563914429902 T:C T C 10 0.535527279857177 0.872767655672926 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75902054_75902226:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75902054_75902226:KRR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 102 97 199 47.3762174545679 51.9461461461462 -4.56992869157821 C:G C G 10 0.535527279857177 0.523194519365391 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 92537846 A/G 1 375 365 740 174.177270053559 195.46745714787 -21.290187094311 A:T:G A G 10 0.535527279857177 0.121637091495452 ENSG00000133639:ENST00000256015:exon_92534074_92538223:BTG1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 93196422 T/G 1 23 10 33 10.6828725632849 5.35527279857177 5.32759976471316 T:G T G 10 0.535527279857177 0.0799007821616742 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93196180_93196510:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93196180_93196510:EEA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 94243853 C/T 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:C C T 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000169372:ENST00000332896:exon_94243746_94244527:CRADD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 94769769 G/A 1 10 4 14 4.64472720142823 2.14210911942871 2.50261808199952 A:G G A 10 0.535527279857177 0.283628757254846 ENSG00000173588:ENST00000339839:exon_94769662_94769793:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397809:exon_94769662_94769793:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397807:exon_94769662_94769793:CCDC41 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 95660182 A/G 1 16 15 31 7.43156352228517 8.03290919785765 -0.601345675572485 A:G A G 10 0.535527279857177 0.858656759427397 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95660133_95660408:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95660133_95660408:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397792:exon_95660133_95660408:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95660133_95660408:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95660133_95660408:VEZT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 95694111 T/G 1 81 53 134 37.6222903315687 28.3829458324304 9.23934449913828 T:G T G 10 0.535527279857177 0.119081881614729 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95693941_95696566:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95693941_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95692870_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95693941_95694944:VEZT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 98926985 C/G 1 10 11 21 4.64472720142823 5.89080007842895 -1.24607287700072 C:G C G 10 0.535527279857177 0.664214712035953 ENSG00000120802:ENST00000266732:exon_98926601_98928321:TMPO HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 98991790 T/C 1 438 443 881 203.439051422557 237.238584976729 -33.7995335541729 A:T:C T C 10 0.535527279857177 0.0235965291514351 ENSG00000075415:ENST00000401722:exon_98991634_98991813:SLC25A3;ENSG00000075415:ENST00000228318:exon_98991634_98991813:SLC25A3;ENSG00000075415:ENST00000188376:exon_98991634_98991813:SLC25A3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 99007623 C/T 1 34 79 113 15.792072484856 42.306655108717 -26.514582623861 T:C C T 10 0.535527279857177 6.07003109753067e-07 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 99020476 C/A 1 5 11 16 2.32236360071412 5.89080007842895 -3.56843647771483 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0832488497756866 ENSG00000166130:ENST00000299157:exon_99018036_99020544:IKBIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 100451442 T/A 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 A:T T A 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000111647:ENST00000279907:exon_100451349_100451524:UHRF1BP1L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 101776996 G/C 1 16 10 26 7.43156352228517 5.35527279857177 2.0762907237134 C:G G C 10 0.535527279857177 0.439359348031197 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101776819_101777091:UTP20 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 102117589 C/T 1 20 15 35 9.28945440285646 8.03290919785765 1.25654520499881 T:C C T 10 0.535527279857177 0.736332608702484 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102117500_102117625:CHPT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 102158763 T/C 1 4 8 12 1.85789088057129 4.28421823885742 -2.42632735828612 T:C T C 10 0.535527279857177 0.24635656157035 ENSG00000111670:ENST00000299314:exon_102157980_102159082:GNPTAB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 104481798 T/A 1 11 3 14 5.10919992157105 1.60658183957153 3.50261808199952 A:T T A 10 0.535527279857177 0.0660528570991714 ENSG00000111727:ENST00000229330:exon_104481764_104481816:HCFC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 104698582 A/G 1 7 7 14 3.25130904099976 3.74869095900024 -0.497381918000477 A:G A G 10 0.535527279857177 0.796028545675074 ENSG00000255150:ENST00000527879:exon_104697517_104698980:EID3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 108086628 G/C 1 40 37 77 18.5789088057129 19.8145093547155 -1.23560054900263 C:G G C 10 0.535527279857177 0.819681621653495 ENSG00000136045:ENST00000258531:exon_108086591_108086676:PWP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 108127965 A/G 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 A:G A G 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000110851:ENST00000228437:exon_108126644_108128299:PRDM4;ENSG00000110851:ENST00000446655:exon_108126644_108128299:PRDM4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 108918146 C/T 1 65 48 113 30.1907268092835 25.7053094331445 4.485417376139 T:C C T 10 0.535527279857177 0.450714814717348 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108918093_108918283:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108918093_108918283:SART3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 108923950 A/G 1 79 66 145 36.693344891283 35.3448004705737 1.34854442070934 A:G A G 10 0.535527279857177 0.867889659021876 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108923919_108924087:SART3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 108954823 C/T 1 16 19 35 7.43156352228517 10.1750183172864 -2.74345479500119 T:C C T 10 0.535527279857177 0.398572922840696 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 109182049 T/C 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 T:C T C 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000084112:ENST00000326495:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000360239:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000303438:exon_109180971_109183020:SSH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 99 81 180 45.9827992941395 43.3777096684313 2.60508962570815 A:T A T 10 0.535527279857177 0.709362836286939 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 22 10 32 10.2183998431421 5.35527279857177 4.86312704457034 T:G G T 10 0.535527279857177 0.109707291305461 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 21 10 31 9.75392712299928 5.35527279857177 4.39865432442751 T:C C T 10 0.535527279857177 0.148880735534832 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 110341933 A/G 1 10 10 20 4.64472720142823 5.35527279857177 -0.71054559714354 A:G A G 10 0.535527279857177 0.824432001736655 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110341742_110341952:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110341742_110341952:TCHP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 110352361 G/A 1 11 4 15 5.10919992157105 2.14210911942871 2.96709080214235 A:G G A 10 0.535527279857177 0.194136764216528 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110352247_110352432:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110352247_110352432:TCHP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 110922929 G/T 1 36 25 61 16.7210179251416 13.3881819964294 3.33283592871221 T:G G T 10 0.535527279857177 0.442029742684914 ENSG00000204856:ENST00000377673:exon_110922883_110923004:C12orf24 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 111160003 G/A 1 84 84 168 39.0157084919971 44.9842915080029 -5.96858301600572 A:G G A 10 0.535527279857177 0.394931427718235 ENSG00000186298:ENST00000335007:exon_111159940_111160074:PPP1CC;ENSG00000186298:ENST00000340766:exon_111159940_111160074:PPP1CC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 112191641 G/A 1 14 6 20 6.50261808199952 3.21316367914306 3.28945440285646 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.179412444802184 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000512792:exon_112191511_112191719:ACAD10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 112580071 C/T 1 21 15 36 9.75392712299928 8.03290919785765 1.72101792514163 T:C C T 10 0.535527279857177 0.61869297554355 ENSG00000135148:ENST00000257604:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000412615:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000432758:exon_112579893_112580099:TRAFD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 113348849 C/T 1 17 5 22 7.89603624242799 2.67763639928588 5.21839984314211 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0312345173583158 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 113357307 G/A 1 424 429 853 196.936433340557 229.741203058729 -32.804769718172 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0256267314287162 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113357292_113357711:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 113386779 C/G 1 14 12 26 6.50261808199952 6.42632735828612 0.0762907237133996 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113386666_113387010:OAS3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 113388598 G/A 1 15 18 33 6.96709080214235 9.63949103742918 -2.67240023528684 A:G G A 10 0.535527279857177 0.385781280718001 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113388498_113388780:OAS3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 113403684 C/T 1 18 10 28 8.36050896257082 5.35527279857177 3.00523616399905 T:C C T 10 0.535527279857177 0.343681705337631 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113403549_113403834:OAS3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 113445605 G/A 1 65 47 112 30.1907268092835 25.1697821532873 5.02094465599618 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.393987895903699 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113445510_113445748:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113445510_113445748:OAS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 113610324 G/A 1 79 92 171 36.693344891283 49.2685097468603 -12.5751648555773 A:G G A 10 0.535527279857177 0.05549939242494 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113610158_113610368:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113610158_113610368:DDX54 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 113629440 A/C 1 40 48 88 18.5789088057129 25.7053094331445 -7.12640062743157 A:C A C 10 0.535527279857177 0.135324673169792 ENSG00000139405:ENST00000266813:exon_113629115_113630166:C12orf52;ENSG00000139405:ENST00000436053:exon_113629115_113630119:C12orf52 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 113826442 C/G 1 25 15 40 11.6118180035706 8.03290919785765 3.57890880571292 C:G C G 10 0.535527279857177 0.27163363697965 ENSG00000151176:ENST00000280800:exon_113826264_113827201:PLBD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 113866981 C/T 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 T:C C T 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000139410:ENST00000345635:exon_113866965_113867104:SDSL;ENSG00000139410:ENST00000403593:exon_113866965_113867104:SDSL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 10 15 25 4.64472720142823 8.03290919785765 -3.38818199642942 T:C C T 10 0.535527279857177 0.228613574956332 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 114374887 T/C 1 16 20 36 7.43156352228517 10.7105455971435 -3.27898207485837 T:C T C 10 0.535527279857177 0.317134436472713 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114374812_114374941:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114374812_114374941:RBM19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 114377835 A/G 1 15 13 28 6.96709080214235 6.9618546381433 0.00523616399904459 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 114377877 T/C 1 17 8 25 7.89603624242799 4.28421823885742 3.61181800357058 T:C T C 10 0.535527279857177 0.164551323510006 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 114377885 G/C 1 12 20 32 5.57367264171388 10.7105455971435 -5.13687295542966 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0771656531600189 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 114383651 C/T 1 12 12 24 5.57367264171388 6.42632735828612 -0.852654716572246 T:C C T 10 0.535527279857177 0.838566839920317 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114383633_114383729:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114383633_114383729:RBM19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 114386639 A/G 1 18 17 35 8.36050896257082 9.10396375757201 -0.743454795001194 A:G A G 10 0.535527279857177 0.866114915546985 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114386638_114386841:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114386638_114386841:RBM19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 114395651 T/C 1 43 38 81 19.9723269661414 20.3500366345727 -0.377709668431333 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114395587_114395855:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114395587_114395855:RBM19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 117160976 T/C 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 T:C T C 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000111412:ENST00000261318:exon_117160872_117161028:C12orf49 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 117465857 T/C 1 4 8 12 1.85789088057129 4.28421823885742 -2.42632735828612 T:C T C 10 0.535527279857177 0.24635656157035 ENSG00000174989:ENST00000309909:exon_117465833_117468953:FBXW8;ENSG00000174989:ENST00000455858:exon_117465833_117468953:FBXW8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 120575840 C/T 1 35 25 60 16.2565452049988 13.3881819964294 2.86836320856938 T:C C T 10 0.535527279857177 0.518253465293186 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120575705_120575848:GCN1L1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 120591143 A/G 1 9 13 22 4.18025448128541 6.9618546381433 -2.78160015685789 A:G A G 10 0.535527279857177 0.286672118812446 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120591017_120591211:GCN1L1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 120636549 C/A 1 35 8 43 16.2565452049988 4.28421823885742 11.9723269661414 A:C C A 10 0.535527279857177 0.000184154599830538 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 121017136 T/C 1 111 89 200 51.5564719358534 47.6619279072887 3.89454402856461 T:C T C 10 0.535527279857177 0.619907773446915 ENSG00000167272:ENST00000357500:exon_121016849_121017215:POP5;ENSG00000167272:ENST00000341039:exon_121016849_121017215:POP5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 11 10 21 5.10919992157105 5.35527279857177 -0.246072877000716 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 39 29 68 18.1144360855701 15.5302911158581 2.58414496971197 A:G G A 10 0.535527279857177 0.545941796040739 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 21 43 64 9.75392712299928 23.0276730338586 -13.2737459108593 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00099987481145929 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 45 59 104 20.901272406427 31.5961095115734 -10.6948371051464 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0388460903917909 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 121442199 T/A 1 22 16 38 10.2183998431421 8.56843647771483 1.64996336542728 A:T T A 10 0.535527279857177 0.628846587952398 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 48 32 80 22.2946905668555 17.1368729554297 5.15781761142584 A:G G A 10 0.535527279857177 0.263790580050341 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 105 95 200 48.7696356149964 50.8750915864318 -2.1054559714354 T:C C T 10 0.535527279857177 0.777111843132829 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 125 141 266 58.0590900178529 75.5093464598619 -17.4502564420091 T:C T C 10 0.535527279857177 0.036427221149003 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 123333065 C/T 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 T:C C T 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000130787:ENST00000452196:exon_123333013_123333155:HIP1R;ENSG00000130787:ENST00000253083:exon_123333013_123333155:HIP1R HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 123345736 C/G 1 18 17 35 8.36050896257082 9.10396375757201 -0.743454795001194 C:G C G 10 0.535527279857177 0.866114915546985 ENSG00000130787:ENST00000253083:exon_123345678_123345739:HIP1R HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 123661295 T/C 1 8 2 10 3.71578176114258 1.07105455971435 2.64472720142823 T:C T C 10 0.535527279857177 0.118249545982972 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123661235_123661336:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123661235_123661336:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000392425:exon_123661235_123661336:MPHOSPH9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 124104049 A/G 1 43 41 84 19.9723269661414 21.9566184741443 -1.98429150800287 A:G A G 10 0.535527279857177 0.66372001231552 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124103979_124104271:DDX55 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 124104686 G/A 1 63 57 120 29.2617813689979 30.5250549518591 -1.26327358286123 A:G G A 10 0.535527279857177 0.854961653924908 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 124144395 A/G 1 19 13 32 8.82498168271364 6.9618546381433 1.86312704457034 A:G A G 10 0.535527279857177 0.596317945495181 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 124229429 T/C 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 T:C T C 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124229429_124229519:ATP6V0A2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 124821666 G/A 1 35 37 72 16.2565452049988 19.8145093547155 -3.55796414971674 A:G G A 10 0.535527279857177 0.410611587655774 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000440187:exon_124821650_124821726:NCOR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 124856618 A/G 1 17 17 34 7.89603624242799 9.10396375757201 -1.20792751514402 A:G A G 10 0.535527279857177 0.732510166657819 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 124856660 T/A 1 14 9 23 6.50261808199952 4.81974551871459 1.68287256328493 A:T T A 10 0.535527279857177 0.535797684122808 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 124886979 C/T 1 1 7 8 0.464472720142823 3.74869095900024 -3.28421823885742 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0289107709309061 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124886950_124887107:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124886950_124887107:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124886950_124887107:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124886950_124887107:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124886950_124887107:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124886950_124887107:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124886950_124887107:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124886950_124887107:NCOR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 124886983 G/A 1 7 1 8 3.25130904099976 0.535527279857177 2.71578176114258 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0758484261005442 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124886950_124887107:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124886950_124887107:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124886950_124887107:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124886950_124887107:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124886950_124887107:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124886950_124887107:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124886950_124887107:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124886950_124887107:NCOR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 125263039 C/T 1 42 59 101 19.5078542459986 31.5961095115734 -12.0882552655749 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0166575392993905 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125262186_125263132:SCARB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 125434580 C/T 1 21 29 50 9.75392712299928 15.5302911158581 -5.77636399285885 T:C C T 10 0.535527279857177 0.118663523887446 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434532_125434605:DHX37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 125437019 T/C 1 24 18 42 11.1473452834278 9.63949103742918 1.50785424599857 T:C T C 10 0.535527279857177 0.757462696473107 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125436944_125437116:DHX37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 125437108 C/T 1 28 35 63 13.005236163999 18.7434547950012 -5.73821863100215 T:C C T 10 0.535527279857177 0.165024127742005 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125436944_125437116:DHX37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 125438516 T/C 1 14 13 27 6.50261808199952 6.9618546381433 -0.459236556143778 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 125438523 C/T 1 11 11 22 5.10919992157105 5.89080007842895 -0.781600156857893 T:C C T 10 0.535527279857177 0.831868960719931 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 125441359 T/C 1 30 17 47 13.9341816042847 9.10396375757201 4.83021784671268 T:C T C 10 0.535527279857177 0.188206406050433 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 125448960 C/T 1 10 9 19 4.64472720142823 4.81974551871459 -0.175018317286362 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 125457141 C/T 1 2 8 10 0.928945440285646 4.28421823885742 -3.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0525767166149741 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125457049_125457145:DHX37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 49 46 95 22.7591632869983 24.6342548734301 -1.87509158643181 A:G A G 10 0.535527279857177 0.757871426648579 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 129299385 G/A 1 23 22 45 10.6828725632849 11.7816001568579 -1.09872759357296 A:G G A 10 0.535527279857177 0.76675033434233 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129299320_129299615:SLC15A4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 129299446 A/G 1 22 14 36 10.2183998431421 7.49738191800048 2.72101792514163 A:G A G 10 0.535527279857177 0.406259189848113 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129299320_129299615:SLC15A4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 132237750 C/T 1 27 28 55 12.5407634438562 14.994763836001 -2.45400039214473 T:C C T 10 0.535527279857177 0.589101266577396 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132237668_132237908:SFSWAP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 132250712 G/C 1 66 67 133 30.6551995294263 35.8803277504309 -5.22512822100454 A:C:G G C 10 0.535527279857177 0.385189384446600 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132250663_132250853:SFSWAP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 132284043 A/G 1 59 44 103 27.4038904884266 23.5632003137158 3.84069017471077 A:G A G 10 0.535527279857177 0.489748475754694 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132283968_132284282:SFSWAP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 132528724 C/T 1 12 12 24 5.57367264171388 6.42632735828612 -0.852654716572246 T:C C T 10 0.535527279857177 0.838566839920317 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132528722_132528856:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132528722_132528856:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132528722_132528856:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132528722_132528856:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132528722_132528856:EP400 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 132625027 G/A 1 29 25 54 13.4697088841419 13.3881819964294 0.0815268877124442 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132624968_132625084:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132624968_132625084:DDX51 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 132625960 G/A 1 15 19 34 6.96709080214235 10.1750183172864 -3.20792751514402 A:G G A 10 0.535527279857177 0.304248882363643 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132625820_132625965:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132625820_132625965:DDX51 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 20 22 42 9.28945440285646 11.7816001568579 -2.49214575400143 A:G G A 10 0.535527279857177 0.444575577074634 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 17 12 29 7.89603624242799 6.42632735828612 1.46970888414187 T:C T C 10 0.535527279857177 0.710434552275237 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 133357412 T/C 1 5 10 15 2.32236360071412 5.35527279857177 -3.03290919785765 T:C T C 10 0.535527279857177 0.128132638231981 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133357384_133357500:GOLGA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 133363006 G/A 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 A:G G A 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133362925_133363141:GOLGA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 133393296 G/T 1 13 13 26 6.0381453618567 6.9618546381433 -0.923709276286601 T:G G T 10 0.535527279857177 0.844640207112493 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133393246_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133393126_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133393126_133393398:GOLGA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 133423662 C/T 1 8 7 15 3.71578176114258 3.74869095900024 -0.0329091978576543 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133423629_133423716:CHFR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 12 133778796 C/T 1 13 5 18 6.0381453618567 2.67763639928588 3.36050896257081 T:C C T 10 0.535527279857177 0.155412508782781 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133778730_133778955:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133778730_133781730:ZNF268 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 19271676 A/T 0 102 0 102 47.3762174545679 0 47.3762174545679 A A 10 0.535527279857177 2.45573823475703e-28 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 20224387 A/G 1 75 81 156 34.8354540107117 43.3777096684313 -8.54225565771961 A:G A G 10 0.535527279857177 0.173287133729972 ENSG00000196199:ENST00000361479:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000414242:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000360754:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 20356941 T/A 1 60 58 118 27.8683632085694 31.0605822317163 -3.19221902314688 A:T T A 10 0.535527279857177 0.580425220753146 ENSG00000121390:ENST00000471658:exon_20356526_20357057:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000492741:exon_20356526_20357082:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000338910:exon_20356526_20357057:PSPC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 20413021 T/C 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 T:C T C 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20412840_20413125:ZMYM5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 20425911 C/A 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20425495_20425936:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 20425948 T/C 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 24411772 T/C 1 11 11 22 5.10919992157105 5.89080007842895 -0.781600156857893 T:C T C 10 0.535527279857177 0.831868960719931 ENSG00000027001:ENST00000382172:exon_24411691_24411895:MIPEP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 25875910 A/C 1 2 8 10 0.928945440285646 4.28421823885742 -3.35527279857177 A:C A C 10 0.535527279857177 0.0525767166149741 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25875662_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000481980:exon_25875694_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000490231:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000480187:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000460326:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000465068:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25875771_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000495460:exon_25875783_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25875785_25876018:NUPL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 27669844 C/T 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:C C T 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000152484:ENST00000282344:exon_27669738_27669967:USP12;ENSG00000152484:ENST00000258451:exon_27669738_27669967:USP12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 28197246 A/G 1 333 336 669 154.66941580756 179.937166032011 -25.2677502244514 A:G A G 10 0.535527279857177 0.052581145675705 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 46705068 C/A 1 560 416 976 260.104723279981 222.779348420586 37.3253748593953 A:T:C C A 10 0.535527279857177 0.0175235690156150 ENSG00000136167:ENST00000323076:exon_46704949_46705073:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000435666:exon_46704949_46705073:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000398576:exon_46704949_46705073:LCP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 12 12 24 5.57367264171388 6.42632735828612 -0.852654716572246 T:C C T 10 0.535527279857177 0.838566839920317 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 48547467 A/T 1 18 15 33 8.36050896257082 8.03290919785765 0.327599764713161 A:T A T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378645:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378642:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000331052:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000434484:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000433022:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000497202:exon_48547399_48547527:SUCLA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 50050620 A/G 1 12 7 19 5.57367264171388 3.74869095900024 1.82498168271364 A:G A G 10 0.535527279857177 0.493201262474126 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50050612_50051175:SETDB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 50057633 A/G 1 17 12 29 7.89603624242799 6.42632735828612 1.46970888414187 A:G A G 10 0.535527279857177 0.710434552275237 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50057600_50057699:SETDB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 356 271 627 165.352288370845 145.127892841295 20.22439552955 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.10928210253729 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 50108252 T/C 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 T:C T C 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50106082_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50106090_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000471984:exon_50108054_50108398:RCBTB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 20 8 28 9.28945440285646 4.28421823885742 5.00523616399904 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0605447664268705 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 53216666 G/A 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 A:G G A 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000139675:ENST00000398039:exon_53216541_53217919:HNRNPA1L2;ENSG00000139675:ENST00000342657:exon_53216541_53217919:HNRNPA1L2;ENSG00000139675:ENST00000357495:exon_53216568_53217915:HNRNPA1L2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 73293132 T/A 1 12 19 31 5.57367264171388 10.1750183172864 -4.60134567557249 A:T T A 10 0.535527279857177 0.107104383392774 ENSG00000204899:ENST00000377818:exon_73293090_73293235:MZT1;ENSG00000204899:ENST00000427549:exon_73293090_73293235:MZT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 74339104 G/T 1 1 8 9 0.464472720142823 4.28421823885742 -3.81974551871459 T:G G T 10 0.535527279857177 0.0150689460626302 ENSG00000118922:ENST00000377669:exon_74339075_74339137:KLF12;ENSG00000118922:ENST00000377666:exon_74339075_74339137:KLF12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 76423248 T/C 1 9 5 14 4.18025448128541 2.67763639928588 1.50261808199952 T:C T C 10 0.535527279857177 0.593847726273405 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76423112_76423428:LMO7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 79940811 T/C 1 5 9 14 2.32236360071412 4.81974551871459 -2.49738191800048 T:C T C 10 0.535527279857177 0.193244891590877 ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000461008:exon_79940768_79940845:RBM26 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 80095030 C/T 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C C T 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000102471:ENST00000218652:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000377116:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000415404:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000487865:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000465762:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000494647:exon_80094945_80095113:NDFIP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 96638636 A/C 1 5 8 13 2.32236360071412 4.28421823885742 -1.9618546381433 A:C A C 10 0.535527279857177 0.405380944075703 ENSG00000102595:ENST00000376747:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376722:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000465196:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376714:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000461329:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000467305:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000397618:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376712:exon_96638587_96638686:UGGT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 99449468 G/A 1 2 7 9 0.928945440285646 3.74869095900024 -2.81974551871459 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0914963800425486 ENSG00000088387:ENST00000376460:exon_99449369_99449507:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000400228:exon_99449369_99449507:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000376455:exon_99449364_99449507:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000357329:exon_99449364_99449507:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000428223:exon_99449364_99449507:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000400220:exon_99449364_99449507:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000400235:exon_99449369_99449507:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000339416:exon_99449369_99449507:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000448493:exon_99449364_99449507:DOCK9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 99907240 C/G 1 9 6 15 4.18025448128541 3.21316367914306 0.967090802142346 C:G C G 10 0.535527279857177 0.796987479524744 ENSG00000125245:ENST00000397470:exon_99906968_99908160:GPR18;ENSG00000125245:ENST00000397473:exon_99906968_99908160:GPR18;ENSG00000125245:ENST00000340807:exon_99906986_99908160:GPR18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 99948097 A/G 1 48 52 100 22.2946905668555 27.8474185525732 -5.55272798571769 A:G A G 10 0.535527279857177 0.271772037197898 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 99948178 C/A 1 62 102 164 28.797308648855 54.6237825454321 -25.826473896577 A:C C A 10 0.535527279857177 5.85704102961791e-05 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 103275386 T/C 1 14 12 26 6.50261808199952 6.42632735828612 0.0762907237133996 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103275227_103275390:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103275227_103275390:TPP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 103328660 A/G 1 107 86 193 49.6985810552821 46.0553460677172 3.64323498756485 A:G A G 10 0.535527279857177 0.614125137607431 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000466153:exon_103328646_103328765:TPP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 10 6 16 4.64472720142823 3.21316367914306 1.43156352228517 T:C T C 10 0.535527279857177 0.618134679686612 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 103506686 C/G 1 7 6 13 3.25130904099976 3.21316367914306 0.0381453618566998 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103506638_103506724:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103506638_103506724:ERCC5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 103513951 A/G 1 16 23 39 7.43156352228517 12.3171274367151 -4.8855639144299 A:G A G 10 0.535527279857177 0.147779940421866 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103513857_103514064:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103513857_103514064:ERCC5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 123 112 235 57.1301445775672 59.9790553440038 -2.84891076643658 C:G G C 10 0.535527279857177 0.743780847757337 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 111176519 G/T 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 T:G G T 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 40 30 70 18.5789088057129 16.0658183957153 2.51309040999761 A:G G A 10 0.535527279857177 0.632039670977607 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 36 42 78 16.7210179251416 22.4921457540014 -5.7711278288598 A:G A G 10 0.535527279857177 0.212036849396732 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 17 21 38 7.89603624242799 11.2460728770007 -3.35003663457272 T:C T C 10 0.535527279857177 0.32962722027678 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 111870037 T/C 1 9 8 17 4.18025448128541 4.28421823885742 -0.103963757572008 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000449979:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000491775:exon_111870026_111870147:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000469877:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000466143:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000467053:exon_111870026_111870212:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426768:exon_111870026_111870232:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111870026_111870227:ARHGEF7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 24 20 44 11.1473452834278 10.7105455971435 0.436799686284214 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 113909339 A/G 1 27 38 65 12.5407634438562 20.3500366345727 -7.8092731907165 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0616148870590435 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 114152755 C/T 1 8 14 22 3.71578176114258 7.49738191800048 -3.78160015685789 T:C C T 10 0.535527279857177 0.134327485283499 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000473287:exon_114152657_114152960:TMCO3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 114154419 G/A 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 A:G G A 10 0.535527279857177 0.782354473542065 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000462877:exon_114154336_114154464:TMCO3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 114175004 C/T 1 9 6 15 4.18025448128541 3.21316367914306 0.967090802142346 T:C C T 10 0.535527279857177 0.796987479524744 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 114748709 G/A 1 17 15 32 7.89603624242799 8.03290919785765 -0.136872955429662 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114747194_114748833:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114747201_114748833:RASA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 114780764 A/G 1 8 2 10 3.71578176114258 1.07105455971435 2.64472720142823 A:G A G 10 0.535527279857177 0.118249545982972 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114780685_114780808:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114780685_114780808:RASA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 115002305 G/A 1 19 13 32 8.82498168271364 6.9618546381433 1.86312704457034 A:G G A 10 0.535527279857177 0.596317945495181 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115002277_115002371:CDC16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 115004914 C/T 1 23 25 48 10.6828725632849 13.3881819964294 -2.70530943314449 T:C C T 10 0.535527279857177 0.471029113474826 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 115004935 T/C 1 41 37 78 19.0433815258557 19.8145093547155 -0.771127828859804 T:C T C 10 0.535527279857177 0.909803009191954 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 115030714 T/C 1 85 110 195 39.48018121214 58.9080007842895 -19.4278195721495 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00623140804139695 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000461716:exon_115030368_115030715:CDC16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 115064423 G/A 1 21 14 35 9.75392712299928 7.49738191800048 2.25654520499881 A:G G A 10 0.535527279857177 0.500276662521839 ENSG00000169062:ENST00000375299:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000351487:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000474056:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000493727:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000475218:exon_115064315_115064475:UPF3A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 115090019 G/A 1 20 24 44 9.28945440285646 12.8526547165722 -3.56320031371579 A:G G A 10 0.535527279857177 0.293725279448287 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 115090193 G/A 1 24 26 50 11.1473452834278 13.9237092762866 -2.77636399285885 A:G G A 10 0.535527279857177 0.479414132257426 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 13 115091399 T/C 1 32 24 56 14.8631270445703 12.8526547165722 2.01047232799809 T:C T C 10 0.535527279857177 0.688129180246803 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 20757728 G/A 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 A:G G A 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20757290_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20757304_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20757688_20757905:TTC5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 20770036 T/C 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:C T C 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20769992_20770124:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20769992_20770124:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20769992_20770124:TTC5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 20823095 G/A 1 60 58 118 27.8683632085694 31.0605822317163 -3.19221902314688 A:G G A 10 0.535527279857177 0.580425220753146 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527384:exon_20822801_20823106:PARP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 25 31 56 11.6118180035706 16.6013456755725 -4.98952767200191 A:C A C 10 0.535527279857177 0.183671397593123 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 28 31 59 13.005236163999 16.6013456755725 -3.59610951157344 C:G G C 10 0.535527279857177 0.363344888929878 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 20841707 C/T 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:C C T 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20841666_20841742:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20841666_20841742:TEP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 21250124 G/A 1 28 49 77 13.005236163999 26.2408367130017 -13.2356005490026 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0028106938715873 ENSG00000169413:ENST00000304677:exon_21249854_21250626:RNASE6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 21928338 C/T 1 21 12 33 9.75392712299928 6.42632735828612 3.32759976471316 T:C C T 10 0.535527279857177 0.296068803828881 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 21928383 T/C 1 14 2 16 6.50261808199952 1.07105455971435 5.43156352228517 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00967875735976586 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 21928397 A/G 0 10 0 10 4.64472720142823 0 4.64472720142823 A A 10 0.535527279857177 0.00240737050809797 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 21928398 T/C 0 10 0 10 4.64472720142823 0 4.64472720142823 T T 10 0.535527279857177 0.00240737050809797 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 21967438 G/A 1 43 48 91 19.9723269661414 25.7053094331445 -5.7329824670031 A:G G A 10 0.535527279857177 0.248152812227444 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 263 232 495 122.156325397562 124.242328926865 -2.0860035293026 T:C T C 10 0.535527279857177 0.857067369598475 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23020919 C/T 1 250 97 347 116.118180035706 51.9461461461462 64.1720338895596 T:C C T 10 0.535527279857177 2.17550935178823e-12 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23020921 G/C 1 302 133 435 140.270761483133 71.2251282210045 69.045633262128 C:G G C 10 0.535527279857177 1.6591317443039e-11 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23020970 G/T 1 344 187 531 159.778615729131 100.143601333292 59.635014395839 T:G G T 10 0.535527279857177 2.00823866981178e-07 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23044002 G/T 1 541 521 1062 251.279741597267 279.009712805589 -27.7299712083219 A:T:G G T 10 0.535527279857177 0.090642667986658 ENSG00000129562:ENST00000250498:exon_23043959_23044133:DAD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23235697 C/T 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:C C T 10 0.535527279857177 0.732042892054444 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23240328 T/A 1 655 720 1375 304.229631693549 385.579641497167 -81.3500098036183 A:T T A 10 0.535527279857177 1.16517486828782e-05 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23282110 A/G 1 11 15 26 5.10919992157105 8.03290919785765 -2.9237092762866 A:G A G 10 0.535527279857177 0.325768302416207 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23282109_23282416:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23282449 C/T 1 4 8 12 1.85789088057129 4.28421823885742 -2.42632735828612 T:C C T 10 0.535527279857177 0.24635656157035 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000488800:exon_23282184_23282649:SLC7A7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23299135 G/T 1 166 132 298 77.1024715437086 70.6896009411474 6.41287060256126 T:G G T 10 0.535527279857177 0.485964482476935 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23299286 T/C 1 222 179 401 103.112943871707 95.8593830944347 7.25356077727204 T:C T C 10 0.535527279857177 0.4835782063649 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299262_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299262_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000461594:exon_23299138_23299319:MRPL52 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23302585 T/A 1 5 12 17 2.32236360071412 6.42632735828612 -4.10396375757201 A:T T A 10 0.535527279857177 0.0531197569251145 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 54 47 101 25.0815268877124 25.1697821532873 -0.0882552655748761 C:G G C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23374435 G/A 1 16 25 41 7.43156352228517 13.3881819964294 -5.95661847414426 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0837752437709186 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374303_23374455:RBM23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23374862 C/T 1 22 14 36 10.2183998431421 7.49738191800048 2.72101792514163 T:C C T 10 0.535527279857177 0.406259189848113 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374815_23374868:RBM23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23549380 G/A 1 39 27 66 18.1144360855701 14.4592365561438 3.65519952942632 A:G G A 10 0.535527279857177 0.389822036450335 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23777081 G/A 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 A:G G A 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000129473:ENST00000250405:exon_23776969_23777408:BCL2L2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 23777099 G/A 1 7 1 8 3.25130904099976 0.535527279857177 2.71578176114258 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0758484261005442 ENSG00000129473:ENST00000250405:exon_23776969_23777408:BCL2L2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24029231 C/T 1 155 158 313 71.9932716221376 84.613310217434 -12.6200385952964 T:C C T 10 0.535527279857177 0.156828117020334 ENSG00000213983:ENST00000308724:exon_24029147_24029245:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000397120:exon_24029147_24029245:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000460049:exon_24029147_24029245:AP1G2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24032546 G/A 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 A:G G A 10 0.535527279857177 0.764423141195016 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24033027 G/A 1 52 55 107 24.1525814474268 29.4540003921447 -5.30141894471793 A:G G A 10 0.535527279857177 0.332745279713069 ENSG00000213983:ENST00000308724:exon_24032925_24033065:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000397120:exon_24032925_24033065:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000460049:exon_24032925_24033065:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000465445:exon_24032925_24033430:AP1G2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 25 21 46 11.6118180035706 11.2460728770007 0.365745126569861 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 11 10 21 5.10919992157105 5.35527279857177 -0.246072877000716 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 1053 1118 2171 489.089774310393 598.719498880324 -109.629724569931 A:T:C:G T C 10 0.535527279857177 2.67465177205762e-06 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 186 154 340 86.3919259465651 82.4712010980053 3.92072484855983 T:C C T 10 0.535527279857177 0.703586703700391 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24706420 G/A 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 A:G G A 10 0.535527279857177 0.760056166562883 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24709351 C/T 1 134 125 259 62.2393444991383 66.9409099821471 -4.70156548300884 T:C C T 10 0.535527279857177 0.575328948601873 ENSG00000092330:ENST00000267415:exon_24709270_24709361:TINF2;ENSG00000092330:ENST00000399423:exon_24708853_24710081:TINF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24709976 C/T 1 105 89 194 48.7696356149964 47.6619279072887 1.10770770770767 T:C C T 10 0.535527279857177 0.885797204657893 ENSG00000092330:ENST00000267415:exon_24709625_24710081:TINF2;ENSG00000092330:ENST00000399423:exon_24708853_24710081:TINF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24718515 G/A 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 A:G G A 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000092295:ENST00000206765:exon_24718322_24718747:TGM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24735688 C/T 1 66 63 129 30.6551995294263 33.7382186310021 -3.08301910157583 T:C C T 10 0.535527279857177 0.597393382549828 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735636_24735723:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735636_24735723:RABGGTA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 90 57 147 41.8025448128541 30.5250549518591 11.277489860995 A:G G A 10 0.535527279857177 0.068705160002382 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 62 37 99 28.797308648855 19.8145093547155 8.98279929413948 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0862115567497394 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24770039 A/T 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 A:T A T 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24769614_24770063:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24769614_24770063:C14orf21 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24774338 G/A 1 9 6 15 4.18025448128541 3.21316367914306 0.967090802142346 A:G G A 10 0.535527279857177 0.796987479524744 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24774144_24778330:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24774144_24774422:C14orf21 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24839083 G/C 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 C:G G C 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000100968:ENST00000440487:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000424781:exon_24838705_24839800:NFATC4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24845841 T/C 1 11 9 20 5.10919992157105 4.81974551871459 0.289454402856461 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 A:C A C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24906515 C/T 1 14 18 32 6.50261808199952 9.63949103742918 -3.13687295542966 T:C C T 10 0.535527279857177 0.290964786174482 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24906534 G/A 1 13 20 33 6.0381453618567 10.7105455971435 -4.67240023528684 A:G G A 10 0.535527279857177 0.117195366512713 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24909281 C/T 1 101 91 192 46.9117447344251 48.7329824670031 -1.82123773257798 T:C C T 10 0.535527279857177 0.828270930382894 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24909362 T/C 1 116 107 223 53.8788355365675 57.3014189447179 -3.42258340815047 T:C T C 10 0.535527279857177 0.687185874446025 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24909475 C/G 1 76 79 155 35.2999267308546 42.306655108717 -7.00672837786243 C:G C G 10 0.535527279857177 0.260896889736423 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24909731 C/T 1 60 33 93 27.8683632085694 17.6724002352868 10.1959629732825 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0373690197727938 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24910846 C/T 1 26 4 30 12.0762907237134 2.14210911942871 9.93418160428469 T:C C T 10 0.535527279857177 0.000170438016432294 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24910876 G/A 0 15 0 15 6.96709080214235 0 6.96709080214235 G G 10 0.535527279857177 9.5554246844474e-05 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24910973 T/G 1 58 34 92 26.9394177682837 18.207927515144 8.73149025313972 T:G T G 10 0.535527279857177 0.0754658978267559 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 24910974 T/A 1 57 32 89 26.4749450481409 17.1368729554297 9.33807209271125 A:T T A 10 0.535527279857177 0.055280687098747 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 36784095 C/T 1 20 30 50 9.28945440285646 16.0658183957153 -6.77636399285885 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0647795188919996 ENSG00000151332:ENST00000416007:exon_36783897_36784121:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000359527:exon_36783897_36784121:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000318473:exon_36783897_36784121:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000396329:exon_36783897_36784121:MBIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 36789775 A/T 1 12 5 17 5.57367264171388 2.67763639928588 2.89603624242799 A:T A T 10 0.535527279857177 0.223914163527513 ENSG00000151332:ENST00000416007:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000359527:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000318473:exon_36789666_36789845:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000396329:exon_36789666_36789882:MBIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 36789795 G/A 0 8 0 8 3.71578176114258 0 3.71578176114258 G G 10 0.535527279857177 0.00893088209752 ENSG00000151332:ENST00000416007:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000359527:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000318473:exon_36789666_36789845:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000396329:exon_36789666_36789882:MBIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 50065717 G/C 1 15 21 36 6.96709080214235 11.2460728770007 -4.27898207485837 C:G G C 10 0.535527279857177 0.181555592466634 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 50081221 A/C 1 57 53 110 26.4749450481409 28.3829458324304 -1.90800078428947 A:T:C A C 10 0.535527279857177 0.774457852491263 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50080974_50081389:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50080974_50081390:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50080974_50081390:PPIL5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 50092471 T/C 1 7 16 23 3.25130904099976 8.56843647771483 -5.31712743671507 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0348627972253583 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50091907_50092766:C14orf104 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 23 31 54 10.6828725632849 16.6013456755725 -5.91847311228756 T:C T C 10 0.535527279857177 0.132744292111776 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 50272841 G/T 1 23 4 27 10.6828725632849 2.14210911942871 8.54076344385622 T:G G T 10 0.535527279857177 0.000780793073332201 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50272739_50272851:SDCCAG1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 116 66 182 53.8788355365675 35.3448004705737 18.5340350659938 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00590887974907674 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 51224417 G/C 1 15 15 30 6.96709080214235 8.03290919785765 -1.06581839571531 C:G G C 10 0.535527279857177 0.717832749087862 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 51225097 T/C 1 11 10 21 5.10919992157105 5.35527279857177 -0.246072877000716 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 51227000 A/G 1 56 49 105 26.0104723279981 26.2408367130017 -0.230364385003579 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51226575_51227077:NIN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 53529669 A/T 1 39 38 77 18.1144360855701 20.3500366345727 -2.23560054900263 A:T A T 10 0.535527279857177 0.648407350465468 ENSG00000100523:ENST00000357758:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395606:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000323669:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395610:exon_53529661_53529923:DDHD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 55408294 C/T 1 35 25 60 16.2565452049988 13.3881819964294 2.86836320856938 T:C C T 10 0.535527279857177 0.518253465293186 ENSG00000198554:ENST00000360586:exon_55405668_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000359167:exon_55406942_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000475379:exon_55407989_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000421192:exon_55408208_55408408:WDHD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 55455876 T/C 1 7 11 18 3.25130904099976 5.89080007842895 -2.63949103742919 T:C T C 10 0.535527279857177 0.242667099484109 ENSG00000198554:ENST00000360586:exon_55455746_55455930:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000359167:exon_55455746_55455930:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000421192:exon_55455746_55455930:WDHD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 55636259 G/A 1 29 21 50 13.4697088841419 11.2460728770007 2.22363600714115 A:G G A 10 0.535527279857177 0.572529840370803 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55636117_55636277:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55636117_55636277:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55636117_55636277:DLGAP5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 55643857 T/G 1 41 33 74 19.0433815258557 17.6724002352868 1.3709812905689 T:G T G 10 0.535527279857177 0.816019653325026 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 55818517 T/A 1 4 9 13 1.85789088057129 4.81974551871459 -2.9618546381433 A:T T A 10 0.535527279857177 0.162035560448580 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 55818706 T/C 1 12 15 27 5.57367264171388 8.03290919785765 -2.45923655614378 T:C T C 10 0.535527279857177 0.440881434887102 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 58955530 T/C 1 9 3 12 4.18025448128541 1.60658183957153 2.57367264171388 T:C T C 10 0.535527279857177 0.158167791151507 ENSG00000100578:ENST00000354386:exon_58955339_58955592:KIAA0586;ENSG00000100578:ENST00000423743:exon_58955339_58955592:KIAA0586;ENSG00000100578:ENST00000261244:exon_58955339_58955592:KIAA0586 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 59112732 C/T 1 3 8 11 1.39341816042847 4.28421823885742 -2.89080007842895 T:C C T 10 0.535527279857177 0.127667889620419 ENSG00000165617:ENST00000395151:exon_59111976_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000395153:exon_59112087_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000335867:exon_59111976_59113888:DACT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 59113430 G/A 1 7 8 15 3.25130904099976 4.28421823885742 -1.03290919785765 A:G G A 10 0.535527279857177 0.614933682686176 ENSG00000165617:ENST00000395151:exon_59111976_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000395153:exon_59112087_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000335867:exon_59111976_59113888:DACT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 59950676 A/C 1 9 5 14 4.18025448128541 2.67763639928588 1.50261808199952 A:C A C 10 0.535527279857177 0.593847726273405 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59950527_59951086:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000481608:exon_59950398_59950724:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000527981:exon_59950398_59951126:C14orf149 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 59950690 A/C 1 8 5 13 3.71578176114258 2.67763639928588 1.0381453618567 A:C A C 10 0.535527279857177 0.593586480755975 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59950527_59951086:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000481608:exon_59950398_59950724:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000527981:exon_59950398_59951126:C14orf149 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 60591829 T/C 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 60591887 G/A 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 60611648 C/T 1 23 11 34 10.6828725632849 5.89080007842895 4.79207248485598 T:C C T 10 0.535527279857177 0.121506106853054 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60610838_60611731:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60611502_60611731:DHRS7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 62249073 A/G 1 4 12 16 1.85789088057129 6.42632735828612 -4.56843647771483 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0247698374239015 ENSG00000023608:ENST00000216294:exon_62248965_62249115:SNAPC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 64637147 C/A 1 9 11 20 4.18025448128541 5.89080007842895 -1.71054559714354 A:C C A 10 0.535527279857177 0.505111632691192 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64636946_64637180:SYNE2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 64686125 G/T 1 84 90 174 39.0157084919971 48.1974551871459 -9.18174669514879 T:G G T 10 0.535527279857177 0.171577856664211 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64685926_64686128:SYNE2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 66028446 A/G 1 17 17 34 7.89603624242799 9.10396375757201 -1.20792751514402 A:G A G 10 0.535527279857177 0.732510166657819 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66028055_66028484:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66028055_66028484:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66028055_66028484:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66028055_66028484:FUT8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 66136163 C/A 1 27 12 39 12.5407634438562 6.42632735828612 6.1144360855701 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0544157805175325 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000358307:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394581:exon_66135961_66136198:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000417683:exon_66136133_66136198:FUT8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 69521345 G/A 1 43 51 94 19.9723269661414 27.311891272716 -7.33956430657463 A:G G A 10 0.535527279857177 0.147507878996066 ENSG00000139990:ENST00000341516:exon_69517638_69522328:DCAF5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 69704553 G/T 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:G G T 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000081177:ENST00000409018:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000193422:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000492815:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000409014:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000312994:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000409675:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000409949:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000409242:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000449989:exon_69704292_69704648:EXD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 72055468 A/C 1 21 9 30 9.75392712299928 4.81974551871459 4.93418160428469 A:C A C 10 0.535527279857177 0.0979547554859608 ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72054288_72056087:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72054288_72056087:SIPA1L1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 72117156 T/C 1 10 12 22 4.64472720142823 6.42632735828612 -1.78160015685789 T:C T C 10 0.535527279857177 0.523672568666477 ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72117052_72117226:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72117052_72117226:SIPA1L1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 73425462 G/A 1 7 11 18 3.25130904099976 5.89080007842895 -2.63949103742919 A:G G A 10 0.535527279857177 0.242667099484109 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73425320_73426300:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73425320_73426411:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73425320_73425654:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73425320_73426356:DCAF4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 73459917 C/T 1 11 11 22 5.10919992157105 5.89080007842895 -0.781600156857893 T:C C T 10 0.535527279857177 0.831868960719931 ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73459851_73460065:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73459851_73460065:ZFYVE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 73491270 C/T 1 7 7 14 3.25130904099976 3.74869095900024 -0.497381918000477 T:C C T 10 0.535527279857177 0.796028545675074 ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73490734_73491650:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73490734_73491650:ZFYVE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 34 13 47 15.792072484856 6.9618546381433 8.83021784671268 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0121356033798219 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 74058832 C/T 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000177465:ENST00000326303:exon_74058410_74059120:ACOT4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 74203789 G/A 0 8 0 8 3.71578176114258 0 3.71578176114258 G G 10 0.535527279857177 0.00893088209752 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74203701_74204000:C14orf43 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 74206658 G/A 1 8 3 11 3.71578176114258 1.60658183957153 2.10919992157105 A:G G A 10 0.535527279857177 0.23951309450586 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000421708:exon_74206515_74206958:C14orf43 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 74538612 T/C 1 1 7 8 0.464472720142823 3.74869095900024 -3.28421823885742 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0289107709309061 ENSG00000119711:ENST00000350259:exon_74538599_74538677:ALDH6A1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 75279395 T/A 1 20 26 46 9.28945440285646 13.9237092762866 -4.63425487343014 A:T T A 10 0.535527279857177 0.185148183729362 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 75359670 G/A 1 17 11 28 7.89603624242799 5.89080007842895 2.00523616399905 A:G G A 10 0.535527279857177 0.570608245390574 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75359537_75359689:DLST HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 75367807 C/T 1 25 30 55 11.6118180035706 16.0658183957153 -4.45400039214473 T:C C T 10 0.535527279857177 0.279380518246369 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75367769_75367936:DLST HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 75513934 T/C 1 1 9 10 0.464472720142823 4.81974551871459 -4.35527279857177 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00779531985117688 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 75574087 C/T 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75574046_75574190:NEK9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 75583942 C/T 1 7 7 14 3.25130904099976 3.74869095900024 -0.497381918000477 T:C C T 10 0.535527279857177 0.796028545675074 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75583898_75584029:NEK9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 75590822 G/A 1 9 2 11 4.18025448128541 1.07105455971435 3.10919992157105 A:G G A 10 0.535527279857177 0.072775715286889 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75590749_75590926:NEK9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 75590846 A/T 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 A:T A T 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75590749_75590926:NEK9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 77492891 G/A 1 14 15 29 6.50261808199952 8.03290919785765 -1.53029111585813 A:G G A 10 0.535527279857177 0.582218305374425 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 77793207 G/A 1 11 22 33 5.10919992157105 11.7816001568579 -6.67240023528684 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0228609758311363 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 78140329 G/A 1 14 12 26 6.50261808199952 6.42632735828612 0.0762907237133996 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100601:ENST00000216489:exon_78138749_78140584:ALKBH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 78140355 T/A 1 11 10 21 5.10919992157105 5.35527279857177 -0.246072877000716 A:T T A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100601:ENST00000216489:exon_78138749_78140584:ALKBH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 78197365 C/T 1 83 70 153 38.5512357718543 37.4869095900024 1.06432618185192 T:C C T 10 0.535527279857177 0.871663640708564 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 91691112 C/G 1 27 22 49 12.5407634438562 11.7816001568579 0.759163286998328 C:G C G 10 0.535527279857177 0.886656178938017 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91691028_91691703:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91691028_91691703:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91691028_91691703:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91691028_91691678:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91691028_91691696:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91691028_91691678:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91691028_91691699:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91691028_91691699:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91691028_91691696:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91691028_91691699:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91691028_91691696:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91691028_91691696:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91691028_91691699:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91691028_91691699:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91691028_91691703:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91691028_91691703:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91691028_91691675:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91691028_91691699:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523576:exon_91691028_91691166:C14orf159 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 91773494 G/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91773382_91773570:CCDC88C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 92436176 C/T 1 25 19 44 11.6118180035706 10.1750183172864 1.43679968628421 T:C C T 10 0.535527279857177 0.762943886028215 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92435462_92436237:TRIP11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 92549586 G/A 1 10 4 14 4.64472720142823 2.14210911942871 2.50261808199952 A:G G A 10 0.535527279857177 0.283628757254846 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92549470_92549602:ATXN3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 444 318 762 206.225887743413 170.297674994582 35.9282127488312 T:G T G 10 0.535527279857177 0.00987486616873238 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 93118198 C/T 1 6 17 23 2.78683632085694 9.10396375757201 -6.31712743671507 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0107859013976102 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 40 66 106 18.5789088057129 35.3448004705737 -16.7658916648608 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00123235561656913 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 93118669 G/A 1 67 40 107 31.1196722495691 21.4210911942871 9.69858105528206 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0654928320705588 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 93170993 C/T 1 300 298 598 139.341816042847 159.587129397439 -20.2453133545918 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.10102349538421 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 93276654 T/C 1 6 10 16 2.78683632085694 5.35527279857177 -2.56843647771483 T:C T C 10 0.535527279857177 0.218648734569296 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93276599_93276722:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93276599_93276722:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93276599_93276722:GOLGA5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 94401102 C/T 1 25 20 45 11.6118180035706 10.7105455971435 0.901272406427037 T:C C T 10 0.535527279857177 0.88150907355531 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94400499_94401138:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94400513_94401138:ASB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 94423294 T/C 1 7 11 18 3.25130904099976 5.89080007842895 -2.63949103742919 T:C T C 10 0.535527279857177 0.242667099484109 ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94423112_94423767:ASB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 94594948 G/A 1 83 38 121 38.5512357718543 20.3500366345727 18.2011991372816 A:G G A 10 0.535527279857177 0.000961419110581281 ENSG00000119632:ENST00000238609:exon_94594851_94595012:IFI27L2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 95912285 C/T 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:C C T 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95912246_95912428:C14orf49 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 97321689 C/T 1 83 51 134 38.5512357718543 27.311891272716 11.2393444991383 T:C C T 10 0.535527279857177 0.056565175783665 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97321561_97321693:VRK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 99876505 A/G 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:G A G 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99876141_99876552:SETD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 472 250 722 219.231123907412 133.881819964294 85.3493039431182 A:G G A 10 0.535527279857177 1.46141038405016e-10 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 100996312 T/C 1 2 7 9 0.928945440285646 3.74869095900024 -2.81974551871459 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0914963800425486 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100996157_100996625:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100996157_100996640:WDR25 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 102482736 A/G 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102482686_102482826:DYNC1H1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 102514227 T/C 1 44 72 116 20.4367996862842 38.5579641497167 -18.1211644634325 T:C T C 10 0.535527279857177 0.000771323849837768 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 301 269 570 139.80628876299 144.056838281581 -4.25054951859087 A:G G A 10 0.535527279857177 0.736995496285039 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 102675350 G/C 1 3 11 14 1.39341816042847 5.89080007842895 -4.49738191800048 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0281580583322303 ENSG00000140153:ENST00000335263:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000454394:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000342702:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000299135:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000401892:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000424963:exon_102674936_102676863:WDR20 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 102695693 T/C 1 8 16 24 3.71578176114258 8.56843647771483 -4.85265471657225 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0637278949628729 ENSG00000080823:ENST00000521249:exon_102695164_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000521766:exon_102695164_102695699:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000517966:exon_102695168_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000523485:exon_102695168_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000519569:exon_102695173_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000523231:exon_102695176_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000524370:exon_102695176_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000522874:exon_102695176_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000518686:exon_102695176_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000361847:exon_102695178_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000392778:exon_102695178_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000522867:exon_102695223_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000520266:exon_102695410_102695994:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000519058:exon_102695457_102695994:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000524214:exon_102695474_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000521937:exon_102695551_102695994:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000522534:exon_102695604_102695994:RAGE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 102792489 G/A 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 102792631 G/A 1 10 4 14 4.64472720142823 2.14210911942871 2.50261808199952 A:G G A 10 0.535527279857177 0.283628757254846 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 102807944 T/G 1 13 10 23 6.0381453618567 5.35527279857177 0.68287256328493 T:G T G 10 0.535527279857177 0.836716139403488 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 102808157 G/A 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 A:G G A 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 103986255 C/T 1 109 87 196 50.6275264955677 46.5908733475744 4.03665314799332 T:C C T 10 0.535527279857177 0.567808105448827 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103985996_103986379:CKB;ENSG00000166165:ENST00000428256:exon_103985996_103986379:CKB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 104027509 T/C 1 15 5 20 6.96709080214235 2.67763639928588 4.28945440285646 T:C T C 10 0.535527279857177 0.071460047416697 ENSG00000166170:ENST00000337322:exon_104022889_104027529:BAG5;ENSG00000166170:ENST00000445922:exon_104022889_104027529:BAG5;ENSG00000166170:ENST00000299204:exon_104022889_104027529:BAG5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 104029449 G/A 1 55 29 84 25.5459996078553 15.5302911158581 10.0157084919971 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0289054540898088 ENSG00000126214:ENST00000409074:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000472726:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000247618:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104029300_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000440963:exon_104029302_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000458117:exon_104029316_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000489117:exon_104029390_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000495778:exon_104029414_104029461:C14orf153 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 104165753 G/A 1 18 13 31 8.36050896257082 6.9618546381433 1.39865432442751 A:G G A 10 0.535527279857177 0.719721870124635 ENSG00000126215:ENST00000445556:exon_104165701_104165913:XRCC3;ENSG00000126215:ENST00000352127:exon_104165701_104165913:XRCC3;ENSG00000126215:ENST00000440302:exon_104165701_104165913:XRCC3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 21 15 36 9.75392712299928 8.03290919785765 1.72101792514163 T:C C T 10 0.535527279857177 0.61869297554355 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 105239894 C/T 0 104 1 105 48.3051628948536 0.535527279857177 47.7696356149964 A:C C A 10 0.535527279857177 5.26924881762676e-27 ENSG00000142208:ENST00000349310:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000407796:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000402615:exon_105239792_105239917:AKT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 48 73 121 22.2946905668555 39.0934914295739 -16.7988008627184 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00251985636531503 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106110137 C/T 1 16 46 62 7.43156352228517 24.6342548734301 -17.202691351145 T:C C T 10 0.535527279857177 1.65003593409896e-05 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106110914 G/T 1 12 29 41 5.57367264171388 15.5302911158581 -9.95661847414426 T:G G T 10 0.535527279857177 0.00249084028488366 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106110966 C/T 0 48 0 48 22.2946905668555 0 22.2946905668555 C C 10 0.535527279857177 1.01653460477978e-13 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106174796 C/T 1 902 369 1271 418.954393568826 197.609566267298 221.344827301528 T:C C T 10 0.535527279857177 8.08196706544616e-37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106306841 C/T 1 715 632 1347 332.097994902118 338.453240869736 -6.35524596761741 T:C C T 10 0.535527279857177 0.743087864248008 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106307418 G/A 1 732 549 1281 339.994031144546 294.00447664159 45.9895545029563 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.0099645236585323 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106307432 T/A 1 548 666 1214 254.531050638267 356.66116838488 -102.130117746613 A:T:G T A 10 0.535527279857177 4.80234381237709e-09 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106318342 T/C 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 T:C T C 10 0.535527279857177 0.760056166562883 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106321146 A/G 1 112 89 201 52.0209446559962 47.6619279072887 4.35901674870743 A:G A G 10 0.535527279857177 0.571814191551043 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106321308 G/A 1 100 55 155 46.4472720142823 29.4540003921447 16.9932716221376 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00613902026911461 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106321590 C/A 1 74 76 150 34.3709812905689 40.7000732691454 -6.32909197857654 A:C:G C A 10 0.535527279857177 0.326107284091383 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106321663 T/C 1 58 48 106 26.9394177682837 25.7053094331445 1.23410833513924 A:T:C T C 10 0.535527279857177 0.845963850454334 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106321989 G/A 1 13 17 30 6.0381453618567 9.10396375757201 -3.06581839571531 A:G G A 10 0.535527279857177 0.277280147402981 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106322093 G/C 1 343 254 597 159.314143008988 136.023929083723 23.2902139252654 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0590464688534249 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106322261 C/T 1 356 242 598 165.352288370845 129.597601725437 35.7546866454082 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00357390947537835 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106329417 C/T 1 518 306 824 240.596869033982 163.871347636296 76.7255213976862 T:C:G C T 10 0.535527279857177 7.00593141472677e-08 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106494269 T/C 1 15 58 73 6.96709080214235 31.0605822317163 -24.0934914295739 T:C T C 10 0.535527279857177 1.05337829109074e-08 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 106791131 A/G 1 315 54 369 146.308906844989 28.9184731122876 117.390433732702 A:C:G A G 10 0.535527279857177 2.78222991207533e-38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 107013129 A/C 1 2 335 337 0.928945440285646 179.401638752154 -178.472693311869 A:C A C 10 0.535527279857177 4.40976411092237e-108 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 107013201 G/T 0 163 0 163 75.7090533832801 0 75.7090533832801 G G 10 0.535527279857177 7.16406399475068e-45 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 107170005 T/C 1 124 2 126 57.5946172977101 1.07105455971435 56.5235627379957 T:C T C 10 0.535527279857177 6.66852735121734e-31 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 14 107170077 C/T 1 5 17 22 2.32236360071412 9.10396375757201 -6.78160015685789 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.00455755566383679 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 21937964 A/G 0 8 0 8 3.71578176114258 0 3.71578176114258 A A 10 0.535527279857177 0.00893088209752 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 22855144 C/T 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 T:C C T 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000153575:ENST00000283645:exon_22855027_22855295:TUBGCP5;ENSG00000153575:ENST00000453949:exon_22855027_22855295:TUBGCP5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 22873262 A/G 1 17 15 32 7.89603624242799 8.03290919785765 -0.136872955429662 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000153575:ENST00000283645:exon_22873202_22873892:TUBGCP5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 22960868 G/C 1 28 15 43 13.005236163999 8.03290919785765 4.97232696614139 C:G G C 10 0.535527279857177 0.168119510191600 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22960793_22960889:CYFIP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 22 25 47 10.2183998431421 13.3881819964294 -3.16978215328732 T:C C T 10 0.535527279857177 0.382325834204734 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 32929624 A/G 1 17 13 30 7.89603624242799 6.9618546381433 0.934181604284691 A:G A G 10 0.535527279857177 0.855262631313688 ENSG00000198826:ENST00000361627:exon_32928458_32932150:ARHGAP11A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 21 23 44 9.75392712299928 12.3171274367151 -2.56320031371579 A:G A G 10 0.535527279857177 0.453611121446254 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 56387859 T/C 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000181827:ENST00000422057:exon_56385831_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000423270:exon_56382732_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000317318:exon_56382732_56388818:RFX7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 58000981 C/T 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000137878:ENST00000460962:exon_58000912_58001556:GCOM1;ENSG00000255529:ENST00000380563:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000299638:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000494490:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464277:exon_58000912_58001382:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000482852:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464308:exon_58000912_58001531:GRINL1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 59323048 C/G 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59323003_59323901:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59323003_59323901:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59323003_59323901:RNF111 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 59466359 C/T 1 61 63 124 28.3328359287122 33.7382186310021 -5.40538270228994 T:C C T 10 0.535527279857177 0.368053015942415 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59466325_59466439:MYO1E HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 59500970 C/T 1 18 14 32 8.36050896257082 7.49738191800048 0.863127044570338 T:C C T 10 0.535527279857177 0.859946497231876 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59500880_59501047:MYO1E HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 14 30 44 6.50261808199952 16.0658183957153 -9.56320031371579 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00585442630720789 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 59963488 A/G 1 6 13 19 2.78683632085694 6.9618546381433 -4.17501831728636 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0660288040617104 ENSG00000140299:ENST00000267859:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000415213:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000409352:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000439052:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000448414:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000464390:exon_59963380_59963513:BNIP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 60734697 A/G 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 A:G A G 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60734615_60734744:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60734615_60734744:NARG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 63414083 A/C 1 18 17 35 8.36050896257082 9.10396375757201 -0.743454795001194 A:C A C 10 0.535527279857177 0.866114915546985 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63413999_63414427:LACTB;ENSG00000103642:ENST00000413507:exon_63414032_63414427:LACTB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 84 85 169 39.0157084919971 45.51981878786 -6.5041102958629 A:G G A 10 0.535527279857177 0.317361516684282 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 15 15 30 6.96709080214235 8.03290919785765 -1.06581839571531 A:G G A 10 0.535527279857177 0.717832749087862 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 43 41 84 19.9723269661414 21.9566184741443 -1.98429150800287 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.66372001231552 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 64419374 G/T 1 41 48 89 19.0433815258557 25.7053094331445 -6.66192790728875 T:G G T 10 0.535527279857177 0.167773848304384 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64419373_64419451:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64419373_64419451:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64419373_64419451:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64419373_64419451:SNX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 64448365 C/T 1 25 21 46 11.6118180035706 11.2460728770007 0.365745126569861 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000157734:ENST00000325881:exon_64446586_64449680:SNX22 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 64737225 G/A 1 26 18 44 12.0762907237134 9.63949103742918 2.43679968628421 A:G G A 10 0.535527279857177 0.546133050382075 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64737205_64737307:TRIP4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 64968147 C/T 1 6 10 16 2.78683632085694 5.35527279857177 -2.56843647771483 T:C C T 10 0.535527279857177 0.218648734569296 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64966115_64968455:ZNF609 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 65108504 A/T 1 29 25 54 13.4697088841419 13.3881819964294 0.0815268877124442 A:T A T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 65153690 G/A 1 4 11 15 1.85789088057129 5.89080007842895 -4.03290919785765 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0409545616380073 ENSG00000249240:ENST00000502574:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000249240:ENST00000437723:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65153676_65153774:PLEKHO2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 65157482 C/T 1 12 23 35 5.57367264171388 12.3171274367151 -6.74345479500119 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0268333869204452 ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65157098_65160206:PLEKHO2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 70351788 T/C 1 19 18 37 8.82498168271364 9.63949103742918 -0.814509354715547 T:C T C 10 0.535527279857177 0.869533408882615 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70351749_70351799:TLE3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 73925567 A/G 1 12 6 18 5.57367264171388 3.21316367914306 2.36050896257082 A:G A G 10 0.535527279857177 0.346375041233422 ENSG00000156642:ENST00000345330:exon_73925466_73925754:NPTN;ENSG00000156642:ENST00000351217:exon_73925466_73925756:NPTN;ENSG00000156642:ENST00000287226:exon_73925466_73925719:NPTN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 74277795 T/C 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000359750:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74277659_74277854:STOML1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 74327556 C/T 1 50 38 88 23.2236360071412 20.3500366345727 2.87359937256843 T:C C T 10 0.535527279857177 0.59355778748126 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 75499466 G/A 1 51 35 86 23.688108727284 18.7434547950012 4.94465393228278 A:G G A 10 0.535527279857177 0.330669402409003 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 75499602 C/A 1 50 64 114 23.2236360071412 34.2737459108593 -11.0501099037182 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0391301085263969 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 75499861 G/A 1 27 32 59 12.5407634438562 17.1368729554297 -4.59610951157344 A:G G A 10 0.535527279857177 0.242233387971222 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 75499995 T/G 1 49 43 92 22.7591632869983 23.0276730338586 -0.268509746860278 T:G T G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 75646115 G/A 1 9 8 17 4.18025448128541 4.28421823885742 -0.103963757572008 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000140398:ENST00000355059:exon_75646080_75646207:NEIL1;ENSG00000140398:ENST00000336572:exon_75646080_75646207:NEIL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 75650636 C/T 1 43 28 71 19.9723269661414 14.994763836001 4.97756313014044 T:C C T 10 0.535527279857177 0.284195318508441 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75650542_75650685:MAN2C1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 75650836 G/A 1 26 34 60 12.0762907237134 18.207927515144 -6.13163679143062 A:G G A 10 0.535527279857177 0.121283195230185 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75650803_75650959:MAN2C1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 75668131 T/A 1 23 19 42 10.6828725632849 10.1750183172864 0.507854245998567 A:T T A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000169375:ENST00000394947:exon_75668006_75668213:SIN3A;ENSG00000169375:ENST00000394949:exon_75668006_75668213:SIN3A;ENSG00000169375:ENST00000360439:exon_75668006_75668213:SIN3A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 75694291 A/G 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 A:G A G 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000169375:ENST00000394947:exon_75694193_75694311:SIN3A;ENSG00000169375:ENST00000394949:exon_75694193_75694311:SIN3A;ENSG00000169375:ENST00000360439:exon_75694193_75694311:SIN3A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 75761101 G/A 1 18 23 41 8.36050896257082 12.3171274367151 -3.95661847414426 A:G G A 10 0.535527279857177 0.272904314717144 ENSG00000169410:ENST00000306726:exon_75759462_75761324:PTPN9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 76726465 G/T 1 8 5 13 3.71578176114258 2.67763639928588 1.0381453618567 T:G G T 10 0.535527279857177 0.593586480755975 ENSG00000140386:ENST00000324767:exon_76726419_76726651:SCAPER;ENSG00000140386:ENST00000303521:exon_76726419_76726651:SCAPER HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 77241542 T/C 1 12 4 16 5.57367264171388 2.14210911942871 3.43156352228517 T:C T C 10 0.535527279857177 0.130378196506160 ENSG00000117906:ENST00000394885:exon_77241411_77242601:RCN2;ENSG00000117906:ENST00000320963:exon_77241411_77242201:RCN2;ENSG00000117906:ENST00000394883:exon_77241411_77242191:RCN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 78458638 C/T 1 95 85 180 44.1249084135682 45.51981878786 -1.39491037429185 T:C C T 10 0.535527279857177 0.881258464625822 ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78458492_78458644:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78458492_78458644:IDH3A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 78585106 C/T 1 40 32 72 18.5789088057129 17.1368729554297 1.44203585028326 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.813444507342862 ENSG00000140395:ENST00000267973:exon_78584958_78585130:WDR61 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 79224727 T/C 1 113 87 200 52.485417376139 46.5908733475744 5.89454402856461 T:C T C 10 0.535527279857177 0.435670060830685 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 80191343 G/A 1 3 11 14 1.39341816042847 5.89080007842895 -4.49738191800048 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0281580583322303 ENSG00000136371:ENST00000478497:exon_80191189_80191467:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000485386:exon_80191246_80191467:MTHFS;ENSG00000180953:ENST00000322484:exon_80191185_80191467:ST20;ENSG00000180953:ENST00000417278:exon_80191185_80191467:ST20 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 81598269 T/G 1 92 55 147 42.7314902531397 29.4540003921447 13.277489860995 T:G T G 10 0.535527279857177 0.0313067400801097 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 81598416 G/A 1 64 52 116 29.7262540891407 27.8474185525732 1.87883553656747 A:G G A 10 0.535527279857177 0.780284343960514 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 82512429 C/G 1 22 11 33 10.2183998431421 5.89080007842895 4.32759976471316 C:G C G 10 0.535527279857177 0.162539476074664 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82512419_82512570:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82512419_82512570:EFTUD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 83502065 A/C 1 8 11 19 3.71578176114258 5.89080007842895 -2.17501831728636 A:C A C 10 0.535527279857177 0.362455450147038 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83501981_83503613:WHAMM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 83502066 C/G 1 8 11 19 3.71578176114258 5.89080007842895 -2.17501831728636 C:G C G 10 0.535527279857177 0.362455450147038 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83501981_83503613:WHAMM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 85189464 T/G 1 7 9 16 3.25130904099976 4.81974551871459 -1.56843647771483 T:G T G 10 0.535527279857177 0.462143040312805 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000419751:exon_85189293_85189579:WDR73 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 85333953 A/G 1 11 10 21 5.10919992157105 5.35527279857177 -0.246072877000716 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85333936_85334114:ZNF592 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 86287910 C/T 1 26 16 42 12.0762907237134 8.56843647771483 3.50785424599857 T:C C T 10 0.535527279857177 0.35347027796099 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 89169614 A/G 1 27 8 35 12.5407634438562 4.28421823885742 8.2565452049988 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00596148868906368 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 975 823 1798 452.860902139252 440.738951322457 12.1219508167958 A:T:G A G 10 0.535527279857177 0.570503300150155 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 89804043 C/T 1 12 3 15 5.57367264171388 1.60658183957153 3.96709080214235 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0663216847685012 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 89811698 T/C 1 11 9 20 5.10919992157105 4.81974551871459 0.289454402856461 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89811630_89811756:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89811630_89811756:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89811630_89811756:FANCI HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 13 24 37 6.0381453618567 12.8526547165722 -6.81450935471555 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0311088193912882 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 108 109 217 50.1630537754249 58.3724735044323 -8.2094197290074 T:C T C 10 0.535527279857177 0.276480624875703 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 90168693 T/A 1 7 9 16 3.25130904099976 4.81974551871459 -1.56843647771483 A:T T A 10 0.535527279857177 0.462143040312805 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 90170237 C/T 1 10 8 18 4.64472720142823 4.28421823885742 0.360508962570814 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90170187_90171250:C15orf42 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 93536197 C/T 1 25 19 44 11.6118180035706 10.1750183172864 1.43679968628421 T:C C T 10 0.535527279857177 0.762943886028215 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93536089_93536228:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93536089_93536228:CHD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 99678145 G/A 1 2 8 10 0.928945440285646 4.28421823885742 -3.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0525767166149741 ENSG00000103852:ENST00000459771:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394132:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000434186:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394136:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000262074:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000427087:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000421732:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000413876:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000494567:exon_99676611_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394135:exon_99677781_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000480371:exon_99677845_99678332:TTC23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 100246936 T/C 1 9 3 12 4.18025448128541 1.60658183957153 2.57367264171388 T:C T C 10 0.535527279857177 0.158167791151507 ENSG00000068305:ENST00000354410:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000346108:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000449277:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000338042:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000453228:exon_100246934_100247060:MEF2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 100246942 G/A 1 8 2 10 3.71578176114258 1.07105455971435 2.64472720142823 A:G G A 10 0.535527279857177 0.118249545982972 ENSG00000068305:ENST00000354410:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000346108:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000449277:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000338042:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000453228:exon_100246934_100247060:MEF2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 100269680 G/C 1 9 14 23 4.18025448128541 7.49738191800048 -3.31712743671507 C:G G C 10 0.535527279857177 0.209916596816924 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 101109677 C/A 1 30 35 65 13.9341816042847 18.7434547950012 -4.8092731907165 A:C C A 10 0.535527279857177 0.263345834319706 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 101109794 C/G 1 37 34 71 17.1854906452845 18.207927515144 -1.02243686985956 C:G C G 10 0.535527279857177 0.813128335216563 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 35 36 71 16.2565452049988 19.2789820748584 -3.02243686985956 A:G G A 10 0.535527279857177 0.478044173096184 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 101109893 C/A 1 27 36 63 12.5407634438562 19.2789820748584 -6.73821863100215 A:C C A 10 0.535527279857177 0.100539783358474 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 101110265 T/A 1 17 11 28 7.89603624242799 5.89080007842895 2.00523616399905 A:T T A 10 0.535527279857177 0.570608245390574 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 101110302 C/G 1 20 8 28 9.28945440285646 4.28421823885742 5.00523616399904 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0605447664268705 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 101113950 A/G 1 4 9 13 1.85789088057129 4.81974551871459 -2.9618546381433 A:G A G 10 0.535527279857177 0.162035560448580 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 101120963 T/C 1 8 8 16 3.71578176114258 4.28421823885742 -0.568436477714831 T:C T C 10 0.535527279857177 0.806722234902998 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101120649_101121152:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101120649_101121150:LINS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 101589972 T/A 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:T T A 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101589849_101589988:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101589849_101589988:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101589849_101589988:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101589849_101589988:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101589849_101589988:LRRK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 101591923 A/G 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 A:G A G 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101591916_101592165:LRRK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 101606889 G/A 1 12 3 15 5.57367264171388 1.60658183957153 3.96709080214235 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0663216847685012 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 101606890 C/A 1 13 3 16 6.0381453618567 1.60658183957153 4.43156352228517 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0414895745905174 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 101717680 G/T 1 3 13 16 1.39341816042847 6.9618546381433 -5.56843647771483 T:G G T 10 0.535527279857177 0.00554786334822113 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 101717888 C/T 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 T:C C T 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 15 102224341 G/A 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 A:G G A 10 0.535527279857177 0.782354473542065 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102224278_102224440:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102224278_102224440:TARSL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 107162 C/G 1 164 175 339 76.173526103423 93.717273975006 -17.543747871583 A:C:G C G 10 0.535527279857177 0.0568355622257479 ENSG00000161981:ENST00000293861:exon_107086_107669:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000383018:exon_107086_107668:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000397876:exon_107086_107372:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000466183:exon_107086_107444:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000481947:exon_107086_107453:SNRNP25 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 249130 C/T 1 38 23 61 17.6499633654273 12.3171274367151 5.33283592871221 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.199372312098429 ENSG00000007392:ENST00000337351:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000293872:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000426094:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000397783:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000490762:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000415507:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000464711:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000419516:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000397780:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000495349:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000418978:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000430864:exon_249061_249237:LUC7L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 418597 G/C 1 147 138 285 68.277489860995 73.9027646202904 -5.62527475929544 C:G G C 10 0.535527279857177 0.514024507273396 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_418501_418626:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_418501_418626:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_418501_418635:MRPL28 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 419154 G/A 1 138 87 225 64.0972353797096 46.5908733475744 17.5063620321352 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0193534541524188 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 420140 G/A 1 166 138 304 77.1024715437086 73.9027646202904 3.19970692341819 A:G G A 10 0.535527279857177 0.73035055530245 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 424288 G/A 1 9 24 33 4.18025448128541 12.8526547165722 -8.67240023528684 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00270391788121844 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 426184 G/A 1 7 26 33 3.25130904099976 13.9237092762866 -10.6724002352868 A:G G A 10 0.535527279857177 0.000181146833883401 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 624114 A/G 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 A:G A G 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000007541:ENST00000409527:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000409439:exon_624066_624592:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000422307:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000439574:exon_624066_624409:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000470411:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000420990:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000443147:exon_624066_624763:PIGQ HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 633125 T/C 1 16 14 30 7.43156352228517 7.49738191800048 -0.0658183957153087 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 633353 T/C 1 18 19 37 8.36050896257082 10.1750183172864 -1.81450935471555 T:C T C 10 0.535527279857177 0.622031610977959 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 633354 G/A 1 18 18 36 8.36050896257082 9.63949103742918 -1.27898207485837 A:G G A 10 0.535527279857177 0.739253657716502 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 677629 T/C 1 5 8 13 2.32236360071412 4.28421823885742 -1.9618546381433 T:C T C 10 0.535527279857177 0.405380944075703 ENSG00000197562:ENST00000248139:exon_677342_679272:RAB40C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 715990 G/A 1 14 8 22 6.50261808199952 4.28421823885742 2.21839984314211 A:G G A 10 0.535527279857177 0.397197441912417 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_715950_716124:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_715950_716124:WDR90 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 717523 G/T 1 9 14 23 4.18025448128541 7.49738191800048 -3.31712743671507 T:G G T 10 0.535527279857177 0.209916596816924 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 718514 C/G 1 28 27 55 13.005236163999 14.4592365561438 -1.45400039214473 C:G C G 10 0.535527279857177 0.787175560326678 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_718488_718569:RHOT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 720986 G/A 1 11 14 25 5.10919992157105 7.49738191800048 -2.38818199642942 A:G G A 10 0.535527279857177 0.423396273780819 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720892_721000:RHOT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 722331 C/T 1 21 22 43 9.75392712299928 11.7816001568579 -2.02767303385861 T:C C T 10 0.535527279857177 0.544961274289938 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722254_722384:RHOT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 722548 A/G 1 24 26 50 11.1473452834278 13.9237092762866 -2.77636399285885 A:G A G 10 0.535527279857177 0.479414132257426 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722489_722566:RHOT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 723647 C/G 1 27 21 48 12.5407634438562 11.2460728770007 1.29469056685551 C:G C G 10 0.535527279857177 0.773153219616852 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 735921 T/C 1 13 14 27 6.0381453618567 7.49738191800048 -1.45923655614378 T:C T C 10 0.535527279857177 0.700369496789269 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_735869_735990:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_735869_735990:WDR24 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 772061 C/T 1 11 7 18 5.10919992157105 3.74869095900024 1.36050896257081 T:C C T 10 0.535527279857177 0.638900023085703 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 774520 C/T 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482152:exon_774322_774635:CCDC78 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 774692 A/G 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 A:G A G 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000485091:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000293889:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000345165:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 778820 G/A 1 15 21 36 6.96709080214235 11.2460728770007 -4.27898207485837 A:G G A 10 0.535527279857177 0.181555592466634 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_778794_779715:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_778794_778868:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_778794_778895:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_778794_779168:HAGHL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 44 45 89 20.4367996862842 24.098727593573 -3.66192790728875 A:G A G 10 0.535527279857177 0.458099996587639 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 781633 G/A 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 A:G G A 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_781565_781702:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_781565_781702:NARFL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 784765 C/T 1 21 7 28 9.75392712299928 3.74869095900024 6.00523616399905 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0234404287532799 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_784737_784871:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_784737_784871:NARFL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 839269 G/A 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 A:G G A 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_839210_839362:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_838931_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_839214_839360:CHTF18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 1004554 C/T 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 T:C C T 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_1004357_1004666:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_1004357_1004666:LMF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 1544301 G/C 1 12 1 13 5.57367264171388 0.535527279857177 5.0381453618567 C:G G C 10 0.535527279857177 0.00440620530740177 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 1544302 A/G 1 12 1 13 5.57367264171388 0.535527279857177 5.0381453618567 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00440620530740177 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 1545448 A/G 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 A:G A G 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1545347_1545624:TELO2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 28 26 54 13.005236163999 13.9237092762866 -0.918473112287556 A:G A G 10 0.535527279857177 0.89165592179847 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 1560954 G/A 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 A:G G A 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000187535:ENST00000397417:exon_1560428_1561151:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000426508:exon_1560431_1561151:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000458658:exon_1560431_1561151:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000361339:exon_1560431_1561151:IFT140 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 1634385 C/T 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000187535:ENST00000397417:exon_1634218_1634421:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000426508:exon_1634218_1634421:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000458658:exon_1634218_1634421:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000361339:exon_1634218_1634421:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000439987:exon_1634218_1634421:IFT140 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 1797050 C/T 1 2 7 9 0.928945440285646 3.74869095900024 -2.81974551871459 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0914963800425486 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1797030_1797276:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1797030_1797276:MAPK8IP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 1814440 A/G 1 7 10 17 3.25130904099976 5.35527279857177 -2.10396375757201 A:G A G 10 0.535527279857177 0.338715846297251 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 1818503 G/C 1 6 10 16 2.78683632085694 5.35527279857177 -2.56843647771483 C:G G C 10 0.535527279857177 0.218648734569296 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 83 127 210 38.5512357718543 68.0119645418615 -29.4607287700072 A:T T A 10 0.535527279857177 5.44120333974985e-05 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 1827836 T/C 1 37 24 61 17.1854906452845 12.8526547165722 4.33283592871221 T:C T C 10 0.535527279857177 0.305011437657646 ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000162032:ENST00000301717:exon_1827748_1827873:SPSB3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 1838050 A/G 1 74 56 130 34.3709812905689 29.9895276720019 4.381453618567 A:G A G 10 0.535527279857177 0.482078946553133 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1837942_1838052:NUBP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 1838640 T/C 1 82 73 155 38.0867630517115 39.0934914295739 -1.00672837786243 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.872461876355713 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2049527 G/A 1 54 39 93 25.0815268877124 20.8855639144299 4.19596297328254 A:G G A 10 0.535527279857177 0.406836722536534 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2114407 C/T 1 11 5 16 5.10919992157105 2.67763639928588 2.43156352228517 T:C C T 10 0.535527279857177 0.316751505566711 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000490108:exon_2114273_2114428:TSC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2125834 T/C 1 24 23 47 11.1473452834278 12.3171274367151 -1.16978215328732 T:C T C 10 0.535527279857177 0.771114440369414 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2125800_2125893:TSC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2138269 T/C 1 68 49 117 31.584144969712 26.2408367130017 5.3433082567103 T:C T C 10 0.535527279857177 0.354326478401221 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138228_2138326:TSC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2138584 G/C 1 53 34 87 24.6170541675696 18.207927515144 6.4091266524256 C:G G C 10 0.535527279857177 0.19694870926855 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138447_2138703:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138447_2138721:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138447_2138712:TSC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2140010 A/G 1 28 18 46 13.005236163999 9.63949103742918 3.36574512656986 A:G A G 10 0.535527279857177 0.375864743530014 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2139528_2140195:PKD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2140321 G/A 1 14 5 19 6.50261808199952 2.67763639928588 3.82498168271364 A:G G A 10 0.535527279857177 0.106138416378817 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2140454 T/C 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 T:C T C 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2140554 G/A 1 9 1 10 4.18025448128541 0.535527279857177 3.64472720142823 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0246218512642377 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2285437 G/A 1 62 53 115 28.797308648855 28.3829458324304 0.414362816424649 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2285217_2285743:E4F1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 70 64 134 32.5130904099976 34.2737459108593 -1.76065550086172 A:C:G C A 10 0.535527279857177 0.795244756150067 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2871555 G/A 1 2 8 10 0.928945440285646 4.28421823885742 -3.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0525767166149741 ENSG00000007038:ENST00000455114:exon_2871367_2871720:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000450020:exon_2871367_2871720:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000005995:exon_2871367_2871720:PRSS21 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 13 9 22 6.0381453618567 4.81974551871459 1.21839984314211 T:G G T 10 0.535527279857177 0.672789147896244 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2983147 C/T 1 9 6 15 4.18025448128541 3.21316367914306 0.967090802142346 T:C C T 10 0.535527279857177 0.796987479524744 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2983516 C/T 1 9 17 26 4.18025448128541 9.10396375757201 -4.9237092762866 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0748738537647927 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 2987315 G/A 1 14 18 32 6.50261808199952 9.63949103742918 -3.13687295542966 A:G G A 10 0.535527279857177 0.290964786174482 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000344592:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000445831:exon_2986530_2987385:FLYWCH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 3191356 G/A 1 9 8 17 4.18025448128541 4.28421823885742 -0.103963757572008 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000085644:ENST00000396878:exon_3190690_3192804:ZNF213;ENSG00000085644:ENST00000332670:exon_3190690_3192804:ZNF213;ENSG00000085644:ENST00000416391:exon_3190690_3192804:ZNF213 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 3640477 C/T 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 T:C C T 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 3707747 G/A 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 A:G G A 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000213918:ENST00000407479:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000414110:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000246949:exon_3707721_3707817:DNASE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 3708193 G/A 1 145 131 276 67.3485444207093 70.1540736612902 -2.80552924058084 A:G G A 10 0.535527279857177 0.762964790665588 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3708038_3708231:TRAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 155 135 290 71.9932716221376 72.2961827807189 -0.302911158581324 C:G G C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 3843454 C/T 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3843387_3843627:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3843387_3843627:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3843387_3843627:CREBBP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 14 16 30 6.50261808199952 8.56843647771483 -2.06581839571531 T:C T C 10 0.535527279857177 0.46949162763975 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 13 18 31 6.0381453618567 9.63949103742918 -3.60134567557249 A:T:G A T 10 0.535527279857177 0.211088561849615 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 15 23 38 6.96709080214235 12.3171274367151 -5.35003663457273 A:T T A 10 0.535527279857177 0.102998501200972 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 4802370 C/A 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000103199:ENST00000219478:exon_4800815_4803059:ZNF500 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 4802386 G/T 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:G G T 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000103199:ENST00000219478:exon_4800815_4803059:ZNF500 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 4855279 A/G 1 47 46 93 21.8302178467127 24.6342548734301 -2.80403702671746 A:G A G 10 0.535527279857177 0.603653110032918 ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4853204_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000436648:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4855102_4855311:GLYR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 5075542 G/A 1 7 6 13 3.25130904099976 3.21316367914306 0.0381453618566998 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 5075633 G/A 1 8 2 10 3.71578176114258 1.07105455971435 2.64472720142823 A:G G A 10 0.535527279857177 0.118249545982972 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 5083483 T/C 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:C T C 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5083274_5083729:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5083274_5083729:NAGPA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 5128001 C/T 1 19 21 40 8.82498168271364 11.2460728770007 -2.42109119428708 T:C C T 10 0.535527279857177 0.526617829622177 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5127908_5128018:ALG1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 5139186 G/C 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 C:G G C 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 5139217 C/G 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 C:G C G 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 5140541 G/C 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 C:G G C 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5140433_5140566:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5140433_5140566:FAM86A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 8729124 G/A 1 11 11 22 5.10919992157105 5.89080007842895 -0.781600156857893 A:G G A 10 0.535527279857177 0.831868960719931 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 8906914 A/C 1 34 23 57 15.792072484856 12.3171274367151 3.47494504814091 A:C A C 10 0.535527279857177 0.425901455789071 ENSG00000140650:ENST00000268261:exon_8906848_8906963:PMM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 12758966 T/C 1 4 11 15 1.85789088057129 5.89080007842895 -4.03290919785765 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0409545616380073 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12756937_12758972:CPPED1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 14742400 T/G 1 20 31 51 9.28945440285646 16.6013456755725 -7.31189127271603 T:G T G 10 0.535527279857177 0.0486408694889374 ENSG00000103429:ENST00000261658:exon_14742245_14742449:BFAR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 15116625 G/T 1 9 2 11 4.18025448128541 1.07105455971435 3.10919992157105 T:G G T 10 0.535527279857177 0.072775715286889 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 15122812 C/G 1 30 31 61 13.9341816042847 16.6013456755725 -2.66716407128779 C:G C G 10 0.535527279857177 0.522574516430757 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15122735_15123657:PDXDC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 15793615 C/T 1 74 66 140 34.3709812905689 35.3448004705737 -0.973819180004774 T:C C T 10 0.535527279857177 0.865969732403786 ENSG00000072864:ENST00000396353:exon_15793586_15793679:NDE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 15818141 A/C 1 9 31 40 4.18025448128541 16.6013456755725 -12.4210911942871 A:C A C 10 0.535527279857177 8.98708426320812e-05 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 35 38 73 16.2565452049988 20.3500366345727 -4.09349142957392 A:G G A 10 0.535527279857177 0.349866120576440 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 15818653 G/A 1 53 30 83 24.6170541675696 16.0658183957153 8.55123577185431 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0619623077167126 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818504_15818656:MYH11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 16138313 G/A 0 9 0 9 4.18025448128541 0 4.18025448128541 G G 10 0.535527279857177 0.00462881858371194 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16138307_16138537:ABCC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 16138322 T/C 0 9 0 9 4.18025448128541 0 4.18025448128541 T T 10 0.535527279857177 0.00462881858371194 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16138307_16138537:ABCC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 16180824 C/A 1 6 10 16 2.78683632085694 5.35527279857177 -2.56843647771483 A:C C A 10 0.535527279857177 0.218648734569296 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16180681_16180848:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16180681_16180848:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16180681_16180848:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16180681_16180848:ABCC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 17228368 G/A 1 9 3 12 4.18025448128541 1.60658183957153 2.57367264171388 A:G G A 10 0.535527279857177 0.158167791151507 ENSG00000103489:ENST00000261381:exon_17228330_17228592:XYLT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 9 18 27 4.18025448128541 9.63949103742918 -5.45923655614378 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0516486930322632 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 19548290 G/A 1 2 9 11 0.928945440285646 4.81974551871459 -3.89080007842895 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0297906587989276 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 19726124 G/A 1 148 99 247 68.7419625811378 53.0172007058605 15.7247618752773 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0478923264966254 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 20873767 T/G 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 T:G T G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000188215:ENST00000324344:exon_20873430_20873965:DCUN1D3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 21272591 G/C 1 5 11 16 2.32236360071412 5.89080007842895 -3.56843647771483 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0832488497756866 ENSG00000103316:ENST00000219599:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000396023:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000415987:exon_21272575_21272659:CRYM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 22237118 A/G 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:G A G 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22236975_22237296:EEF2K HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 23489711 C/G 1 30 21 51 13.9341816042847 11.2460728770007 2.68810872728397 C:G C G 10 0.535527279857177 0.48509708860321 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23489689_23489822:GGA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 23503068 G/A 1 21 22 43 9.75392712299928 11.7816001568579 -2.02767303385861 A:G G A 10 0.535527279857177 0.544961274289938 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23502998_23503121:GGA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 23535680 A/C 1 11 17 28 5.10919992157105 9.10396375757201 -3.99476383600096 A:C A C 10 0.535527279857177 0.134938635465867 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23533335_23535775:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23534832_23535775:EARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 23536684 T/C 1 5 21 26 2.32236360071412 11.2460728770007 -8.9237092762866 T:C T C 10 0.535527279857177 0.000535956973516882 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23536448_23536700:EARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 23546561 G/C 1 12 8 20 5.57367264171388 4.28421823885742 1.28945440285646 C:G G C 10 0.535527279857177 0.656931290438306 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23546209_23546681:EARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 23563501 C/T 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23563470_23563625:EARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 23607504 G/C 1 134 117 251 62.2393444991383 62.6566917432897 -0.417347244151422 C:G G C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000004779:ENST00000007516:exon_23607444_23607677:NDUFAB1;ENSG00000004779:ENST00000484769:exon_23607444_23607624:NDUFAB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 23677006 A/G 1 42 63 105 19.5078542459986 33.7382186310021 -14.2303643850036 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00598895210425029 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23676947_23677049:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23676996_23677049:DCTN5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 23701538 A/G 1 227 240 467 105.435307472421 128.526547165722 -23.0912396933016 A:C:G A G 10 0.535527279857177 0.032866470902825 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 23847575 C/A 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:C C A 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_23847322_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_23847345_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000498058:exon_23847403_23847669:PRKCB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 24166130 T/C 1 13 6 19 6.0381453618567 3.21316367914306 2.82498168271364 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.251478317815371 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 24231449 C/T 1 99 112 211 45.9827992941395 59.9790553440038 -13.9962560498643 T:C C T 10 0.535527279857177 0.062137119886509 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24231282_24231932:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24225979_24231932:PRKCB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 189 201 390 87.7853441069935 107.640983251293 -19.855639144299 A:C:G A G 10 0.535527279857177 0.0476078770281516 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 24788645 T/A 1 7 6 13 3.25130904099976 3.21316367914306 0.0381453618566998 A:T T A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24788569_24788679:TNRC6A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 24801737 G/A 1 14 4 18 6.50261808199952 2.14210911942871 4.36050896257082 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0560797144511649 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 24801979 C/T 1 7 8 15 3.25130904099976 4.28421823885742 -1.03290919785765 T:C C T 10 0.535527279857177 0.614933682686176 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 24802325 C/T 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 24835149 C/T 1 27 25 52 12.5407634438562 13.3881819964294 -0.847418552573203 T:C C T 10 0.535527279857177 0.889660313518179 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834753_24836196:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834753_24837545:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834753_24836090:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834753_24836107:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834753_24836107:TNRC6A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 24835168 G/A 1 23 26 49 10.6828725632849 13.9237092762866 -3.24083671300167 A:G G A 10 0.535527279857177 0.391420756130833 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834753_24836196:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834753_24837545:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834753_24836090:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834753_24836107:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834753_24836107:TNRC6A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 24946807 C/T 1 128 109 237 59.4525081782813 58.3724735044323 1.08003467384906 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.89658963975252 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24946791_24946960:ARHGAP17 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 62 41 103 28.797308648855 21.9566184741443 6.84069017471077 T:C T C 10 0.535527279857177 0.199109204494071 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 27353479 C/T 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27353442_27353580:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27353442_27353580:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27353442_27353580:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27353442_27353580:IL4R HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 27356203 A/G 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 A:G A G 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27356190_27356341:IL4R HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 27373833 C/T 1 13 17 30 6.0381453618567 9.10396375757201 -3.06581839571531 T:C C T 10 0.535527279857177 0.277280147402981 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 28123226 G/A 1 44 43 87 20.4367996862842 23.0276730338586 -2.59087334757439 A:G G A 10 0.535527279857177 0.592440355098059 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28123138_28123327:XPO6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 28222690 G/A 0 14 0 14 6.50261808199952 0 6.50261808199952 G G 10 0.535527279857177 0.000181315927639718 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28222687_28223190:XPO6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 28488944 G/T 1 30 28 58 13.9341816042847 14.994763836001 -1.06058223171626 T:G G T 10 0.535527279857177 0.793741863520328 ENSG00000188603:ENST00000359984:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000360019:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357857:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357806:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000354630:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000355477:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000395653:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000333496:exon_28488601_28488956:CLN3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 28506428 C/T 1 8 12 20 3.71578176114258 6.42632735828612 -2.71054559714354 T:C C T 10 0.535527279857177 0.265322195681750 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28506420_28507410:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28506420_28507410:AC138894.1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 28508447 A/G 1 10 10 20 4.64472720142823 5.35527279857177 -0.71054559714354 A:G A G 10 0.535527279857177 0.824432001736655 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 28944700 G/T 1 56 48 104 26.0104723279981 25.7053094331445 0.305162894853598 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944555_28944830:CD19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 29675928 C/T 1 91 102 193 42.2670175329969 54.6237825454321 -12.3567650124352 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0830803234704954 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 29811319 C/T 1 145 157 302 67.3485444207093 84.0777829375768 -16.7292385168674 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0568887555777527 ENSG00000079616:ENST00000160827:exon_29811234_29811369:KIF22;ENSG00000079616:ENST00000400750:exon_29811234_29811369:KIF22 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 29814234 G/A 1 115 121 236 53.4143628164246 64.7988008627184 -11.3844380462938 A:G G A 10 0.535527279857177 0.150966916214636 ENSG00000079616:ENST00000160827:exon_29814090_29814258:KIF22;ENSG00000079616:ENST00000400750:exon_29814090_29814258:KIF22 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 29819009 C/T 1 180 146 326 83.6050896257081 78.1869828591478 5.41810676656031 T:C C T 10 0.535527279857177 0.578817964986365 ENSG00000103495:ENST00000322945:exon_29818299_29819149:MAZ;ENSG00000103495:ENST00000219782:exon_29818299_29819149:MAZ HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 30007849 C/T 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 T:C C T 10 0.535527279857177 1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 30012758 A/C 1 49 33 82 22.7591632869983 17.6724002352868 5.08676305171149 A:C A C 10 0.535527279857177 0.270340740638203 ENSG00000169592:ENST00000304516:exon_30012735_30012851:INO80E HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 30081367 G/T 1 1 8 9 0.464472720142823 4.28421823885742 -3.81974551871459 T:G G T 10 0.535527279857177 0.0150689460626302 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 30199584 G/A 1 20 12 32 9.28945440285646 6.42632735828612 2.86312704457034 A:G G A 10 0.535527279857177 0.37664187110767 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 30536672 A/G 1 42 45 87 19.5078542459986 24.098727593573 -4.59087334757439 A:G A G 10 0.535527279857177 0.335041883510995 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 30594521 A/C 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 A:C A C 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000197162:ENST00000470110:exon_30593832_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000321694:exon_30593674_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000443190:exon_30593674_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000395222:exon_30593674_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000395216:exon_30591977_30594764:ZNF785 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 30594744 C/T 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:C C T 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000197162:ENST00000470110:exon_30593832_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000321694:exon_30593674_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000443190:exon_30593674_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000395222:exon_30593674_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000395216:exon_30591977_30594764:ZNF785 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 30616317 A/G 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:G A G 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000156853:ENST00000287461:exon_30613879_30616768:ZNF689 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 30667461 T/G 1 141 129 270 65.4906535401381 69.0830191015758 -3.59236556143777 T:G T G 10 0.535527279857177 0.669717120469449 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30667353_30667733:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30667353_30667761:PRR14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 30903962 T/C 1 80 83 163 37.1578176114258 44.4487642281457 -7.29094661671985 T:C T C 10 0.535527279857177 0.271771184291199 ENSG00000099385:ENST00000380317:exon_30903907_30904068:BCL7C;ENSG00000099385:ENST00000215115:exon_30903907_30904068:BCL7C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 31088625 A/G 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 A:G A G 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 31091757 G/A 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 31121793 G/A 1 21 31 52 9.75392712299928 16.6013456755725 -6.8474185525732 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0699295326354882 ENSG00000103507:ENST00000394951:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000219794:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394950:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000287507:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394952:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000441132:exon_31121722_31121801:BCKDK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 50118125 G/A 1 9 5 14 4.18025448128541 2.67763639928588 1.50261808199952 A:G G A 10 0.535527279857177 0.593847726273405 ENSG00000155393:ENST00000285767:exon_50118045_50118202:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000483299:exon_50117848_50118562:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000299192:exon_50118045_50118202:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000405152:exon_50118045_50118202:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000401635:exon_50118045_50118202:HEATR3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 50745199 C/T 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:C C T 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000167207:ENST00000526417:exon_50744469_50746284:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000300589:exon_50744469_50746284:NOD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 53358439 A/G 1 12 6 18 5.57367264171388 3.21316367914306 2.36050896257082 A:G A G 10 0.535527279857177 0.346375041233422 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53357932_53358807:CHD9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 53528079 T/C 1 4 10 14 1.85789088057129 5.35527279857177 -3.49738191800048 T:C T C 10 0.535527279857177 0.104526436185540 ENSG00000166971:ENST00000394657:exon_53528050_53528157:AKTIP;ENSG00000166971:ENST00000300245:exon_53528050_53528157:AKTIP;ENSG00000166971:ENST00000425875:exon_53528050_53528157:AKTIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 56660816 G/A 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 A:G G A 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000169715:ENST00000306061:exon_56660792_56661024:MT1E HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 57059427 C/T 1 1 7 8 0.464472720142823 3.74869095900024 -3.28421823885742 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0289107709309061 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 57111232 C/T 1 9 9 18 4.18025448128541 4.81974551871459 -0.639491037429185 T:C C T 10 0.535527279857177 0.816111256590493 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57111208_57111291:NLRC5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 57499902 T/C 1 48 36 84 22.2946905668555 19.2789820748584 3.01570849199714 T:C T C 10 0.535527279857177 0.584691136806107 ENSG00000102978:ENST00000219252:exon_57499865_57499933:POLR2C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 57771126 G/T 1 11 10 21 5.10919992157105 5.35527279857177 -0.246072877000716 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57770890_57771195:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57770890_57771195:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57771117_57771195:KATNB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 57786711 C/T 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786690_57786840:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786690_57786840:KATNB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 58074601 C/T 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 T:C C T 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000102996:ENST00000219271:exon_58074441_58074602:MMP15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 58589187 G/A 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 A:G G A 10 0.535527279857177 0.809233970242324 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58589155_58589441:CNOT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 69189792 T/C 1 34 19 53 15.792072484856 10.1750183172864 5.61705416756962 T:C T C 10 0.535527279857177 0.131274763870144 ENSG00000141076:ENST00000314423:exon_69189774_69189896:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000453167:exon_69189774_69189896:CIRH1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 69354963 A/G 1 51 61 112 23.688108727284 32.6671640712878 -8.97905534400382 A:G A G 10 0.535527279857177 0.106883467289172 ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 69373414 T/C 1 10 12 22 4.64472720142823 6.42632735828612 -1.78160015685789 T:C T C 10 0.535527279857177 0.523672568666477 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69373079_69373513:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69373079_69373460:COG8;ENSG00000132603:ENST00000254940:exon_69373343_69373788:NIP7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 51 24 75 23.688108727284 12.8526547165722 10.8354540107117 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.0145403831276885 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 69782855 C/T 1 127 121 248 58.9880354581385 64.7988008627184 -5.81076540457988 T:C C T 10 0.535527279857177 0.48392069478245 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782821_69783021:NOB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 69973825 G/A 1 24 23 47 11.1473452834278 12.3171274367151 -1.16978215328732 A:G G A 10 0.535527279857177 0.771114440369414 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973744_69975644:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973744_69975643:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973744_69975643:WWP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 70287177 A/G 1 157 144 301 72.9222170624232 77.1159282994335 -4.19371123701026 A:G A G 10 0.535527279857177 0.64411553179411 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70287171_70287284:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70287171_70287284:AARS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 70358495 A/G 1 59 51 110 27.4038904884266 27.311891272716 0.0919992157105334 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000157349:ENST00000451014:exon_70358488_70358590:DDX19B;ENSG00000157349:ENST00000355992:exon_70358488_70358590:DDX19B;ENSG00000157349:ENST00000393657:exon_70358488_70358590:DDX19B;ENSG00000157349:ENST00000288071:exon_70358488_70358590:DDX19B;ENSG00000157349:ENST00000417604:exon_70358488_70358590:DDX19B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 30 20 50 13.9341816042847 10.7105455971435 3.22363600714115 T:C C T 10 0.535527279857177 0.396910313695782 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 70546234 G/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70546142_70546321:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70546176_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70546222_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70546226_70546335:COG4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 24 19 43 11.1473452834278 10.1750183172864 0.972326966141392 A:T A T 10 0.535527279857177 0.878742494186702 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 76 66 142 35.2999267308546 35.3448004705737 -0.0448737397191294 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 70726795 C/A 1 14 15 29 6.50261808199952 8.03290919785765 -1.53029111585813 A:C C A 10 0.535527279857177 0.582218305374425 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70726724_70726874:VAC14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 71318001 G/T 1 12 10 22 5.57367264171388 5.35527279857177 0.218399843142107 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 71950450 C/T 1 10 22 32 4.64472720142823 11.7816001568579 -7.13687295542966 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.0127684944262348 ENSG00000182149:ENST00000378799:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000378798:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000439924:exon_71950365_71950511:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000424485:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000329908:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000456820:exon_71950365_71950545:KIAA0174 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 72057421 C/T 1 15 16 31 6.96709080214235 8.56843647771483 -1.60134567557249 T:C C T 10 0.535527279857177 0.592970704514405 ENSG00000102967:ENST00000219240:exon_72057373_72057532:DHODH;ENSG00000102967:ENST00000378782:exon_72057373_72057532:DHODH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 72130125 T/C 1 17 10 27 7.89603624242799 5.35527279857177 2.54076344385622 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.343173783053281 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 72130815 C/A 1 12 21 33 5.57367264171388 11.2460728770007 -5.67240023528684 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0548969189608858 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 72137561 G/A 1 19 18 37 8.82498168271364 9.63949103742918 -0.814509354715547 A:G G A 10 0.535527279857177 0.869533408882615 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 72139184 C/A 1 35 44 79 16.2565452049988 23.5632003137158 -7.30665510871698 A:C C A 10 0.535527279857177 0.11405257434216 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72139131_72139247:DHX38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 36 0 36 16.7210179251416 0 16.7210179251416 C C 10 0.535527279857177 2.15795655433996e-10 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 74490556 G/A 1 31 36 67 14.3986543244275 19.2789820748584 -4.88032775043085 A:G G A 10 0.535527279857177 0.270332658729382 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74490547_74490653:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74490547_74490653:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74490547_74490653:GLG1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 75269003 G/A 1 26 23 49 12.0762907237134 12.3171274367151 -0.240836713001672 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 75269267 A/G 1 18 14 32 8.36050896257082 7.49738191800048 0.863127044570338 A:G A G 10 0.535527279857177 0.859946497231876 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 75269325 C/T 1 22 4 26 10.2183998431421 2.14210911942871 8.0762907237134 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00128702143434726 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 75646685 G/T 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 T:G G T 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 77225440 G/T 1 10 16 26 4.64472720142823 8.56843647771483 -3.9237092762866 T:G G T 10 0.535527279857177 0.167638781651660 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77225373_77225530:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000320859:exon_77225373_77225530:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77225373_77225530:MON1B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 81730248 T/C 1 16 21 37 7.43156352228517 11.2460728770007 -3.81450935471555 T:C T C 10 0.535527279857177 0.248972654058311 ENSG00000153815:ENST00000398040:exon_81730165_81730272:AC099480.1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 81888152 A/G 1 53 30 83 24.6170541675696 16.0658183957153 8.55123577185431 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0619623077167126 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81888049_81888192:PLCG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 81941319 C/T 1 74 48 122 34.3709812905689 25.7053094331445 8.66567185742441 T:C C T 10 0.535527279857177 0.123191515016634 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81941290_81941379:PLCG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 102 127 229 47.3762174545679 68.0119645418615 -20.6357470872935 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00655864126427092 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 81991638 T/C 1 192 163 355 89.178762267422 87.2909466167199 1.88781565070218 T:C T C 10 0.535527279857177 0.873218698167572 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81991561_81991898:PLCG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 82182286 C/G 1 4 19 23 1.85789088057129 10.1750183172864 -8.31712743671507 C:G C G 10 0.535527279857177 0.000531904124500915 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 82182354 G/A 1 12 15 27 5.57367264171388 8.03290919785765 -2.45923655614378 A:G G A 10 0.535527279857177 0.440881434887102 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 83949076 A/G 1 12 24 36 5.57367264171388 12.8526547165722 -7.27898207485837 A:G A G 10 0.535527279857177 0.018463415230233 ENSG00000103150:ENST00000262430:exon_83948561_83949785:MLYCD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 84088026 T/C 1 32 20 52 14.8631270445703 10.7105455971435 4.1525814474268 T:C T C 10 0.535527279857177 0.268370482496236 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 84100173 C/T 1 16 7 23 7.43156352228517 3.74869095900024 3.68287256328493 T:C C T 10 0.535527279857177 0.145529269824070 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84100094_84100218:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84100094_84100218:MBTPS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 84115483 G/A 1 9 11 20 4.18025448128541 5.89080007842895 -1.71054559714354 A:G G A 10 0.535527279857177 0.505111632691192 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84115352_84115513:MBTPS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 84691044 C/T 1 21 16 37 9.75392712299928 8.56843647771483 1.18549064528445 T:C C T 10 0.535527279857177 0.743804421265413 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84690477_84691550:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84690477_84691519:KLHL36 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 84778690 C/T 1 71 2 73 32.9775631301404 1.07105455971435 31.9065085704261 A:T:C C T 10 0.535527279857177 4.83397970266643e-17 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 84778697 G/C 1 68 3 71 31.584144969712 1.60658183957153 29.9775631301404 C:G G C 10 0.535527279857177 2.99736000556097e-15 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 32 45 77 14.8631270445703 24.098727593573 -9.23560054900263 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0394356223452479 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 27 22 49 12.5407634438562 11.7816001568579 0.759163286998328 T:G T G 10 0.535527279857177 0.886656178938017 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 84792371 C/G 1 51 32 83 23.688108727284 17.1368729554297 6.55123577185431 A:C:G C G 10 0.535527279857177 0.154229549433824 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84792322_84792413:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84792322_84792413:USP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 49 55 104 22.7591632869983 29.4540003921447 -6.6948371051464 A:G A G 10 0.535527279857177 0.201746557522122 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 85690900 G/A 1 6 11 17 2.78683632085694 5.89080007842895 -3.10396375757201 A:G G A 10 0.535527279857177 0.149487157554358 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85690883_85691210:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85690883_85691210:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85690883_85691210:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85690883_85691210:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85690883_85691210:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85690883_85691210:KIAA0182 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 85695298 C/T 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 T:C C T 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85694752_85695371:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000479488:exon_85695096_85695371:KIAA0182 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 85711860 C/T 1 158 102 260 73.386689782566 54.6237825454321 18.762907237134 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0212854721617429 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 85722496 A/C 1 12 17 29 5.57367264171388 9.10396375757201 -3.53029111585813 A:C A C 10 0.535527279857177 0.197981940147675 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85722415_85722605:GINS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 87795580 G/C 1 42 40 82 19.5078542459986 21.4210911942871 -1.91323694828851 C:G G C 10 0.535527279857177 0.74003068063274 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87795555_87795646:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87795555_87795646:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87795555_87795646:KLHDC4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 88052161 C/A 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88052034_88052273:BANP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 88061150 C/T 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 T:C C T 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88061089_88061256:BANP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 88600792 C/T 1 21 11 32 9.75392712299928 5.89080007842895 3.86312704457034 T:C C T 10 0.535527279857177 0.214818527860921 ENSG00000179588:ENST00000319555:exon_88599556_88601389:ZFPM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 88713236 A/G 1 679 724 1403 315.376976976977 387.721750616596 -72.3447736396193 A:C:G A G 10 0.535527279857177 0.000114833832637120 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88713163_88713246:CYBA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 88713473 G/A 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 A:G G A 10 0.535527279857177 0.732042892054444 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 88763958 G/A 1 12 13 25 5.57367264171388 6.9618546381433 -1.38818199642942 A:G G A 10 0.535527279857177 0.689410637065013 ENSG00000158717:ENST00000312838:exon_88762903_88764041:RNF166 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 88779132 C/T 1 28 17 45 13.005236163999 9.10396375757201 3.90127240642704 T:C C T 10 0.535527279857177 0.29573371832178 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779030_88779313:CTU2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 88779753 C/T 1 25 27 52 11.6118180035706 14.4592365561438 -2.8474185525732 T:C C T 10 0.535527279857177 0.487587224252618 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 88780090 G/A 1 24 25 49 11.1473452834278 13.3881819964294 -2.24083671300167 A:G G A 10 0.535527279857177 0.567987817021846 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780055_88780186:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780055_88780186:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780055_88780186:CTU2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 88781614 G/C 1 46 38 84 21.3657451265699 20.3500366345727 1.01570849199713 C:G G C 10 0.535527279857177 0.912982373264668 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000103335:ENST00000301015:exon_88781588_88782262:FAM38A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 88871908 A/G 1 52 45 97 24.1525814474268 24.098727593573 0.053853853853834 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88871848_88872045:CDT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 58 64 122 26.9394177682837 34.2737459108593 -7.33432814257559 A:G A G 10 0.535527279857177 0.203801181325153 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 88874545 G/T 1 90 70 160 41.8025448128541 37.4869095900024 4.31563522285168 T:G G T 10 0.535527279857177 0.526409170360109 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 88874632 C/G 1 89 86 175 41.3380720927113 46.0553460677172 -4.71727397500597 A:C:G C G 10 0.535527279857177 0.495623174616154 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89167140 G/C 1 12 9 21 5.57367264171388 4.81974551871459 0.753927122999285 C:G G C 10 0.535527279857177 0.828752253980847 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89180883 G/A 1 30 30 60 13.9341816042847 16.0658183957153 -2.13163679143062 A:G G A 10 0.535527279857177 0.606380470736746 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89199651 G/A 1 23 26 49 10.6828725632849 13.9237092762866 -3.24083671300167 A:G G A 10 0.535527279857177 0.391420756130833 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89199544_89199670:ACSF3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89294595 C/T 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89349788 T/C 1 96 77 173 44.589381133711 41.2356005490026 3.35378058470839 T:C T C 10 0.535527279857177 0.647681364514119 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89349769_89349933:ANKRD11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89617008 C/T 1 24 30 54 11.1473452834278 16.0658183957153 -4.91847311228755 T:C C T 10 0.535527279857177 0.219206800250926 ENSG00000197912:ENST00000268704:exon_89616902_89617017:SPG7;ENSG00000197912:ENST00000312613:exon_89617008_89617017:SPG7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89620302 G/A 1 22 23 45 10.2183998431421 12.3171274367151 -2.09872759357296 A:G G A 10 0.535527279857177 0.552857972870736 ENSG00000197912:ENST00000268704:exon_89620202_89620368:SPG7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89627460 T/G 1 2463 2064 4527 1143.99630971177 1105.32830562521 38.6680040865599 T:G T G 10 0.535527279857177 0.251272472375694 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627119_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89627671 C/T 1 4134 3764 7898 1920.13022507043 2015.72468138241 -95.5944563119835 A:T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.0311915414926631 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89662990 T/C 1 14 10 24 6.50261808199952 5.35527279857177 1.14734528342775 T:C T C 10 0.535527279857177 0.686885042146951 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89663072 G/A 1 28 14 42 13.005236163999 7.49738191800048 5.50785424599857 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0913651691347858 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89760652 C/T 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 T:C C T 10 0.535527279857177 1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89764549 G/A 1 1 9 10 0.464472720142823 4.81974551871459 -4.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00779531985117688 ENSG00000158792:ENST00000289805:exon_89762751_89764713:SPATA2L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89777761 C/T 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 T:C C T 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000075399:ENST00000389386:exon_89777735_89777820:C16orf7;ENSG00000075399:ENST00000261625:exon_89777735_89777820:C16orf7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89805261 A/G 1 13 11 24 6.0381453618567 5.89080007842895 0.147345283427753 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 89849480 C/T 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:C C T 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89849415_89849510:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89849415_89849510:FANCA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 90102835 A/G 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 A:G A G 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90102789_90102994:GAS8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 16 90109711 A/G 1 15 14 29 6.96709080214235 7.49738191800048 -0.530291115858132 A:G A G 10 0.535527279857177 0.854578961351753 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90109604_90111383:GAS8;ENSG00000222019:ENST00000517889:exon_90109310_90110397:AC133919.6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 263475 G/A 1 1 7 8 0.464472720142823 3.74869095900024 -3.28421823885742 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0289107709309061 ENSG00000187624:ENST00000360127:exon_262939_264367:C17orf97 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 20 11 31 9.28945440285646 5.89080007842895 3.39865432442751 A:G G A 10 0.535527279857177 0.280261422723049 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 526907 G/T 1 2 7 9 0.928945440285646 3.74869095900024 -2.81974551871459 T:G G T 10 0.535527279857177 0.0914963800425486 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_526773_526914:VPS53 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 649703 T/C 1 28 36 64 13.005236163999 19.2789820748584 -6.27374591085932 T:C T C 10 0.535527279857177 0.132561325639626 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 49 52 101 22.7591632869983 27.8474185525732 -5.08825526557487 T:C T C 10 0.535527279857177 0.319935597784898 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 1377943 A/G 1 50 46 96 23.2236360071412 24.6342548734301 -1.41061886628899 A:G A G 10 0.535527279857177 0.83799428017881 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1377904_1377984:MYO1C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 1383893 G/A 1 30 26 56 13.9341816042847 13.9237092762866 0.0104723279980892 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1383821_1383919:MYO1C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 1387472 C/T 1 20 15 35 9.28945440285646 8.03290919785765 1.25654520499881 T:C C T 10 0.535527279857177 0.736332608702484 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1387442_1387597:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1387442_1387597:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1387442_1387597:MYO1C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 1494567 G/A 1 17 18 35 7.89603624242799 9.63949103742918 -1.74345479500119 A:G G A 10 0.535527279857177 0.612839258964269 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 1542153 G/A 1 8 3 11 3.71578176114258 1.60658183957153 2.10919992157105 A:G G A 10 0.535527279857177 0.23951309450586 ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1542100_1542220:SCARF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 1542190 G/A 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 A:G G A 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1542100_1542220:SCARF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 1578939 C/T 1 30 51 81 13.9341816042847 27.311891272716 -13.3777096684313 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00353923233935141 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1578914_1579106:PRPF8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 1580929 G/C 1 12 6 18 5.57367264171388 3.21316367914306 2.36050896257082 C:G G C 10 0.535527279857177 0.346375041233422 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1580859_1580988:PRPF8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 1584324 A/G 1 17 22 39 7.89603624242799 11.7816001568579 -3.8855639144299 A:G A G 10 0.535527279857177 0.261075612401984 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1584223_1584348:PRPF8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 1585130 A/G 1 15 12 27 6.96709080214235 6.42632735828612 0.540763443856222 A:G A G 10 0.535527279857177 0.850128429900867 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1585114_1585332:PRPF8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 1637126 G/A 1 11 15 26 5.10919992157105 8.03290919785765 -2.9237092762866 A:G G A 10 0.535527279857177 0.325768302416207 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 2585113 C/T 1 99 69 168 45.9827992941395 36.9513823101452 9.03141698399427 T:C C T 10 0.535527279857177 0.164815068926057 ENSG00000007168:ENST00000397195:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000451360:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000006951:exon_2585023_2585201:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000397193:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 40 39 79 18.5789088057129 20.8855639144299 -2.30665510871698 A:G G A 10 0.535527279857177 0.652345298867404 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 3564068 G/A 1 8 1 9 3.71578176114258 0.535527279857177 3.18025448128541 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0433473902079845 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 3564073 A/G 1 9 1 10 4.18025448128541 0.535527279857177 3.64472720142823 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0246218512642377 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 3564084 T/C 0 9 0 9 4.18025448128541 0 4.18025448128541 T T 10 0.535527279857177 0.00462881858371194 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 3583051 G/A 1 36 41 77 16.7210179251416 21.9566184741443 -5.23560054900263 A:G G A 10 0.535527279857177 0.253824262879907 ENSG00000083454:ENST00000381833:exon_3582884_3583078:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000435558:exon_3582884_3583078:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3582884_3583078:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000345901:exon_3582884_3583078:P2RX5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 3627473 C/T 1 5 10 15 2.32236360071412 5.35527279857177 -3.03290919785765 T:C C T 10 0.535527279857177 0.128132638231981 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 3628212 T/C 1 9 9 18 4.18025448128541 4.81974551871459 -0.639491037429185 T:C T C 10 0.535527279857177 0.816111256590493 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 3628362 T/C 1 14 17 31 6.50261808199952 9.10396375757201 -2.60134567557249 T:C T C 10 0.535527279857177 0.372478400047806 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 3832733 C/T 1 16 16 32 7.43156352228517 8.56843647771483 -1.13687295542966 T:C C T 10 0.535527279857177 0.725380877409574 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3832622_3832739:ATP2A3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 3833680 C/T 1 15 18 33 6.96709080214235 9.63949103742918 -2.67240023528684 T:C C T 10 0.535527279857177 0.385781280718001 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3833595_3833728:ATP2A3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 3845927 A/G 1 11 17 28 5.10919992157105 9.10396375757201 -3.99476383600096 A:G A G 10 0.535527279857177 0.134938635465867 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3845900_3846025:ATP2A3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 3850910 A/G 1 14 14 28 6.50261808199952 7.49738191800048 -0.994763836000955 A:G A G 10 0.535527279857177 0.709830757062613 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3850685_3851149:ATP2A3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 3916823 G/A 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 A:G G A 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3916743_3916908:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000414864:exon_3916743_3916908:ZZEF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 3920884 C/T 1 5 12 17 2.32236360071412 6.42632735828612 -4.10396375757201 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0531197569251145 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3920665_3921024:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000414864:exon_3920665_3921024:ZZEF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 3920977 C/T 1 11 13 24 5.10919992157105 6.9618546381433 -1.85265471657225 T:C C T 10 0.535527279857177 0.540640797126488 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3920665_3921024:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000414864:exon_3920665_3921024:ZZEF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 3924566 C/T 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 T:C C T 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3924423_3924614:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000414864:exon_3924423_3924614:ZZEF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4442818 G/A 1 89 95 184 41.3380720927113 50.8750915864318 -9.53701949372056 A:G G A 10 0.535527279857177 0.160984946278418 ENSG00000183018:ENST00000329078:exon_4440748_4443228:SPNS2;ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4442734_4443262:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4442199_4443262:MYBBP1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4448167 A/G 1 41 24 65 19.0433815258557 12.8526547165722 6.1907268092835 A:G A G 10 0.535527279857177 0.136257411439506 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4448046_4448216:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4448046_4448216:MYBBP1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4448590 C/T 1 42 44 86 19.5078542459986 23.5632003137158 -4.05534606771722 T:C C T 10 0.535527279857177 0.389161911173514 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4448554_4448640:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4448554_4448640:MYBBP1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4451576 T/C 1 43 24 67 19.9723269661414 12.8526547165722 7.11967224956915 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0870068749642337 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4451438_4451605:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4451438_4451605:MYBBP1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4453508 C/T 1 24 8 32 11.1473452834278 4.28421823885742 6.86312704457034 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0198216849836699 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4453353_4453648:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4453353_4453648:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4453353_4453648:MYBBP1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4457571 C/T 1 20 24 44 9.28945440285646 12.8526547165722 -3.56320031371579 T:C C T 10 0.535527279857177 0.293725279448287 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4457490_4457573:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4457490_4457573:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4457490_4457573:MYBBP1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4458598 G/C 1 18 21 39 8.36050896257082 11.2460728770007 -2.8855639144299 C:G G C 10 0.535527279857177 0.422707679943069 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4458422_4458681:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4458422_4458679:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4458422_4458681:MYBBP1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4575283 A/G 1 229 224 453 106.364252912706 119.958110688008 -13.5938577753012 A:G A G 10 0.535527279857177 0.203700788813714 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4575910 G/A 1 83 64 147 38.5512357718543 34.2737459108593 4.27748986099498 A:G G A 10 0.535527279857177 0.508793432345147 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4575409_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4576620 C/T 1 83 82 165 38.5512357718543 43.9132369482885 -5.36200117643421 T:C C T 10 0.535527279857177 0.435267779749549 ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4576545_4576751:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4576545_4576751:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4576545_4576751:PELP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4607350 G/T 1 8 15 23 3.71578176114258 8.03290919785765 -4.31712743671507 T:G G T 10 0.535527279857177 0.0932088331135184 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4607158_4607632:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4607158_4607632:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4607158_4607632:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4607158_4607632:PELP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4622638 C/T 1 46 29 75 21.3657451265699 15.5302911158581 5.83545401071173 T:C C T 10 0.535527279857177 0.202958893529278 ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4622578_4622715:ARRB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4699552 G/A 1 57 41 98 26.4749450481409 21.9566184741443 4.51832657399666 A:G G A 10 0.535527279857177 0.417976401615265 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4699439_4699591:PSMB6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4720469 C/T 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4720441_4720554:PLD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4790953 A/G 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 A:G A G 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4790875_4791085:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4790875_4791085:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4790875_4791085:MINK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4851714 G/A 1 3821 3563 7384 1774.75026366573 1908.08369813112 -133.333434465395 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.00191160277657547 ENSG00000108518:ENST00000225655:exon_4851558_4852309:PFN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4893461 A/G 1 8 5 13 3.71578176114258 2.67763639928588 1.0381453618567 A:G A G 10 0.535527279857177 0.593586480755975 ENSG00000196388:ENST00000355025:exon_4893447_4893560:INCA1;ENSG00000196388:ENST00000396829:exon_4893447_4893560:INCA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4926780 T/C 1 67 59 126 31.1196722495691 31.5961095115734 -0.4764372620043 T:C T C 10 0.535527279857177 0.929147055314262 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4926882 A/G 1 57 50 107 26.4749450481409 26.7763639928588 -0.301418944717934 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 4927121 G/A 1 110 113 223 51.0919992157105 60.514582623861 -9.42258340815046 A:G G A 10 0.535527279857177 0.226815503337868 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 5286525 C/G 1 21 20 41 9.75392712299928 10.7105455971435 -0.956618474144255 C:G C G 10 0.535527279857177 0.875832794765671 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5286417_5286912:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5286417_5286912:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5286417_5286720:RABEP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 268 271 539 124.478688998277 145.127892841295 -20.6492038430184 A:T:C:G A G 10 0.535527279857177 0.0766867394596928 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 110 83 193 51.0919992157105 44.4487642281457 6.64323498756485 T:C C T 10 0.535527279857177 0.348929655235151 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 75 79 154 34.8354540107117 42.306655108717 -7.47120109800525 A:T:C:G C G 10 0.535527279857177 0.257974587048008 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 15 27 42 6.96709080214235 14.4592365561438 -7.49214575400143 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0290921370195399 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 6483046 T/C 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 T:C T C 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6481646_6483184:KIAA0753 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 6493198 T/C 1 10 5 15 4.64472720142823 2.67763639928588 1.96709080214235 T:C T C 10 0.535527279857177 0.438857166783305 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6493099_6493323:KIAA0753 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 6511781 A/G 1 1 7 8 0.464472720142823 3.74869095900024 -3.28421823885742 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0289107709309061 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6511668_6511784:KIAA0753 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 6538355 G/A 1 9 2 11 4.18025448128541 1.07105455971435 3.10919992157105 A:G G A 10 0.535527279857177 0.072775715286889 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6538331_6538491:KIAA0753 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 6919093 T/C 1 435 292 727 202.045633262128 156.373965718296 45.6716675438323 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.000706189763421211 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6919093_6919194:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6919093_6919194:C17orf49 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 6943266 G/A 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6943082_6943438:SLC16A13 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7126173 A/G 1 107 75 182 49.6985810552821 40.1645459892883 9.53403506599379 A:G A G 10 0.535527279857177 0.158823426566393 ENSG00000072778:ENST00000356839:exon_7125986_7126184:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000322910:exon_7125986_7126184:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000350303:exon_7125986_7126184:ACADVL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 25 18 43 11.6118180035706 9.63949103742918 1.97232696614139 T:C C T 10 0.535527279857177 0.647051402978065 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7144182 G/A 1 597 561 1158 277.290213925265 300.430803999876 -23.1405900746109 A:T:C:G G A 10 0.535527279857177 0.175417305437459 ENSG00000170296:ENST00000302386:exon_7143333_7144238:GABARAP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7210352 G/C 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 C:G G C 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000132507:ENST00000336452:exon_7210318_7210434:EIF5A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7214824 C/T 1 15 13 28 6.96709080214235 6.9618546381433 0.00523616399904459 T:C C T 10 0.535527279857177 1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7216763 C/T 1 106 108 214 49.2341083351392 57.8369462245751 -8.60283788943588 T:C C T 10 0.535527279857177 0.244564583645379 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7216699_7216788:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7216699_7216788:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7216699_7216788:GPS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7217463 T/C 1 68 50 118 31.584144969712 26.7763639928588 4.80778097685312 T:C T C 10 0.535527279857177 0.406674562064737 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7217399_7217478:GPS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7221385 G/A 1 25 19 44 11.6118180035706 10.1750183172864 1.43679968628421 A:G G A 10 0.535527279857177 0.762943886028215 ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7221384_7221491:GPS2;ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7221384_7221491:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7221384_7221491:NEURL4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7222471 G/A 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7222369_7222527:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7222369_7222527:NEURL4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7245371 A/G 1 86 83 169 39.9446539322828 44.4487642281457 -4.50411029586291 A:G A G 10 0.535527279857177 0.488871571896874 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7245267_7245386:ACAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7251605 G/C 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 C:G G C 10 0.535527279857177 0.809233970242324 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7293715 C/T 1 39 37 76 18.1144360855701 19.8145093547155 -1.70007326914545 T:C C T 10 0.535527279857177 0.730826774496964 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7293055_7293760:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7293055_7293760:PLSCR3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7579472 G/C 1 99 94 193 45.9827992941395 50.3395643065746 -4.35676501243515 C:G G C 10 0.535527279857177 0.563889148643142 ENSG00000141510:ENST00000413465:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000269305:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000455263:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000420246:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000445888:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000419024:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000359597:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000505014:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000414315:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000508793:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000503591:exon_7579312_7579590:TP53 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7606722 C/G 1 16 6 22 7.43156352228517 3.21316367914306 4.21839984314211 C:G C G 10 0.535527279857177 0.08728031897682 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7751778 G/A 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 A:G G A 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7754993 G/A 1 20 15 35 9.28945440285646 8.03290919785765 1.25654520499881 A:G G A 10 0.535527279857177 0.736332608702484 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7754966_7755114:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7754966_7755114:KDM6B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 247 245 492 114.724761875277 131.204183565008 -16.4794216897311 A:G G A 10 0.535527279857177 0.148008826207820 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 90 77 167 41.8025448128541 41.2356005490026 0.566944263851447 A:G A G 10 0.535527279857177 0.938355836463737 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7843053 C/T 1 19 20 39 8.82498168271364 10.7105455971435 -1.8855639144299 T:C C T 10 0.535527279857177 0.630776619558793 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000419170:exon_7842831_7843067:CNTROB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7847955 C/A 1 38 35 73 17.6499633654273 18.7434547950012 -1.09349142957392 A:C C A 10 0.535527279857177 0.815340843997364 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7847794_7847956:CNTROB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 7849087 C/G 1 36 31 67 16.7210179251416 16.6013456755725 0.119672249569145 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7849046_7849304:CNTROB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8025712 A/G 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 A:G A G 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000179111:ENST00000317814:exon_8025661_8025748:HES7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8046664 C/T 1 16 7 23 7.43156352228517 3.74869095900024 3.68287256328493 T:C C T 10 0.535527279857177 0.145529269824070 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8046584_8047194:PER1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8046680 G/A 1 19 5 24 8.82498168271364 2.67763639928588 6.14734528342775 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0131192891058497 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8046584_8047194:PER1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8046737 C/T 1 16 10 26 7.43156352228517 5.35527279857177 2.0762907237134 T:C C T 10 0.535527279857177 0.439359348031197 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8046584_8047194:PER1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8048139 G/A 1 13 14 27 6.0381453618567 7.49738191800048 -1.45923655614378 A:G G A 10 0.535527279857177 0.700369496789269 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8048169 T/C 1 13 12 25 6.0381453618567 6.42632735828612 -0.388181996429424 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8048283 G/A 1 17 15 32 7.89603624242799 8.03290919785765 -0.136872955429662 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8053344 G/A 1 11 6 17 5.10919992157105 3.21316367914306 1.89603624242799 A:G G A 10 0.535527279857177 0.467819685510286 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8053289_8053443:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8053289_8053443:PER1;ENSG00000179094:ENST00000413754:exon_8053289_8053443:PER1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8064083 T/G 1 72 55 127 33.4420358502833 29.4540003921447 3.98803545813853 T:G T G 10 0.535527279857177 0.53363993310323 ENSG00000220205:ENST00000316509:exon_8062467_8064189:VAMP2;ENSG00000220205:ENST00000404970:exon_8063724_8064842:VAMP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8076778 C/T 1 7 7 14 3.25130904099976 3.74869095900024 -0.497381918000477 T:C C T 10 0.535527279857177 0.796028545675074 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8092694 T/G 1 7 11 18 3.25130904099976 5.89080007842895 -2.63949103742919 T:G T G 10 0.535527279857177 0.242667099484109 ENSG00000196544:ENST00000389017:exon_8091652_8093564:C17orf59;ENSG00000196544:ENST00000357939:exon_8092385_8093056:C17orf59 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8108331 A/G 1 261 126 387 121.227379957277 67.4764372620043 53.7509426952725 A:G A G 10 0.535527279857177 3.12011261386373e-08 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 273 127 400 126.801052598991 68.0119645418615 58.7890880571292 A:G G A 10 0.535527279857177 2.5980659379732e-09 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8132763 T/C 1 22 26 48 10.2183998431421 13.9237092762866 -3.70530943314449 T:C T C 10 0.535527279857177 0.31255756362317 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8132620_8132764:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8132620_8132764:C17orf68 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8135444 C/G 1 13 11 24 6.0381453618567 5.89080007842895 0.147345283427753 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8135221_8135545:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8135221_8135545:C17orf68 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8138569 C/G 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 C:G C G 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8138371_8138603:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8138371_8138603:C17orf68 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8157310 C/T 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8157177_8157397:PFAS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8166458 T/A 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 A:T T A 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8166427_8166583:PFAS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8166498 G/A 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:G G A 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8166427_8166583:PFAS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8167600 T/C 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:C T C 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8167530_8167655:PFAS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8168224 T/C 1 7 7 14 3.25130904099976 3.74869095900024 -0.497381918000477 T:C T C 10 0.535527279857177 0.796028545675074 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8168213_8168443:PFAS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 8192922 C/T 1 47 31 78 21.8302178467127 16.6013456755725 5.2288721711402 T:C C T 10 0.535527279857177 0.257204034874009 ENSG00000125434:ENST00000312524:exon_8192892_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000396278:exon_8192892_8192961:SLC25A35 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 9471711 T/G 1 25 18 43 11.6118180035706 9.63949103742918 1.97232696614139 T:G T G 10 0.535527279857177 0.647051402978065 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9471688_9471787:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9471688_9471787:STX8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 36 34 70 16.7210179251416 18.207927515144 -1.48690959000239 A:G A G 10 0.535527279857177 0.721265385689723 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 12899902 C/T 1 42 41 83 19.5078542459986 21.9566184741443 -2.44876422814569 T:C C T 10 0.535527279857177 0.66007369017847 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 12899963 T/C 1 25 22 47 11.6118180035706 11.7816001568579 -0.169782153287317 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 12915009 G/A 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 A:G G A 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12914980_12915099:ELAC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 10 5 15 4.64472720142823 2.67763639928588 1.96709080214235 A:G G A 10 0.535527279857177 0.438857166783305 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 16342833 T/C 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 T:C T C 10 0.535527279857177 0.633274593383561 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 T:C T C 10 0.535527279857177 0.189602051724503 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 57 52 109 26.4749450481409 27.8474185525732 -1.37247350443229 A:G G A 10 0.535527279857177 0.84783588884692 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 17997209 G/A 1 12 15 27 5.57367264171388 8.03290919785765 -2.45923655614378 A:G G A 10 0.535527279857177 0.440881434887102 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000473213:exon_17997127_17997594:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000496428:exon_17997127_17997282:DRG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 18881683 G/A 0 16 0 16 7.43156352228517 0 7.43156352228517 G G 10 0.535527279857177 5.04541196526414e-05 ENSG00000188522:ENST00000388995:exon_18880897_18882163:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000345041:exon_18880897_18882163:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000399096:exon_18877220_18882986:FAM83G HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 19812541 T/C 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 T:C T C 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19812494_19812589:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19812494_19812589:AKAP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 20108184 C/G 1 10 14 24 4.64472720142823 7.49738191800048 -2.85265471657225 C:G C G 10 0.535527279857177 0.306793066047406 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 20108239 A/T 1 13 8 21 6.0381453618567 4.28421823885742 1.75392712299928 A:T A T 10 0.535527279857177 0.515688372849167 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 20163529 A/G 1 8 7 15 3.71578176114258 3.74869095900024 -0.0329091978576543 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20163505_20163607:SPECC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 20922410 C/T 1 12 9 21 5.57367264171388 4.81974551871459 0.753927122999285 T:C C T 10 0.535527279857177 0.828752253980847 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20922397_20922498:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20922397_20922498:USP22;ENSG00000124422:ENST00000476111:exon_20922397_20922498:USP22 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 20924523 G/A 1 5 11 16 2.32236360071412 5.89080007842895 -3.56843647771483 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0832488497756866 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000476111:exon_20924426_20924539:USP22 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 58 0 58 26.9394177682837 0 26.9394177682837 T T 10 0.535527279857177 2.95272911009694e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 52 0 52 24.1525814474268 0 24.1525814474268 T T 10 0.535527279857177 8.17517031824912e-15 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 46 0 46 21.3657451265699 0 21.3657451265699 G G 10 0.535527279857177 3.60033153463687e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 47 0 47 21.8302178467127 0 21.8302178467127 G G 10 0.535527279857177 1.91225539243665e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 47 0 47 21.8302178467127 0 21.8302178467127 C C 10 0.535527279857177 1.91225539243665e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 71 0 71 32.9775631301404 0 32.9775631301404 C C 10 0.535527279857177 6.30521889971826e-20 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 66 0 66 30.6551995294263 0 30.6551995294263 C C 10 0.535527279857177 1.56394220699736e-18 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 46 0 46 21.3657451265699 0 21.3657451265699 C C 10 0.535527279857177 3.60033153463687e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 58 0 58 26.9394177682837 0 26.9394177682837 C C 10 0.535527279857177 2.95272911009694e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 68 0 68 31.584144969712 0 31.584144969712 G G 10 0.535527279857177 4.30804314101332e-19 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 129 0 129 59.9169808984242 0 59.9169808984242 G G 10 0.535527279857177 1.24822349228541e-35 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 25909850 G/T 1 10 4 14 4.64472720142823 2.14210911942871 2.50261808199952 T:G G T 10 0.535527279857177 0.283628757254846 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 90 72 162 41.8025448128541 38.5579641497167 3.24458066313733 A:G G A 10 0.535527279857177 0.636978579790435 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 10 17 27 4.64472720142823 9.10396375757201 -4.45923655614378 A:G G A 10 0.535527279857177 0.121116362653133 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 25974258 T/C 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:C T C 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000168961:ENST00000486774:exon_25974056_25974458:LGALS9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 26874314 G/A 1 106 122 228 49.2341083351392 65.3343281425756 -16.1002198074363 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0336610138541945 ENSG00000109103:ENST00000335765:exon_26873725_26874427:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000484980:exon_26873726_26874427:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000301032:exon_26873726_26874867:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000470125:exon_26873729_26874867:UNC119 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 27225586 A/T 1 10 11 21 4.64472720142823 5.89080007842895 -1.24607287700072 A:T A T 10 0.535527279857177 0.664214712035953 ENSG00000167536:ENST00000378895:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000394901:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000426464:exon_27224801_27225910:DHRS13 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 21 22 43 9.75392712299928 11.7816001568579 -2.02767303385861 T:C C T 10 0.535527279857177 0.544961274289938 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 27441077 C/G 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 C:G C G 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533399:exon_27441029_27441286:MYO18A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 27889643 C/T 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 T:C C T 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 27889986 T/C 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 29111125 T/G 1 15 8 23 6.96709080214235 4.28421823885742 2.68287256328493 T:G T G 10 0.535527279857177 0.300673562790689 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 29111368 A/G 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 A:G A G 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 29113016 A/G 1 7 12 19 3.25130904099976 6.42632735828612 -3.17501831728636 A:G A G 10 0.535527279857177 0.170306763434808 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29112937_29113049:CRLF3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 29161845 G/A 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 A:G G A 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 29162173 T/C 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 T:C T C 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 29214387 T/C 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 T:C T C 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29214210_29214390:ATAD5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 29226228 T/C 1 15 21 36 6.96709080214235 11.2460728770007 -4.27898207485837 T:C T C 10 0.535527279857177 0.181555592466634 ENSG00000172171:ENST00000306049:exon_29226001_29226624:C17orf42 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 33288582 C/G 1 14 10 24 6.50261808199952 5.35527279857177 1.14734528342775 C:G C G 10 0.535527279857177 0.686885042146951 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 33289046 G/C 1 24 27 51 11.1473452834278 14.4592365561438 -3.31189127271603 C:G G C 10 0.535527279857177 0.400324885410726 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 33680060 C/T 1 12 6 18 5.57367264171388 3.21316367914306 2.36050896257082 T:C C T 10 0.535527279857177 0.346375041233422 ENSG00000172716:ENST00000308377:exon_33677324_33680158:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000394566:exon_33677324_33680158:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000321335:exon_33677324_33680158:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000442678:exon_33677331_33680158:SLFN11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 33749546 A/G 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:G A G 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 33998802 G/C 1 11 18 29 5.10919992157105 9.63949103742918 -4.53029111585813 C:G G C 10 0.535527279857177 0.097130117980667 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 34416063 C/A 1 729 462 1191 338.600612984118 247.413603294016 91.1870096901023 A:C C A 10 0.535527279857177 1.17616240081553e-07 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34415602_34416108:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34415602_34416108:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34415605_34416108:CCL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 34416537 G/A 1 1049 812 1861 487.231883429821 434.848151244028 52.3837321857937 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.0156312183422203 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 34432581 T/C 1 8 2 10 3.71578176114258 1.07105455971435 2.64472720142823 T:C T C 10 0.535527279857177 0.118249545982972 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 34432586 A/G 1 9 2 11 4.18025448128541 1.07105455971435 3.10919992157105 A:G A G 10 0.535527279857177 0.072775715286889 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 34432663 A/G 1 588 273 861 273.10995944398 146.198947401009 126.911012042971 A:C:G A G 10 0.535527279857177 1.67849262884615e-18 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 34432664 T/A 1 594 273 867 275.896795764837 146.198947401009 129.697848363828 A:T:C T A 10 0.535527279857177 3.47391891400745e-19 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 35771468 C/T 1 6 12 18 2.78683632085694 6.42632735828612 -3.63949103742918 T:C C T 10 0.535527279857177 0.100224935165788 ENSG00000108264:ENST00000394395:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000490992:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000225396:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000417170:exon_35771356_35771477:TADA2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 36873149 C/T 1 8 2 10 3.71578176114258 1.07105455971435 2.64472720142823 T:C C T 10 0.535527279857177 0.118249545982972 ENSG00000108292:ENST00000325718:exon_36872620_36873234:MLLT6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 37334243 G/A 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:G G A 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000067191:ENST00000394303:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000344140:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000394310:exon_37334237_37334332:CACNB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 37814080 G/A 1 18 10 28 8.36050896257082 5.35527279857177 3.00523616399905 A:G G A 10 0.535527279857177 0.343681705337631 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000484773:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000443521:exon_37814028_37814105:STARD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 38146154 T/C 1 174 183 357 80.8182533048512 98.0014922138634 -17.1832389090122 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0712384840247567 ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38145992_38146182:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38145992_38146182:PSMD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 38175866 G/A 1 68 71 139 31.584144969712 38.0224368698596 -6.43829190014759 A:G G A 10 0.535527279857177 0.307530089240734 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000476821:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38175351_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38175355_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38175361_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000491466:exon_38175398_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000422942:exon_38175756_38175898:MED24 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 38186106 C/T 1 13 17 30 6.0381453618567 9.10396375757201 -3.06581839571531 T:C C T 10 0.535527279857177 0.277280147402981 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38186001_38186112:MED24 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 38285677 G/A 1 66 53 119 30.6551995294263 28.3829458324304 2.27225369699594 A:G G A 10 0.535527279857177 0.713645134115867 ENSG00000188895:ENST00000339569:exon_38285498_38285880:MSL1;ENSG00000188895:ENST00000398532:exon_38285498_38285880:MSL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 38991003 T/C 1 9 18 27 4.18025448128541 9.63949103742918 -5.45923655614378 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0516486930322632 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 38991052 T/G 1 22 7 29 10.2183998431421 3.74869095900024 6.46970888414187 T:G T G 10 0.535527279857177 0.0158119099475805 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 38991053 T/A 1 21 7 28 9.75392712299928 3.74869095900024 6.00523616399905 A:T T A 10 0.535527279857177 0.0234404287532799 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 39912145 T/A 1 38 5 43 17.6499633654273 2.67763639928588 14.9723269661414 A:T T A 10 0.535527279857177 1.69493916468494e-06 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39910856_39912147:JUP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 39983849 G/C 1 46 16 62 21.3657451265699 8.56843647771483 12.797308648855 C:G G C 10 0.535527279857177 0.00126671838719609 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 40049320 C/T 1 37 22 59 17.1854906452845 11.7816001568579 5.40389048842656 T:C C T 10 0.535527279857177 0.191569443210057 ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40049286_40049427:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40049286_40049427:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40049286_40049427:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40049286_40049427:ACLY HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 40125864 G/A 1 62 74 136 28.797308648855 39.6290187094311 -10.8317100605761 A:G G A 10 0.535527279857177 0.07075350742633 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 40695470 G/A 1 29 38 67 13.4697088841419 20.3500366345727 -6.88032775043086 A:G G A 10 0.535527279857177 0.110777692059768 ENSG00000108784:ENST00000225927:exon_40695046_40696464:NAGLU;ENSG00000108784:ENST00000377405:exon_40695046_40696464:NAGLU HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 40696233 C/G 1 36 16 52 16.7210179251416 8.56843647771483 8.1525814474268 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0257641080136747 ENSG00000108784:ENST00000225927:exon_40695046_40696464:NAGLU;ENSG00000108784:ENST00000377405:exon_40695046_40696464:NAGLU HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 40722162 G/A 1 50 56 106 23.2236360071412 29.9895276720019 -6.76589166486076 A:G G A 10 0.535527279857177 0.205744760569411 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000429573:exon_40722115_40722201:MLX HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 40832447 G/T 1 81 67 148 37.6222903315687 35.8803277504309 1.74196258113781 T:G G T 10 0.535527279857177 0.80505721029761 ENSG00000184451:ENST00000332438:exon_40830907_40832635:CCR10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 40931054 T/C 1 116 101 217 53.8788355365675 54.0882552655749 -0.209419729007401 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40930975_40931616:VPS25 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 41165262 G/A 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 T:C T C 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 41244524 C/T 1 7 8 15 3.25130904099976 4.28421823885742 -1.03290919785765 T:C C T 10 0.535527279857177 0.614933682686176 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 41244815 T/C 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 T:C T C 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:G G A 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 41246567 T/C 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:C T C 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000470026:exon_41245601_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000477152:exon_41245603_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000492859:exon_41246129_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000497488:exon_41246129_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000494123:exon_41246129_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000473961:exon_41246187_41246877:BRCA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 41367866 T/A 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 A:T T A 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000184988:ENST00000331615:exon_41367807_41367960:TMEM106A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 41477710 A/G 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 A:G A G 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000175906:ENST00000320033:exon_41477029_41478503:ARL4D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 42225547 A/C 1 13 10 23 6.0381453618567 5.35527279857177 0.68287256328493 A:C A C 10 0.535527279857177 0.836716139403488 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42225226_42226395:C17orf53;ENSG00000125319:ENST00000245382:exon_42225226_42226395:C17orf53 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 16 13 29 7.43156352228517 6.9618546381433 0.469708884141868 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 42254281 A/G 1 7 11 18 3.25130904099976 5.89080007842895 -2.63949103742919 A:G A G 10 0.535527279857177 0.242667099484109 ENSG00000161664:ENST00000293414:exon_42254106_42254598:ASB16;ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 122 124 246 56.6656718574244 66.4053827022899 -9.73971084486553 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.224714227518022 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 42398052 A/G 1 106 106 212 49.2341083351392 56.7658916648608 -7.53178332972152 A:G A G 10 0.535527279857177 0.302582006435773 ENSG00000013306:ENST00000225308:exon_42397990_42398099:SLC25A39;ENSG00000013306:ENST00000377095:exon_42397990_42398099:SLC25A39 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 42398757 C/A 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 A:T:C C A 10 0.535527279857177 0.782354473542065 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 43176804 C/T 1 170 155 325 78.9603624242799 83.0067283778624 -4.04636595358251 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.656818509595479 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43176773_43176881:NMT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 173 180 353 80.3537805847084 96.3949103742919 -16.0411297895835 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0879616474783107 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 43316360 G/A 1 31 37 68 14.3986543244275 19.8145093547155 -5.41585503028803 A:G G A 10 0.535527279857177 0.223861697705708 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43316322_43316432:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43316322_43316432:FMNL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 43342141 G/C 1 15 9 24 6.96709080214235 4.81974551871459 2.14734528342775 C:G G C 10 0.535527279857177 0.419204092334723 ENSG00000006062:ENST00000344686:exon_43340488_43342167:MAP3K14;ENSG00000006062:ENST00000376926:exon_43340495_43342167:MAP3K14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 43472825 G/C 1 9 5 14 4.18025448128541 2.67763639928588 1.50261808199952 C:G G C 10 0.535527279857177 0.593847726273405 ENSG00000159314:ENST00000532038:exon_43471275_43472999:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000376922:exon_43471275_43472999:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000531735:exon_43471275_43472999:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000528384:exon_43472309_43472999:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000532891:exon_43472822_43472999:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000442348:exon_43472822_43472999:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000428638:exon_43472822_43472999:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000455881:exon_43472822_43472999:ARHGAP27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 45822499 G/A 1 22 23 45 10.2183998431421 12.3171274367151 -2.09872759357296 A:G G A 10 0.535527279857177 0.552857972870736 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45822114_45823485:TBX21 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 16 16 32 7.43156352228517 8.56843647771483 -1.13687295542966 T:C C T 10 0.535527279857177 0.725380877409574 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 45915395 T/C 1 13 14 27 6.0381453618567 7.49738191800048 -1.45923655614378 T:C T C 10 0.535527279857177 0.700369496789269 ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 46926615 G/A 1 161 114 275 74.7801079429945 61.0501099037182 13.7299980392763 A:G G A 10 0.535527279857177 0.102631512630814 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509415:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000505071:exon_46926614_46926631:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000502761:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46926614_46926739:CALCOCO2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 128 119 247 59.4525081782813 63.7277463030041 -4.27523812472271 A:C:G C G 10 0.535527279857177 0.610023510287908 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 47000251 C/T 1 62 42 104 28.797308648855 22.4921457540014 6.3051628948536 T:C C T 10 0.535527279857177 0.238391090356184 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 47293906 G/A 0 86 0 86 39.9446539322828 0 39.9446539322828 G G 10 0.535527279857177 8.4288030449856e-24 ENSG00000108798:ENST00000225941:exon_47293893_47294060:ABI3;ENSG00000108798:ENST00000419580:exon_47293893_47294042:ABI3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 47778793 C/T 1 36 12 48 16.7210179251416 6.42632735828612 10.2946905668555 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00337462137626224 ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47778305_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47778649_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47778682_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47778683_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508749:exon_47778690_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507477:exon_47778690_47780373:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47778701_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47778701_47778872:SLC35B1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 47788755 G/A 1 45 53 98 20.901272406427 28.3829458324304 -7.48167342600334 A:G G A 10 0.535527279857177 0.155886999490465 ENSG00000121104:ENST00000240364:exon_47787694_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000513602:exon_47788357_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000503573:exon_47788707_47788917:FAM117A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 48431032 G/A 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 A:G G A 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000509778:exon_48430991_48431035:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 48431197 C/T 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C C T 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 48432324 G/C 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 C:G G C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48432215_48432417:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48432215_48432417:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48432215_48432417:XYLT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 48455985 A/T 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 A:T A T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511519:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48455956_48456042:EME1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 48456193 T/C 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:C T C 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48456135_48456256:EME1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 48539035 T/C 1 18 15 33 8.36050896257082 8.03290919785765 0.327599764713161 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539018_48539047:ACSF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 48559559 A/G 1 8 3 11 3.71578176114258 1.60658183957153 2.10919992157105 A:G A G 10 0.535527279857177 0.23951309450586 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000515221:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000451010:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000504284:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000506211:exon_48559458_48559817:RSAD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 48629458 A/G 1 9 8 17 4.18025448128541 4.28421823885742 -0.103963757572008 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48629146_48629541:SPATA20 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 49052217 T/G 1 20 14 34 9.28945440285646 7.49738191800048 1.79207248485598 T:G T G 10 0.535527279857177 0.607875644967397 ENSG00000008294:ENST00000262013:exon_49052132_49052308:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357804:exon_49052132_49052308:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000376407:exon_49052132_49052308:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000510283:exon_49052132_49052308:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000505279:exon_49052132_49052308:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357122:exon_49052132_49052308:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000506500:exon_49052132_49052721:SPAG9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 53851228 C/T 1 14 11 25 6.50261808199952 5.89080007842895 0.611818003570576 T:C C T 10 0.535527279857177 0.84378896045112 ENSG00000141179:ENST00000268896:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000417982:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000325214:exon_53851085_53851256:PCTP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 55183203 T/C 1 6 10 16 2.78683632085694 5.35527279857177 -2.56843647771483 T:C T C 10 0.535527279857177 0.218648734569296 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 55183716 T/C 1 10 22 32 4.64472720142823 11.7816001568579 -7.13687295542966 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0127684944262348 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 57093035 C/T 1 12 9 21 5.57367264171388 4.81974551871459 0.753927122999285 T:C C T 10 0.535527279857177 0.828752253980847 ENSG00000108395:ENST00000393066:exon_57092971_57093160:TRIM37;ENSG00000108395:ENST00000262294:exon_57092971_57093160:TRIM37;ENSG00000108395:ENST00000393065:exon_57092971_57093160:TRIM37;ENSG00000108395:ENST00000376149:exon_57092971_57093160:TRIM37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 57125141 A/C 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 A:C A C 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000108395:ENST00000393066:exon_57125044_57125180:TRIM37;ENSG00000108395:ENST00000262294:exon_57125044_57125180:TRIM37;ENSG00000108395:ENST00000393065:exon_57125044_57125180:TRIM37;ENSG00000108395:ENST00000376149:exon_57125044_57125180:TRIM37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 57287653 C/T 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 T:C C T 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57287371_57289171:C17orf71 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 36 52 88 16.7210179251416 27.8474185525732 -11.1264006274316 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0186427315115934 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 57292364 G/T 1 12 16 28 5.57367264171388 8.56843647771483 -2.99476383600095 T:G G T 10 0.535527279857177 0.263198055324704 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57292166_57292608:C17orf71 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 59667953 G/A 0 8 0 8 3.71578176114258 0 3.71578176114258 G G 10 0.535527279857177 0.00893088209752 ENSG00000253506:ENST00000521764:exon_59667794_59668563:NACA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 59668021 G/C 0 8 0 8 3.71578176114258 0 3.71578176114258 G G 10 0.535527279857177 0.00893088209752 ENSG00000253506:ENST00000521764:exon_59667794_59668563:NACA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 61888461 G/A 1 13 21 34 6.0381453618567 11.2460728770007 -5.20792751514402 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0856094868468478 ENSG00000198231:ENST00000359353:exon_61888436_61888533:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000389924:exon_61888436_61888533:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000457800:exon_61888436_61888533:DDX42 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 65116644 G/A 1 4 8 12 1.85789088057129 4.28421823885742 -2.42632735828612 A:G G A 10 0.535527279857177 0.24635656157035 ENSG00000198265:ENST00000358691:exon_65116521_65116728:HELZ HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 65714095 C/T 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 T:C C T 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65714059_65714204:NOL11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 65732093 A/G 1 11 16 27 5.10919992157105 8.56843647771483 -3.45923655614378 A:G A G 10 0.535527279857177 0.246559677217583 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65732016_65732139:NOL11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 99 108 207 45.9827992941395 57.8369462245751 -11.8541469304356 A:G A G 10 0.535527279857177 0.108849854169417 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 66449122 G/A 1 15 13 28 6.96709080214235 6.9618546381433 0.00523616399904459 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000070540:ENST00000262139:exon_66449051_66449133:WIPI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 67081830 T/C 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 T:C T C 10 0.535527279857177 0.782354473542065 ENSG00000154262:ENST00000284425:exon_67081766_67081857:ABCA6;ENSG00000154262:ENST00000446604:exon_67081766_67081857:ABCA6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 72440049 C/A 1 11 10 21 5.10919992157105 5.35527279857177 -0.246072877000716 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000481232:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000420926:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000262616:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000392629:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000392628:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000417745:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000482723:exon_72439224_72440051:GPRC5C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 72859001 T/C 1 93 84 177 43.1959629732825 44.9842915080029 -1.78832853472032 T:C T C 10 0.535527279857177 0.821290268384438 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72858623_72859069:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72858623_72859069:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72858623_72859069:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72858623_72859069:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72858623_72859069:FDXR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73008804 G/T 1 27 31 58 12.5407634438562 16.6013456755725 -4.06058223171626 T:G G T 10 0.535527279857177 0.295103921080906 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73008776_73008967:ICT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 83 85 168 38.5512357718543 45.51981878786 -6.96858301600573 T:C C T 10 0.535527279857177 0.314643604088193 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 113 118 231 52.485417376139 63.1922190231469 -10.7068016470079 T:C T C 10 0.535527279857177 0.166137116180254 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73125173 A/G 1 8 5 13 3.71578176114258 2.67763639928588 1.0381453618567 A:G A G 10 0.535527279857177 0.593586480755975 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73142764 G/A 1 426 408 834 197.865378780843 218.495130181728 -20.6297514008856 A:G G A 10 0.535527279857177 0.154730456648476 ENSG00000189159:ENST00000409753:exon_73142761_73142779:HN1;ENSG00000189159:ENST00000476258:exon_73142761_73142779:HN1;ENSG00000189159:ENST00000405458:exon_73142761_73142779:HN1;ENSG00000189159:ENST00000482348:exon_73142761_73142779:HN1;ENSG00000189159:ENST00000304834:exon_73142761_73142779:HN1;ENSG00000189159:ENST00000470924:exon_73142761_73142779:HN1;ENSG00000189159:ENST00000481094:exon_73142761_73142875:HN1;ENSG00000189159:ENST00000481647:exon_73142761_73142779:HN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73221439 C/T 1 43 37 80 19.9723269661414 19.8145093547155 0.157817611425845 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73221437_73221559:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000449421:exon_73221437_73221559:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73221437_73221559:NUP85 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73230796 T/C 1 61 41 102 28.3328359287122 21.9566184741443 6.37621745456795 T:C T C 10 0.535527279857177 0.23360188552736 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73230732_73230883:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73230732_73231009:NUP85 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73230856 C/T 1 47 43 90 21.8302178467127 23.0276730338586 -1.19745518714593 T:C C T 10 0.535527279857177 0.833018147984277 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73230732_73230883:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73230732_73231009:NUP85 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73236124 A/G 1 11 12 23 5.10919992157105 6.42632735828612 -1.31712743671507 A:G A G 10 0.535527279857177 0.677416798105031 ENSG00000125447:ENST00000245541:exon_73235870_73236189:GGA3;ENSG00000125447:ENST00000351904:exon_73235870_73236189:GGA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73263012 C/T 1 31 51 82 14.3986543244275 27.311891272716 -12.9132369482885 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0053389767071045 ENSG00000125457:ENST00000245551:exon_73262313_73263048:MIF4GD;ENSG00000125457:ENST00000325102:exon_73263000_73263035:MIF4GD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73269530 A/G 1 67 62 129 31.1196722495691 33.202691351145 -2.08301910157583 A:G A G 10 0.535527279857177 0.72478253749142 ENSG00000125454:ENST00000375261:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73269062_73269720:SLC25A19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73279624 A/G 1 22 22 44 10.2183998431421 11.7816001568579 -1.56320031371579 A:G A G 10 0.535527279857177 0.653133596031045 ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73279504_73279674:SLC25A19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73513289 C/G 1 8 8 16 3.71578176114258 4.28421823885742 -0.568436477714831 C:G C G 10 0.535527279857177 0.806722234902998 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73513242_73513325:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73513242_73513325:TSEN54 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73513677 A/C 1 2 9 11 0.928945440285646 4.81974551871459 -3.89080007842895 A:C A C 10 0.535527279857177 0.0297906587989276 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73513638_73513736:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73513638_73513736:TSEN54 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73625286 G/A 1 22 20 42 10.2183998431421 10.7105455971435 -0.492145754001433 A:G G A 10 0.535527279857177 0.878574483565324 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73625430 G/A 1 10 10 20 4.64472720142823 5.35527279857177 -0.71054559714354 A:G G A 10 0.535527279857177 0.824432001736655 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 73819525 C/T 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73819346_73819603:UNK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 74266322 T/C 1 490 518 1008 227.591632869983 277.403130966018 -49.8114980960344 A:T:C T C 10 0.535527279857177 0.00176033433342733 ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74266275_74267375:FAM100B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 74387284 C/T 1 36 25 61 16.7210179251416 13.3881819964294 3.33283592871221 T:C C T 10 0.535527279857177 0.442029742684914 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74385614_74387694:UBE2O HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 74395733 C/T 1 7 9 16 3.25130904099976 4.81974551871459 -1.56843647771483 T:C C T 10 0.535527279857177 0.462143040312805 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74395530_74396002:UBE2O HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 74401374 G/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74401287_74401397:UBE2O HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 76117147 G/A 1 46 52 98 21.3657451265699 27.8474185525732 -6.48167342600334 A:G G A 10 0.535527279857177 0.224075130734524 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76117094_76117245:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76117094_76117245:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76117094_76117245:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76117051_76117245:TMC6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 76121031 C/T 1 23 32 55 10.6828725632849 17.1368729554297 -6.45400039214473 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.103911372260179 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120970_76121066:TMC6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 76130575 A/T 1 15 7 22 6.96709080214235 3.74869095900024 3.21839984314211 A:T A T 10 0.535527279857177 0.202291951159974 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130475_76130645:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130537_76130645:TMC8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 76167047 C/T 1 302 317 619 140.270761483133 169.762147714725 -29.4913862315925 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0193595906617816 ENSG00000108639:ENST00000225777:exon_76166898_76167135:SYNGR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 76178748 T/C 1 52 46 98 24.1525814474268 24.6342548734301 -0.481673426003344 T:C T C 10 0.535527279857177 0.919782966445854 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 14 26 40 6.50261808199952 13.9237092762866 -7.42109119428708 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0252832912151439 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 76803263 G/A 1 36 38 74 16.7210179251416 20.3500366345727 -3.62901870943109 A:G G A 10 0.535527279857177 0.416274176682209 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76803041_76803718:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76803041_76803718:USP36 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 76817090 C/T 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C C T 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76817073_76817143:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76817073_76817143:USP36 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 76831552 G/A 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 A:G G A 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76831362_76831583:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76831362_76831583:USP36;ENSG00000055483:ENST00000432878:exon_76831362_76831583:USP36 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 76993546 A/G 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 A:G A G 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76993074_76994045:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76993074_76993726:CANT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 77082314 C/T 1 11 5 16 5.10919992157105 2.67763639928588 2.43156352228517 T:C C T 10 0.535527279857177 0.316751505566711 ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77082015_77084681:ENGASE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 77768654 C/A 1 12 5 17 5.57367264171388 2.67763639928588 2.89603624242799 A:C C A 10 0.535527279857177 0.223914163527513 ENSG00000141570:ENST00000269385:exon_77765931_77769357:CBX8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 78087109 A/G 1 5 13 18 2.32236360071412 6.9618546381433 -4.63949103742919 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0333546744685474 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78087017_78087165:GAA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 78113832 G/A 1 31 40 71 14.3986543244275 21.4210911942871 -7.02243686985956 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0971977228103223 ENSG00000141543:ENST00000269349:exon_78113807_78113939:EIF4A3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 78175483 T/C 1 11 3 14 5.10919992157105 1.60658183957153 3.50261808199952 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0660528570991714 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 78184393 C/T 1 11 11 22 5.10919992157105 5.89080007842895 -0.781600156857893 T:C C T 10 0.535527279857177 0.831868960719931 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 78865630 A/G 1 1 10 11 0.464472720142823 5.35527279857177 -4.89080007842895 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00400881933576279 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78865520_78865637:RPTOR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 78896529 C/T 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78896524_78896627:RPTOR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79170576 C/T 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 T:C C T 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79170501_79170626:AZI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79173184 T/C 1 5 10 15 2.32236360071412 5.35527279857177 -3.03290919785765 T:C T C 10 0.535527279857177 0.128132638231981 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79173181_79173349:AZI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79173224 T/C 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 T:C T C 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79173181_79173349:AZI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79182778 T/C 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 T:C T C 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79182728_79182822:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79182728_79182822:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79182728_79182822:AZI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79202956 T/C 1 9 8 17 4.18025448128541 4.28421823885742 -0.103963757572008 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79205736 G/A 1 4 9 13 1.85789088057129 4.81974551871459 -2.9618546381433 A:G G A 10 0.535527279857177 0.162035560448580 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79205647_79205821:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79205647_79205821:C17orf56 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79220224 G/C 1 44 33 77 20.4367996862842 17.6724002352868 2.76439945099737 C:G G C 10 0.535527279857177 0.568831572936355 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79224985 C/T 1 9 12 21 4.18025448128541 6.42632735828612 -2.24607287700072 T:C C T 10 0.535527279857177 0.384351839373372 ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79225000 A/G 1 8 2 10 3.71578176114258 1.07105455971435 2.64472720142823 A:G A G 10 0.535527279857177 0.118249545982972 ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79225330 C/A 1 33 27 60 15.3275997647132 14.4592365561438 0.868363208569381 A:C C A 10 0.535527279857177 0.89725531436354 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225293_79225412:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79226264 T/C 1 37 33 70 17.1854906452845 17.6724002352868 -0.486909590002387 T:C T C 10 0.535527279857177 0.905345700490561 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79478870 C/A 1 9 3 12 4.18025448128541 1.60658183957153 2.57367264171388 A:C C A 10 0.535527279857177 0.158167791151507 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79478871 C/T 1 9 3 12 4.18025448128541 1.60658183957153 2.57367264171388 T:C C T 10 0.535527279857177 0.158167791151507 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79508395 C/G 1 36 14 50 16.7210179251416 7.49738191800048 9.22363600714115 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0101440324147272 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79508335_79508421:C17orf70 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 17 10 27 7.89603624242799 5.35527279857177 2.54076344385622 A:G G A 10 0.535527279857177 0.343173783053281 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79580457 C/A 1 12 21 33 5.57367264171388 11.2460728770007 -5.67240023528684 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0548969189608858 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79580344_79580520:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79580344_79580520:NPLOC4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79589242 G/A 1 19 8 27 8.82498168271364 4.28421823885742 4.54076344385622 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0854473712474619 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79589192_79589304:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79589192_79589304:NPLOC4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79596811 C/T 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 T:C C T 10 0.535527279857177 0.809233970242324 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79596751_79596831:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79596751_79596831:NPLOC4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79618059 C/T 1 36 28 64 16.7210179251416 14.994763836001 1.72625408914068 T:C C T 10 0.535527279857177 0.708089724559034 ENSG00000185527:ENST00000331056:exon_79617489_79618180:PDE6G;ENSG00000185527:ENST00000374743:exon_79617489_79618180:PDE6G HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79618098 C/G 1 26 14 40 12.0762907237134 7.49738191800048 4.57890880571292 C:G C G 10 0.535527279857177 0.156684043921896 ENSG00000185527:ENST00000331056:exon_79617489_79618180:PDE6G;ENSG00000185527:ENST00000374743:exon_79617489_79618180:PDE6G HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79632363 C/T 1 134 98 232 62.2393444991383 52.4816734260033 9.75767107313494 T:C C T 10 0.535527279857177 0.211260934515229 ENSG00000204237:ENST00000374741:exon_79632067_79632614:C17orf90 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79637367 C/G 1 30 23 53 13.9341816042847 12.3171274367151 1.61705416756962 C:G C G 10 0.535527279857177 0.681876080038363 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79637255_79637483:CCDC137 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79639550 G/A 1 32 14 46 14.8631270445703 7.49738191800048 7.36574512656986 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0374439609388852 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79639708 C/T 1 34 16 50 15.792072484856 8.56843647771483 7.22363600714115 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0466774377839970 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79663880 T/C 1 50 41 91 23.2236360071412 21.9566184741443 1.2670175329969 T:C T C 10 0.535527279857177 0.8339220744503 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79663931 T/C 1 38 23 61 17.6499633654273 12.3171274367151 5.33283592871221 T:C T C 10 0.535527279857177 0.199372312098429 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79667826 C/T 1 43 51 94 19.9723269661414 27.311891272716 -7.33956430657463 T:C C T 10 0.535527279857177 0.147507878996066 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79667725_79667844:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79667725_79667844:HGS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79668135 G/T 1 114 92 206 52.9498900962818 49.2685097468603 3.68138034942154 T:G G T 10 0.535527279857177 0.625398144760054 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668075_79668161:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668075_79668161:HGS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79668552 C/T 1 109 97 206 50.6275264955677 51.9461461461462 -1.31861965057845 T:C C T 10 0.535527279857177 0.888963312635624 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668538_79669143:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668538_79669149:HGS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79671714 T/C 1 353 311 664 163.958870210417 166.548984035582 -2.5901138251655 T:C T C 10 0.535527279857177 0.845844162596564 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79671663_79671746:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79671663_79671746:MRPL12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79682558 T/C 1 1 8 9 0.464472720142823 4.28421823885742 -3.81974551871459 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0150689460626302 ENSG00000183048:ENST00000331531:exon_79682508_79682622:SLC25A10;ENSG00000183048:ENST00000350690:exon_79682508_79682622:SLC25A10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79682766 C/T 1 9 9 18 4.18025448128541 4.81974551871459 -0.639491037429185 T:C C T 10 0.535527279857177 0.816111256590493 ENSG00000183048:ENST00000331531:exon_79682723_79682771:SLC25A10;ENSG00000183048:ENST00000350690:exon_79682723_79682771:SLC25A10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79954544 T/A 1 19 21 40 8.82498168271364 11.2460728770007 -2.42109119428708 A:T T A 10 0.535527279857177 0.526617829622177 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79954296_79954722:ASPSCR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 33 35 68 15.3275997647132 18.7434547950012 -3.41585503028804 T:C T C 10 0.535527279857177 0.46602050355787 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79980756 C/A 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 A:C C A 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000169689:ENST00000306704:exon_79980702_79980794:STRA13;ENSG00000169689:ENST00000392359:exon_79980702_79980794:STRA13 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79986156 C/T 1 18 13 31 8.36050896257082 6.9618546381433 1.39865432442751 T:C C T 10 0.535527279857177 0.719721870124635 ENSG00000169683:ENST00000306688:exon_79986110_79986187:LRRC45 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79994026 G/A 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 0.204199871162889 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 79994600 C/T 1 90 119 209 41.8025448128541 63.7277463030041 -21.92520149015 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00278175747153294 ENSG00000169738:ENST00000306869:exon_79994597_79994639:DCXR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 80012449 G/A 1 88 69 157 40.8735993725684 36.9513823101452 3.92221706242321 A:G G A 10 0.535527279857177 0.575622732910079 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80012374_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000320548:exon_80012408_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 80051183 A/G 1 12 7 19 5.57367264171388 3.74869095900024 1.82498168271364 A:G A G 10 0.535527279857177 0.493201262474126 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80051095_80051295:FASN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 80059596 T/C 1 258 195 453 119.833961796848 104.42781957215 15.4061422246988 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.157570372734606 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80059566_80059742:CCDC57 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 80373377 G/T 1 9 8 17 4.18025448128541 4.28421823885742 -0.103963757572008 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 80373452 C/T 1 16 6 22 7.43156352228517 3.21316367914306 4.21839984314211 T:C C T 10 0.535527279857177 0.08728031897682 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 80401946 A/G 1 48 44 92 22.2946905668555 23.5632003137158 -1.26850974686028 A:G A G 10 0.535527279857177 0.834691674898218 ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80401498_80401980:C17orf62 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 80442683 T/G 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:G T G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 80442722 T/C 1 34 37 71 15.792072484856 19.8145093547155 -4.02243686985956 T:C T C 10 0.535527279857177 0.344017755032896 ENSG00000141562:ENST00000390006:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000345415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000374611:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000309794:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000457415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412719:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412079:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 80579609 T/C 1 14 14 28 6.50261808199952 7.49738191800048 -0.994763836000955 T:C T C 10 0.535527279857177 0.709830757062613 ENSG00000141580:ENST00000392325:exon_80579485_80579675:WDR45L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 80674643 C/G 1 7 7 14 3.25130904099976 3.74869095900024 -0.497381918000477 C:G C G 10 0.535527279857177 0.796028545675074 ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80674582_80674772:FN3KRP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 80684784 G/A 1 26 20 46 12.0762907237134 10.7105455971435 1.36574512656986 A:G G A 10 0.535527279857177 0.76816771206416 ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80684709_80685892:FN3KRP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 80863857 T/C 1 6 9 15 2.78683632085694 4.81974551871459 -2.03290919785765 T:C T C 10 0.535527279857177 0.312914646957404 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80863812_80863929:TBCD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 59 49 108 27.4038904884266 26.2408367130017 1.16305377542489 T:C T C 10 0.535527279857177 0.847505647036328 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 21 16 37 9.75392712299928 8.56843647771483 1.18549064528445 A:G G A 10 0.535527279857177 0.743804421265413 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 166819 T/C 1 33 10 43 15.3275997647132 5.35527279857177 9.97232696614139 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00206581478506505 ENSG00000101557:ENST00000400266:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000261601:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000383589:exon_166787_166819:USP14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 224184 C/G 1 8 2 10 3.71578176114258 1.07105455971435 2.64472720142823 C:G C G 10 0.535527279857177 0.118249545982972 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 252559 G/A 1 17 26 43 7.89603624242799 13.9237092762866 -6.02767303385861 A:G G A 10 0.535527279857177 0.068209210597755 ENSG00000079134:ENST00000261600:exon_252539_252612:THOC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 2925359 C/T 0 8 0 8 3.71578176114258 0 3.71578176114258 C C 10 0.535527279857177 0.00893088209752 ENSG00000101577:ENST00000261596:exon_2925222_2925366:LPIN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 3253245 C/T 1 528 552 1080 245.241596235411 295.611058481162 -50.3694622457512 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00227059708298229 ENSG00000101608:ENST00000217652:exon_3253231_3253426:MYL12A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 9119489 A/T 1 3 8 11 1.39341816042847 4.28421823885742 -2.89080007842895 A:T A T 10 0.535527279857177 0.127667889620419 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9119472_9119588:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9119472_9119588:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9119472_9119523:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9119472_9119564:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000465096:exon_9119471_9119588:NDUFV2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 228 192 420 105.899780192564 102.821237732578 3.07854245998568 A:C:G A G 10 0.535527279857177 0.769393583897641 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 12308793 G/C 1 78 140 218 36.2288721711402 74.9738191800048 -38.7449470088646 C:G G C 10 0.535527279857177 1.85314215598e-07 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12308686_12308794:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12308686_12308794:TUBB6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 77 110 187 35.7643994509974 58.9080007842895 -23.1436013332921 C:G C G 10 0.535527279857177 0.000723111462058686 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 46 36 82 21.3657451265699 19.2789820748584 2.08676305171149 T:C T C 10 0.535527279857177 0.659689367475569 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 42 42 84 19.5078542459986 22.4921457540014 -2.98429150800286 T:C C T 10 0.535527279857177 0.514217871194094 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 12718593 A/G 1 66 63 129 30.6551995294263 33.7382186310021 -3.08301910157583 A:C:G A G 10 0.535527279857177 0.597393382549828 ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12718516_12718634:PSMG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 13068109 G/A 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:G G A 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13068093_13068236:CEP192 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 13095591 G/A 1 9 4 13 4.18025448128541 2.14210911942871 2.0381453618567 A:G G A 10 0.535527279857177 0.282589464001187 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13095502_13095680:CEP192 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 13124609 T/C 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13124486_13125029:CEP192 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 13731574 G/C 1 7 16 23 3.25130904099976 8.56843647771483 -5.31712743671507 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0348627972253583 ENSG00000101654:ENST00000383314:exon_13731475_13731933:RNMT;ENSG00000101654:ENST00000262173:exon_13731473_13731933:RNMT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 20577669 G/A 1 42 29 71 19.5078542459986 15.5302911158581 3.97756313014044 A:G G A 10 0.535527279857177 0.405128789588303 ENSG00000101773:ENST00000327155:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000327174:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000360790:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399725:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399722:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399721:exon_20577583_20577697:RBBP8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 21100240 C/T 1 14 34 48 6.50261808199952 18.207927515144 -11.7053094331445 T:C C T 10 0.535527279857177 0.000757205858745201 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 21120444 T/C 1 7 7 14 3.25130904099976 3.74869095900024 -0.497381918000477 T:C T C 10 0.535527279857177 0.796028545675074 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21120412_21120501:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21120412_21120501:NPC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 23612484 C/G 1 32 36 68 14.8631270445703 19.2789820748584 -4.41585503028803 C:G C G 10 0.535527279857177 0.330831839992594 ENSG00000141380:ENST00000415083:exon_23612363_23612496:SS18;ENSG00000141380:ENST00000269137:exon_23612363_23612496:SS18;ENSG00000141380:ENST00000269138:exon_23612363_23612496:SS18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 23854774 A/G 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23854627_23854788:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23854627_23854788:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23854627_23854788:TAF4B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 24035675 T/C 1 13 17 30 6.0381453618567 9.10396375757201 -3.06581839571531 T:C T C 10 0.535527279857177 0.277280147402981 ENSG00000134504:ENST00000317932:exon_24034874_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000417602:exon_24034877_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000408011:exon_24034877_24035865:KCTD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 32822382 G/T 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 T:G G T 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000186812:ENST00000330501:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000261333:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000355632:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000421371:exon_32822355_32822848:ZNF397 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 T:C T C 10 0.535527279857177 0.809233970242324 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 34398914 C/T 1 19 20 39 8.82498168271364 10.7105455971435 -1.8855639144299 T:C C T 10 0.535527279857177 0.630776619558793 ENSG00000134779:ENST00000334295:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000383056:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000415958:exon_34398857_34398936:C18orf10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 46690066 G/A 1 31 47 78 14.3986543244275 25.1697821532873 -10.7711278288598 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0167651667172601 ENSG00000141627:ENST00000442713:exon_46690055_46690157:DYM;ENSG00000141627:ENST00000418472:exon_46690055_46690157:DYM;ENSG00000141627:ENST00000269445:exon_46690055_46690157:DYM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 47803066 C/T 1 25 21 46 11.6118180035706 11.2460728770007 0.365745126569861 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803032_47803114:MBD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 47908556 G/A 1 14 16 30 6.50261808199952 8.56843647771483 -2.06581839571531 A:G G A 10 0.535527279857177 0.46949162763975 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000488454:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47908499_47908596:SKA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 15 22 37 6.96709080214235 11.7816001568579 -4.81450935471555 A:C A C 10 0.535527279857177 0.137567453167498 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 55221648 T/C 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:C T C 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55221492_55221656:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55221492_55221656:FECH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 55226383 G/C 1 4 11 15 1.85789088057129 5.89080007842895 -4.03290919785765 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0409545616380073 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55226377_55226475:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55226377_55226475:FECH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 56202231 T/C 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 T:C T C 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 56202418 T/C 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 T:C T C 10 0.535527279857177 0.809233970242324 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 56203837 G/A 1 14 12 26 6.50261808199952 6.42632735828612 0.0762907237133996 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 56415092 G/A 1 72 45 117 33.4420358502833 24.098727593573 9.3433082567103 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0949695488775486 ENSG00000172175:ENST00000348428:exon_56414637_56421130:MALT1;ENSG00000172175:ENST00000345724:exon_56414637_56415386:MALT1;ENSG00000172175:ENST00000446453:exon_56414637_56415263:MALT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 60241732 C/T 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 T:C C T 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60241290_60242783:ZCCHC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 10 13 23 4.64472720142823 6.9618546381433 -2.31712743671507 T:C C T 10 0.535527279857177 0.404605690601376 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 T:C T C 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 67718688 A/G 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67718647_67718784:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67718647_67718784:RTTN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 71816278 G/A 1 31 29 60 14.3986543244275 15.5302911158581 -1.13163679143062 A:G G A 10 0.535527279857177 0.79674171013507 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71815746_71816344:C18orf55 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 77246406 T/G 1 9 7 16 4.18025448128541 3.74869095900024 0.431563522285169 T:G T G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 18 77805856 A/C 1 64 55 119 29.7262540891407 29.4540003921447 0.272253696995943 A:C A C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 532066 C/T 1 25 20 45 11.6118180035706 10.7105455971435 0.901272406427037 T:C C T 10 0.535527279857177 0.88150907355531 ENSG00000099804:ENST00000215574:exon_531733_532108:CDC34 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 236 202 438 109.615561953706 108.17651053115 1.43905142255649 T:C T C 10 0.535527279857177 0.923692107868446 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 617614 G/A 1 97 76 173 45.0538538538538 40.7000732691454 4.35378058470839 A:G G A 10 0.535527279857177 0.542281302545578 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_617570_617655:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_617570_617655:POLRMT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 C:G G C 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 621063 A/G 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 A:G A G 10 0.535527279857177 0.809233970242324 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 621070 G/A 1 10 8 18 4.64472720142823 4.28421823885742 0.360508962570814 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 629846 G/A 1 14 14 28 6.50261808199952 7.49738191800048 -0.994763836000955 A:G G A 10 0.535527279857177 0.709830757062613 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_629540_630168:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_629540_630168:POLRMT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 810846 C/T 1 235 222 457 109.151089233563 118.887056128293 -9.73596689472987 T:C C T 10 0.535527279857177 0.373045667075953 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_810694_812327:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_810694_812327:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_810694_812327:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_810694_812327:PTBP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 871222 G/A 1 71 74 145 32.9775631301404 39.6290187094311 -6.65145557929065 A:G G A 10 0.535527279857177 0.279766296596905 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_871037_871253:MED16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 872089 A/G 1 36 24 60 16.7210179251416 12.8526547165722 3.86836320856938 A:G A G 10 0.535527279857177 0.36546102821039 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 880066 G/A 1 19 24 43 8.82498168271364 12.8526547165722 -4.02767303385861 A:G G A 10 0.535527279857177 0.225299205448026 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 984533 T/C 1 114 38 152 52.9498900962818 20.3500366345727 32.5998534617091 T:C T C 10 0.535527279857177 7.9108381995278e-08 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 984537 A/G 1 42 116 158 19.5078542459986 62.1211644634325 -42.613310217434 A:C:G A G 10 0.535527279857177 7.0676898904206e-12 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 984554 C/G 1 110 49 159 51.0919992157105 26.2408367130017 24.8511625027089 C:G C G 10 0.535527279857177 6.47530207459217e-05 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 990238 C/T 1 44 74 118 20.4367996862842 39.6290187094311 -19.1922190231469 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00042307128914943 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_990223_990364:WDR18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 991129 G/A 1 85 118 203 39.48018121214 63.1922190231469 -23.7120378110069 A:G G A 10 0.535527279857177 0.000913055802055965 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991081_991145:WDR18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1011338 C/T 1 12 9 21 5.57367264171388 4.81974551871459 0.753927122999285 T:C C T 10 0.535527279857177 0.828752253980847 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1012120 G/A 1 55 52 107 25.5459996078553 27.8474185525732 -2.30141894471793 A:G G A 10 0.535527279857177 0.698590392683336 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1012065_1012187:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1012065_1012187:C19orf6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1014377 A/G 1 34 47 81 15.792072484856 25.1697821532873 -9.37770966843133 A:C:G A G 10 0.535527279857177 0.0443738245820158 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1047161 A/G 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 A:G A G 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1047156_1047377:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1047156_1047377:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1047156_1047377:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000533574:exon_1047156_1047377:ABCA7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1049305 C/A 1 7 1 8 3.25130904099976 0.535527279857177 2.71578176114258 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0758484261005442 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1049265_1049436:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1049265_1049436:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1049265_1049436:ABCA7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 19 11 30 8.82498168271364 5.89080007842895 2.93418160428469 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.360614188179226 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 22 13 35 10.2183998431421 6.9618546381433 3.25654520499881 A:G G A 10 0.535527279857177 0.311221891782477 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1074000 A/T 1 43 30 73 19.9723269661414 16.0658183957153 3.90650857042608 A:T A T 10 0.535527279857177 0.411799830074152 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1073947_1074013:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1073947_1074013:HMHA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1077985 A/G 1 51 48 99 23.688108727284 25.7053094331445 -2.01720070586052 A:G A G 10 0.535527279857177 0.688334530357577 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1077856_1078044:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1077856_1078044:HMHA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1080311 G/C 1 93 91 184 43.1959629732825 48.7329824670031 -5.53701949372056 C:G G C 10 0.535527279857177 0.417256525375902 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1080254_1080378:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1080254_1080378:HMHA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1081617 A/G 1 80 64 144 37.1578176114258 34.2737459108593 2.88407170056652 A:G A G 10 0.535527279857177 0.676388989741109 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1081549_1081737:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1081549_1081737:HMHA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 92 89 181 42.7314902531397 47.6619279072887 -4.93043765414903 A:C:G A G 10 0.535527279857177 0.502550075494628 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1106477 G/C 1 4 8 12 1.85789088057129 4.28421823885742 -2.42632735828612 C:G G C 10 0.535527279857177 0.24635656157035 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1819125 T/C 1 29 26 55 13.4697088841419 13.9237092762866 -0.454000392144733 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1827565 A/G 1 7 12 19 3.25130904099976 6.42632735828612 -3.17501831728636 A:G A G 10 0.535527279857177 0.170306763434808 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1854557 A/G 1 22 28 50 10.2183998431421 14.994763836001 -4.77636399285885 A:G A G 10 0.535527279857177 0.2022490876187 ENSG00000129911:ENST00000250916:exon_1852398_1854759:KLF16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 15 12 27 6.96709080214235 6.42632735828612 0.540763443856222 T:C T C 10 0.535527279857177 0.850128429900867 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1912986 C/T 1 21 18 39 9.75392712299928 9.63949103742918 0.1144360855701 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1924189 C/T 1 20 16 36 9.28945440285646 8.56843647771483 0.721017925141629 T:C C T 10 0.535527279857177 0.868312064879531 ENSG00000227500:ENST00000316097:exon_1924107_1926012:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000414057:exon_1924107_1925015:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000409472:exon_1924107_1926011:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000472442:exon_1924107_1926005:SCAMP4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 66 67 133 30.6551995294263 35.8803277504309 -5.22512822100454 A:G A G 10 0.535527279857177 0.385189384446600 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 11 23 34 5.10919992157105 12.3171274367151 -7.20792751514402 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0154721466561132 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 81 53 134 37.6222903315687 28.3829458324304 9.23934449913828 A:G A G 10 0.535527279857177 0.119081881614729 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 81 62 143 37.6222903315687 33.202691351145 4.41959898042369 T:C T C 10 0.535527279857177 0.502626395315412 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 2097986 T/C 1 8 10 18 3.71578176114258 5.35527279857177 -1.63949103742919 T:C T C 10 0.535527279857177 0.484703765251006 ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 2226655 C/A 1 41 31 72 19.0433815258557 16.6013456755725 2.44203585028326 A:C C A 10 0.535527279857177 0.636879777740236 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 2351565 C/T 1 13 12 25 6.0381453618567 6.42632735828612 -0.388181996429424 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2351432_2351592:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2351432_2351613:AC004410.1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 48 37 85 22.2946905668555 19.8145093547155 2.48018121213996 A:C A C 10 0.535527279857177 0.663862208450161 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 35 33 68 16.2565452049988 17.6724002352868 -1.41585503028804 T:G G T 10 0.535527279857177 0.80811961099264 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 2917093 C/A 1 13 7 20 6.0381453618567 3.74869095900024 2.28945440285646 A:C C A 10 0.535527279857177 0.373042117571353 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000522294:exon_2916922_2917157:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 2917178 G/A 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 A:G G A 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 2917509 G/A 1 5 10 15 2.32236360071412 5.35527279857177 -3.03290919785765 A:G G A 10 0.535527279857177 0.128132638231981 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 2917522 G/A 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 A:G G A 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 2917612 T/C 1 3 11 14 1.39341816042847 5.89080007842895 -4.49738191800048 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0281580583322303 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 2917798 A/G 1 11 7 18 5.10919992157105 3.74869095900024 1.36050896257081 A:G A G 10 0.535527279857177 0.638900023085703 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 2933480 C/T 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 3157885 T/C 1 1 10 11 0.464472720142823 5.35527279857177 -4.89080007842895 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00400881933576279 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 3157887 A/G 1 1 7 8 0.464472720142823 3.74869095900024 -3.28421823885742 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0289107709309061 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 3157916 C/T 1 1 8 9 0.464472720142823 4.28421823885742 -3.81974551871459 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0150689460626302 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 3534842 G/A 1 28 24 52 13.005236163999 12.8526547165722 0.152581447426799 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3534793_3536755:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3534793_3538325:FZR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 3546340 G/A 1 24 30 54 11.1473452834278 16.0658183957153 -4.91847311228755 A:G G A 10 0.535527279857177 0.219206800250926 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3546253_3546423:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3546253_3546423:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3546253_3546423:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3546253_3546423:C19orf28 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 3611972 G/A 1 18 15 33 8.36050896257082 8.03290919785765 0.327599764713161 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3610626_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3611925_3612411:C19orf29;ENSG00000226800:ENST00000447295:exon_3611729_3612412:C19orf29OS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 3624005 G/A 1 8 10 18 3.71578176114258 5.35527279857177 -1.63949103742919 A:G G A 10 0.535527279857177 0.484703765251006 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3623686_3624160:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3623686_3624160:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3623786_3624125:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3623686_3624160:C19orf29 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 3653525 C/T 1 14 2 16 6.50261808199952 1.07105455971435 5.43156352228517 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00967875735976586 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3653288_3653587:PIP5K1C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 3752874 A/G 1 20 27 47 9.28945440285646 14.4592365561438 -5.16978215328732 A:G A G 10 0.535527279857177 0.144583908962273 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752818_3753060:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752818_3752988:APBA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 3753874 G/A 0 42 0 42 19.5078542459986 0 19.5078542459986 G G 10 0.535527279857177 4.57129913110644e-12 ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3753763_3753924:APBA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 4028783 C/T 1 20 14 34 9.28945440285646 7.49738191800048 1.79207248485598 T:C C T 10 0.535527279857177 0.607875644967397 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4028718_4028846:PIAS4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 11 9 20 5.10919992157105 4.81974551871459 0.289454402856461 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 4362691 G/C 1 24 39 63 11.1473452834278 20.8855639144299 -9.73821863100215 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0160119028163742 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4362609_4362733:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4362609_4362733:SH3GL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 4409756 A/G 1 32 41 73 14.8631270445703 21.9566184741443 -7.09349142957392 A:G A G 10 0.535527279857177 0.101294454011161 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 4446621 C/T 1 73 85 158 33.9065085704261 45.51981878786 -11.613310217434 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.0667779604355522 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4446497_4446716:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4446497_4446716:UBXN6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 4454083 C/T 1 71 40 111 32.9775631301404 21.4210911942871 11.5564719358534 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0286828029412011 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 4457650 C/T 1 24 38 62 11.1473452834278 20.3500366345727 -9.20269135114497 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0216002944638793 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4457612_4457694:UBXN6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 4538255 C/T 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 T:C C T 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000171236:ENST00000306390:exon_4537227_4538963:LRG1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 4658047 A/G 1 145 113 258 67.3485444207093 60.514582623861 6.83396179684835 A:T:G A G 10 0.535527279857177 0.417323624596469 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4657566_4658096:C19orf10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 4847868 G/A 1 36 11 47 16.7210179251416 5.89080007842895 10.8302178467127 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00181054579086586 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 17 15 32 7.89603624242799 8.03290919785765 -0.136872955429662 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 4859631 G/T 1 42 46 88 19.5078542459986 24.6342548734301 -5.12640062743157 T:G G T 10 0.535527279857177 0.286488791891636 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859602_4859684:PLIN3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 96 84 180 44.589381133711 44.9842915080029 -0.394910374291847 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 5789565 T/C 1 20 10 30 9.28945440285646 5.35527279857177 3.93418160428469 T:C T C 10 0.535527279857177 0.199513097202572 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 5908969 G/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000187650:ENST00000339485:exon_5908835_5910864:VMAC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 5914951 C/A 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914951_5915157:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914951_5915157:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914951_5915076:CAPS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6213104 G/A 1 22 29 51 10.2183998431421 15.5302911158581 -5.31189127271603 A:G G A 10 0.535527279857177 0.160205987359261 ENSG00000130382:ENST00000252674:exon_6212966_6213181:MLLT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6441979 G/A 1 57 61 118 26.4749450481409 32.6671640712878 -6.19221902314688 A:G G A 10 0.535527279857177 0.268670150352945 ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6440075_6442170:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6440075_6442170:SLC25A23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6441980 G/T 1 54 61 115 25.0815268877124 32.6671640712878 -7.58563718357535 T:G G T 10 0.535527279857177 0.161709261069327 ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6440075_6442170:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6440075_6442170:SLC25A23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6454651 T/C 1 20 12 32 9.28945440285646 6.42632735828612 2.86312704457034 T:C T C 10 0.535527279857177 0.37664187110767 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6454570_6454728:SLC25A23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6456497 G/A 1 9 17 26 4.18025448128541 9.10396375757201 -4.9237092762866 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0748738537647927 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6456431_6456542:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6456431_6456542:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6456431_6456542:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6456431_6456542:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6456431_6456542:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6456431_6456542:SLC25A23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6468061 C/T 1 178 171 349 82.6761441854225 91.5751648555773 -8.89902067015475 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.361646102742702 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6467219_6468129:DENND1C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 1439 1231 2670 668.376244285522 659.234081504185 9.14216278133756 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.726951299748195 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6677989 G/A 1 7 6 13 3.25130904099976 3.21316367914306 0.0381453618566998 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000125730:ENST00000245907:exon_6677846_6678034:C3;ENSG00000125730:ENST00000428815:exon_6677846_6678034:C3;ENSG00000125730:ENST00000467528:exon_6677852_6678034:C3;ENSG00000125730:ENST00000482039:exon_6677878_6678034:C3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6731057 T/C 1 85 60 145 39.48018121214 32.1316367914306 7.34854442070935 T:C T C 10 0.535527279857177 0.243872507271164 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6735929 C/T 1 15 8 23 6.96709080214235 4.28421823885742 2.68287256328493 T:C C T 10 0.535527279857177 0.300673562790689 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6735919_6735969:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6735919_6735969:GPR108 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6737481 T/C 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6737468_6737633:GPR108 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6755007 T/C 1 20 20 40 9.28945440285646 10.7105455971435 -1.42109119428708 T:C T C 10 0.535527279857177 0.751703119483862 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6755155 T/C 1 10 18 28 4.64472720142823 9.63949103742918 -4.99476383600095 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0863160807025595 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6759631 C/T 1 9 17 26 4.18025448128541 9.10396375757201 -4.9237092762866 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0748738537647927 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6759605_6759681:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6759605_6759681:SH2D3A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6760974 T/C 1 5 8 13 2.32236360071412 4.28421823885742 -1.9618546381433 T:C T C 10 0.535527279857177 0.405380944075703 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6760649_6760998:SH2D3A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6763718 A/G 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6763691_6763827:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6763691_6763827:SH2D3A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 6837061 T/C 1 28 32 60 13.005236163999 17.1368729554297 -4.13163679143062 T:C T C 10 0.535527279857177 0.302348341839789 ENSG00000141968:ENST00000304076:exon_6836996_6837061:VAV1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 7584483 A/C 1 17 7 24 7.89603624242799 3.74869095900024 4.14734528342775 A:C A C 10 0.535527279857177 0.103284160119401 ENSG00000198816:ENST00000361576:exon_7584091_7585912:ZNF358;ENSG00000198816:ENST00000394341:exon_7584088_7585911:ZNF358 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 7694393 G/A 1 14 13 27 6.50261808199952 6.9618546381433 -0.459236556143778 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7694363_7694439:XAB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 7712417 A/G 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 A:G A G 10 0.535527279857177 0.366092140083572 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 7712425 G/C 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 C:G G C 10 0.535527279857177 0.356091231788076 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 7712708 G/A 1 103 74 177 47.8406901747108 39.6290187094311 8.21167146527968 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.228333910768336 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712611_7712758:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712611_7712758:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712611_7712758:STXBP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 7747445 G/A 1 625 722 1347 290.295450089264 386.650696056882 -96.3552459676173 A:T:G G A 10 0.535527279857177 1.50581081753698e-07 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 7755056 G/A 1 528 431 959 245.241596235411 230.812257618443 14.4293386169673 A:G G A 10 0.535527279857177 0.364709215692973 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7755045_7755151:FCER2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 7755285 A/G 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 A:G A G 10 0.535527279857177 0.741702985954337 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 7761812 A/G 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 A:G A G 10 0.535527279857177 0.366092140083572 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 7763248 G/A 1 488 431 919 226.662687429698 230.812257618443 -4.14957018874563 A:T:C:G G A 10 0.535527279857177 0.791406322071928 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763242_7763295:FCER2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 7986638 C/G 1 26 32 58 12.0762907237134 17.1368729554297 -5.06058223171626 C:G C G 10 0.535527279857177 0.190325190080046 ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7986590_7986658:SNAPC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 7998386 G/C 1 45 30 75 20.901272406427 16.0658183957153 4.83545401071173 C:G G C 10 0.535527279857177 0.297879576711503 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7998370_7998455:TIMM44 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 8028544 A/G 1 171 177 348 79.4248351444227 94.7883285347203 -15.3634933902976 A:T:G A G 10 0.535527279857177 0.106807284567390 ENSG00000066044:ENST00000351593:exon_8023458_8028691:ELAVL1;ENSG00000066044:ENST00000407627:exon_8023458_8028691:ELAVL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 8326866 C/T 1 79 68 147 36.693344891283 36.415855030288 0.277489860994983 T:C:G C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 74 87 161 34.3709812905689 46.5908733475744 -12.2198920570055 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0578428207400499 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 8326944 G/A 1 84 69 153 39.0157084919971 36.9513823101452 2.06432618185192 A:G G A 10 0.535527279857177 0.746612861627494 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 8326999 C/T 1 55 25 80 25.5459996078553 13.3881819964294 12.1578176114258 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0068856370319385 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 8370080 C/T 1 8 1 9 3.71578176114258 0.535527279857177 3.18025448128541 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0433473902079845 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 8373152 T/C 1 34 23 57 15.792072484856 12.3171274367151 3.47494504814091 T:C T C 10 0.535527279857177 0.425901455789071 ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8373033_8373239:CD320 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 8376431 G/A 1 143 109 252 66.4195989804237 58.3724735044323 8.04712547599141 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.313143907018443 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8376234_8376479:NDUFA7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 8468337 C/T 1 180 214 394 83.6050896257081 114.602837889436 -30.9977482637277 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00202569915763882 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 8551094 T/C 1 286 299 585 132.839197960847 160.122656677296 -27.2834587164485 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0251474138066843 ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8550487_8551289:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8550487_8551289:HNRNPM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 8553630 C/T 1 249 202 451 115.653707315563 108.17651053115 7.4771967844132 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.50872141302059 ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8553575_8553885:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8553575_8553885:HNRNPM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 8578000 G/A 1 34 30 64 15.792072484856 16.0658183957153 -0.273745910859324 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 8578118 A/G 1 13 28 41 6.0381453618567 14.994763836001 -8.95661847414426 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00702297290215693 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 8578199 T/C 1 27 17 44 12.5407634438562 9.10396375757201 3.43679968628421 T:C T C 10 0.535527279857177 0.364842505184606 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 9949152 G/A 1 205 157 362 95.2169076292787 84.0777829375768 11.1391246917019 A:G G A 10 0.535527279857177 0.2467047867744 ENSG00000127445:ENST00000247970:exon_9949112_9949324:PIN1;ENSG00000127445:ENST00000424497:exon_9949112_9949324:PIN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 180 189 369 83.6050896257081 101.214655893006 -17.6095662672983 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0678393482217199 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 18 15 33 8.36050896257082 8.03290919785765 0.327599764713161 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 34 36 70 15.792072484856 19.2789820748584 -3.48690959000239 T:C C T 10 0.535527279857177 0.404922803270679 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10224845 G/A 1 30 9 39 13.9341816042847 4.81974551871459 9.1144360855701 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00347180408842503 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 557 591 1148 258.711305119552 316.496622395592 -57.7853172760392 A:T:G A G 10 0.535527279857177 0.000662232498239613 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 517 535 1052 240.13239631384 286.50709472359 -46.3746984097502 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00443985270014836 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10249270 G/A 1 26 18 44 12.0762907237134 9.63949103742918 2.43679968628421 A:G G A 10 0.535527279857177 0.546133050382075 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10249115_10249281:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10249115_10249281:DNMT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10334663 T/G 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 T:G T G 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000175898:ENST00000317726:exon_10332109_10335623:S1PR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10367416 G/A 1 88 82 170 40.8735993725684 43.9132369482885 -3.03963757572009 A:G G A 10 0.535527279857177 0.645387810894055 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10367384_10367501:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10367384_10367501:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10367384_10367501:MRPL4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10395468 G/A 1 73 52 125 33.9065085704261 27.8474185525732 6.05909001785288 A:G G A 10 0.535527279857177 0.283512762248405 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10577771 C/T 1 10 12 22 4.64472720142823 6.42632735828612 -1.78160015685789 T:C C T 10 0.535527279857177 0.523672568666477 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10577563_10580305:PDE4A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 32 26 58 14.8631270445703 13.9237092762866 0.939417768283736 C:G G C 10 0.535527279857177 0.895450417018939 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10664632 A/G 1 43 51 94 19.9723269661414 27.311891272716 -7.33956430657463 A:G A G 10 0.535527279857177 0.147507878996066 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10668452 A/G 1 46 33 79 21.3657451265699 17.6724002352868 3.69334489128302 A:G A G 10 0.535527279857177 0.431277807000955 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668445_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668445_10668571:KRI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10668673 A/G 1 42 32 74 19.5078542459986 17.1368729554297 2.37098129056891 A:G A G 10 0.535527279857177 0.64162497281164 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668648_10668736:KRI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10676423 G/A 1 14 9 23 6.50261808199952 4.81974551871459 1.68287256328493 A:G G A 10 0.535527279857177 0.535797684122808 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10676393_10676696:KRI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10738639 C/T 1 24 22 46 11.1473452834278 11.7816001568579 -0.634254873430139 T:C C T 10 0.535527279857177 0.883242572710905 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10738596_10738680:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10738596_10738680:SLC44A2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10742170 A/G 1 28 17 45 13.005236163999 9.10396375757201 3.90127240642704 A:G A G 10 0.535527279857177 0.29573371832178 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10742151_10742211:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10742151_10742211:SLC44A2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 10794630 G/T 1 161 126 287 74.7801079429945 67.4764372620043 7.30367068099021 T:G G T 10 0.535527279857177 0.40759886366925 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794593_10794652:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794593_10794646:ILF3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 11218226 G/A 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 0.204199871162889 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 11224265 A/G 1 10 8 18 4.64472720142823 4.28421823885742 0.360508962570814 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11224211_11224438:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11224211_11224438:LDLR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 11277232 G/A 1 9 2 11 4.18025448128541 1.07105455971435 3.10919992157105 A:G G A 10 0.535527279857177 0.072775715286889 ENSG00000197256:ENST00000355150:exon_11274943_11277287:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000432929:exon_11274943_11277287:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000439675:exon_11276266_11277287:KANK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 11465533 C/T 1 12 12 24 5.57367264171388 6.42632735828612 -0.852654716572246 T:C C T 10 0.535527279857177 0.838566839920317 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 11488877 C/T 1 12 5 17 5.57367264171388 2.67763639928588 2.89603624242799 T:C C T 10 0.535527279857177 0.223914163527513 ENSG00000187266:ENST00000222139:exon_11488475_11489271:EPOR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 11558275 G/A 1 222 174 396 103.112943871707 93.1817466951488 9.93119717655793 A:G G A 10 0.535527279857177 0.338491550930944 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11558254_11558433:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11558254_11558412:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11558254_11558433:PRKCSH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 11598483 T/C 1 10 4 14 4.64472720142823 2.14210911942871 2.50261808199952 T:C T C 10 0.535527279857177 0.283628757254846 ENSG00000161914:ENST00000293771:exon_11598107_11598718:ZNF653 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 12059543 G/A 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 A:G G A 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000196757:ENST00000254321:exon_12059091_12061578:ZNF700;ENSG00000196757:ENST00000482090:exon_12059091_12061588:ZNF700 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 12060786 A/G 1 25 12 37 11.6118180035706 6.42632735828612 5.18549064528445 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0998693665354762 ENSG00000196757:ENST00000254321:exon_12059091_12061578:ZNF700;ENSG00000196757:ENST00000482090:exon_12059091_12061588:ZNF700 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 13008607 G/T 1 45 38 83 20.901272406427 20.3500366345727 0.551235771854312 T:G G T 10 0.535527279857177 0.912951986753124 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008517_13008677:GCDH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 13211843 C/T 1 23 22 45 10.6828725632849 11.7816001568579 -1.09872759357296 T:C C T 10 0.535527279857177 0.76675033434233 ENSG00000104903:ENST00000264824:exon_13211651_13212009:LYL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 13249244 A/G 1 69 55 124 32.0486176898548 29.4540003921447 2.59461729771006 A:G A G 10 0.535527279857177 0.653779315402514 ENSG00000160877:ENST00000292431:exon_13248961_13251955:NACC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 13 8 21 6.0381453618567 4.28421823885742 1.75392712299928 A:G A G 10 0.535527279857177 0.515688372849167 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 14040896 G/A 1 61 47 108 28.3328359287122 25.1697821532873 3.16305377542489 A:G G A 10 0.535527279857177 0.563895480670614 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14040891_14040967:CC2D1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 14153293 T/C 1 13 14 27 6.0381453618567 7.49738191800048 -1.45923655614378 T:C T C 10 0.535527279857177 0.700369496789269 ENSG00000104998:ENST00000263379:exon_14153265_14153424:IL27RA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 14231256 T/C 1 92 76 168 42.7314902531397 40.7000732691454 2.03141698399427 T:C T C 10 0.535527279857177 0.816589313498101 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 14582539 C/T 1 177 135 312 82.2116714652797 72.2961827807189 9.91548868456078 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.280871735170602 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 18 21 39 8.36050896257082 11.2460728770007 -2.8855639144299 A:G G A 10 0.535527279857177 0.422707679943069 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 14682804 G/C 1 126 113 239 58.5235627379957 60.514582623861 -1.99101988586529 C:G G C 10 0.535527279857177 0.795772241207534 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14682701_14682886:NDUFB7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 26 16 42 12.0762907237134 8.56843647771483 3.50785424599857 A:G G A 10 0.535527279857177 0.35347027796099 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 15 11 26 6.96709080214235 5.89080007842895 1.0762907237134 A:C C A 10 0.535527279857177 0.69952867420128 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 15350594 G/A 1 57 43 100 26.4749450481409 23.0276730338586 3.44727201428231 A:G G A 10 0.535527279857177 0.547760983470735 ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15350470_15350632:BRD4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 15533902 C/T 1 27 37 64 12.5407634438562 19.8145093547155 -7.27374591085933 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0790170573226913 ENSG00000011451:ENST00000263381:exon_15532319_15534046:WIZ;ENSG00000011451:ENST00000389282:exon_15532319_15534046:WIZ;ENSG00000011451:ENST00000416927:exon_15532319_15534046:WIZ HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 15569378 G/C 1 20 22 42 9.28945440285646 11.7816001568579 -2.49214575400143 C:G G C 10 0.535527279857177 0.444575577074634 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15569340_15569466:RASAL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 15574858 C/T 1 48 49 97 22.2946905668555 26.2408367130017 -3.94614614614616 T:C C T 10 0.535527279857177 0.476317586209553 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15574842_15575188:RASAL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 30 65 95 13.9341816042847 34.8092731907165 -20.8750915864318 T:C C T 10 0.535527279857177 1.91284781221666e-05 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 16547778 C/T 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000127527:ENST00000455140:exon_16547748_16547810:EPS15L1;ENSG00000127527:ENST00000248070:exon_16547748_16547810:EPS15L1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 17160720 G/A 1 27 24 51 12.5407634438562 12.8526547165722 -0.311891272716025 A:T:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17160573_17160986:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17160573_17160986:HAUS8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 17163661 C/T 1 40 41 81 18.5789088057129 21.9566184741443 -3.37770966843134 T:C C T 10 0.535527279857177 0.504236163337906 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17163635_17163776:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17163635_17163776:HAUS8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 54 44 98 25.0815268877124 23.5632003137158 1.51832657399666 T:C T C 10 0.535527279857177 0.839621943905892 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 46 52 98 21.3657451265699 27.8474185525732 -6.48167342600334 A:G A G 10 0.535527279857177 0.224075130734524 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 17337555 C/A 1 23 12 35 10.6828725632849 6.42632735828612 4.25654520499881 A:C C A 10 0.535527279857177 0.175991512534223 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 17389648 C/T 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 T:C C T 10 0.535527279857177 0.189602051724503 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 17389704 G/A 1 78 60 138 36.2288721711402 32.1316367914306 4.09723537970958 A:G G A 10 0.535527279857177 0.496085771017794 ENSG00000105393:ENST00000447614:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000359435:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000300965:exon_17389654_17390144:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000442848:exon_17389654_17390144:C19orf62 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 17397244 C/T 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17397189_17397361:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17397189_17398455:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17397189_17398455:ANKLE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 17417080 C/T 1 120 135 255 55.7367264171388 72.2961827807189 -16.5594563635801 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0383929930082233 ENSG00000130312:ENST00000252602:exon_17416975_17417652:MRPL34 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 17622614 C/T 1 75 34 109 34.8354540107117 18.207927515144 16.6275264955677 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00143946467552461 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17622432_17622769:PGLS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 88 88 176 40.8735993725684 47.1264006274316 -6.25280125486314 A:G A G 10 0.535527279857177 0.364803414368686 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 17885270 A/G 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 A:G A G 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17885203_17885287:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17885203_17885287:FCHO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 17886940 G/A 1 13 8 21 6.0381453618567 4.28421823885742 1.75392712299928 A:G G A 10 0.535527279857177 0.515688372849167 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17886792_17886970:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17886792_17886970:FCHO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 18170384 G/A 1 10 20 30 4.64472720142823 10.7105455971435 -6.06581839571531 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0285715048547694 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 18186575 G/A 1 9 3 12 4.18025448128541 1.60658183957153 2.57367264171388 A:G G A 10 0.535527279857177 0.158167791151507 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 18186618 T/C 1 7 8 15 3.25130904099976 4.28421823885742 -1.03290919785765 T:C T C 10 0.535527279857177 0.614933682686176 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 18191664 C/G 1 12 8 20 5.57367264171388 4.28421823885742 1.28945440285646 C:G C G 10 0.535527279857177 0.656931290438306 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18191642_18191811:IL12RB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 18860635 C/T 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:C C T 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000105662:ENST00000262813:exon_18860591_18860685:CRTC1;ENSG00000105662:ENST00000338797:exon_18860591_18860685:CRTC1;ENSG00000105662:ENST00000321949:exon_18860591_18860685:CRTC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 19011244 T/C 1 574 616 1190 266.60734136198 329.884804392021 -63.2774630300406 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.000248035324791084 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19011190_19011258:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19011190_19011258:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19011190_19011258:COPE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 19021842 G/A 1 156 137 293 72.4577443422804 73.3672373404332 -0.909492998152857 A:G G A 10 0.535527279857177 0.95330965539219 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19021780_19021880:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19021780_19021880:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19021780_19021880:COPE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 143 122 265 66.4195989804237 65.3343281425756 1.08527083784811 T:C T C 10 0.535527279857177 0.902151328914119 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 19032680 T/C 1 25 15 40 11.6118180035706 8.03290919785765 3.57890880571292 T:C T C 10 0.535527279857177 0.27163363697965 ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19032652_19032773:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19032652_19032773:DDX49 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 19105131 G/A 1 10 15 25 4.64472720142823 8.03290919785765 -3.38818199642942 A:G G A 10 0.535527279857177 0.228613574956332 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 19105259 G/A 1 62 62 124 28.797308648855 33.202691351145 -4.40538270228994 A:G G A 10 0.535527279857177 0.471546844575671 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19105175_19105295:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19105175_19105295:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000456085:exon_19105175_19106089:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19105175_19105295:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19105175_19105295:SUGP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 19136541 C/T 1 19 14 33 8.82498168271364 7.49738191800048 1.32759976471316 T:C C T 10 0.535527279857177 0.7283277168968 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 20003109 A/G 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 A:G A G 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000355095:exon_20003002_20003556:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000427401:exon_20003035_20003166:ZNF90 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 20003576 C/G 1 14 22 36 6.50261808199952 11.7816001568579 -5.27898207485837 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0942326952420247 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 20116963 C/T 1 8 2 10 3.71578176114258 1.07105455971435 2.64472720142823 T:C C T 10 0.535527279857177 0.118249545982972 ENSG00000197124:ENST00000397165:exon_20115227_20118084:ZNF682;ENSG00000197124:ENST00000397162:exon_20115227_20118084:ZNF682;ENSG00000197124:ENST00000358523:exon_20115227_20118084:ZNF682 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 23543873 G/A 1 9 3 12 4.18025448128541 1.60658183957153 2.57367264171388 A:G G A 10 0.535527279857177 0.158167791151507 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 23926916 T/C 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 T:C T C 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000196172:ENST00000402377:exon_23921997_23928125:ZNF681;ENSG00000196172:ENST00000360204:exon_23921999_23928125:ZNF681 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 23927345 T/C 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C T C 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000196172:ENST00000402377:exon_23921997_23928125:ZNF681;ENSG00000196172:ENST00000360204:exon_23921999_23928125:ZNF681 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 24310032 A/T 1 8 11 19 3.71578176114258 5.89080007842895 -2.17501831728636 A:T A T 10 0.535527279857177 0.362455450147038 ENSG00000213096:ENST00000357002:exon_24309056_24312643:ZNF254 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 30308425 A/G 1 21 14 35 9.75392712299928 7.49738191800048 2.25654520499881 A:G A G 10 0.535527279857177 0.500276662521839 ENSG00000105173:ENST00000262643:exon_30308313_30308448:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000357943:exon_30308313_30308448:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000444983:exon_30308313_30308448:CCNE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 32873698 A/G 1 10 14 24 4.64472720142823 7.49738191800048 -2.85265471657225 A:G A G 10 0.535527279857177 0.306793066047406 ENSG00000168813:ENST00000355898:exon_32873623_32878572:ZNF507;ENSG00000168813:ENST00000311921:exon_32873623_32878572:ZNF507 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 33096786 G/A 1 14 17 31 6.50261808199952 9.10396375757201 -2.60134567557249 A:G G A 10 0.535527279857177 0.372478400047806 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 30 19 49 13.9341816042847 10.1750183172864 3.75916328699833 T:C C T 10 0.535527279857177 0.31747152067797 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 9 12 21 4.18025448128541 6.42632735828612 -2.24607287700072 T:C C T 10 0.535527279857177 0.384351839373372 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 33183352 G/C 1 17 15 32 7.89603624242799 8.03290919785765 -0.136872955429662 C:G G C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 7 11 18 3.25130904099976 5.89080007842895 -2.63949103742919 A:G G A 10 0.535527279857177 0.242667099484109 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 33467515 T/C 1 8 15 23 3.71578176114258 8.03290919785765 -4.31712743671507 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0932088331135184 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 33602757 C/T 1 15 7 22 6.96709080214235 3.74869095900024 3.21839984314211 T:C C T 10 0.535527279857177 0.202291951159974 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33602630_33602808:GPATCH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 33608733 C/A 1 20 4 24 9.28945440285646 2.14210911942871 7.14734528342775 A:C C A 10 0.535527279857177 0.00344783730506492 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33608731_33608947:GPATCH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 33617583 C/T 1 9 17 26 4.18025448128541 9.10396375757201 -4.9237092762866 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0748738537647927 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33617494_33617639:GPATCH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 33878198 A/G 1 24 29 53 11.1473452834278 15.5302911158581 -4.38294583243038 A:G A G 10 0.535527279857177 0.270608485366989 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33877865_33878387:PEPD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 33878837 G/A 1 24 20 44 11.1473452834278 10.7105455971435 0.436799686284214 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33878796_33878987:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33878796_33878987:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33878796_33878987:PEPD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 34843761 C/A 0 8 0 8 3.71578176114258 0 3.71578176114258 C C 10 0.535527279857177 0.00893088209752 ENSG00000166398:ENST00000299505:exon_34843552_34846471:KIAA0355 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 35175749 C/G 1 14 10 24 6.50261808199952 5.35527279857177 1.14734528342775 C:G C G 10 0.535527279857177 0.686885042146951 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 35233027 C/T 1 13 8 21 6.0381453618567 4.28421823885742 1.75392712299928 T:C C T 10 0.535527279857177 0.515688372849167 ENSG00000197841:ENST00000392232:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000448715:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000425140:exon_35231516_35233774:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000492450:exon_35231516_35233091:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000459757:exon_35231516_35233091:ZNF181 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 256 305 561 118.905016356563 163.335820356439 -44.4308039998763 T:C:G T G 10 0.535527279857177 0.000190366967957689 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 613 456 1069 284.72177744755 244.200439614873 40.5213378326778 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0129996725713304 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 35660508 G/A 1 656 561 1217 304.694104413692 300.430803999876 4.26330041381561 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.818200597902706 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35660469_35660536:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 35757427 G/A 1 54 46 100 25.0815268877124 24.6342548734301 0.447272014282301 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35757262_35757435:LSR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 35836530 G/A 1 293 284 577 136.090507001847 152.089747479438 -15.9992404775911 A:G G A 10 0.535527279857177 0.182004294418065 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35836505_35836623:CD22 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 36207510 G/A 1 252 210 462 117.047125475991 112.460728770007 4.58639670598424 A:G G A 10 0.535527279857177 0.674957803438681 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36207380_36207940:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36207380_36207940:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36207380_36207654:ZBTB32 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 37004938 T/C 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 T:C T C 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 37210805 C/T 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 T:C C T 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 37441111 C/T 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 T:C C T 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000198453:ENST00000333987:exon_37440414_37441990:ZNF568;ENSG00000198453:ENST00000415168:exon_37440414_37443645:ZNF568 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 14 13 27 6.50261808199952 6.9618546381433 -0.459236556143778 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 37854580 C/T 1 22 18 40 10.2183998431421 9.63949103742918 0.578908805712922 T:C C T 10 0.535527279857177 0.875587467242644 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 62 80 142 28.797308648855 42.8421823885742 -14.0448737397191 A:T:C T C 10 0.535527279857177 0.018565074831294 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 70 66 136 32.5130904099976 35.3448004705737 -2.83171006057607 T:C C T 10 0.535527279857177 0.66755502399918 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 69 58 127 32.0486176898548 31.0605822317163 0.988035458138523 T:C C T 10 0.535527279857177 0.929161423501087 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 39322087 T/G 1 208 230 438 96.6103257897072 123.171274367151 -26.5609485774435 T:G T G 10 0.535527279857177 0.0111225717084043 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 39412881 C/T 1 5 15 20 2.32236360071412 8.03290919785765 -5.71054559714354 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0126166881050140 ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39412878_39412907:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39412878_39412907:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39412878_39412907:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39412878_39412907:FBXO17 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 39888390 G/C 1 33 39 72 15.3275997647132 20.8855639144299 -5.55796414971674 C:G G C 10 0.535527279857177 0.195620774918379 ENSG00000063322:ENST00000315588:exon_39888097_39891201:MED29;ENSG00000063322:ENST00000435462:exon_39888167_39888397:MED29 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 39908214 C/T 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:C C T 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39908195_39908332:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39908195_39908332:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39908195_39908332:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39908195_39908332:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39908195_39908332:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39908195_39908332:PLEKHG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 39972581 G/C 1 24 32 56 11.1473452834278 17.1368729554297 -5.98952767200191 C:G G C 10 0.535527279857177 0.139867997562190 ENSG00000105197:ENST00000314349:exon_39972523_39972673:TIMM50 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 40197998 G/A 1 8 13 21 3.71578176114258 6.9618546381433 -3.24607287700072 A:G G A 10 0.535527279857177 0.190471702102025 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40197818_40198028:LGALS14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 40199914 C/G 1 7 9 16 3.25130904099976 4.81974551871459 -1.56843647771483 C:G C G 10 0.535527279857177 0.462143040312805 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40199837_40200087:LGALS14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 40480456 G/A 1 225 197 422 104.506362032135 105.498874131864 -0.992512099728671 A:G G A 10 0.535527279857177 0.922342790041774 ENSG00000013275:ENST00000157812:exon_40480431_40480540:PSMC4;ENSG00000013275:ENST00000455878:exon_40480431_40480540:PSMC4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 40719076 T/C 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 T:C T C 10 0.535527279857177 0.809233970242324 ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40718983_40719095:MAP3K10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 24 15 39 11.1473452834278 8.03290919785765 3.1144360855701 T:C T C 10 0.535527279857177 0.339697115276141 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 41128309 C/T 1 8 10 18 3.71578176114258 5.35527279857177 -1.63949103742919 T:C C T 10 0.535527279857177 0.484703765251006 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41128306_41128572:LTBP4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 42583294 T/C 1 8 5 13 3.71578176114258 2.67763639928588 1.0381453618567 T:C T C 10 0.535527279857177 0.593586480755975 ENSG00000105732:ENST00000222339:exon_42582739_42585717:ZNF574;ENSG00000105732:ENST00000359044:exon_42582739_42585717:ZNF574 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 42795554 T/C 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 T:C T C 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000079432:ENST00000160740:exon_42794385_42795618:CIC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 42906914 G/T 1 23 21 44 10.6828725632849 11.2460728770007 -0.563200313715786 T:G G T 10 0.535527279857177 0.880949379207489 ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42906759_42907183:LIPE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 42910416 C/T 1 8 3 11 3.71578176114258 1.60658183957153 2.10919992157105 T:C C T 10 0.535527279857177 0.23951309450586 ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42910313_42910540:LIPE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 42911558 C/T 1 12 16 28 5.57367264171388 8.56843647771483 -2.99476383600095 T:C C T 10 0.535527279857177 0.263198055324704 ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42911326_42911620:LIPE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 20 24 44 9.28945440285646 12.8526547165722 -3.56320031371579 T:C T C 10 0.535527279857177 0.293725279448287 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44057574 G/A 1 53 59 112 24.6170541675696 31.5961095115734 -6.97905534400382 A:G G A 10 0.535527279857177 0.217954349549769 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057553_44057664:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057553_44057664:XRCC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44153003 C/T 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 T:C C T 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44152732_44153295:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44152732_44153295:PLAUR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44156472 T/C 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000011422:ENST00000339082:exon_44156377_44156523:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44156377_44156523:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44156377_44156523:PLAUR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44571154 T/C 1 16 7 23 7.43156352228517 3.74869095900024 3.68287256328493 T:C T C 10 0.535527279857177 0.145529269824070 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44610665 A/G 1 7 10 17 3.25130904099976 5.35527279857177 -2.10396375757201 A:G A G 10 0.535527279857177 0.338715846297251 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44610798 A/T 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 A:T A T 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 17 3 20 7.89603624242799 1.60658183957153 6.28945440285646 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00571818397324624 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44611420 A/G 1 11 9 20 5.10919992157105 4.81974551871459 0.289454402856461 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 20 8 28 9.28945440285646 4.28421823885742 5.00523616399904 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0605447664268705 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 22 9 31 10.2183998431421 4.81974551871459 5.39865432442751 A:T A T 10 0.535527279857177 0.0701884893647852 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 22 20 42 10.2183998431421 10.7105455971435 -0.492145754001433 A:G A G 10 0.535527279857177 0.878574483565324 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44739303 T/C 1 5 10 15 2.32236360071412 5.35527279857177 -3.03290919785765 T:C T C 10 0.535527279857177 0.128132638231981 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44739399 T/C 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 T:C T C 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44981525 G/A 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 A:G G A 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 44981883 C/G 1 1 9 10 0.464472720142823 4.81974551871459 -4.35527279857177 C:G C G 10 0.535527279857177 0.00779531985117688 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 45490570 A/G 1 11 20 31 5.10919992157105 10.7105455971435 -5.60134567557249 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0482942822791167 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 16 24 40 7.43156352228517 12.8526547165722 -5.42109119428708 T:C T C 10 0.535527279857177 0.111873293090683 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 45567305 G/A 1 21 26 47 9.75392712299928 13.9237092762866 -4.16978215328732 A:G G A 10 0.535527279857177 0.243679666219694 ENSG00000104859:ENST00000221455:exon_45567270_45567485:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391953:exon_45567270_45567485:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391952:exon_45567270_45567485:CLASRP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 45854919 T/G 1 19 13 32 8.82498168271364 6.9618546381433 1.86312704457034 T:G T G 10 0.535527279857177 0.596317945495181 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45854853_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45854853_45854979:ERCC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 45855524 G/A 1 33 24 57 15.3275997647132 12.8526547165722 2.47494504814091 A:G G A 10 0.535527279857177 0.59574253745059 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45855467_45855610:ERCC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 45868309 T/G 1 13 17 30 6.0381453618567 9.10396375757201 -3.06581839571531 T:G T G 10 0.535527279857177 0.277280147402981 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391940:exon_45868300_45868416:ERCC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 46216642 G/T 1 12 7 19 5.57367264171388 3.74869095900024 1.82498168271364 T:G G T 10 0.535527279857177 0.493201262474126 ENSG00000177051:ENST00000317683:exon_46213887_46216831:FBXO46 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 46275976 G/C 1 7 11 18 3.25130904099976 5.89080007842895 -2.63949103742919 C:G G C 10 0.535527279857177 0.242667099484109 ENSG00000104936:ENST00000458663:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000447742:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000291270:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000377750:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000342805:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000343373:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000348168:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000354227:exon_46275899_46276010:DMPK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 46341824 C/T 1 50 49 99 23.2236360071412 26.2408367130017 -3.01720070586052 T:C C T 10 0.535527279857177 0.547340794630314 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46341719_46341873:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46341719_46341873:SYMPK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 46352122 A/G 1 28 20 48 13.005236163999 10.7105455971435 2.29469056685551 A:G A G 10 0.535527279857177 0.564082535333613 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46352008_46352134:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46352008_46352134:SYMPK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 46387344 G/A 1 26 23 49 12.0762907237134 12.3171274367151 -0.240836713001672 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 46387503 T/C 1 13 24 37 6.0381453618567 12.8526547165722 -6.81450935471555 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0311088193912882 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 46518651 A/G 1 7 12 19 3.25130904099976 6.42632735828612 -3.17501831728636 A:G A G 10 0.535527279857177 0.170306763434808 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 46518682 G/A 1 7 12 19 3.25130904099976 6.42632735828612 -3.17501831728636 A:G G A 10 0.535527279857177 0.170306763434808 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 47137459 C/T 1 20 8 28 9.28945440285646 4.28421823885742 5.00523616399904 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0605447664268705 ENSG00000167414:ENST00000300873:exon_47137333_47137461:GNG8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 47278938 G/A 1 243 202 445 112.866870994706 108.17651053115 4.69036046355625 A:G G A 10 0.535527279857177 0.669065426847441 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47278142_47279004:SLC1A5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 47280263 T/G 1 183 203 386 84.9985077861366 108.712037811007 -23.7135300248703 T:G T G 10 0.535527279857177 0.0164169002245025 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47280232_47280366:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47280232_47280366:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47280232_47280366:SLC1A5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 127 104 231 58.9880354581385 55.6948371051464 3.29319835299212 A:G G A 10 0.535527279857177 0.69250762666339 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 47585517 G/C 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 C:G G C 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47585441_47585552:ZC3H4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 47764017 G/A 1 25 27 52 11.6118180035706 14.4592365561438 -2.8474185525732 A:G G A 10 0.535527279857177 0.487587224252618 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47763845_47764096:CCDC9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 47768128 G/C 1 17 20 37 7.89603624242799 10.7105455971435 -2.81450935471555 C:G G C 10 0.535527279857177 0.410874358951243 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47768030_47768203:CCDC9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 47770015 A/C 1 36 39 75 16.7210179251416 20.8855639144299 -4.16454598928827 A:C A C 10 0.535527279857177 0.35569947313672 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 49 26 75 22.7591632869983 13.9237092762866 8.83545401071173 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0484800887055989 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 47984058 G/C 1 9 9 18 4.18025448128541 4.81974551871459 -0.639491037429185 C:G G C 10 0.535527279857177 0.816111256590493 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47984017_47984090:KPTN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 48248834 T/C 1 390 318 708 181.144360855701 170.297674994582 10.8466858611187 T:C T C 10 0.535527279857177 0.428873176427093 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 48248907 G/C 1 701 514 1215 325.595376820119 275.261021846589 50.33435497353 T:C:G G C 10 0.535527279857177 0.00400785177268317 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 48254799 T/C 1 508 408 916 235.952141832554 218.495130181728 17.4570116508259 T:C T C 10 0.535527279857177 0.260056250100556 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48254777_48254847:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48254777_48254847:GLTSCR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 240 307 547 111.473452834278 164.406874916153 -52.9334220818758 A:C:G A G 10 0.535527279857177 6.39040003880794e-06 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 48259200 A/G 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 A:G A G 10 0.535527279857177 0.437064527654044 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 48259787 C/T 1 697 647 1344 323.737485939548 346.486150067593 -22.7486641280458 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.218499968610406 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48259785_48259861:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48259785_48259861:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000422743:exon_48259785_48259861:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000325566:exon_48259785_48259861:GLTSCR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 48601454 T/C 1 9 9 18 4.18025448128541 4.81974551871459 -0.639491037429185 T:C T C 10 0.535527279857177 0.816111256590493 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48601396_48601516:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48601364_48601516:PLA2G4C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 48608598 C/G 1 3 8 11 1.39341816042847 4.28421823885742 -2.89080007842895 C:G C G 10 0.535527279857177 0.127667889620419 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48608590_48608701:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48608590_48608701:PLA2G4C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 40 30 70 18.5789088057129 16.0658183957153 2.51309040999761 T:C:G C G 10 0.535527279857177 0.632039670977607 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 48668830 G/A 1 29 19 48 13.4697088841419 10.1750183172864 3.29469056685551 A:G G A 10 0.535527279857177 0.386549728291418 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48668807_48668880:LIG1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 20 23 43 9.28945440285646 12.3171274367151 -3.02767303385861 T:C T C 10 0.535527279857177 0.363569228971288 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 7 13 20 3.25130904099976 6.9618546381433 -3.71054559714354 T:C C T 10 0.535527279857177 0.117313042346182 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 49335965 G/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000087076:ENST00000263278:exon_49335923_49335989:HSD17B14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 49377231 C/A 1 232 259 491 107.757671073135 138.701565483009 -30.9438944098739 A:T:C C A 10 0.535527279857177 0.00572964494631751 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 49378875 G/A 1 180 188 368 83.6050896257081 100.679128613149 -17.0740389874411 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0757383564033024 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 159 186 345 73.8511625027089 99.6080740534349 -25.7569115507261 A:T:G A G 10 0.535527279857177 0.00585649265721009 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 155 146 301 71.9932716221376 78.1869828591478 -6.19371123701026 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.488327303222404 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 138 106 244 64.0972353797096 56.7658916648608 7.33134371484881 A:C:G G C 10 0.535527279857177 0.36908150323401 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 889 994 1883 412.91624820697 532.314116178034 -119.397867971064 T:C T C 10 0.535527279857177 3.69803002716322e-08 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 49485548 G/A 1 6 11 17 2.78683632085694 5.89080007842895 -3.10396375757201 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.149487157554358 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 49949912 G/A 1 40 52 92 18.5789088057129 27.8474185525732 -9.26850974686028 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0596385282257465 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949808_49949951:PIH1D1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 49983673 C/T 1 18 10 28 8.36050896257082 5.35527279857177 3.00523616399905 T:C C T 10 0.535527279857177 0.343681705337631 ENSG00000090554:ENST00000204637:exon_49983555_49983733:FLT3LG;ENSG00000090554:ENST00000436815:exon_49983555_49983733:FLT3LG HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 49994470 T/A 1 8 10 18 3.71578176114258 5.35527279857177 -1.63949103742919 A:T T A 10 0.535527279857177 0.484703765251006 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 49994476 T/C 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 T:C T C 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 50017724 C/T 1 16 13 29 7.43156352228517 6.9618546381433 0.469708884141868 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000104870:ENST00000221466:exon_50017468_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000426395:exon_50017468_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000415900:exon_50017697_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000452439:exon_50017468_50017743:FCGRT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 216 211 427 100.32610755085 112.996256049864 -12.6701484990146 C:G C G 10 0.535527279857177 0.225335266145961 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 50435998 C/T 1 82 106 188 38.0867630517115 56.7658916648608 -18.6791286131493 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00674854213340118 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 50436371 G/A 1 210 142 352 97.5392712299928 76.0448737397191 21.4943974902737 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.0216153881542011 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 29 36 65 13.4697088841419 19.2789820748584 -5.8092731907165 A:G G A 10 0.535527279857177 0.171291455309282 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 50496183 C/T 1 17 25 42 7.89603624242799 13.3881819964294 -5.49214575400143 T:C C T 10 0.535527279857177 0.120826780230311 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50496117_50496209:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50496117_50496209:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50496117_50496209:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50496117_50496209:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50496117_50496209:VRK3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 51920613 C/T 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000142512:ENST00000353836:exon_51920336_51920719:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000432469:exon_51920386_51920719:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000442846:exon_51920336_51920688:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000441969:exon_51920336_51920719:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000525998:exon_51920336_51920719:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000436984:exon_51920336_51920719:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000439889:exon_51920336_51920719:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000339313:exon_51920336_51920719:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000524527:exon_51920177_51920719:SIGLEC10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 52448384 T/C 1 6 12 18 2.78683632085694 6.42632735828612 -3.63949103742918 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.100224935165788 ENSG00000176024:ENST00000391794:exon_52447372_52449005:ZNF613;ENSG00000176024:ENST00000293471:exon_52447372_52449005:ZNF613 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 52468998 A/G 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 A:G A G 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 52471872 A/G 1 8 7 15 3.71578176114258 3.74869095900024 -0.0329091978576543 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 52887437 A/C 0 0 13 13 0 6.9618546381433 -6.9618546381433 C A C 10 0.535527279857177 4.68255354058548e-05 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 T:C T C 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 53344701 A/G 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000204604:ENST00000243639:exon_53341786_53345404:ZNF468;ENSG00000204604:ENST00000396409:exon_53343932_53345404:ZNF468 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 53453777 C/T 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 54657604 G/A 1 3 8 11 1.39341816042847 4.28421823885742 -2.89080007842895 A:G G A 10 0.535527279857177 0.127667889620419 ENSG00000088038:ENST00000482247:exon_54657452_54659418:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000489953:exon_54657452_54659419:CNOT3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55174498 T/C 1 22 11 33 10.2183998431421 5.89080007842895 4.32759976471316 T:C T C 10 0.535527279857177 0.162539476074664 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174124_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174407_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174447_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174450_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174472_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174479_55174519:LILRB4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 9 13 22 4.18025448128541 6.9618546381433 -2.78160015685789 T:C C T 10 0.535527279857177 0.286672118812446 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 22 11 33 10.2183998431421 5.89080007842895 4.32759976471316 A:G A G 10 0.535527279857177 0.162539476074664 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55179364 A/G 1 35 30 65 16.2565452049988 16.0658183957153 0.190726809283497 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55179324_55181810:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55179324_55179844:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55179324_55179855:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55179324_55179848:LILRB4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55378083 T/C 0 8 0 8 3.71578176114258 0 3.71578176114258 T T 10 0.535527279857177 0.00893088209752 ENSG00000167633:ENST00000355608:exon_55377977_55378662:KIR3DL1;ENSG00000240403:ENST00000326321:exon_55377977_55378662:KIR3DL2;ENSG00000240403:ENST00000270442:exon_55377977_55378415:KIR3DL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55481398 G/A 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 A:G G A 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55481367_55481663:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55481367_55481663:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55481367_55481663:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55481367_55481663:NLRP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55485899 G/A 1 20 7 27 9.28945440285646 3.74869095900024 5.54076344385622 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0344618172951378 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55485868_55485912:NLRP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55494466 G/A 1 28 15 43 13.005236163999 8.03290919785765 4.97232696614139 A:G G A 10 0.535527279857177 0.168119510191600 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55494651 A/G 1 25 26 51 11.6118180035706 13.9237092762866 -2.31189127271603 A:G A G 10 0.535527279857177 0.575230501488791 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55494740 T/C 1 22 40 62 10.2183998431421 21.4210911942871 -11.202691351145 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00486097962393513 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55494881 C/G 1 28 32 60 13.005236163999 17.1368729554297 -4.13163679143062 A:C:G C G 10 0.535527279857177 0.302348341839789 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55505686 C/G 1 19 31 50 8.82498168271364 16.6013456755725 -7.77636399285885 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0328025838516542 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55505637_55505807:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55505637_55505807:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55505637_55505807:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55505637_55505807:NLRP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55512137 C/A 1 118 54 172 54.8077809768531 28.9184731122876 25.8893078645656 A:C C A 10 0.535527279857177 6.47862553011544e-05 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55512232 C/A 1 58 81 139 26.9394177682837 43.3777096684313 -16.4382919001476 A:C C A 10 0.535527279857177 0.00630898536219746 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55512316 T/G 1 52 91 143 24.1525814474268 48.7329824670031 -24.5804010195763 T:G T G 10 0.535527279857177 4.88403480142758e-05 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 20 22 42 9.28945440285646 11.7816001568579 -2.49214575400143 T:C T C 10 0.535527279857177 0.444575577074634 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55738746 G/A 1 9 9 18 4.18025448128541 4.81974551871459 -0.639491037429185 A:G G A 10 0.535527279857177 0.816111256590493 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55738116_55738931:TMEM86B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 11 11 22 5.10919992157105 5.89080007842895 -0.781600156857893 T:C C T 10 0.535527279857177 0.831868960719931 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55995272 G/A 1 6 9 15 2.78683632085694 4.81974551871459 -2.03290919785765 A:G G A 10 0.535527279857177 0.312914646957404 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 55998262 C/T 1 15 9 24 6.96709080214235 4.81974551871459 2.14734528342775 T:C C T 10 0.535527279857177 0.419204092334723 ENSG00000090971:ENST00000205194:exon_55997775_55998935:NAT14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 56089353 C/T 1 28 37 65 13.005236163999 19.8145093547155 -6.8092731907165 T:C C T 10 0.535527279857177 0.105617585848880 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 56114045 C/T 1 26 26 52 12.0762907237134 13.9237092762866 -1.8474185525732 T:C C T 10 0.535527279857177 0.677191733564713 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 44 60 104 20.4367996862842 32.1316367914306 -11.6948371051464 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0235841403171038 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 56156447 A/G 1 105 87 192 48.7696356149964 46.5908733475744 2.17876226742202 A:G A G 10 0.535527279857177 0.772649396956255 ENSG00000171425:ENST00000270451:exon_56155919_56156988:ZNF581 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 56203331 C/T 0 104 0 104 48.3051628948536 0 48.3051628948536 C C 10 0.535527279857177 6.87464816893675e-29 ENSG00000063245:ENST00000085079:exon_56203120_56203423:EPN1;ENSG00000063245:ENST00000270460:exon_56203120_56203423:EPN1;ENSG00000063245:ENST00000411543:exon_56203120_56203423:EPN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 56935527 A/G 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000198440:ENST00000291598:exon_56934260_56936400:ZNF583 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 58083467 C/T 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:C C T 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000083817:ENST00000196489:exon_58082935_58085069:ZNF416 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 58152361 T/A 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 A:T T A 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 58152795 C/T 1 14 10 24 6.50261808199952 5.35527279857177 1.14734528342775 T:C C T 10 0.535527279857177 0.686885042146951 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 58152817 G/C 1 13 12 25 6.0381453618567 6.42632735828612 -0.388181996429424 A:C:G G C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 58153000 T/C 1 11 10 21 5.10919992157105 5.35527279857177 -0.246072877000716 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 58153009 C/T 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 T:C C T 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 58153577 T/C 1 9 13 22 4.18025448128541 6.9618546381433 -2.78160015685789 T:C T C 10 0.535527279857177 0.286672118812446 ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 58213952 C/A 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:C C A 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000249233:ENST00000512439:exon_58213003_58214156:ZNF154 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 58453342 T/C 1 13 7 20 6.0381453618567 3.74869095900024 2.28945440285646 T:C T C 10 0.535527279857177 0.373042117571353 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58452206_58454015:ZNF256 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 58718269 G/A 1 15 18 33 6.96709080214235 9.63949103742918 -2.67240023528684 A:G G A 10 0.535527279857177 0.385781280718001 ENSG00000171606:ENST00000326804:exon_58718087_58718568:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000424679:exon_58718087_58718361:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000345813:exon_58718087_58718361:ZNF274 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 19 58991638 C/T 1 13 8 21 6.0381453618567 4.28421823885742 1.75392712299928 T:C C T 10 0.535527279857177 0.515688372849167 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 12 16 28 5.57367264171388 8.56843647771483 -2.99476383600095 T:C C T 10 0.535527279857177 0.263198055324704 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 124 162 286 57.5946172977101 86.7554193368627 -29.1608020391526 A:G A G 10 0.535527279857177 0.000572085165084271 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 677295 C/T 0 60 0 60 27.8683632085694 0 27.8683632085694 C C 10 0.535527279857177 7.85550784396461e-17 ENSG00000151353:ENST00000281017:exon_677289_677439:TMEM18;ENSG00000151353:ENST00000432667:exon_677289_677406:TMEM18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 8871342 C/A 1 15 29 44 6.96709080214235 15.5302911158581 -8.56320031371579 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0101709192605535 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 9634856 A/G 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 A:G A G 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000134330:ENST00000481367:exon_9634831_9634989:IAH1;ENSG00000151694:ENST00000310823:exon_9634766_9634896:ADAM17 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 10059770 G/T 1 14 8 22 6.50261808199952 4.28421823885742 2.21839984314211 T:G G T 10 0.535527279857177 0.397197441912417 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 10930903 T/C 1 195 131 326 90.5721804278505 70.1540736612902 20.4181067665603 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0262005681284100 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10930845_10930959:PDIA6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 170 112 282 78.9603624242799 59.9790553440038 18.9813070802761 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0233613935873059 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 22 21 43 10.2183998431421 11.2460728770007 -1.02767303385861 T:C C T 10 0.535527279857177 0.762236365418988 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 15372562 C/T 1 13 12 25 6.0381453618567 6.42632735828612 -0.388181996429424 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15372546_15372635:NBAS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 15378808 C/G 1 41 38 79 19.0433815258557 20.3500366345727 -1.30665510871698 C:G C G 10 0.535527279857177 0.821807932191592 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15378592_15378810:NBAS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 15763639 A/G 1 59 56 115 27.4038904884266 29.9895276720019 -2.58563718357535 A:G A G 10 0.535527279857177 0.641220933248415 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15763560_15763706:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15763560_15763706:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000470674:exon_15763560_15763706:DDX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 17884495 C/T 1 19 4 23 8.82498168271364 2.14210911942871 6.68287256328493 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00559662733248374 ENSG00000163029:ENST00000448223:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000351948:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000381272:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000402989:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000446852:exon_17884424_17884559:SMC6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 17897488 T/C 1 15 18 33 6.96709080214235 9.63949103742918 -2.67240023528684 T:C T C 10 0.535527279857177 0.385781280718001 ENSG00000163029:ENST00000448223:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000351948:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000381272:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000402989:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000446852:exon_17897353_17897531:SMC6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 17962518 C/T 1 9 1 10 4.18025448128541 0.535527279857177 3.64472720142823 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0246218512642377 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 20403949 C/T 1 3 8 11 1.39341816042847 4.28421823885742 -2.89080007842895 T:C C T 10 0.535527279857177 0.127667889620419 ENSG00000115884:ENST00000254351:exon_20403574_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000381150:exon_20403574_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000403076:exon_20403723_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000482879:exon_20403763_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000429035:exon_20403579_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000447124:exon_20403913_20404052:SDC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 20838318 G/A 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 A:G G A 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 24290671 G/A 1 205 177 382 95.2169076292787 94.7883285347203 0.428579094558401 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000115128:ENST00000233468:exon_24290454_24290721:AC008073.5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 24305824 A/G 1 26 8 34 12.0762907237134 4.28421823885742 7.79207248485598 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00896790134402984 ENSG00000115129:ENST00000335934:exon_24305755_24306022:TP53I3;ENSG00000115129:ENST00000238721:exon_24305755_24306022:TP53I3;ENSG00000115129:ENST00000313482:exon_24305755_24306022:TP53I3;ENSG00000115129:ENST00000407482:exon_24305755_24306022:TP53I3;ENSG00000115129:ENST00000413037:exon_24305755_24306022:TP53I3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 24431184 C/T 1 17 23 40 7.89603624242799 12.3171274367151 -4.42109119428708 T:C C T 10 0.535527279857177 0.204267301663680 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000427234:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449392:exon_24431106_24431185:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24431106_24431188:ITSN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 24432839 A/G 1 15 15 30 6.96709080214235 8.03290919785765 -1.06581839571531 A:G A G 10 0.535527279857177 0.717832749087862 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24432687_24433198:ITSN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 24524958 C/T 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 T:C C T 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000406921:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449230:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000412011:exon_24524834_24524971:ITSN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 26455127 G/A 1 69 52 121 32.0486176898548 27.8474185525732 4.20119913728158 A:G G A 10 0.535527279857177 0.466866463639617 ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000457468:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000461025:exon_26455070_26455147:HADHA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 26502875 T/C 1 71 102 173 32.9775631301404 54.6237825454321 -21.6462194152916 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00101781105464058 ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26502862_26502983:HADHB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 27355991 G/T 1 52 49 101 24.1525814474268 26.2408367130017 -2.08825526557487 T:G G T 10 0.535527279857177 0.6909076736296 ENSG00000138073:ENST00000468045:exon_27355985_27357497:PREB;ENSG00000138073:ENST00000260643:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000444452:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000406567:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000474802:exon_27355985_27356589:PREB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 27424636 G/A 1 25 26 51 11.6118180035706 13.9237092762866 -2.31189127271603 A:G G A 10 0.535527279857177 0.575230501488791 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 13 11 24 6.0381453618567 5.89080007842895 0.147345283427753 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 27 27 54 12.5407634438562 14.4592365561438 -1.91847311228756 A:G A G 10 0.535527279857177 0.682745837825282 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 29356669 A/G 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000115295:ENST00000426642:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401605:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401617:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000415891:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000404424:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000402240:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000456385:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000320081:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000530644:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000379543:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000450018:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000449202:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000438819:exon_29356521_29356682:CLIP4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 71 62 133 32.9775631301404 33.202691351145 -0.225128221004532 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 32822957 G/A 1 36 28 64 16.7210179251416 14.994763836001 1.72625408914068 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.708089724559034 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32822818_32823035:BIRC6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 37429962 A/G 1 74 80 154 34.3709812905689 42.8421823885742 -8.47120109800525 A:G A G 10 0.535527279857177 0.195988678939252 ENSG00000218739:ENST00000402297:exon_37429006_37431884:AC007390.5;ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37429927_37430008:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37429927_37430008:CEBPZ HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 71 79 150 32.9775631301404 42.306655108717 -9.32909197857654 A:G G A 10 0.535527279857177 0.140512614061400 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 37458711 G/A 1 18 12 30 8.36050896257082 6.42632735828612 1.93418160428469 A:G G A 10 0.535527279857177 0.583930457533564 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 37458898 G/A 1 8 7 15 3.71578176114258 3.74869095900024 -0.0329091978576543 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000003509:ENST00000455230:exon_37458774_37458903:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000414639:exon_37458774_37458903:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37458774_37458903:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37458774_37458903:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37458806_37458903:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37458809_37458903:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000336237:exon_37458822_37458903:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000431821:exon_37458832_37458903:C2orf56 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 37468837 G/A 1 9 4 13 4.18025448128541 2.14210911942871 2.0381453618567 A:G G A 10 0.535527279857177 0.282589464001187 ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37468721_37468934:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37468721_37468934:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37468721_37469836:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37468721_37468934:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000431821:exon_37468721_37468934:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000469831:exon_37468721_37469099:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000483999:exon_37468721_37468934:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000439218:exon_37468721_37468934:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000432075:exon_37468721_37468882:C2orf56 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 37486774 A/G 1 6 10 16 2.78683632085694 5.35527279857177 -2.56843647771483 A:G A G 10 0.535527279857177 0.218648734569296 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37486726_37486824:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37486726_37486824:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000469275:exon_37486726_37486824:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000452104:exon_37486726_37486824:PRKD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 38537579 T/C 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 T:C T C 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38537451_38537589:ATL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 42515437 A/G 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 A:G A G 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 23 6 29 10.6828725632849 3.21316367914306 7.46970888414187 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0050098382628214 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 A:T T A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 43015719 T/C 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C T C 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 43518843 A/G 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485018:exon_43518835_43519361:THADA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 43801712 A/G 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 A:G A G 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43801475_43801952:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43801475_43802166:THADA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 20 23 43 9.28945440285646 12.3171274367151 -3.02767303385861 T:C T C 10 0.535527279857177 0.363569228971288 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 44201376 T/C 1 51 57 108 23.688108727284 30.5250549518591 -6.83694622457511 T:C T C 10 0.535527279857177 0.209780724508792 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44201289_44201434:LRPPRC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 44209477 C/T 1 11 9 20 5.10919992157105 4.81974551871459 0.289454402856461 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44209377_44209573:LRPPRC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 44547574 G/A 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 A:G G A 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000138079:ENST00000260649:exon_44547338_44548633:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409380:exon_44547338_44547960:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409740:exon_44547338_44547937:SLC3A1;ENSG00000138078:ENST00000425263:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000426481:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409957:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409411:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409936:exon_44545905_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000444696:exon_44547405_44547782:PREPL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 45640374 C/A 1 14 28 42 6.50261808199952 14.994763836001 -8.49214575400143 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0123645457708417 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 45645512 C/T 1 17 35 52 7.89603624242799 18.7434547950012 -10.8474185525732 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00316494158831574 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45645504_45645680:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45645504_45645680:SRBD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 47710049 T/C 1 35 57 92 16.2565452049988 30.5250549518591 -14.2685097468603 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00326604413913876 ENSG00000095002:ENST00000233146:exon_47709918_47710367:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394794:exon_47709918_47710360:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000419559:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000432737:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000453755:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000448533:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394792:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000413880:exon_47709918_47710088:MSH2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 54849508 A/G 1 16 17 33 7.43156352228517 9.10396375757201 -1.67240023528684 A:G A G 10 0.535527279857177 0.603164691033159 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54849437_54849624:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000389980:exon_54849437_54849624:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54849437_54849624:SPTBN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 54858214 A/G 1 82 64 146 38.0867630517115 34.2737459108593 3.81301714085216 A:G A G 10 0.535527279857177 0.561782838298682 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 54858664 C/T 1 66 61 127 30.6551995294263 32.6671640712878 -2.01196454186147 T:C C T 10 0.535527279857177 0.722973113992249 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 79 78 157 36.693344891283 41.7711278288598 -5.07778293757679 A:G G A 10 0.535527279857177 0.424651913126311 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 27 29 56 12.5407634438562 15.5302911158581 -2.98952767200191 A:G A G 10 0.535527279857177 0.425589241139246 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 36 33 69 16.7210179251416 17.6724002352868 -0.95138231014521 A:G A G 10 0.535527279857177 0.904050149220145 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 60687959 A/G 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 A:G A G 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000119866:ENST00000356842:exon_60687817_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000378117:exon_60687817_60688453:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000335712:exon_60684333_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000477659:exon_60686955_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000358510:exon_60687409_60689559:BCL11A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 60689522 G/A 1 14 7 21 6.50261808199952 3.74869095900024 2.75392712299928 A:G G A 10 0.535527279857177 0.277002137235975 ENSG00000119866:ENST00000356842:exon_60687817_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000359629:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000378117:exon_60688487_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000489516:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000492272:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000335712:exon_60684333_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000477659:exon_60686955_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000358510:exon_60687409_60689559:BCL11A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 61175312 T/C 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:C T C 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000162927:ENST00000316752:exon_61175178_61175320:PUS10;ENSG00000162927:ENST00000407787:exon_61175178_61175320:PUS10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 113 104 217 52.485417376139 55.6948371051464 -3.2094197290074 A:G A G 10 0.535527279857177 0.683302067458975 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 62100380 G/T 1 113 106 219 52.485417376139 56.7658916648608 -4.28047428872176 A:T:G G T 10 0.535527279857177 0.588064501929501 ENSG00000115484:ENST00000394440:exon_62100332_62100428:CCT4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 63176075 G/A 1 8 7 15 3.71578176114258 3.74869095900024 -0.0329091978576543 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000115504:ENST00000405015:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000431489:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000263991:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000354487:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000405289:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000454124:exon_63176068_63176297:EHBP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 63176179 A/G 1 7 8 15 3.25130904099976 4.28421823885742 -1.03290919785765 A:G A G 10 0.535527279857177 0.614933682686176 ENSG00000115504:ENST00000405015:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000431489:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000263991:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000354487:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000405289:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000454124:exon_63176068_63176297:EHBP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 64124722 C/A 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 A:C C A 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000143952:ENST00000354504:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000272322:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000409558:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000416400:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000394400:exon_64124630_64124724:VPS54 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 67630980 G/A 1 4 15 19 1.85789088057129 8.03290919785765 -6.17501831728636 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00506327777812486 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 67632125 C/T 1 16 17 33 7.43156352228517 9.10396375757201 -1.67240023528684 T:C C T 10 0.535527279857177 0.603164691033159 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 68364478 T/C 1 15 7 22 6.96709080214235 3.74869095900024 3.21839984314211 T:C T C 10 0.535527279857177 0.202291951159974 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68364431_68364565:PPP3R1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 24 23 47 11.1473452834278 12.3171274367151 -1.16978215328732 A:G A G 10 0.535527279857177 0.771114440369414 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 128 114 242 59.4525081782813 61.0501099037182 -1.59760172543682 T:C:G G T 10 0.535527279857177 0.846914299186392 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 405 223 628 188.111451657843 119.42258340815 68.6888682496929 C:G G C 10 0.535527279857177 3.04806013392624e-08 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 68622990 T/C 1 379 189 568 176.03516093413 101.214655893006 74.8205050411235 T:C T C 10 0.535527279857177 2.21621171543836e-10 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 19 17 36 8.82498168271364 9.10396375757201 -0.278982074858371 A:T A T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 70096862 T/C 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 T:C T C 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000087338:ENST00000282570:exon_70096851_70096996:GMCL1;ENSG00000087338:ENST00000495047:exon_70096689_70096996:GMCL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 118 91 209 54.8077809768531 48.7329824670031 6.07479850985001 A:G G A 10 0.535527279857177 0.406296118820084 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 71297695 T/C 1 115 63 178 53.4143628164246 33.7382186310021 19.6761441854225 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00329258105320299 ENSG00000124357:ENST00000497690:exon_71297632_71297749:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000434004:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000531934:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000465105:exon_71297632_71298149:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000480411:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71295780_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000533981:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71296108_71298957:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000464638:exon_71297430_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000428360:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524736:exon_71297643_71297716:NAGK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 71305456 C/T 1 153 87 240 71.0643261818519 46.5908733475744 24.4734528342775 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00149391694730230 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71305448_71305484:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 71351403 C/A 1 12 7 19 5.57367264171388 3.74869095900024 1.82498168271364 A:C C A 10 0.535527279857177 0.493201262474126 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 71360282 G/A 1 90 86 176 41.8025448128541 46.0553460677172 -4.25280125486314 A:G G A 10 0.535527279857177 0.545808935573214 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 71415577 G/A 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:G G A 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000124374:ENST00000244221:exon_71409869_71415665:PAIP2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 71654450 A/G 1 44 33 77 20.4367996862842 17.6724002352868 2.76439945099737 A:G A G 10 0.535527279857177 0.568831572936355 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71654413_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000492262:exon_71654425_71654544:ZNF638 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 71658541 C/T 1 64 79 143 29.7262540891407 42.306655108717 -12.5804010195763 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0362170053303326 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000472758:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000488126:exon_71658153_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000460310:exon_71658313_71658558:ZNF638 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 71661946 A/T 1 77 67 144 35.7643994509974 35.8803277504309 -0.115928299433484 A:T A T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71661872_71662187:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71661872_71662187:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71661872_71662191:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71661872_71662191:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71661872_71662188:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71661872_71662190:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71661872_71661952:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71661872_71661952:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71661872_71662199:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000472758:exon_71661872_71661999:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000488126:exon_71661872_71662188:ZNF638 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 73828538 G/A 1 8 13 21 3.71578176114258 6.9618546381433 -3.24607287700072 A:G G A 10 0.535527279857177 0.190471702102025 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73828322_73828563:ALMS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 20 46 66 9.28945440285646 24.6342548734301 -15.3448004705737 A:G A G 10 0.535527279857177 0.000172452651738707 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 75915035 C/T 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75914953_75915103:C2orf3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 75923413 T/C 1 11 6 17 5.10919992157105 3.21316367914306 1.89603624242799 T:C T C 10 0.535527279857177 0.467819685510286 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000442309:exon_75923378_75923441:C2orf3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 85553784 C/T 1 18 19 37 8.36050896257082 10.1750183172864 -1.81450935471555 T:C C T 10 0.535527279857177 0.622031610977959 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000282120:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000398263:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 85554080 G/A 1 22 13 35 10.2183998431421 6.9618546381433 3.25654520499881 A:G G A 10 0.535527279857177 0.311221891782477 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 85570440 G/A 0 31 0 31 14.3986543244275 0 14.3986543244275 G G 10 0.535527279857177 5.65201549909386e-09 ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85569079_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85569079_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85569211_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85569211_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85569805_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000438611:exon_85570114_85570504:RETSAT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 85622059 T/C 1 86 125 211 39.9446539322828 66.9409099821471 -26.9962560498643 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.000237175703288445 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85621871_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85621876_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85621890_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85621951_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85622016_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85622018_85622081:CAPG HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 85824251 T/C 1 630 489 1119 292.617813689979 261.87283985016 30.744973839819 A:T:C T C 10 0.535527279857177 0.0675082833705414 ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85824227_85824704:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000456023:exon_85824076_85824301:RNF181 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 85852667 G/A 1 24 29 53 11.1473452834278 15.5302911158581 -4.38294583243038 A:G G A 10 0.535527279857177 0.270608485366989 ENSG00000168883:ENST00000459775:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000448971:exon_85852662_85852712:USP39;ENSG00000168883:ENST00000442708:exon_85852662_85852740:USP39;ENSG00000168883:ENST00000450066:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409268:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409025:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000452873:exon_85852662_85852719:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409470:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000487400:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000323701:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000458268:exon_85852662_85852813:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409766:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000493829:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000467885:exon_85852662_85852814:USP39 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 86315741 C/T 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000486964:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000424089:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409024:exon_86315689_86315792:POLR1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 86400824 G/A 1 65 62 127 30.1907268092835 33.202691351145 -3.01196454186147 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.594883508976835 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86400773_86400885:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86400631_86400884:IMMT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 86433240 C/T 1 194 187 381 90.1077077077077 100.143601333292 -10.0358936255844 T:C C T 10 0.535527279857177 0.304801272631720 ENSG00000132313:ENST00000254644:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000337109:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000409180:exon_86433229_86433418:MRPL35 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 88879131 T/C 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:C T C 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000478003:exon_88879036_88879487:EIF2AK3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 88892805 C/T 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:C C T 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88892790_88892923:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88892790_88892923:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88892790_88892923:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000477083:exon_88892790_88892923:EIF2AK3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 89156948 C/G 1 7313 8 7321 3396.68900240446 4.28421823885742 3392.40478416561 A:T:C:G C A 10 0.535527279857177 0 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 96861159 C/G 1 29 24 53 13.4697088841419 12.8526547165722 0.617054167569622 C:G C G 10 0.535527279857177 0.891350478441777 ENSG00000084090:ENST00000337288:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000393595:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000462501:exon_96861079_96861252:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000443962:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000488084:exon_96860941_96861287:STARD7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 96919642 C/T 1 23 21 44 10.6828725632849 11.2460728770007 -0.563200313715786 T:C C T 10 0.535527279857177 0.880949379207489 ENSG00000135956:ENST00000258439:exon_96916312_96919853:TMEM127;ENSG00000135956:ENST00000432959:exon_96917398_96919853:TMEM127;ENSG00000135956:ENST00000435268:exon_96919538_96919853:TMEM127 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 96993757 C/T 1 13 13 26 6.0381453618567 6.9618546381433 -0.923709276286601 T:C C T 10 0.535527279857177 0.844640207112493 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 96993884 A/G 1 17 10 27 7.89603624242799 5.35527279857177 2.54076344385622 A:G A G 10 0.535527279857177 0.343173783053281 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 97030247 T/C 1 54 41 95 25.0815268877124 21.9566184741443 3.12490841356819 T:C T C 10 0.535527279857177 0.538768789576468 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435349:exon_97030218_97030329:NCAPH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 97166204 A/G 1 16 22 38 7.43156352228517 11.7816001568579 -4.35003663457272 A:G A G 10 0.535527279857177 0.192981436122139 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 97218017 G/A 1 186 194 380 86.3919259465651 103.892292292292 -17.5003663457272 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0802245096652611 ENSG00000196843:ENST00000359765:exon_97217991_97218366:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000357485:exon_97216836_97218375:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000412735:exon_97216836_97218367:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000454558:exon_97216836_97218371:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000497920:exon_97216836_97218371:ARID5A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 97493505 G/T 1 9 2 11 4.18025448128541 1.07105455971435 3.10919992157105 T:G G T 10 0.535527279857177 0.072775715286889 ENSG00000168763:ENST00000377060:exon_97493468_97493637:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000424641:exon_97493468_97493637:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000305510:exon_97493468_97493637:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000465224:exon_97493468_97494871:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000494595:exon_97493468_97493717:CNNM3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 98354511 G/A 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000115085:ENST00000264972:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000389518:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000463643:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000442208:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000487283:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000451498:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000489250:exon_98354458_98355040:ZAP70 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 98355990 G/A 1 5 8 13 2.32236360071412 4.28421823885742 -1.9618546381433 A:G G A 10 0.535527279857177 0.405380944075703 ENSG00000115085:ENST00000264972:exon_98355838_98356323:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000389518:exon_98355838_98356323:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000463643:exon_98355838_98356325:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000442208:exon_98355838_98356323:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000487283:exon_98355838_98356322:ZAP70 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 99193496 C/T 1 7 8 15 3.25130904099976 4.28421823885742 -1.03290919785765 T:C C T 10 0.535527279857177 0.614933682686176 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409463:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000498026:exon_99193452_99193606:INPP4A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 12 24 36 5.57367264171388 12.8526547165722 -7.27898207485837 T:C T C 10 0.535527279857177 0.018463415230233 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 15 21 36 6.96709080214235 11.2460728770007 -4.27898207485837 T:C T C 10 0.535527279857177 0.181555592466634 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 99804642 T/C 1 32 47 79 14.8631270445703 25.1697821532873 -10.306655108717 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0236298157248743 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000410042:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000473743:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000449429:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409145:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000476721:exon_99804640_99804720:MRPL30 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 31 38 69 14.3986543244275 20.3500366345727 -5.95138231014521 A:G G A 10 0.535527279857177 0.183912626071755 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 101925026 T/C 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 T:C T C 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101924591_101925163:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101924591_101925158:RNF149 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 105665808 C/T 1 55 37 92 25.5459996078553 19.8145093547155 5.73149025313972 T:C C T 10 0.535527279857177 0.250971032695033 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105665629_105665808:MRPS9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 105705507 C/T 1 22 21 43 10.2183998431421 11.2460728770007 -1.02767303385861 T:C C T 10 0.535527279857177 0.762236365418988 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105705442_105705527:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105705476_105705527:MRPS9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 105713697 A/G 1 65 58 123 30.1907268092835 31.0605822317163 -0.869855422432767 A:G A G 10 0.535527279857177 0.928031249787466 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105713613_105713782:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105713613_105713746:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000472220:exon_105713613_105713782:MRPS9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 113404708 G/A 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000144136:ENST00000272542:exon_113404140_113404739:SLC20A1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 113498566 A/G 1 5 8 13 2.32236360071412 4.28421823885742 -1.9618546381433 A:G A G 10 0.535527279857177 0.405380944075703 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113498395_113498584:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113498395_113498584:CKAP2L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 113956371 G/C 1 39 45 84 18.1144360855701 24.098727593573 -5.98429150800287 C:G G C 10 0.535527279857177 0.228670886278451 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000460725:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000465592:exon_113956317_113956407:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000464559:exon_113956135_113956803:PSD4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 114220055 T/C 1 4 10 14 1.85789088057129 5.35527279857177 -3.49738191800048 T:C T C 10 0.535527279857177 0.104526436185540 ENSG00000136682:ENST00000259199:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000448780:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000426479:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000358604:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000456188:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000492566:exon_114219985_114220411:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000472995:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000486174:exon_114219985_114220071:CBWD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 118583940 C/T 1 25 25 50 11.6118180035706 13.3881819964294 -1.77636399285885 T:C C T 10 0.535527279857177 0.671460015084407 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583845_118587042:DDX18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 342 331 673 158.849670288845 177.259529632726 -18.4098593438801 A:T:C A C 10 0.535527279857177 0.16411777839928 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 128464116 G/A 1 54 40 94 25.0815268877124 21.4210911942871 3.66043569342536 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.470646005399505 ENSG00000136709:ENST00000322313:exon_128458596_128464126:WDR33 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 128477084 G/C 1 37 25 62 17.1854906452845 13.3881819964294 3.79730864885503 C:G G C 10 0.535527279857177 0.373734983307804 ENSG00000136709:ENST00000322313:exon_128476839_128477927:WDR33 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 128522383 T/C 1 95 50 145 44.1249084135682 26.7763639928588 17.3485444207093 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0044819673132668 ENSG00000136709:ENST00000409658:exon_128520107_128522553:WDR33 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 128608184 C/T 1 19 15 34 8.82498168271364 8.03290919785765 0.792072484855984 T:C C T 10 0.535527279857177 0.86428240511532 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 128610648 T/C 1 21 26 47 9.75392712299928 13.9237092762866 -4.16978215328732 T:C T C 10 0.535527279857177 0.243679666219694 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409955:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128610499_128610679:POLR2D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 128934400 T/C 1 4 10 14 1.85789088057129 5.35527279857177 -3.49738191800048 T:C T C 10 0.535527279857177 0.104526436185540 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128934388_128934472:UGGT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 128939799 C/T 1 9 5 14 4.18025448128541 2.67763639928588 1.50261808199952 T:C C T 10 0.535527279857177 0.593847726273405 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 10 10 20 4.64472720142823 5.35527279857177 -0.71054559714354 A:G G A 10 0.535527279857177 0.824432001736655 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 131103635 C/T 1 287 224 511 133.30367068099 119.958110688008 13.3455599929826 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.248904109853755 ENSG00000136718:ENST00000259239:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409935:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462392:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000464432:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000473689:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409649:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460766:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000428740:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000452955:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460100:exon_131103591_131103822:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462357:exon_131103352_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000475074:exon_131103518_131103685:IMP4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 132290464 G/A 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 A:G G A 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000163040:ENST00000295171:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000409856:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000434330:exon_132290437_132290514:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000467992:exon_132290437_132290510:CCDC74A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 135920415 A/G 1 34 39 73 15.792072484856 20.8855639144299 -5.09349142957392 A:G A G 10 0.535527279857177 0.242374294335965 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135920318_135920421:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135920318_135920421:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135920318_135920421:RAB3GAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 143798189 A/G 1 73 112 185 33.9065085704261 59.9790553440038 -26.0725467735777 A:G A G 10 0.535527279857177 0.000155619838876987 ENSG00000115919:ENST00000264170:exon_143797997_143798227:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000409512:exon_143797997_143798227:KYNU HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 144899559 C/A 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 A:C C A 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000121964:ENST00000392869:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000409214:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000344850:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000241391:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392867:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000409298:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392871:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000415569:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000463875:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000491448:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000476958:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000482601:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000437114:exon_144899449_144899622:GTDC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 148716428 T/C 1 10 4 14 4.64472720142823 2.14210911942871 2.50261808199952 T:C T C 10 0.535527279857177 0.283628757254846 ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000461711:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148716161_148716435:ORC4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 50 67 117 23.2236360071412 35.8803277504309 -12.6566917432897 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0203998534264626 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 152139416 G/A 1 87 84 171 40.4091266524256 44.9842915080029 -4.57516485557726 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.491100147989072 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000491771:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000414946:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000477072:exon_152139285_152139468:NMI HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 152322095 A/T 1 36 36 72 16.7210179251416 19.2789820748584 -2.55796414971674 A:T A T 10 0.535527279857177 0.556830521916871 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 152331418 C/G 1 10 13 23 4.64472720142823 6.9618546381433 -2.31712743671507 C:G C G 10 0.535527279857177 0.404605690601376 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152331371_152332136:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152331371_152332419:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152331371_152333863:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152331371_152331733:RIF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 160112881 G/T 1 18 16 34 8.36050896257082 8.56843647771483 -0.207927515144016 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160112707_160112886:WDSUB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 169732622 C/G 1 30 13 43 13.9341816042847 6.9618546381433 6.97232696614139 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0455777902227884 ENSG00000152253:ENST00000479309:exon_169732582_169732686:SPC25;ENSG00000152253:ENST00000282074:exon_169732582_169732686:SPC25 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 424 418 842 196.936433340557 223.8504029803 -26.913969639743 A:T:C T A 10 0.535527279857177 0.0670220883185861 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 171910313 C/T 1 33 17 50 15.3275997647132 9.10396375757201 6.22363600714115 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0888473540516136 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000409443:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000478683:exon_171910271_171911639:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000486857:exon_171910227_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000453628:exon_171910292_171910363:TLK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 22 21 43 10.2183998431421 11.2460728770007 -1.02767303385861 A:G G A 10 0.535527279857177 0.762236365418988 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 172725301 A/G 1 9 2 11 4.18025448128541 1.07105455971435 3.10919992157105 A:G A G 10 0.535527279857177 0.072775715286889 ENSG00000115840:ENST00000422440:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000392592:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000263812:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000426896:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000475360:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000472748:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000484227:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000464063:exon_172725191_172725333:SLC25A12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 175300997 G/A 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 A:G G A 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000163328:ENST00000392552:exon_175296966_175301144:GPR155;ENSG00000163328:ENST00000392551:exon_175298880_175301144:GPR155;ENSG00000163328:ENST00000295500:exon_175299872_175301144:GPR155 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 177134337 G/A 1 12 6 18 5.57367264171388 3.21316367914306 2.36050896257082 A:G G A 10 0.535527279857177 0.346375041233422 ENSG00000128654:ENST00000420864:exon_177134123_177134397:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000392529:exon_177134137_177134397:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000249442:exon_177134147_177134397:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000423461:exon_177134182_177134397:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000443241:exon_177134198_177134397:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000452865:exon_177134230_177134397:MTX2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 179296905 G/A 0 87 0 87 40.4091266524256 0 40.4091266524256 G G 10 0.535527279857177 4.31195191218334e-24 ENSG00000180228:ENST00000325748:exon_179296141_179296981:PRKRA;ENSG00000180228:ENST00000490501:exon_179296142_179296981:PRKRA;ENSG00000180228:ENST00000424699:exon_179296381_179296981:PRKRA;ENSG00000180228:ENST00000487082:exon_179296693_179296981:PRKRA;ENSG00000180228:ENST00000432031:exon_179296703_179296981:PRKRA;ENSG00000180228:ENST00000438687:exon_179296824_179296981:PRKRA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 179360341 A/C 1 5 9 14 2.32236360071412 4.81974551871459 -2.49738191800048 A:C A C 10 0.535527279857177 0.193244891590877 ENSG00000116095:ENST00000234453:exon_179360223_179360387:PLEKHA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 180810180 C/T 1 130 118 248 60.381453618567 63.1922190231469 -2.81076540457989 T:C C T 10 0.535527279857177 0.750372177649452 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 180810264 A/T 1 123 93 216 57.1301445775672 49.8040370267175 7.32610755084978 A:T A T 10 0.535527279857177 0.339771659425332 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 182374534 A/G 1 29 24 53 13.4697088841419 12.8526547165722 0.617054167569622 A:G A G 10 0.535527279857177 0.891350478441777 ENSG00000115232:ENST00000425522:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000490435:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000476824:exon_182374385_182374534:ITGA4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 182395345 G/A 1 16 16 32 7.43156352228517 8.56843647771483 -1.13687295542966 A:G G A 10 0.535527279857177 0.725380877409574 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182395251_182395376:ITGA4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 182399097 T/C 1 36 31 67 16.7210179251416 16.6013456755725 0.119672249569145 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 182767178 C/G 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 C:G C G 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000138434:ENST00000431877:exon_182766493_182767193:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000320370:exon_182766493_182767193:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000409001:exon_182766493_182767193:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000261006:exon_182766493_182767193:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000428267:exon_182766493_182767193:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000454579:exon_182766493_182767193:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000440623:exon_182766493_182767193:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000416081:exon_182766493_182767193:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000491720:exon_182766493_182767193:SSFA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 183593697 C/T 1 7 9 16 3.25130904099976 4.81974551871459 -1.56843647771483 T:C C T 10 0.535527279857177 0.462143040312805 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000494462:exon_183593303_183593834:DNAJC10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 183622547 T/G 1 10 11 21 4.64472720142823 5.89080007842895 -1.24607287700072 T:G T G 10 0.535527279857177 0.664214712035953 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183622419_183622552:DNAJC10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 32 25 57 14.8631270445703 13.3881819964294 1.47494504814091 A:G A G 10 0.535527279857177 0.790869638698028 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 185803364 C/G 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 C:G C G 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 191064753 C/T 1 17 15 32 7.89603624242799 8.03290919785765 -0.136872955429662 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 191161622 T/C 1 9 19 28 4.18025448128541 10.1750183172864 -5.99476383600095 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0352046065365757 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000409934:exon_191161539_191161679:HIBCH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 191184475 A/G 1 17 13 30 7.89603624242799 6.9618546381433 0.934181604284691 A:G A G 10 0.535527279857177 0.855262631313688 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191184442_191184616:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191184442_191184771:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191184442_191184771:HIBCH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 191224981 G/T 1 11 8 19 5.10919992157105 4.28421823885742 0.824981682713638 T:G G T 10 0.535527279857177 0.819687245305986 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 191231458 G/A 1 8 8 16 3.71578176114258 4.28421823885742 -0.568436477714831 A:G G A 10 0.535527279857177 0.806722234902998 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191231421_191231584:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191231421_191231621:INPP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 191231503 G/A 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 A:G G A 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191231421_191231584:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191231421_191231621:INPP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 191235901 A/C 1 44 35 79 20.4367996862842 18.7434547950012 1.69334489128302 A:C A C 10 0.535527279857177 0.73606033991439 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191235570_191236390:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191235570_191236391:INPP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 191301368 A/G 1 11 5 16 5.10919992157105 2.67763639928588 2.43156352228517 A:G A G 10 0.535527279857177 0.316751505566711 ENSG00000151690:ENST00000392328:exon_191300703_191302287:MFSD6;ENSG00000151690:ENST00000281416:exon_191300638_191302287:MFSD6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 197662526 T/C 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 T:C T C 10 0.535527279857177 0.809233970242324 ENSG00000119041:ENST00000263956:exon_197662521_197662632:GTF3C3;ENSG00000119041:ENST00000409364:exon_197662521_197662632:GTF3C3;ENSG00000119041:ENST00000455546:exon_197662521_197662623:GTF3C3;ENSG00000119041:ENST00000448539:exon_197662521_197662632:GTF3C3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 198001319 A/G 1 9 8 17 4.18025448128541 4.28421823885742 -0.103963757572008 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000065413:ENST00000282272:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000328737:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000450567:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000337207:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409153:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409919:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000447713:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000443014:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000463879:exon_197998695_198001386:ANKRD44 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 105 119 224 48.7696356149964 63.7277463030041 -14.9581106880076 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.0518296651044790 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 99 79 178 45.9827992941395 42.306655108717 3.6761441854225 A:G A G 10 0.535527279857177 0.599530268984279 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 38 34 72 17.6499633654273 18.207927515144 -0.557964149716742 A:T:C T C 10 0.535527279857177 0.906482162747075 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 408 375 783 189.504869818272 200.822729946441 -11.3178601281696 T:C T C 10 0.535527279857177 0.430620588129247 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 113 98 211 52.485417376139 52.4816734260033 0.00374395013566442 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 201337667 A/C 1 58 75 133 26.9394177682837 40.1645459892883 -13.2251282210045 A:C A C 10 0.535527279857177 0.0236341122377700 ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409385:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000468832:exon_201337555_201337770:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000462190:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000460095:exon_201337555_201337715:SPATS2L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 34 24 58 15.792072484856 12.8526547165722 2.93941776828374 C:G C G 10 0.535527279857177 0.510880315476263 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 201437328 C/A 1 13 23 36 6.0381453618567 12.3171274367151 -6.27898207485837 A:C C A 10 0.535527279857177 0.044075429080022 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 201437334 T/C 1 13 23 36 6.0381453618567 12.3171274367151 -6.27898207485837 T:C T C 10 0.535527279857177 0.044075429080022 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 201736112 T/C 1 56 26 82 26.0104723279981 13.9237092762866 12.0867630517115 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00769551154024964 ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 201736166 A/C 1 75 24 99 34.8354540107117 12.8526547165722 21.9827992941395 A:C A C 10 0.535527279857177 6.81208211231826e-06 ENSG00000240344:ENST00000422134:exon_201736166_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 201768238 C/T 1 39 31 70 18.1144360855701 16.6013456755725 1.51309040999761 T:C C T 10 0.535527279857177 0.81081157402901 ENSG00000196290:ENST00000416651:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000419903:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000358515:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000403702:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409020:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000359683:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409357:exon_201768217_201768619:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409588:exon_201768217_201768648:NIF3L1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 202006096 G/A 1 21 89 110 9.75392712299928 47.6619279072887 -37.9080007842895 A:G G A 10 0.535527279857177 1.52377013633221e-13 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 202025131 G/A 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 A:G G A 10 0.535527279857177 0.298960436382335 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 71 70 141 32.9775631301404 37.4869095900024 -4.50934645986195 A:G A G 10 0.535527279857177 0.448825849460234 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 202050677 A/G 1 7 9 16 3.25130904099976 4.81974551871459 -1.56843647771483 A:G A G 10 0.535527279857177 0.462143040312805 ENSG00000003400:ENST00000286186:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000360132:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000460140:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000272879:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000438843:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000374650:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000346817:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000313728:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000448480:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000484926:exon_202050494_202051103:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000492363:exon_202050501_202050847:CASP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 202082459 T/A 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 A:T T A 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000003400:ENST00000286186:exon_202082311_202086388:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000360132:exon_202082311_202086383:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000346817:exon_202082311_202086388:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000313728:exon_202082311_202082493:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000492363:exon_202082311_202082464:CASP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 202245423 A/T 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 A:T A T 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202241930_202245941:TRAK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 202490812 C/A 1 8 8 16 3.71578176114258 4.28421823885742 -0.568436477714831 A:C C A 10 0.535527279857177 0.806722234902998 ENSG00000155755:ENST00000409444:exon_202490749_202490870:ALS2CR4;ENSG00000155755:ENST00000409883:exon_202490749_202490870:ALS2CR4;ENSG00000155755:ENST00000435876:exon_202490749_202490870:ALS2CR4;ENSG00000155755:ENST00000426684:exon_202490749_202490870:ALS2CR4;ENSG00000155755:ENST00000495329:exon_202490749_202491046:ALS2CR4;ENSG00000155755:ENST00000286196:exon_202490749_202490870:ALS2CR4;ENSG00000155755:ENST00000471318:exon_202490749_202490870:ALS2CR4;ENSG00000155755:ENST00000409099:exon_202490749_202490870:ALS2CR4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 203420621 C/T 1 18 11 29 8.36050896257082 5.89080007842895 2.46970888414187 T:C C T 10 0.535527279857177 0.457199191884996 ENSG00000204217:ENST00000374580:exon_203419975_203421254:BMPR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 207006676 T/C 1 65 57 122 30.1907268092835 30.5250549518591 -0.33432814257559 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207006665_207006793:NDUFS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 215712095 A/G 0 90 0 90 41.8025448128541 0 41.8025448128541 A A 10 0.535527279857177 5.86480916099026e-25 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 217279850 T/C 1 16 27 43 7.43156352228517 14.4592365561438 -7.02767303385861 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0330712554626782 ENSG00000138375:ENST00000430374:exon_217279370_217279864:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217279370_217280238:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217279370_217280238:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000427645:exon_217279731_217280238:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217279836_217280238:SMARCAL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 217285104 C/G 1 13 11 24 6.0381453618567 5.89080007842895 0.147345283427753 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217285022_217285255:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217285022_217285255:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000427645:exon_217285022_217285255:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217285022_217285255:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000412913:exon_217285022_217285255:SMARCAL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 217364013 C/T 1 2273 2140 4413 1055.74649288464 1146.02837889436 -90.2818860097218 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.00659347952717293 ENSG00000197756:ENST00000491306:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000490649:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217363548_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000487233:exon_217363993_217366183:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000446558:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000420712:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000359681:exon_217363590_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000456586:exon_217363993_217364121:RPL37A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 218940259 C/T 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000188282:ENST00000457754:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000344321:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000374155:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000463872:exon_218939816_218940443:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000441828:exon_218939816_218940463:RUFY4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 219508372 A/T 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 A:T A T 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 219508988 T/C 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:C T C 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 219529924 T/G 1 32 34 66 14.8631270445703 18.207927515144 -3.34480047057368 T:G T G 10 0.535527279857177 0.459516165662625 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219529878_219529970:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219529878_219529970:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219529878_219529970:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219529877_219529970:RNF25 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 219564014 G/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000163482:ENST00000295709:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000392106:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000392105:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000440309:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000431040:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000419433:exon_219563325_219564071:STK36 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 219602499 G/C 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 C:G G C 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000135912:ENST00000415717:exon_219602302_219602702:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219602302_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000437755:exon_219602302_219602922:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219602302_219603886:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000424644:exon_219602302_219602701:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219602297_219603886:TTLL4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 219610433 A/G 1 3 8 11 1.39341816042847 4.28421823885742 -2.89080007842895 A:G A G 10 0.535527279857177 0.127667889620419 ENSG00000135912:ENST00000457313:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000417196:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000461181:exon_219610110_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000494428:exon_219610276_219610524:TTLL4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 220083279 C/T 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:C C T 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000115657:ENST00000265316:exon_220082847_220083712:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000439002:exon_220082847_220083673:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000427013:exon_220083177_220083395:ABCB6;ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220082847_220085174:ATG9A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 220087441 T/C 1 23 32 55 10.6828725632849 17.1368729554297 -6.45400039214473 T:C T C 10 0.535527279857177 0.103911372260179 ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220087367_220087460:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000429920:exon_220087367_220087615:ATG9A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 220113159 C/T 1 105 73 178 48.7696356149964 39.0934914295739 9.6761441854225 T:C C T 10 0.535527279857177 0.153691045463446 ENSG00000115661:ENST00000409638:exon_220113143_220115059:STK16;ENSG00000115661:ENST00000396738:exon_220113143_220113614:STK16;ENSG00000115661:ENST00000409516:exon_220113143_220113468:STK16;ENSG00000115661:ENST00000496443:exon_220113143_220113626:STK16;ENSG00000115661:ENST00000409260:exon_220113143_220113613:STK16;ENSG00000115661:ENST00000478018:exon_220113143_220113617:STK16;ENSG00000115661:ENST00000409743:exon_220113143_220113424:STK16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 220371035 C/G 1 74 74 148 34.3709812905689 39.6290187094311 -5.25803741886219 C:G C G 10 0.535527279857177 0.410267869676453 ENSG00000144591:ENST00000313597:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373917:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000358215:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000443704:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373908:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000341142:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000481170:exon_220370976_220371709:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000480034:exon_220370976_220371416:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000496536:exon_220370976_220371144:GMPPA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 52 55 107 24.1525814474268 29.4540003921447 -5.30141894471793 T:C C T 10 0.535527279857177 0.332745279713069 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 38 50 88 17.6499633654273 26.7763639928588 -9.12640062743157 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0545767927138439 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 220405217 C/T 1 32 19 51 14.8631270445703 10.1750183172864 4.68810872728397 T:C C T 10 0.535527279857177 0.207918673015511 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 27 23 50 12.5407634438562 12.3171274367151 0.223636007141151 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 220406722 T/C 1 22 24 46 10.2183998431421 12.8526547165722 -2.63425487343014 T:C T C 10 0.535527279857177 0.462428816700698 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 220473355 G/A 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 A:G G A 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000426736:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000475396:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000473899:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220473305_220473510:STK11IP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 223783841 G/A 1 14 8 22 6.50261808199952 4.28421823885742 2.21839984314211 A:G G A 10 0.535527279857177 0.397197441912417 ENSG00000123983:ENST00000357430:exon_223783782_223783920:ACSL3;ENSG00000123983:ENST00000392066:exon_223783782_223783920:ACSL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 225346646 T/C 1 161 173 334 74.7801079429945 92.6462194152916 -17.8661114722971 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0547266657113096 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225346609_225346795:CUL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 228194480 A/T 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 A:T A T 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228193394_228195562:MFF;ENSG00000168958:ENST00000485697:exon_228194322_228194806:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436237:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000443428:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000418961:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228194462_228194499:MFF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 228194481 G/T 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 T:G G T 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228193394_228195562:MFF;ENSG00000168958:ENST00000485697:exon_228194322_228194806:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436237:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000443428:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000418961:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228194462_228194499:MFF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 228221725 A/G 1 85 87 172 39.48018121214 46.5908733475744 -7.11069213543443 A:G A G 10 0.535527279857177 0.285251866144757 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228221702_228222550:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228221702_228221970:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228221702_228221931:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228221702_228222515:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228221702_228221867:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228221702_228221847:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228221702_228222528:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228221702_228222543:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228221702_228222524:MFF;ENSG00000168958:ENST00000456345:exon_228221702_228222097:MFF;ENSG00000168958:ENST00000490857:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476262:exon_228221702_228222547:MFF;ENSG00000168958:ENST00000477362:exon_228221702_228221897:MFF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 230668858 T/C 1 13 5 18 6.0381453618567 2.67763639928588 3.36050896257081 T:C T C 10 0.535527279857177 0.155412508782781 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000487178:exon_230668715_230668943:TRIP12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 231077112 G/A 1 154 97 251 71.5287989019947 51.9461461461462 19.5826527558486 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.0135396911321629 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077111_231077145:SP110 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 231406680 T/C 1 9 12 21 4.18025448128541 6.42632735828612 -2.24607287700072 T:C T C 10 0.535527279857177 0.384351839373372 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406607_231406750:SP100 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 24 30 54 11.1473452834278 16.0658183957153 -4.91847311228755 T:C C T 10 0.535527279857177 0.219206800250926 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 24 75 99 11.1473452834278 40.1645459892883 -29.0172007058605 A:G G A 10 0.535527279857177 3.60044653608422e-09 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 132 31 163 61.3103990588526 16.6013456755725 44.7090533832801 T:C C T 10 0.535527279857177 3.73094902907889e-13 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 1 134 18 152 62.2393444991383 9.63949103742918 52.5998534617091 A:C:G G A 10 0.535527279857177 7.17353087322221e-20 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 232141355 G/A 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 A:G G A 10 0.535527279857177 0.809233970242324 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232141349_232141488:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232141349_232141488:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232141349_232141488:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000436339:exon_232141349_232141489:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000467698:exon_232141349_232141488:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000424740:exon_232141349_232141488:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000446447:exon_232141349_232141488:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000481520:exon_232141349_232141488:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232141349_232141488:ARMC9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 232576045 T/C 1 9 5 14 4.18025448128541 2.67763639928588 1.50261808199952 T:C T C 10 0.535527279857177 0.593847726273405 ENSG00000187514:ENST00000467816:exon_232575841_232576129:PTMA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 232952286 A/G 1 3 8 11 1.39341816042847 4.28421823885742 -2.89080007842895 A:G A G 10 0.535527279857177 0.127667889620419 ENSG00000144535:ENST00000273009:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000360410:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409401:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000445090:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000464554:exon_232952197_232952554:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000470087:exon_232952197_232952431:DIS3L2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 233925166 G/A 1 10 13 23 4.64472720142823 6.9618546381433 -2.31712743671507 A:G G A 10 0.535527279857177 0.404605690601376 ENSG00000168918:ENST00000422935:exon_233924677_233925322:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000451407:exon_233925062_233925322:INPP5D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 234394568 C/T 1 11 5 16 5.10919992157105 2.67763639928588 2.43156352228517 T:C C T 10 0.535527279857177 0.316751505566711 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 234749783 C/G 1 65 66 131 30.1907268092835 35.3448004705737 -5.15407366129018 A:C:G C G 10 0.535527279857177 0.381884424401438 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 10 22 32 4.64472720142823 11.7816001568579 -7.13687295542966 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0127684944262348 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 239155053 C/T 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:C C T 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000132326:ENST00000254657:exon_239152679_239155165:PER2;ENSG00000132326:ENST00000254658:exon_239152679_239155165:PER2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 239353013 C/T 1 14 19 33 6.50261808199952 10.1750183172864 -3.67240023528684 T:C C T 10 0.535527279857177 0.223967864022598 ENSG00000065802:ENST00000463352:exon_239352983_239353016:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000264607:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000409297:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000438264:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000491653:exon_239352983_239353115:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000468122:exon_239352983_239353368:ASB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 64 42 106 29.7262540891407 22.4921457540014 7.23410833513924 T:C T C 10 0.535527279857177 0.173146148440113 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 241500896 C/T 1 11 8 19 5.10919992157105 4.28421823885742 0.824981682713638 T:C C T 10 0.535527279857177 0.819687245305986 ENSG00000188542:ENST00000343217:exon_241500747_241500936:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000405954:exon_241500747_241503431:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000438823:exon_241500747_241500936:DUSP28 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 241512581 G/A 1 9 17 26 4.18025448128541 9.10396375757201 -4.9237092762866 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0748738537647927 ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241512527_241512678:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241512527_241512678:RNPEPL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 241516094 G/C 1 47 55 102 21.8302178467127 29.4540003921447 -7.62378254543205 C:G G C 10 0.535527279857177 0.137135796945973 ENSG00000142327:ENST00000451363:exon_241515952_241516144:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241513530_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000493398:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000464550:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000471657:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000437406:exon_241515985_241516182:RNPEPL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 241536126 A/G 1 12 15 27 5.57367264171388 8.03290919785765 -2.45923655614378 A:G A G 10 0.535527279857177 0.440881434887102 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241536098_241536359:CAPN10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 15 22 37 6.96709080214235 11.7816001568579 -4.81450935471555 A:G G A 10 0.535527279857177 0.137567453167498 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 241570249 A/C 1 7 8 15 3.25130904099976 4.28421823885742 -1.03290919785765 A:C A C 10 0.535527279857177 0.614933682686176 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 242045997 C/T 1 93 80 173 43.1959629732825 42.8421823885742 0.353780584708382 A:T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242045514_242046138:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242045710_242046138:PASK;ENSG00000115687:ENST00000472072:exon_242045710_242046138:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242045712_242046138:PASK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 242065624 A/G 1 16 13 29 7.43156352228517 6.9618546381433 0.469708884141868 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 242065986 C/G 1 20 21 41 9.28945440285646 11.2460728770007 -1.95661847414426 C:G C G 10 0.535527279857177 0.639106621472687 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 24 31 55 11.1473452834278 16.6013456755725 -5.45400039214473 T:C T C 10 0.535527279857177 0.175898785826033 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 242072306 T/G 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 T:G T G 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242072289_242074184:PASK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 242192848 T/C 1 61 40 101 28.3328359287122 21.4210911942871 6.91174473442513 T:C T C 10 0.535527279857177 0.194529758298994 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000453141:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000467435:exon_242192808_242192912:HDLBP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 242572846 A/G 1 67 83 150 31.1196722495691 44.4487642281457 -13.3290919785765 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0330485426915959 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 242617882 C/T 1 97 103 200 45.0538538538538 55.1593098252892 -10.1054559714354 T:C C T 10 0.535527279857177 0.156681675294542 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 40 62 102 18.5789088057129 33.202691351145 -14.6237825454321 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00391205020756313 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 10 10 20 4.64472720142823 5.35527279857177 -0.71054559714354 A:T T A 10 0.535527279857177 0.824432001736655 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 257733 A/G 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 14 6 20 6.50261808199952 3.21316367914306 3.28945440285646 C:G G C 10 0.535527279857177 0.179412444802184 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 52 21 73 24.1525814474268 11.2460728770007 12.9065085704261 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00307470008841043 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 371972 T/C 1 18 28 46 8.36050896257082 14.994763836001 -6.63425487343014 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0549441425275635 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 41 49 90 19.0433815258557 26.2408367130017 -7.19745518714593 T:C C T 10 0.535527279857177 0.139329922760574 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 163 166 329 75.7090533832801 88.8975284562914 -13.1884750730112 T:C C T 10 0.535527279857177 0.150813765891978 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 75 76 151 34.8354540107117 40.7000732691454 -5.86461925843372 T:G T G 10 0.535527279857177 0.369610146332591 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 1143797 T/C 1 115 122 237 53.4143628164246 65.3343281425756 -11.9199653261509 A:T:C T C 10 0.535527279857177 0.134028988568656 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1143774_1143827:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1143774_1143827:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1143774_1143827:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1143774_1143827:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1143774_1143827:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1143774_1143827:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1143774_1143827:PSMF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 84 75 159 39.0157084919971 40.1645459892883 -1.14883749729113 T:C C T 10 0.535527279857177 0.873879640722918 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 2446369 T/A 1 264 243 507 122.620798117705 130.133129005294 -7.51233088758872 A:T:C T A 10 0.535527279857177 0.504612720747066 ENSG00000125835:ENST00000381342:exon_2446354_2446465:SNRPB;ENSG00000125835:ENST00000438552:exon_2446354_2446465:SNRPB;ENSG00000125835:ENST00000474384:exon_2446354_2446465:SNRPB;ENSG00000125835:ENST00000339610:exon_2446354_2446465:SNRPB;ENSG00000125835:ENST00000336808:exon_2446344_2446465:SNRPB;ENSG00000125835:ENST00000303103:exon_2446354_2446465:SNRPB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 2464112 T/C 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C T C 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000088876:ENST00000278772:exon_2462463_2465302:ZNF343;ENSG00000088876:ENST00000465019:exon_2462463_2465302:ZNF343 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 969 955 1924 450.074065818396 511.428552263604 -61.3544864452085 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.00528524065259809 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 2639162 T/C 1 137 110 247 63.6327626595668 58.9080007842895 4.7247618752773 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.566278099745199 ENSG00000101365:ENST00000474315:exon_2639041_2639168:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000466494:exon_2639041_2639168:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000469213:exon_2639041_2639296:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000492240:exon_2639041_2639168:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000380851:exon_2639041_2639168:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000380843:exon_2639041_2639483:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000488299:exon_2639041_2639483:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000435594:exon_2639043_2639483:IDH3B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 2840773 C/T 1 9 11 20 4.18025448128541 5.89080007842895 -1.71054559714354 T:C C T 10 0.535527279857177 0.505111632691192 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2840700_2840797:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2840700_2840797:VPS16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 2945759 C/T 1 24 19 43 11.1473452834278 10.1750183172864 0.972326966141392 T:C C T 10 0.535527279857177 0.878742494186702 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000455631:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000431048:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000418580:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000430705:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2945507_2945848:PTPRA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 3128578 A/C 1 16 25 41 7.43156352228517 13.3881819964294 -5.95661847414426 A:C A C 10 0.535527279857177 0.0837752437709186 ENSG00000215251:ENST00000380266:exon_3127165_3129906:FASTKD5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 4164283 A/G 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 A:G A G 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000088826:ENST00000339123:exon_4164141_4164301:SMOX;ENSG00000088826:ENST00000305958:exon_4164141_4164301:SMOX;ENSG00000088826:ENST00000278795:exon_4164141_4164301:SMOX;ENSG00000088826:ENST00000443211:exon_4164141_4164301:SMOX;ENSG00000088826:ENST00000446259:exon_4164141_4164301:SMOX;ENSG00000088826:ENST00000379460:exon_4164141_4164301:SMOX;ENSG00000088826:ENST00000457205:exon_4164141_4164301:SMOX;ENSG00000088826:ENST00000494098:exon_4164141_4164301:SMOX;ENSG00000088826:ENST00000486998:exon_4164141_4164301:SMOX;ENSG00000088826:ENST00000466004:exon_4164141_4164301:SMOX HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 5843917 C/T 1 18 12 30 8.36050896257082 6.42632735828612 1.93418160428469 T:C C T 10 0.535527279857177 0.583930457533564 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 5844121 C/T 1 10 9 19 4.64472720142823 4.81974551871459 -0.175018317286362 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 9 9 18 4.18025448128541 4.81974551871459 -0.639491037429185 A:G A G 10 0.535527279857177 0.816111256590493 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 6011934 C/T 1 51 52 103 23.688108727284 27.8474185525732 -4.15930982528923 T:C C T 10 0.535527279857177 0.430387214482475 ENSG00000088766:ENST00000378863:exon_6011931_6012016:CRLS1;ENSG00000088766:ENST00000378868:exon_6011931_6012016:CRLS1;ENSG00000088766:ENST00000489345:exon_6011931_6012016:CRLS1;ENSG00000088766:ENST00000464921:exon_6011931_6012016:CRLS1;ENSG00000088766:ENST00000478846:exon_6011809_6012016:CRLS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 6194789 C/T 0 24 0 24 11.1473452834278 0 11.1473452834278 C C 10 0.535527279857177 6.00973589226821e-07 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 6195753 T/C 0 18 0 18 8.36050896257082 0 8.36050896257082 T T 10 0.535527279857177 1.41363179801029e-05 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 7980390 C/T 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 T:C C T 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000527925:exon_7980379_7980469:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000462384:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000530935:exon_7980379_7980507:TMX4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 17595470 C/T 1 54 53 107 25.0815268877124 28.3829458324304 -3.30141894471794 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.561299070907382 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17595382_17595525:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17595382_17595525:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17595382_17595525:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17595385_17595525:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17595382_17595525:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17595382_17595525:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17595382_17595525:RRBP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 44 37 81 20.4367996862842 19.8145093547155 0.622290331568667 A:C C A 10 0.535527279857177 0.911764694909608 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 17599304 T/C 1 53 37 90 24.6170541675696 19.8145093547155 4.80254481285407 T:C T C 10 0.535527279857177 0.342131498922567 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17599241_17599324:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17599241_17599324:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17599241_17599324:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17599241_17599324:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17599241_17599324:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17599241_17599324:RRBP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 17602166 G/A 1 58 18 76 26.9394177682837 9.63949103742918 17.2999267308546 A:G G A 10 0.535527279857177 6.99919825772015e-05 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17602103_17602192:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17602103_17602192:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17602103_17602192:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17602103_17602192:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17602103_17602192:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17602103_17602192:RRBP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 17943492 A/T 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:T A T 10 0.535527279857177 0.484883763152571 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 18142564 A/G 1 9 8 17 4.18025448128541 4.28421823885742 -0.103963757572008 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18142464_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18142467_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18142464_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18142464_18142883:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18142467_18142883:CSRP2BP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 18296076 G/A 1 3 10 13 1.39341816042847 5.35527279857177 -3.9618546381433 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0472708235212517 ENSG00000125846:ENST00000377671:exon_18295716_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000396026:exon_18295716_18297638:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000401790:exon_18295713_18297637:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000402618:exon_18295716_18297460:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000316358:exon_18295713_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000462170:exon_18295713_18297640:ZNF133 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 18462421 A/G 1 5 11 16 2.32236360071412 5.89080007842895 -3.56843647771483 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0832488497756866 ENSG00000132664:ENST00000377603:exon_18462263_18462454:POLR3F;ENSG00000132664:ENST00000462997:exon_18462263_18462454:POLR3F HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 18523002 C/G 1 88 70 158 40.8735993725684 37.4869095900024 3.38668978256604 C:G C G 10 0.535527279857177 0.632491808685711 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18522940_18523046:SEC23B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 18534947 G/T 1 61 67 128 28.3328359287122 35.8803277504309 -7.54749182171865 T:G G T 10 0.535527279857177 0.184882474757426 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18534879_18535034:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18534879_18535034:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18534879_18535034:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18534879_18535034:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18534879_18535034:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18534879_18535034:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000422877:exon_18534879_18535034:SEC23B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 12 4 16 5.57367264171388 2.14210911942871 3.43156352228517 T:C T C 10 0.535527279857177 0.130378196506160 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 21142523 C/G 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 C:G C G 10 0.535527279857177 0.517677205697999 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 21142813 T/C 1 11 4 15 5.10919992157105 2.14210911942871 2.96709080214235 T:C T C 10 0.535527279857177 0.194136764216528 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 23345844 A/C 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:C A C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 24930085 G/A 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000077984:ENST00000480798:exon_24929866_24930211:CST7;ENSG00000077984:ENST00000376835:exon_24929866_24930211:CST7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 24944523 C/T 1 47 51 98 21.8302178467127 27.311891272716 -5.48167342600334 T:C C T 10 0.535527279857177 0.267602437749964 ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24943561_24944658:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24943561_24944658:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24943581_24944658:C20orf3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 24994289 C/T 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 T:C C T 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_24994172_24994298:ACSS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 25252086 T/C 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25252019_25252122:PYGB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 30381758 G/C 1 52 54 106 24.1525814474268 28.9184731122876 -4.76589166486076 C:G G C 10 0.535527279857177 0.381298383213267 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30381651_30381827:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30381651_30381827:TPX2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 31023500 C/T 1 19 11 30 8.82498168271364 5.89080007842895 2.93418160428469 T:C C T 10 0.535527279857177 0.360614188179226 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 31024274 T/C 1 33 37 70 15.3275997647132 19.8145093547155 -4.48690959000239 T:C T C 10 0.535527279857177 0.284063352929156 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 31025163 A/G 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 A:G A G 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 31291161 C/T 1 79 69 148 36.693344891283 36.9513823101452 -0.258037418862195 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000149600:ENST00000278980:exon_31290493_31291260:COMMD7;ENSG00000149600:ENST00000446419:exon_31290494_31291260:COMMD7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 32212690 C/T 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 T:C C T 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000078699:ENST00000375279:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000342704:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000346541:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397800:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000492345:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000359606:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397803:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000491618:exon_32212570_32212823:CBFA2T2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 33334661 T/C 1 5 8 13 2.32236360071412 4.28421823885742 -1.9618546381433 T:C T C 10 0.535527279857177 0.405380944075703 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33334611_33334732:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33334611_33334732:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33334611_33334732:NCOA6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 33657126 G/A 1 15 10 25 6.96709080214235 5.35527279857177 1.61181800357058 A:G G A 10 0.535527279857177 0.55392591166511 ENSG00000100991:ENST00000252015:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000451813:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000432634:exon_33657099_33657215:TRPC4AP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 33706509 G/A 1 44 27 71 20.4367996862842 14.4592365561438 5.97756313014044 A:G G A 10 0.535527279857177 0.190252444293030 ENSG00000088298:ENST00000374491:exon_33706401_33706522:EDEM2;ENSG00000088298:ENST00000374492:exon_33706401_33706522:EDEM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 8 11 19 3.71578176114258 5.89080007842895 -2.17501831728636 T:C C T 10 0.535527279857177 0.362455450147038 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 34064394 G/T 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34064274_34064420:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34064274_34064420:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34064274_34064420:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000461386:exon_34064274_34064420:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000448421:exon_34064274_34064420:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425934:exon_34064274_34064420:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425096:exon_34064274_34064420:CEP250 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 34505443 T/C 1 19 13 32 8.82498168271364 6.9618546381433 1.86312704457034 T:C T C 10 0.535527279857177 0.596317945495181 ENSG00000025293:ENST00000374012:exon_34505406_34505584:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000439301:exon_34505406_34505584:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000373994:exon_34505406_34505584:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000420233:exon_34505406_34505581:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000413965:exon_34505406_34505584:PHF20 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 35399559 T/C 1 21 14 35 9.75392712299928 7.49738191800048 2.25654520499881 T:C T C 10 0.535527279857177 0.500276662521839 ENSG00000149636:ENST00000373745:exon_35399276_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000426836:exon_35399276_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000448110:exon_35399276_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000373733:exon_35399521_35399569:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000373750:exon_35399276_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000480153:exon_35399276_35399876:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000473615:exon_35399521_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000449595:exon_35399276_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000447406:exon_35399276_35399596:DSN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 36641471 C/T 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 T:C C T 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000101407:ENST00000373448:exon_36639917_36642259:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000373447:exon_36639917_36642259:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000449821:exon_36639917_36642305:TTI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 37667182 C/T 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 T:C C T 10 0.535527279857177 0.782354473542065 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37667142_37668363:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000449559:exon_37667142_37667289:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000493450:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000482619:exon_37667142_37667279:DHX35 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 42252537 G/C 1 11 21 32 5.10919992157105 11.2460728770007 -6.13687295542966 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0334184048285338 ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42252531_42252685:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42252531_42252685:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000436476:exon_42252531_42252685:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000467024:exon_42252531_42252762:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000468420:exon_42252531_42252685:IFT52 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 42825929 C/T 1 98 73 171 45.5183265739967 39.0934914295739 6.42483514442274 T:C C T 10 0.535527279857177 0.357668684104706 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 42826350 A/C 1 59 50 109 27.4038904884266 26.7763639928588 0.627526495567711 A:C A C 10 0.535527279857177 0.923790019915807 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 43530234 A/C 1 124 105 229 57.5946172977101 56.2303643850036 1.36425291270648 A:C A C 10 0.535527279857177 0.894653704204543 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 43566787 A/G 1 11 6 17 5.10919992157105 3.21316367914306 1.89603624242799 A:G A G 10 0.535527279857177 0.467819685510286 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000476056:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217075:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000479873:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372826:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000474208:exon_43566743_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000489068:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372822:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000482486:exon_43566484_43566832:PABPC1L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 43572217 T/C 1 76 66 142 35.2999267308546 35.3448004705737 -0.0448737397191294 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000025772:ENST00000372813:exon_43572094_43572220:TOMM34;ENSG00000025772:ENST00000372810:exon_43572094_43572220:TOMM34 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 43629135 G/A 1 22 20 42 10.2183998431421 10.7105455971435 -0.492145754001433 A:G G A 10 0.535527279857177 0.878574483565324 ENSG00000101109:ENST00000372806:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000396731:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000372801:exon_43629033_43629161:STK4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 55 42 97 25.5459996078553 22.4921457540014 3.05385385385384 T:C T C 10 0.535527279857177 0.543475976950334 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 44581348 G/A 1 12 20 32 5.57367264171388 10.7105455971435 -5.13687295542966 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0771656531600189 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44581237_44581348:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44581237_44581348:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44581237_44581348:ZNF335 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 44596207 C/G 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 C:G C G 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44595506_44596273:ZNF335 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 44596545 G/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44596373_44597497:ZNF335 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 45853037 A/G 1 30 17 47 13.9341816042847 9.10396375757201 4.83021784671268 A:G A G 10 0.535527279857177 0.188206406050433 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45852970_45853209:ZMYND8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 45867852 A/G 1 20 11 31 9.28945440285646 5.89080007842895 3.39865432442751 A:G A G 10 0.535527279857177 0.280261422723049 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45866054_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45867242_45867882:ZMYND8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 46256424 C/T 1 8 8 16 3.71578176114258 4.28421823885742 -0.568436477714831 T:C C T 10 0.535527279857177 0.806722234902998 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46256305_46256493:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46256305_46256493:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46256305_46256493:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46256305_46256493:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46256305_46256493:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000497292:exon_46256305_46256493:NCOA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 46294683 T/A 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:T T A 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000196562:ENST00000359930:exon_46294601_46294697:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000361612:exon_46294601_46294697:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000447361:exon_46294601_46294697:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000371978:exon_46294601_46294697:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000484875:exon_46294601_46294697:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000467815:exon_46294601_46294697:SULF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 47246069 C/T 1 16 26 42 7.43156352228517 13.9237092762866 -6.49214575400143 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0620928743524166 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47245987_47246159:PREX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 47253043 G/A 1 29 27 56 13.4697088841419 14.4592365561438 -0.989527672001911 A:G G A 10 0.535527279857177 0.790680016611161 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47253001_47253221:PREX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 47258763 C/T 1 25 32 57 11.6118180035706 17.1368729554297 -5.52505495185909 T:C C T 10 0.535527279857177 0.146488525537006 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000496915:exon_47258651_47258796:PREX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 47261017 T/C 1 36 37 73 16.7210179251416 19.8145093547155 -3.09349142957392 T:C T C 10 0.535527279857177 0.48336671373693 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47260947_47261035:PREX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 47267480 A/G 1 24 19 43 11.1473452834278 10.1750183172864 0.972326966141392 A:G A G 10 0.535527279857177 0.878742494186702 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267432_47267593:PREX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 47267940 G/A 1 21 20 41 9.75392712299928 10.7105455971435 -0.956618474144255 A:G G A 10 0.535527279857177 0.875832794765671 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267934_47268121:PREX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 47269233 C/G 1 14 4 18 6.50261808199952 2.14210911942871 4.36050896257082 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0560797144511649 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47269124_47269244:PREX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 47273726 C/T 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47273578_47273726:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47273578_47273726:PREX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 47307618 G/A 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47307485_47307634:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47307485_47307634:PREX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 47734412 T/C 1 45 38 83 20.901272406427 20.3500366345727 0.551235771854312 T:C T C 10 0.535527279857177 0.912951986753124 ENSG00000124214:ENST00000396163:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000433926:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371828:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000340954:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371856:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000360426:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000347458:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371805:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371802:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371792:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371830:exon_47734314_47734633:STAU1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 40 60 100 18.5789088057129 32.1316367914306 -13.5527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00677426002187597 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 30 20 50 13.9341816042847 10.7105455971435 3.22363600714115 A:G G A 10 0.535527279857177 0.396910313695782 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 47872327 A/G 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 A:G A G 10 0.535527279857177 0.529514337684375 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 15 14 29 6.96709080214235 7.49738191800048 -0.530291115858132 C:G C G 10 0.535527279857177 0.854578961351753 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 48491258 T/G 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:G T G 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000197818:ENST00000417961:exon_48491242_48491358:SLC9A8;ENSG00000197818:ENST00000361573:exon_48491242_48491358:SLC9A8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 48746189 C/T 1 24 9 33 11.1473452834278 4.81974551871459 6.32759976471316 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0348730293787606 ENSG00000240849:ENST00000522930:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371650:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371656:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371652:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000453505:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371658:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000124208:ENST00000341698:exon_48746083_48746227:TMEM189-UBE2V1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 49509184 G/A 1 54 49 103 25.0815268877124 26.2408367130017 -1.15930982528923 A:G G A 10 0.535527279857177 0.843783870190966 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 50769183 G/A 1 18 18 36 8.36050896257082 9.63949103742918 -1.27898207485837 A:G G A 10 0.535527279857177 0.739253657716502 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 50769379 C/T 1 18 13 31 8.36050896257082 6.9618546381433 1.39865432442751 T:C C T 10 0.535527279857177 0.719721870124635 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 50769549 A/G 1 11 12 23 5.10919992157105 6.42632735828612 -1.31712743671507 A:G A G 10 0.535527279857177 0.677416798105031 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 50803444 C/T 1 5 10 15 2.32236360071412 5.35527279857177 -3.03290919785765 T:C C T 10 0.535527279857177 0.128132638231981 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 50803573 G/A 1 10 9 19 4.64472720142823 4.81974551871459 -0.175018317286362 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 52192637 T/C 1 10 9 19 4.64472720142823 4.81974551871459 -0.175018317286362 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 52193088 C/T 1 11 15 26 5.10919992157105 8.03290919785765 -2.9237092762866 T:C C T 10 0.535527279857177 0.325768302416207 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 52198340 T/A 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 A:T T A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52198000_52199707:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52198000_52199636:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52198000_52199707:ZNF217 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 52198967 A/G 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 A:G A G 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52198000_52199707:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52198000_52199636:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52198000_52199707:ZNF217 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 55931594 C/T 1 23 28 51 10.6828725632849 14.994763836001 -4.31189127271603 T:C C T 10 0.535527279857177 0.261729850657365 ENSG00000101146:ENST00000395841:exon_55931502_55931594:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000371242:exon_55931502_55931594:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000527947:exon_55931502_55931594:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000492498:exon_55931502_55931594:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000411894:exon_55931502_55931594:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000429339:exon_55931502_55931594:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000395840:exon_55931502_55931594:RAE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 56191401 T/C 1 8 1 9 3.71578176114258 0.535527279857177 3.18025448128541 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0433473902079845 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56191300_56191524:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56191300_56191524:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56190568_56193137:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56191300_56191524:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56191300_56191524:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000480037:exon_56190568_56191524:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000432548:exon_56191109_56191524:ZBP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 57244493 G/A 1 14 11 25 6.50261808199952 5.89080007842895 0.611818003570576 A:G G A 10 0.535527279857177 0.84378896045112 ENSG00000254995:ENST00000371138:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000435446:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000124222:ENST00000355957:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000312283:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000359617:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371141:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371132:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000358029:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000464640:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361830:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361770:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000468590:exon_57244358_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000438253:exon_57244347_57244509:STX16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 57269495 G/A 1 8 7 15 3.71578176114258 3.74869095900024 -0.0329091978576543 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57269478_57269648:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000533788:exon_57269477_57269648:NPEPL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 57564695 C/T 1 17 12 29 7.89603624242799 6.42632735828612 1.46970888414187 T:C C T 10 0.535527279857177 0.710434552275237 ENSG00000101158:ENST00000344018:exon_57564543_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000482747:exon_57563969_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000460601:exon_57564543_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000477741:exon_57564543_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000474543:exon_57564543_57564695:TH1L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 57610059 C/A 1 40 50 90 18.5789088057129 26.7763639928588 -8.19745518714593 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0909603063643313 ENSG00000101166:ENST00000355937:exon_57608200_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000371033:exon_57609689_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000463057:exon_57609964_57610181:SLMO2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 60881780 T/C 1 155 142 297 71.9932716221376 76.0448737397191 -4.05160211758155 T:C T C 10 0.535527279857177 0.642116792639178 ENSG00000130706:ENST00000423787:exon_60881704_60881790:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000253003:exon_60881704_60881790:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000462554:exon_60881704_60881790:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000465805:exon_60881704_60881790:ADRM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 61288446 G/A 1 5 10 15 2.32236360071412 5.35527279857177 -3.03290919785765 A:G G A 10 0.535527279857177 0.128132638231981 ENSG00000101187:ENST00000370512:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000217159:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000497209:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000370507:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000342674:exon_61287807_61288563:SLCO4A1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 61472073 C/A 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 A:C C A 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61471894_61472496:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61471894_61472511:COL9A3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 61488785 T/C 1 15 21 36 6.96709080214235 11.2460728770007 -4.27898207485837 T:C T C 10 0.535527279857177 0.181555592466634 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61488747_61488990:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61488747_61488990:TCFL5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 61491494 T/C 1 13 5 18 6.0381453618567 2.67763639928588 3.36050896257081 T:C T C 10 0.535527279857177 0.155412508782781 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61491477_61491660:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61491477_61491660:TCFL5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 61512185 G/C 1 4 8 12 1.85789088057129 4.28421823885742 -2.42632735828612 C:G G C 10 0.535527279857177 0.24635656157035 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61509090_61513766:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61509095_61513766:DIDO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 61537114 G/A 1 68 70 138 31.584144969712 37.4869095900024 -5.90276462029042 A:G G A 10 0.535527279857177 0.347923529098343 ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61536350_61537452:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61536355_61537452:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61536357_61537452:DIDO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 61538601 C/T 1 25 33 58 11.6118180035706 17.6724002352868 -6.06058223171626 T:C C T 10 0.535527279857177 0.115757696499762 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370366:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000266071:exon_61538499_61538711:DIDO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 61542863 G/A 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 A:G G A 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370366:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000266071:exon_61542126_61542966:DIDO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 20 61588159 A/G 1 10 23 33 4.64472720142823 12.3171274367151 -7.67240023528684 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00840214539542086 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000411611:exon_61588117_61588314:SLC17A9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 15873026 T/C 1 77 37 114 35.7643994509974 19.8145093547155 15.9498900962818 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00260788895387894 ENSG00000155307:ENST00000285670:exon_15872850_15873056:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15872850_15873056:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15872850_15873056:SAMSN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 33 71 104 15.3275997647132 38.0224368698596 -22.6948371051464 C:G G C 10 0.535527279857177 1.12509046888316e-05 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 30411367 T/G 1 42 25 67 19.5078542459986 13.3881819964294 6.11967224956915 T:C:G T G 10 0.535527279857177 0.142874181834131 ENSG00000156256:ENST00000399975:exon_30411347_30411477:USP16;ENSG00000156256:ENST00000399976:exon_30411347_30411477:USP16;ENSG00000156256:ENST00000334352:exon_30411347_30411477:USP16;ENSG00000156256:ENST00000474835:exon_30411347_30411477:USP16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 30714776 T/C 1 2 10 12 0.928945440285646 5.35527279857177 -4.42632735828612 T:C T C 10 0.535527279857177 0.016688085548077 ENSG00000156273:ENST00000286800:exon_30714720_30718469:BACH1;ENSG00000156273:ENST00000399921:exon_30714720_30718469:BACH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 33068962 T/C 1 11 8 19 5.10919992157105 4.28421823885742 0.824981682713638 T:C T C 10 0.535527279857177 0.819687245305986 ENSG00000156304:ENST00000435228:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000419806:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000434667:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000286835:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000399804:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000467731:exon_33068882_33069049:SFRS15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 12 36 48 5.57367264171388 19.2789820748584 -13.7053094331445 T:G T G 10 0.535527279857177 6.92417787850571e-05 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 34883618 T/C 1 58 53 111 26.9394177682837 28.3829458324304 -1.44352806414664 A:T:C T C 10 0.535527279857177 0.849172430125996 ENSG00000159131:ENST00000414353:exon_34883559_34883664:GART;ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34883559_34883765:GART HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 34897113 C/T 1 35 34 69 16.2565452049988 18.207927515144 -1.95138231014521 T:C C T 10 0.535527279857177 0.717583350522665 ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000460305:exon_34897076_34897135:GART;ENSG00000159131:ENST00000467575:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000361093:exon_34896316_34897307:GART HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 34924243 T/C 1 26 27 53 12.0762907237134 14.4592365561438 -2.38294583243038 T:C T C 10 0.535527279857177 0.582266160295617 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 34925689 G/A 1 37 18 55 17.1854906452845 9.63949103742918 7.54599960785527 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0430785776875816 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 44 39 83 20.4367996862842 20.8855639144299 -0.448764228145688 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 9 40 49 4.18025448128541 21.4210911942871 -17.2408367130017 T:C T C 10 0.535527279857177 7.9578351944116e-07 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 43221826 T/C 1 3 10 13 1.39341816042847 5.35527279857177 -3.9618546381433 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0472708235212517 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000486812:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000470586:exon_43221154_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000465955:exon_43221788_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000477633:exon_43221817_43221882:PRDM15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 43803167 T/C 1 11 8 19 5.10919992157105 4.28421823885742 0.824981682713638 T:C T C 10 0.535527279857177 0.819687245305986 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43802174_43803860:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43803142_43803307:TMPRSS3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 43974226 T/C 1 13 14 27 6.0381453618567 7.49738191800048 -1.45923655614378 T:C T C 10 0.535527279857177 0.700369496789269 ENSG00000160190:ENST00000398341:exon_43974172_43974252:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000352133:exon_43974172_43974252:SLC37A1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 44270229 C/T 1 10 12 22 4.64472720142823 6.42632735828612 -1.78160015685789 T:C C T 10 0.535527279857177 0.523672568666477 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44270151_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44269336_44270352:WDR4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 44273858 G/A 1 11 6 17 5.10919992157105 3.21316367914306 1.89603624242799 A:G G A 10 0.535527279857177 0.467819685510286 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44273679_44273862:WDR4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 13 11 24 6.0381453618567 5.89080007842895 0.147345283427753 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 43 68 111 19.9723269661414 36.415855030288 -16.4435280641466 T:G T G 10 0.535527279857177 0.00218682331351110 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 68 61 129 31.584144969712 32.6671640712878 -1.08301910157583 A:G G A 10 0.535527279857177 0.860271231913959 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 44485350 G/A 1 7 10 17 3.25130904099976 5.35527279857177 -2.10396375757201 A:G G A 10 0.535527279857177 0.338715846297251 ENSG00000160200:ENST00000352178:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000359624:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398165:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398158:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000461686:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398168:exon_44485313_44485382:CBS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 45096206 G/A 1 12 15 27 5.57367264171388 8.03290919785765 -2.45923655614378 A:G G A 10 0.535527279857177 0.440881434887102 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45096153_45096217:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45096153_45096217:RRP1B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 45107562 T/C 1 25 14 39 11.6118180035706 7.49738191800048 4.1144360855701 T:C T C 10 0.535527279857177 0.202169304205643 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000470886:exon_45107397_45108121:RRP1B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 45217559 T/C 1 111 99 210 51.5564719358534 53.0172007058605 -1.46072877000716 T:C T C 10 0.535527279857177 0.88999565967533 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217512_45217576:RRP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 43 33 76 19.9723269661414 17.6724002352868 2.29992673085455 T:C T C 10 0.535527279857177 0.646276786449506 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 45219524 T/C 1 57 51 108 26.4749450481409 27.311891272716 -0.836946224575112 T:C T C 10 0.535527279857177 0.923229332868274 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 45220483 A/G 1 90 68 158 41.8025448128541 36.415855030288 5.38668978256604 A:G A G 10 0.535527279857177 0.42532139505123 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45220398_45220495:RRP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 45502844 T/G 1 14 12 26 6.50261808199952 6.42632735828612 0.0762907237133996 T:G T G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000461889:exon_45502669_45502896:TRAPPC10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 46271452 C/T 1 33 20 53 15.3275997647132 10.7105455971435 4.61705416756962 T:C C T 10 0.535527279857177 0.217607458899813 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 46330685 G/T 1 48 48 96 22.2946905668555 25.7053094331445 -3.41061886628898 T:G G T 10 0.535527279857177 0.539511178445191 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46330640_46330741:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523663:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522931:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517563:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522688:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000520389:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000524251:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517819:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397846:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000521995:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000518033:exon_46330236_46330700:ITGB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 46951556 A/G 1 7 6 13 3.25130904099976 3.21316367914306 0.0381453618566998 A:T:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000477688:exon_46951332_46952062:SLC19A1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 46957794 T/C 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 T:C T C 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000427839:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000443742:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000486303:exon_46957685_46957847:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000528477:exon_46957692_46957922:SLC19A1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 15 39 54 6.96709080214235 20.8855639144299 -13.9184731122876 A:C A C 10 0.535527279857177 0.000173006595409985 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 47614528 C/T 1 17 59 76 7.89603624242799 31.5961095115734 -23.7000732691454 T:C C T 10 0.535527279857177 4.49513358310963e-08 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 47676837 C/T 1 27 27 54 12.5407634438562 14.4592365561438 -1.91847311228756 T:C C T 10 0.535527279857177 0.682745837825282 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 47783655 C/G 1 9 4 13 4.18025448128541 2.14210911942871 2.0381453618567 C:G C G 10 0.535527279857177 0.282589464001187 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47783395_47783849:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47783395_47783849:PCNT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 47831309 G/A 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 A:G G A 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47831103_47831981:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47831103_47831981:PCNT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 47831522 G/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47831103_47831981:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47831103_47831981:PCNT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 47831729 G/A 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47831103_47831981:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47831103_47831981:PCNT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 47836206 A/C 1 11 4 15 5.10919992157105 2.14210911942871 2.96709080214235 A:C A C 10 0.535527279857177 0.194136764216528 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 47836216 A/G 1 9 4 13 4.18025448128541 2.14210911942871 2.0381453618567 A:G A G 10 0.535527279857177 0.282589464001187 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 47836395 T/G 1 11 5 16 5.10919992157105 2.67763639928588 2.43156352228517 T:G T G 10 0.535527279857177 0.316751505566711 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 47836426 T/C 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C T C 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 47836547 T/C 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 T:C T C 10 0.535527279857177 0.809233970242324 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 47848459 G/A 1 9 11 20 4.18025448128541 5.89080007842895 -1.71054559714354 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.505111632691192 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47848309_47848504:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47848309_47848504:PCNT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 19 17 36 8.82498168271364 9.10396375757201 -0.278982074858371 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 17625915 G/A 1 15 13 28 6.96709080214235 6.9618546381433 0.00523616399904459 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17625914_17626007:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17625914_17626007:CECR5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 17630486 C/A 1 21 15 36 9.75392712299928 8.03290919785765 1.72101792514163 A:C C A 10 0.535527279857177 0.61869297554355 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000480451:exon_17630432_17630635:CECR5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 17690409 G/A 1 12 21 33 5.57367264171388 11.2460728770007 -5.67240023528684 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0548969189608858 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17690246_17690575:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17690246_17690779:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17690246_17690614:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000441548:exon_17690246_17690613:CECR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 18111431 T/C 1 38 36 74 17.6499633654273 19.2789820748584 -1.62901870943109 T:C T C 10 0.535527279857177 0.727677418030172 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18111369_18111584:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18111369_18111513:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18111369_18111499:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000478963:exon_18111369_18111514:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000460085:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 18165995 T/G 1 15 14 29 6.96709080214235 7.49738191800048 -0.530291115858132 T:G T G 10 0.535527279857177 0.854578961351753 ENSG00000099968:ENST00000399781:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000464649:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000337612:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18165980_18166087:BCL2L13 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 18209613 A/G 1 18 14 32 8.36050896257082 7.49738191800048 0.863127044570338 A:G A G 10 0.535527279857177 0.859946497231876 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 18209718 C/T 1 21 17 38 9.75392712299928 9.10396375757201 0.649963365427276 T:C C T 10 0.535527279857177 0.87207052479811 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 18220831 A/G 1 195 237 432 90.5721804278505 126.919965326151 -36.3477848983004 A:G A G 10 0.535527279857177 0.000502731967190219 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399765:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000494097:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18220824_18220995:BID HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 19124865 C/T 1 18 15 33 8.36050896257082 8.03290919785765 0.327599764713161 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19124836_19124945:DGCR14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 20079438 C/T 1 13 6 19 6.0381453618567 3.21316367914306 2.82498168271364 T:C C T 10 0.535527279857177 0.251478317815371 ENSG00000128191:ENST00000351989:exon_20079392_20079493:DGCR8;ENSG00000128191:ENST00000383024:exon_20079392_20079493:DGCR8;ENSG00000128191:ENST00000495826:exon_20079392_20079493:DGCR8;ENSG00000128191:ENST00000407755:exon_20079392_20079493:DGCR8;ENSG00000128191:ENST00000498171:exon_20079392_20079493:DGCR8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 20761063 G/A 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 A:G G A 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000185252:ENST00000400451:exon_20759667_20761968:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000403682:exon_20759667_20761697:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000357502:exon_20759667_20761971:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000493734:exon_20759667_20761970:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000356671:exon_20759667_20762752:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000437275:exon_20759667_20762745:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000405993:exon_20759667_20761258:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000476678:exon_20759667_20761683:ZNF74 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 21141300 T/C 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000099937:ENST00000215727:exon_21141163_21142008:SERPIND1;ENSG00000099937:ENST00000406799:exon_21141163_21141520:SERPIND1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 21213380 C/T 1 31 29 60 14.3986543244275 15.5302911158581 -1.13163679143062 T:C C T 10 0.535527279857177 0.79674171013507 ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 21213416 A/G 1 48 42 90 22.2946905668555 22.4921457540014 -0.197455187145923 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000241973:ENST00000449120:exon_21213411_21213705:PI4KA;ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 22162126 A/G 1 15 20 35 6.96709080214235 10.7105455971435 -3.74345479500119 A:G A G 10 0.535527279857177 0.236600445119263 ENSG00000100030:ENST00000215832:exon_22161953_22162135:MAPK1;ENSG00000100030:ENST00000415911:exon_22161953_22162135:MAPK1;ENSG00000100030:ENST00000398822:exon_22161953_22162135:MAPK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 22318538 C/T 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 T:C C T 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 22330082 T/C 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:C T C 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22330012_22330087:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449517:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000424393:exon_22330012_22330116:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437929:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000430142:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000489581:exon_22330012_22330168:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000456075:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449704:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000442653:exon_22330012_22330341:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437103:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000434517:exon_22330018_22330179:TOP3B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 22517026 T/C 1 19 1 20 8.82498168271364 0.535527279857177 8.28945440285646 T:C T C 10 0.535527279857177 0.000129463955411863 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 22550450 C/G 1 26 36 62 12.0762907237134 19.2789820748584 -7.20269135114497 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0746496628996276 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 22550510 T/G 1 40 60 100 18.5789088057129 32.1316367914306 -13.5527279857177 A:T:G T G 10 0.535527279857177 0.00677426002187597 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 22569448 T/A 1 5 214 219 2.32236360071412 114.602837889436 -112.280474288722 A:T T A 10 0.535527279857177 9.66666772419795e-64 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 22569640 T/G 0 0 20 20 0 10.7105455971435 -10.7105455971435 A:G T G 10 0.535527279857177 2.18375661512116e-07 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 23029526 G/C 1 17 10 27 7.89603624242799 5.35527279857177 2.54076344385622 C:G G C 10 0.535527279857177 0.343173783053281 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 23055533 G/A 0 82 3 85 38.0867630517115 1.60658183957153 36.48018121214 C:G G C 10 0.535527279857177 6.48014025768479e-19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 23055539 G/T 0 90 0 90 41.8025448128541 0 41.8025448128541 G G 10 0.535527279857177 5.86480916099026e-25 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 23264785 C/A 1 7 8 15 3.25130904099976 4.28421823885742 -1.03290919785765 A:C C A 10 0.535527279857177 0.614933682686176 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 23627369 A/G 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000466076:exon_23627220_23627388:BCR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 28 28 56 13.005236163999 14.994763836001 -1.98952767200191 T:C T C 10 0.535527279857177 0.59543604715493 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 25017036 C/T 1 25 27 52 11.6118180035706 14.4592365561438 -2.8474185525732 T:C C T 10 0.535527279857177 0.487587224252618 ENSG00000100031:ENST00000248923:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000412658:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000400382:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000430030:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000400383:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000417817:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000446402:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000421833:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000400380:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000406383:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000425895:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000450398:exon_25016880_25017037:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000480228:exon_25016295_25018006:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000428338:exon_25016880_25017037:GGT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 26829916 A/C 1 10 14 24 4.64472720142823 7.49738191800048 -2.85265471657225 A:C A C 10 0.535527279857177 0.306793066047406 ENSG00000128203:ENST00000215906:exon_26829358_26830467:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000382701:exon_26829358_26830467:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000456021:exon_26829581_26830467:ASPHD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 26860269 G/C 1 34 21 55 15.792072484856 11.2460728770007 4.54599960785527 C:G G C 10 0.535527279857177 0.227174415110855 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26860210_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26860205_26860792:HPS4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 59 83 142 27.4038904884266 44.4487642281457 -17.0448737397191 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00531112413827471 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 29737521 C/T 1 71 64 135 32.9775631301404 34.2737459108593 -1.29618278071889 T:C C T 10 0.535527279857177 0.863127842877608 ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29737490_29737749:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29737490_29737749:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29737490_29737749:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29737490_29737749:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29737490_29737749:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29737490_29737749:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29737490_29737749:AP1B1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 29886413 A/G 1 20 15 35 9.28945440285646 8.03290919785765 1.25654520499881 A:G A G 10 0.535527279857177 0.736332608702484 ENSG00000100285:ENST00000310624:exon_29884838_29887379:NEFH;ENSG00000100285:ENST00000328842:exon_29886042_29886692:NEFH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 29908072 C/T 1 31 27 58 14.3986543244275 14.4592365561438 -0.0605822317162641 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29908010_29908125:THOC5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 29913272 C/T 1 21 23 44 9.75392712299928 12.3171274367151 -2.56320031371579 T:C C T 10 0.535527279857177 0.453611121446254 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 30700607 T/G 1 21 26 47 9.75392712299928 13.9237092762866 -4.16978215328732 T:G T G 10 0.535527279857177 0.243679666219694 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30700520_30700640:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000393906:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000490449:exon_30700520_30700619:TBC1D10A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 30733111 C/A 1 41 39 80 19.0433815258557 20.8855639144299 -1.84218238857416 A:C C A 10 0.535527279857177 0.737004404513118 ENSG00000099995:ENST00000439242:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000446990:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000215793:exon_30733015_30733169:SF3A1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 30987861 G/C 1 21 9 30 9.75392712299928 4.81974551871459 4.93418160428469 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0979547554859608 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 19 8 27 8.82498168271364 4.28421823885742 4.54076344385622 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0854473712474619 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 31342376 G/C 1 6 9 15 2.78683632085694 4.81974551871459 -2.03290919785765 C:G G C 10 0.535527279857177 0.312914646957404 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000476152:exon_31342328_31342436:MORC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 31491295 G/C 1 7 12 19 3.25130904099976 6.42632735828612 -3.17501831728636 C:G G C 10 0.535527279857177 0.170306763434808 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 31494813 G/C 1 16 5 21 7.43156352228517 2.67763639928588 4.75392712299928 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0475089451446931 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31494653_31494826:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31494653_31494826:SMTN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 32792223 A/G 1 80 58 138 37.1578176114258 31.0605822317163 6.09723537970958 A:G A G 10 0.535527279857177 0.307047589745573 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32792061_32792236:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32792061_32792236:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32792061_32792236:C22orf28 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 76 88 164 35.2999267308546 47.1264006274316 -11.826473896577 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0715536615701704 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 36537500 A/T 1 64 84 148 29.7262540891407 44.9842915080029 -15.2580374188622 A:T A T 10 0.535527279857177 0.0132548515847333 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 36537763 C/T 1 76 71 147 35.2999267308546 38.0224368698596 -2.72251013900501 T:C C T 10 0.535527279857177 0.679671253248687 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 36537893 A/G 1 39 38 77 18.1144360855701 20.3500366345727 -2.23560054900263 A:G A G 10 0.535527279857177 0.648407350465468 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 36623920 G/A 1 105 86 191 48.7696356149964 46.0553460677172 2.7142895472792 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.717217562878719 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 36661330 G/A 1 36 34 70 16.7210179251416 18.207927515144 -1.48690959000239 A:G G A 10 0.535527279857177 0.721265385689723 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36661197_36661361:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 36661536 C/A 1 77 89 166 35.7643994509974 47.6619279072887 -11.8975284562914 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0732218125586826 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 36661566 G/A 1 90 86 176 41.8025448128541 46.0553460677172 -4.25280125486314 A:G G A 10 0.535527279857177 0.545808935573214 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 36661646 G/A 1 76 80 156 35.2999267308546 42.8421823885742 -7.54225565771961 A:G G A 10 0.535527279857177 0.229627952237482 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 36661842 G/A 1 72 62 134 33.4420358502833 33.202691351145 0.239344499138291 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 299 201 500 138.877343322704 107.640983251293 31.2363600714115 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.0053954915039683 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 281 166 447 130.516834360133 88.8975284562914 41.6193059038419 A:C C A 10 0.535527279857177 7.96098789174383e-05 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 37271802 C/T 1 36 37 73 16.7210179251416 19.8145093547155 -3.09349142957392 T:C C T 10 0.535527279857177 0.48336671373693 ENSG00000100365:ENST00000447071:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37271695_37271825:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000439078:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 37273742 G/A 1 46 39 85 21.3657451265699 20.8855639144299 0.480181212139957 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 37407194 G/A 1 49 47 96 22.7591632869983 25.1697821532873 -2.41061886628899 A:G G A 10 0.535527279857177 0.68256702452205 ENSG00000128311:ENST00000403892:exon_37406900_37407366:TST;ENSG00000128311:ENST00000249042:exon_37406900_37407366:TST HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 56 71 127 26.0104723279981 38.0224368698596 -12.0119645418615 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0403196943242083 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 38204089 C/T 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 T:C C T 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38203912_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38203919_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000445195:exon_38203923_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000415371:exon_38203930_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000478203:exon_38203941_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000426858:exon_38203945_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000451984:exon_38204021_38204170:GCAT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 7 10 17 3.25130904099976 5.35527279857177 -2.10396375757201 A:G A G 10 0.535527279857177 0.338715846297251 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 643 616 1259 298.655959051835 329.884804392021 -31.2288453401858 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0798064970596904 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 38323507 G/T 1 10 12 22 4.64472720142823 6.42632735828612 -1.78160015685789 T:G G T 10 0.535527279857177 0.523672568666477 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 39069181 T/C 1 19 16 35 8.82498168271364 8.56843647771483 0.256545204998806 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 39134207 C/T 1 61 56 117 28.3328359287122 29.9895276720019 -1.6566917432897 T:C C T 10 0.535527279857177 0.78145750207443 ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39133956_39134304:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000489527:exon_39133956_39134300:GTPBP1;ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39133765_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134040_39134270:SUN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 39134715 T/C 1 46 43 89 21.3657451265699 23.0276730338586 -1.66192790728875 T:C T C 10 0.535527279857177 0.750575366304493 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 39147235 A/C 1 24 37 61 11.1473452834278 19.8145093547155 -8.66716407128779 A:C A C 10 0.535527279857177 0.0289247256951006 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000417595:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000438058:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000456894:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000480307:exon_39147215_39147446:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000420859:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000452294:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000494273:exon_39146903_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000433561:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000417332:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000439339:exon_39147215_39147378:SUN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 39477123 T/C 1 205 197 402 95.2169076292787 105.498874131864 -10.2819665025851 T:C T C 10 0.535527279857177 0.317381847822440 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000486357:exon_39476938_39477199:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39475667_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39476640_39477232:APOBEC3G HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 53 28 81 24.6170541675696 14.994763836001 9.62229033156867 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0342327285862378 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 21 8 29 9.75392712299928 4.28421823885742 5.46970888414187 C:G G C 10 0.535527279857177 0.060745025877056 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 54 16 70 25.0815268877124 8.56843647771483 16.5130904099976 C:G G C 10 0.535527279857177 5.91302390791805e-05 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 40815089 G/C 1 13 19 32 6.0381453618567 10.1750183172864 -4.13687295542966 C:G G C 10 0.535527279857177 0.158370597920366 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 40815256 C/T 1 16 7 23 7.43156352228517 3.74869095900024 3.68287256328493 T:C C T 10 0.535527279857177 0.145529269824070 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 40816955 G/A 1 22 18 40 10.2183998431421 9.63949103742918 0.578908805712922 A:G G A 10 0.535527279857177 0.875587467242644 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40816851_40817104:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40816851_40817104:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40816851_40817104:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40816851_40817104:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40816851_40817104:MKL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 40820273 C/T 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 T:C C T 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40820210_40820385:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40820210_40820385:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40820210_40820385:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40820210_40820385:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40820210_40820385:MKL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 41548008 A/G 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100393:ENST00000263253:exon_41547837_41548016:EP300 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 41613188 C/T 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 T:C C T 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41613127_41615540:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000449635:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41613127_41613206:L3MBTL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 41645757 C/G 1 56 60 116 26.0104723279981 32.1316367914306 -6.12116446343252 C:G C G 10 0.535527279857177 0.264965304262642 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41645733_41645821:RANGAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 41752747 G/A 1 9 15 24 4.18025448128541 8.03290919785765 -3.85265471657225 A:G G A 10 0.535527279857177 0.151134011177156 ENSG00000100403:ENST00000352645:exon_41752649_41752812:ZC3H7B;ENSG00000100403:ENST00000351589:exon_41752649_41752812:ZC3H7B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 41833116 C/T 1 8 1 9 3.71578176114258 0.535527279857177 3.18025448128541 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0433473902079845 ENSG00000183864:ENST00000327492:exon_41829496_41833411:TOB2;ENSG00000183864:ENST00000434408:exon_41833046_41833411:TOB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 41903813 A/C 1 53 39 92 24.6170541675696 20.8855639144299 3.73149025313972 A:C A C 10 0.535527279857177 0.465429612255505 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000471094:exon_41903795_41904053:ACO2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 42482252 G/A 1 382 205 587 177.428579094558 109.783092370721 67.6454867238371 A:T:G G A 10 0.535527279857177 2.01517734015118e-08 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42481529_42482318:NDUFA6;ENSG00000184983:ENST00000470753:exon_42482120_42482318:NDUFA6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 42607338 C/T 1 25 15 40 11.6118180035706 8.03290919785765 3.57890880571292 T:C C T 10 0.535527279857177 0.27163363697965 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 42610099 T/C 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 T:C T C 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 42912106 C/T 1 101 156 257 46.9117447344251 83.5422556577196 -36.6305109232945 T:C C T 10 0.535527279857177 5.85652385017292e-06 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 35 57 92 16.2565452049988 30.5250549518591 -14.2685097468603 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00326604413913876 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 43089849 T/C 1 25 42 67 11.6118180035706 22.4921457540014 -10.8803277504309 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00963554010783006 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 43195134 C/T 1 18 28 46 8.36050896257082 14.994763836001 -6.63425487343014 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0549441425275635 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43195045_43195166:ARFGAP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 43206950 A/C 1 20 19 39 9.28945440285646 10.1750183172864 -0.885563914429902 A:C A C 10 0.535527279857177 0.872767655672926 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43206819_43206950:ARFGAP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 43435812 C/T 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C C T 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43435645_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43435675_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43435773_43435911:TTLL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 37 39 76 17.1854906452845 20.8855639144299 -3.70007326914545 C:G G C 10 0.535527279857177 0.421905623831145 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 43558926 A/G 1 178 149 327 82.6761441854225 79.7935646987194 2.88257948670314 A:T:G A G 10 0.535527279857177 0.781704962788618 ENSG00000100300:ENST00000337554:exon_43558809_43559248:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000396265:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000361449:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000329563:exon_43558809_43559216:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000445018:exon_43558809_43558997:TSPO HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 43576904 G/A 1 18 14 32 8.36050896257082 7.49738191800048 0.863127044570338 A:G G A 10 0.535527279857177 0.859946497231876 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000357017:exon_43576762_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43576748_43576946:TTLL12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 43579081 C/T 1 7 9 16 3.25130904099976 4.81974551871459 -1.56843647771483 T:C C T 10 0.535527279857177 0.462143040312805 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43578986_43579155:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43578986_43579155:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000357017:exon_43578986_43579155:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43578986_43579155:TTLL12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 41 65 106 19.0433815258557 34.8092731907165 -15.7658916648608 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00242168558103414 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 44386281 C/T 1 138 131 269 64.0972353797096 70.1540736612902 -6.05683828158061 T:C C T 10 0.535527279857177 0.463882424247928 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000494795:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000465768:exon_44386208_44386286:SAMM50 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 208 184 392 96.6103257897072 98.5370194937206 -1.92669370401337 A:C A C 10 0.535527279857177 0.879285758850923 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 45723807 G/C 1 13 2 15 6.0381453618567 1.07105455971435 4.96709080214235 C:G G C 10 0.535527279857177 0.00954151482574078 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000427777:exon_45723723_45723841:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 45723842 G/A 1 14 3 17 6.50261808199952 1.60658183957153 4.89603624242799 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0256420277318128 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 45728370 G/A 1 51 10 61 23.688108727284 5.35527279857177 18.3328359287122 A:G G A 10 0.535527279857177 1.05050518739194e-06 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 46685754 C/T 1 19 4 23 8.82498168271364 2.14210911942871 6.68287256328493 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00559662733248374 ENSG00000075234:ENST00000381031:exon_46685723_46685796:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000445282:exon_46685723_46685796:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000451998:exon_46685723_46685796:TTC38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 46722400 T/C 1 10 24 34 4.64472720142823 12.8526547165722 -8.20792751514402 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00547627054842897 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46722333_46723213:GTSE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 47087670 G/A 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 A:G G A 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47087469_47087674:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47087469_47087674:CERK;ENSG00000100422:ENST00000471929:exon_47087469_47087674:CERK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50187853 C/T 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C C T 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000100425:ENST00000404034:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000216267:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000404760:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000438393:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000342989:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000457780:exon_50187682_50187942:BRD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50217387 G/A 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 A:G G A 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000100425:ENST00000404034:exon_50216599_50217979:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000216267:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000404760:exon_50216599_50217979:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000342989:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000457780:exon_50216599_50218452:BRD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50280136 T/C 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 T:C T C 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50301476 T/C 1 16 16 32 7.43156352228517 8.56843647771483 -1.13687295542966 T:C T C 10 0.535527279857177 0.725380877409574 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50301369_50301566:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50301369_50301592:ALG12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50313438 T/C 1 24 16 40 11.1473452834278 8.56843647771483 2.57890880571292 T:C T C 10 0.535527279857177 0.433029573000097 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50313378_50313488:CRELD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50315952 C/T 1 9 1 10 4.18025448128541 0.535527279857177 3.64472720142823 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0246218512642377 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50315945_50316091:CRELD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50317989 C/T 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:C C T 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50320943 C/T 1 146 66 212 67.8130171408522 35.3448004705737 32.4682166702785 A:T:C C T 10 0.535527279857177 6.61557749874609e-06 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50320903_50321188:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50320903_50321176:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50320903_50321182:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50320903_50321182:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50320903_50321176:CRELD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50356302 C/T 1 10 3 13 4.64472720142823 1.60658183957153 3.0381453618567 T:C C T 10 0.535527279857177 0.102869269884982 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50632869 C/T 1 40 32 72 18.5789088057129 17.1368729554297 1.44203585028326 T:C C T 10 0.535527279857177 0.813444507342862 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50632769_50632935:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50632769_50632935:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50632769_50632935:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50632769_50632935:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50632769_50632935:TRABD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50635848 C/G 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000170638:ENST00000472677:exon_50635322_50636615:TRABD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50647086 G/A 1 11 9 20 5.10919992157105 4.81974551871459 0.289454402856461 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000073169:ENST00000380903:exon_50646965_50647145:RP3-402G11.5;ENSG00000073169:ENST00000492092:exon_50646917_50647145:RP3-402G11.5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50648577 C/T 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 T:C C T 10 0.535527279857177 0.298960436382335 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50658698 T/A 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 A:T T A 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658680_50658845:TUBGCP6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50660137 G/A 1 8 5 13 3.71578176114258 2.67763639928588 1.0381453618567 A:G G A 10 0.535527279857177 0.593586480755975 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50659704_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50664612 A/G 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:G A G 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000473946:exon_50664479_50664620:TUBGCP6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 81 94 175 37.6222903315687 50.3395643065746 -12.717273975006 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0580723055995375 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 39 43 82 18.1144360855701 23.0276730338586 -4.91323694828851 A:G A G 10 0.535527279857177 0.319101032933829 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50720622 C/T 1 18 19 37 8.36050896257082 10.1750183172864 -1.81450935471555 T:C C T 10 0.535527279857177 0.622031610977959 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720613_50720991:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720613_50720742:PLXNB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50877135 G/A 1 32 14 46 14.8631270445703 7.49738191800048 7.36574512656986 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0374439609388852 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50877028_50877191:PPP6R2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50878196 G/A 1 15 24 39 6.96709080214235 12.8526547165722 -5.8855639144299 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0762505623742275 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50878182_50878478:PPP6R2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50879447 T/G 1 18 23 41 8.36050896257082 12.3171274367151 -3.95661847414426 T:G T G 10 0.535527279857177 0.272904314717144 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50879251_50879503:PPP6R2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50885534 C/T 1 93 91 184 43.1959629732825 48.7329824670031 -5.53701949372056 T:C C T 10 0.535527279857177 0.417256525375902 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885184_50885669:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885235_50885669:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885236_50885669:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885239_50885669:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885255_50885669:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885512_50885669:SBF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50895020 C/T 1 18 16 34 8.36050896257082 8.56843647771483 -0.207927515144016 T:C:G C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000476293:exon_50895018_50895102:SBF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50942121 C/T 1 35 35 70 16.2565452049988 18.7434547950012 -2.48690959000239 T:C C T 10 0.535527279857177 0.552024894970239 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50943004 C/A 1 24 12 36 11.1473452834278 6.42632735828612 4.72101792514163 A:C C A 10 0.535527279857177 0.133296399696246 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50943010 G/A 1 24 16 40 11.1473452834278 8.56843647771483 2.57890880571292 A:G G A 10 0.535527279857177 0.433029573000097 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50943232 G/A 1 24 22 46 11.1473452834278 11.7816001568579 -0.634254873430139 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.883242572710905 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50943231_50943413:LMF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 16 23 39 7.43156352228517 12.3171274367151 -4.8855639144299 A:G G A 10 0.535527279857177 0.147779940421866 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50944163 G/A 1 17 13 30 7.89603624242799 6.9618546381433 0.934181604284691 A:G G A 10 0.535527279857177 0.855262631313688 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50962259 G/A 1 140 133 273 65.0261808199952 71.2251282210045 -6.19894740100932 A:G G A 10 0.535527279857177 0.466847677313133 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50964153 T/C 1 13 2 15 6.0381453618567 1.07105455971435 4.96709080214235 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00954151482574078 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50987843 C/T 1 6 13 19 2.78683632085694 6.9618546381433 -4.17501831728636 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0660288040617104 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50988105 G/A 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 50988193 A/G 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 22 51011376 G/C 1 11 6 17 5.10919992157105 3.21316367914306 1.89603624242799 C:G G C 10 0.535527279857177 0.467819685510286 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000475238:exon_51011304_51011529:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 3189279 A/G 1 9 19 28 4.18025448128541 10.1750183172864 -5.99476383600095 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0352046065365757 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3189134_3189387:TRNT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 4829732 A/G 1 10 8 18 4.64472720142823 4.28421823885742 0.360508962570814 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4829631_4829823:ITPR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 4856180 T/C 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 T:C T C 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 4856234 G/A 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 A:G G A 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 15 14 29 6.96709080214235 7.49738191800048 -0.530291115858132 T:C T C 10 0.535527279857177 0.854578961351753 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 12 15 27 5.57367264171388 8.03290919785765 -2.45923655614378 T:C T C 10 0.535527279857177 0.440881434887102 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 37 31 68 17.1854906452845 16.6013456755725 0.584144969711968 A:G G A 10 0.535527279857177 0.903923906038016 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 9885615 G/C 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 C:G G C 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000156990:ENST00000433535:exon_9885574_9885698:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000383820:exon_9885574_9885700:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000287624:exon_9885574_9885678:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000424438:exon_9885409_9885626:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000427174:exon_9885574_9885670:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000484134:exon_9885574_9885700:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000418713:exon_9885574_9885686:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000472381:exon_9885149_9885702:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433972:exon_9885574_9885743:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433555:exon_9885574_9885660:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000451405:exon_9885409_9885679:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000460909:exon_9885574_9885700:RPUSD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 10142949 C/T 1 38 23 61 17.6499633654273 12.3171274367151 5.33283592871221 T:C C T 10 0.535527279857177 0.199372312098429 ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10142872_10143610:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10142872_10142966:FANCD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 10302172 G/A 1 25 20 45 11.6118180035706 10.7105455971435 0.901272406427037 A:G G A 10 0.535527279857177 0.88150907355531 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 12962074 G/A 1 18 9 27 8.36050896257082 4.81974551871459 3.54076344385622 A:G G A 10 0.535527279857177 0.183001936277486 ENSG00000144711:ENST00000273221:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000435445:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000450726:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000429247:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000452608:exon_12961930_12962096:IQSEC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 13395076 C/G 1 11 17 28 5.10919992157105 9.10396375757201 -3.99476383600096 C:G C G 10 0.535527279857177 0.134938635465867 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395054_13395160:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395054_13395160:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395054_13395160:NUP210 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 14187449 G/T 1 61 68 129 28.3328359287122 36.415855030288 -8.08301910157583 T:G G T 10 0.535527279857177 0.158654595947722 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14186647_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14186650_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14187229_14187659:XPC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 14199887 G/A 1 19 25 44 8.82498168271364 13.3881819964294 -4.56320031371579 A:G G A 10 0.535527279857177 0.176574758782132 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 15080696 G/A 1 3 8 11 1.39341816042847 4.28421823885742 -2.89080007842895 A:G G A 10 0.535527279857177 0.127667889620419 ENSG00000177463:ENST00000425241:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000323373:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000475707:exon_15079507_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000393102:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000383792:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000396874:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000478572:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000439011:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000413194:exon_15080629_15080734:NR2C2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 15298568 A/G 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 A:G A G 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000131370:ENST00000448619:exon_15298360_15298620:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000383791:exon_15298360_15298620:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000412806:exon_15298360_15298620:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000426925:exon_15298360_15298620:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000253688:exon_15298360_15298620:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000408919:exon_15298360_15298620:SH3BP5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 29 16 45 13.4697088841419 8.56843647771483 4.90127240642704 C:G C G 10 0.535527279857177 0.178203238804942 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 16312564 C/T 1 8 1 9 3.71578176114258 0.535527279857177 3.18025448128541 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0433473902079845 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16312452_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16312452_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16312436_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000486267:exon_16312452_16312702:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16312452_16312578:OXNAD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 16327855 T/G 1 7 1 8 3.25130904099976 0.535527279857177 2.71578176114258 T:G T G 10 0.535527279857177 0.0758484261005442 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16327849_16327955:OXNAD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 246 260 506 114.260289155134 139.237092762866 -24.9768036077315 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0288748241257403 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 201 186 387 93.3590167487074 99.6080740534349 -6.24905730472749 A:C A C 10 0.535527279857177 0.54099656451375 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 16364954 C/T 1 164 143 307 76.173526103423 76.5804010195763 -0.406874916153328 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 17208267 T/C 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 T:C T C 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000131374:ENST00000450163:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000437885:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000253692:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000429383:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000414318:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000446818:exon_17208259_17208420:TBC1D5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 19992432 G/T 1 5 10 15 2.32236360071412 5.35527279857177 -3.03290919785765 T:G G T 10 0.535527279857177 0.128132638231981 ENSG00000144566:ENST00000273047:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000443878:exon_19992298_19992436:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000412966:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000446547:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000422242:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000476544:exon_19992298_19992717:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000455772:exon_19992298_19992553:RAB5A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 27424718 A/G 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000033867:ENST00000419036:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000295736:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000428386:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000425128:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000349751:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000435667:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000388777:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000454389:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000440156:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000457377:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000438530:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437179:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000446700:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000455077:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000445684:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000465487:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437266:exon_27424644_27424741:SLC4A7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 33138549 G/A 1 11 5 16 5.10919992157105 2.67763639928588 2.43156352228517 A:G G A 10 0.535527279857177 0.316751505566711 ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33138503_33138722:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000482097:exon_33138503_33138610:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000485698:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000498537:exon_33138503_33138634:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000415454:exon_33138503_33138613:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000438227:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000440656:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000436768:exon_33138503_33138694:GLB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 33879770 G/A 1 29 27 56 13.4697088841419 14.4592365561438 -0.989527672001911 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.790680016611161 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33879696_33879819:PDCD6IP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 33907915 A/G 1 71 68 139 32.9775631301404 36.415855030288 -3.4382919001476 A:G A G 10 0.535527279857177 0.610069886497416 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 37053568 A/G 1 27 25 52 12.5407634438562 13.3881819964294 -0.847418552573203 A:G A G 10 0.535527279857177 0.889660313518179 ENSG00000076242:ENST00000231790:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000457004:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000432299:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000396438:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000456676:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000458205:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000455445:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000435176:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000441265:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000383761:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000421440:exon_37053532_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000447829:exon_37053533_37053590:MLH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 37366459 C/A 1 32 42 74 14.8631270445703 22.4921457540014 -7.62901870943109 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0808689239550267 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 37368755 T/A 1 28 39 67 13.005236163999 20.8855639144299 -7.88032775043086 A:T T A 10 0.535527279857177 0.0654914227450604 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 11 7 18 5.10919992157105 3.74869095900024 1.36050896257081 C:G G C 10 0.535527279857177 0.638900023085703 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 38048481 G/A 1 18 18 36 8.36050896257082 9.63949103742918 -1.27898207485837 A:G G A 10 0.535527279857177 0.739253657716502 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38048433_38048679:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38048433_38048676:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38048433_38048676:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38048433_38048652:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38048433_38048675:VILL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 38240280 A/G 1 8 3 11 3.71578176114258 1.60658183957153 2.10919992157105 A:G A G 10 0.535527279857177 0.23951309450586 ENSG00000172939:ENST00000446845:exon_38240213_38240354:OXSR1;ENSG00000172939:ENST00000311806:exon_38240213_38240354:OXSR1;ENSG00000172939:ENST00000426620:exon_38240213_38240354:OXSR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 93 31 124 43.1959629732825 16.6013456755725 26.5946172977101 A:T:C:G T C 10 0.535527279857177 1.26762990836835e-06 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 42236415 A/G 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 A:G A G 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000484786:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000449246:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000427771:exon_42236296_42236433:TRAK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 14 18 32 6.50261808199952 9.63949103742918 -3.13687295542966 A:G A G 10 0.535527279857177 0.290964786174482 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 42610515 G/A 1 22 10 32 10.2183998431421 5.35527279857177 4.86312704457034 A:G G A 10 0.535527279857177 0.109707291305461 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 43602803 C/T 1 15 8 23 6.96709080214235 4.28421823885742 2.68287256328493 T:C C T 10 0.535527279857177 0.300673562790689 ENSG00000160746:ENST00000292246:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000350459:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000396091:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000414522:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000451430:exon_43602712_43602894:ANO10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 44871505 A/T 1 17 12 29 7.89603624242799 6.42632735828612 1.46970888414187 A:T A T 10 0.535527279857177 0.710434552275237 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000429516:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44871463_44871567:KIF15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 7 8 15 3.25130904099976 4.28421823885742 -1.03290919785765 A:C C A 10 0.535527279857177 0.614933682686176 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 45533224 G/A 1 9 9 18 4.18025448128541 4.81974551871459 -0.639491037429185 A:G G A 10 0.535527279857177 0.816111256590493 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45533009_45533292:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45533009_45533292:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45533009_45533292:LARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 45557707 G/A 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 A:G G A 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45557586_45557768:LARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 45965244 G/A 1 7 1 8 3.25130904099976 0.535527279857177 2.71578176114258 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0758484261005442 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_45965148_45965257:FYCO1;ENSG00000163820:ENST00000433878:exon_45965148_45965257:FYCO1;ENSG00000163820:ENST00000438446:exon_45965148_45965257:FYCO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 47018214 T/C 1 23 15 38 10.6828725632849 8.03290919785765 2.64996336542728 T:C T C 10 0.535527279857177 0.419972689363019 ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_47018127_47018333:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_47018127_47018238:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_47018127_47018249:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000446836:exon_47018127_47018333:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000494655:exon_47018127_47018235:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000460035:exon_47018127_47018247:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000492819:exon_47017497_47018270:CCDC12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 44 32 76 20.4367996862842 17.1368729554297 3.29992673085455 C:G C G 10 0.535527279857177 0.491052305233887 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 58 42 100 26.9394177682837 22.4921457540014 4.44727201428231 A:G G A 10 0.535527279857177 0.422732818386047 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 47162661 A/G 1 10 12 22 4.64472720142823 6.42632735828612 -1.78160015685789 A:G A G 10 0.535527279857177 0.523672568666477 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 47452118 G/A 1 8 10 18 3.71578176114258 5.35527279857177 -1.63949103742919 A:G G A 10 0.535527279857177 0.484703765251006 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 21 11 32 9.75392712299928 5.89080007842895 3.86312704457034 A:G G A 10 0.535527279857177 0.214818527860921 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 47459679 C/T 1 21 14 35 9.75392712299928 7.49738191800048 2.25654520499881 T:C C T 10 0.535527279857177 0.500276662521839 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000383739:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47459624_47459739:SCAP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 16 22 38 7.43156352228517 11.7816001568579 -4.35003663457272 T:C T C 10 0.535527279857177 0.192981436122139 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 48474249 A/G 1 31 23 54 14.3986543244275 12.3171274367151 2.08152688771244 A:G A G 10 0.535527279857177 0.588474141499197 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 48498706 C/T 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000164053:ENST00000421175:exon_48498659_48498816:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48498659_48498816:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48498659_48498816:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48498659_48498816:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48498659_48498816:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48498659_48498816:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000491468:exon_48498659_48498816:ATRIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 175 150 325 81.282726024994 80.3290919785765 0.953634046417491 T:C C T 10 0.535527279857177 0.95566501562708 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 48508966 G/A 1 221 263 484 102.648471151564 140.843674602438 -38.1952034508736 A:G G A 10 0.535527279857177 0.000525352209719177 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 48727112 G/A 1 30 14 44 13.9341816042847 7.49738191800048 6.43679968628421 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0685372052184501 ENSG00000068745:ENST00000328631:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395507:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395509:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000479914:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000491686:exon_48727043_48727146:IP6K2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 49455330 C/T 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 T:C C T 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000145020:ENST00000465925:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000427987:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000458307:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000476226:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000273588:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000454938:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000395338:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000476127:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000399379:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000473163:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000430521:exon_49455328_49455406:AMT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 49570200 C/T 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 T:C C T 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000173402:ENST00000308775:exon_49568230_49573044:DAG1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 49714225 T/C 1 46 38 84 21.3657451265699 20.3500366345727 1.01570849199713 T:C T C 10 0.535527279857177 0.912982373264668 ENSG00000164062:ENST00000296456:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000449966:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000446089:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000442186:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000438011:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000463995:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447436:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000457042:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447541:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000482301:exon_49714210_49714250:APEH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 49721532 G/A 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:G G A 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721381_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721482_49721622:MST1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 49721798 C/A 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 A:C C A 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484144:exon_49721758_49721886:MST1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 49845526 T/C 1 75 52 127 34.8354540107117 27.8474185525732 6.98803545813853 T:C T C 10 0.535527279857177 0.247380072456725 ENSG00000182179:ENST00000333486:exon_49845453_49845545:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000488536:exon_49845475_49845545:UBA7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 49866584 T/G 1 10 14 24 4.64472720142823 7.49738191800048 -2.85265471657225 T:G T G 10 0.535527279857177 0.306793066047406 ENSG00000183763:ENST00000331456:exon_49866034_49866658:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000491060:exon_49866054_49866941:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000473195:exon_49866521_49866658:TRAIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 50114515 C/T 1 27 14 41 12.5407634438562 7.49738191800048 5.04338152585574 T:C C T 10 0.535527279857177 0.1202157089391 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50114441_50114682:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50114441_50114683:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50114441_50114680:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50114441_50114682:RBM6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 50144951 T/C 1 12 10 22 5.57367264171388 5.35527279857177 0.218399843142107 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000395174:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000496179:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000474818:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000494360:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000441812:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000489437:exon_50144914_50145002:RBM5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 50153356 T/C 1 82 102 184 38.0867630517115 54.6237825454321 -16.5370194937206 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0147743217093192 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475128:exon_50153339_50153376:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475590:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000492430:exon_50153339_50153613:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000479275:exon_50153339_50153664:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464988:exon_50153339_50153413:RBM5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 52022794 G/A 1 56 46 102 26.0104723279981 24.6342548734301 1.37621745456795 A:G G A 10 0.535527279857177 0.842827360708583 ENSG00000114786:ENST00000463721:exon_52022782_52022842:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463937:exon_52022782_52022842:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000458031:exon_52022782_52022842:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000515879:exon_52022782_52022842:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000232907:exon_52022782_52022842:RP11-155D18.11;ENSG00000243989:ENST00000491318:exon_52022782_52022842:ACY1;ENSG00000243989:ENST00000476854:exon_52022782_52022842:ACY1;ENSG00000243989:ENST00000476351:exon_52022782_52022842:ACY1;ENSG00000243989:ENST00000494103:exon_52022782_52022842:ACY1;ENSG00000243989:ENST00000404366:exon_52022782_52022842:ACY1;ENSG00000243989:ENST00000490244:exon_52022318_52022842:ACY1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 52561680 C/T 1 46 57 103 21.3657451265699 30.5250549518591 -9.15930982528923 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0755416126466249 ENSG00000168268:ENST00000307092:exon_52561633_52561734:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000463947:exon_52561633_52561700:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000307076:exon_52561633_52561734:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000422318:exon_52561633_52561734:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000459839:exon_52561633_52561734:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000492555:exon_52561633_52561734:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000466112:exon_52561310_52561784:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000478091:exon_52561633_52561947:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000489316:exon_52561633_52561734:NT5DC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 52728106 G/A 1 506 476 982 235.023196392268 254.910985212016 -19.8877888197478 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.212129181914832 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52728053_52728119:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52728053_52728119:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52728053_52728119:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52728053_52728119:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52728053_52728119:GNL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 53125922 T/C 1 78 87 165 36.2288721711402 46.5908733475744 -10.3620011764342 T:C T C 10 0.535527279857177 0.118342098124349 ENSG00000163933:ENST00000296292:exon_53122499_53126086:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000394738:exon_53125681_53126086:RFT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 53226177 G/A 1 192 204 396 89.178762267422 109.247565090864 -20.0688028234421 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0439605711437856 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53226124_53226733:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53226124_53226570:PRKCD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 53899057 A/G 1 33 20 53 15.3275997647132 10.7105455971435 4.61705416756962 A:G A G 10 0.535527279857177 0.217607458899813 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53898773_53899827:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53898773_53899615:IL17RB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 53905308 T/C 1 37 44 81 17.1854906452845 23.5632003137158 -6.37770966843133 T:C T C 10 0.535527279857177 0.181081428747697 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53905185_53905523:ACTR8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 53906513 G/A 1 18 29 47 8.36050896257082 15.5302911158581 -7.16978215328732 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0404976931783654 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53906411_53906551:ACTR8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 53914093 G/A 1 8 25 33 3.71578176114258 13.3881819964294 -9.67240023528684 A:G G A 10 0.535527279857177 0.000755160292231177 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53913966_53914099:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000498740:exon_53913966_53914136:ACTR8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 56667682 G/C 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 C:G G C 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56667072_56668000:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56667072_56667871:C3orf63 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 56771251 A/C 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:C A C 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000495373:exon_56771213_56771383:ARHGEF3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 58109162 G/A 1 8 10 18 3.71578176114258 5.35527279857177 -1.63949103742919 A:G G A 10 0.535527279857177 0.484703765251006 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58108820_58109417:FLNB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 58112488 C/T 1 10 9 19 4.64472720142823 4.81974551871459 -0.175018317286362 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58112329_58112489:FLNB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 58118555 G/A 1 11 14 25 5.10919992157105 7.49738191800048 -2.38818199642942 A:G G A 10 0.535527279857177 0.423396273780819 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58117805_58118658:FLNB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 46 38 84 21.3657451265699 20.3500366345727 1.01570849199713 T:C C T 10 0.535527279857177 0.912982373264668 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 58382846 C/T 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383715:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000484288:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58382766_58382927:PXK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 58395863 A/G 1 15 2 17 6.96709080214235 1.07105455971435 5.89603624242799 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00560333285628438 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383715:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000484288:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000459676:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000495557:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000493474:exon_58395817_58395886:PXK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 58410554 C/T 1 15 15 30 6.96709080214235 8.03290919785765 -1.06581839571531 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.717832749087862 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58410479_58411748:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58410479_58411746:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58410479_58411601:PXK;ENSG00000168297:ENST00000493474:exon_58410479_58410902:PXK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 58416535 C/T 1 45 22 67 20.901272406427 11.7816001568579 9.11967224956914 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0273224192176907 ENSG00000168291:ENST00000302746:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000383714:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000469364:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000479945:exon_58416384_58417520:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000474765:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000461692:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000480626:exon_58416384_58416669:PDHB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 69082708 C/G 1 14 22 36 6.50261808199952 11.7816001568579 -5.27898207485837 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0942326952420247 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69082699_69082855:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69082699_69082855:TMF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 69151152 C/A 1 26 34 60 12.0762907237134 18.207927515144 -6.13163679143062 A:C C A 10 0.535527279857177 0.121283195230185 ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000435015:exon_69151060_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69151110_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000470936:exon_69150990_69151381:ARL6IP5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 73111368 T/C 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 T:C T C 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 73111973 A/G 1 1 7 8 0.464472720142823 3.74869095900024 -3.28421823885742 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0289107709309061 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 73111998 C/T 1 2 8 10 0.928945440285646 4.28421823885742 -3.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0525767166149741 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 81698130 T/C 1 18 12 30 8.36050896257082 6.42632735828612 1.93418160428469 T:C T C 10 0.535527279857177 0.583930457533564 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 87276699 C/T 1 41 27 68 19.0433815258557 14.4592365561438 4.58414496971196 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.276465538419815 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87276421_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87276435_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87276452_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87276459_87276706:CHMP2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 87299075 A/C 1 16 6 22 7.43156352228517 3.21316367914306 4.21839984314211 A:C A C 10 0.535527279857177 0.08728031897682 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87299025_87299127:CHMP2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 88199177 G/C 1 4 17 21 1.85789088057129 9.10396375757201 -7.24607287700072 C:G G C 10 0.535527279857177 0.00166756850019009 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 88199179 T/C 1 17 4 21 7.89603624242799 2.14210911942871 5.75392712299928 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0144484899854253 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 88199298 T/C 1 21 20 41 9.75392712299928 10.7105455971435 -0.956618474144255 T:C T C 10 0.535527279857177 0.875832794765671 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 97677897 T/G 1 21 12 33 9.75392712299928 6.42632735828612 3.32759976471316 T:G T G 10 0.535527279857177 0.296068803828881 ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97677895_97678023:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97677895_97678023:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97677895_97678023:MINA;ENSG00000170854:ENST00000514314:exon_97677895_97678023:MINA;ENSG00000170854:ENST00000330299:exon_97677895_97678023:MINA;ENSG00000170854:ENST00000507612:exon_97677895_97678023:MINA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 50 54 104 23.2236360071412 28.9184731122876 -5.69483710514641 A:G G A 10 0.535527279857177 0.280206296234303 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 100119548 T/C 1 14 12 26 6.50261808199952 6.42632735828612 0.0762907237133996 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100119470_100120242:TOMM70A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 101520537 C/T 1 2 8 10 0.928945440285646 4.28421823885742 -3.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0525767166149741 ENSG00000144815:ENST00000273347:exon_101520079_101520833:FAM55C;ENSG00000144815:ENST00000491511:exon_101520079_101520833:FAM55C;ENSG00000144815:ENST00000477909:exon_101520079_101520833:FAM55C;ENSG00000144815:ENST00000422132:exon_101520079_101520833:FAM55C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 105258861 A/G 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 A:G A G 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105258819_105258946:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105258819_105258946:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105258819_105258946:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000481337:exon_105258819_105258946:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105258819_105258946:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000460954:exon_105258819_105258901:ALCAM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 105266331 A/G 1 8 13 21 3.71578176114258 6.9618546381433 -3.24607287700072 A:G A G 10 0.535527279857177 0.190471702102025 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000389927:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000465413:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000491388:exon_105266234_105266371:ALCAM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 105464766 G/A 1 2 7 9 0.928945440285646 3.74869095900024 -2.81974551871459 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0914963800425486 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105464761_105464882:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105464761_105464882:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105464761_105464882:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105464761_105464882:CBLB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 113176122 G/A 1 1 7 8 0.464472720142823 3.74869095900024 -3.28421823885742 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0289107709309061 ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113175983_113176204:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000496105:exon_113175983_113176204:SPICE1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 119133554 G/A 1 18 20 38 8.36050896257082 10.7105455971435 -2.35003663457272 A:G G A 10 0.535527279857177 0.516206535659463 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 119263680 C/T 1 90 86 176 41.8025448128541 46.0553460677172 -4.25280125486314 T:C C T 10 0.535527279857177 0.545808935573214 ENSG00000121594:ENST00000264246:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383669:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383668:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000478182:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000463729:exon_119263190_119263714:CD80 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 119305379 T/A 1 14 6 20 6.50261808199952 3.21316367914306 3.28945440285646 A:T T A 10 0.535527279857177 0.179412444802184 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 119338492 G/A 1 81 73 154 37.6222903315687 39.0934914295739 -1.47120109800525 A:G G A 10 0.535527279857177 0.809190345508453 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119338410_119338499:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119338410_119338499:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119338410_119338499:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119338410_119338499:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119338410_119338499:PLA1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 266 225 491 123.549743557991 120.493637967865 3.05610559012611 T:C T C 10 0.535527279857177 0.786263031583159 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 121354583 G/A 1 267 217 484 124.014216278134 116.209419729007 7.80479654912634 A:G G A 10 0.535527279857177 0.494391053245963 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121354582_121354651:HCLS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 121383297 G/A 1 103 91 194 47.8406901747108 48.7329824670031 -0.892292292292332 A:G G A 10 0.535527279857177 0.942646854983306 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 121413637 G/A 1 35 42 77 16.2565452049988 22.4921457540014 -6.23560054900263 A:G G A 10 0.535527279857177 0.170665943932989 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 121414061 C/T 1 43 32 75 19.9723269661414 17.1368729554297 2.83545401071173 T:C C T 10 0.535527279857177 0.563403826860087 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 121415720 T/C 1 23 19 42 10.6828725632849 10.1750183172864 0.507854245998567 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 121416623 G/C 1 13 10 23 6.0381453618567 5.35527279857177 0.68287256328493 C:G G C 10 0.535527279857177 0.836716139403488 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000426235:exon_121415847_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000489400:exon_121415874_121417776:GOLGB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 62 81 143 28.797308648855 43.3777096684313 -14.5804010195763 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0150479749960573 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 121526204 G/A 1 8 16 24 3.71578176114258 8.56843647771483 -4.85265471657225 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0637278949628729 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000460108:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000498104:exon_121526191_121526290:IQCB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 121712051 A/C 1 11 7 18 5.10919992157105 3.74869095900024 1.36050896257081 A:C A C 10 0.535527279857177 0.638900023085703 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 121712805 G/C 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 C:G G C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000383663:exon_121712627_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 85 72 157 39.48018121214 38.5579641497167 0.922217062423222 T:C T C 10 0.535527279857177 0.936272176984737 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 26 35 61 12.0762907237134 18.7434547950012 -6.6671640712878 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0955512560756936 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 122345870 C/T 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:C C T 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122345674_122345880:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122345674_122345880:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122345674_122345880:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000473627:exon_122345674_122345880:PARP15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 122354716 C/T 1 49 58 107 22.7591632869983 31.0605822317163 -8.30141894471793 T:C C T 10 0.535527279857177 0.120816069192511 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 122354792 G/A 1 62 47 109 28.797308648855 25.1697821532873 3.62752649556771 A:G G A 10 0.535527279857177 0.502920725513165 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 122864436 G/A 1 28 20 48 13.005236163999 10.7105455971435 2.29469056685551 A:G G A 10 0.535527279857177 0.564082535333613 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 123665902 T/G 1 7 10 17 3.25130904099976 5.35527279857177 -2.10396375757201 T:G T G 10 0.535527279857177 0.338715846297251 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000426152:exon_123665651_123665904:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000435910:exon_123665860_123666166:CCDC14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 124692689 C/T 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:C C T 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124692575_124692749:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000487661:exon_124692575_124692749:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000482699:exon_124692575_124692751:HEG1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 124826596 C/A 1 25 26 51 11.6118180035706 13.9237092762866 -2.31189127271603 A:C C A 10 0.535527279857177 0.575230501488791 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124826325_124826615:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124826321_124826970:SLC12A8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 126451937 G/T 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 T:C:G G T 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000514908:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126451921_126452065:CHCHD6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 127318358 T/G 1 84 68 152 39.0157084919971 36.415855030288 2.5998534617091 T:G T G 10 0.535527279857177 0.685189809010941 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127318161_127318390:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127318161_127318390:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000480910:exon_127318161_127318390:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000472731:exon_127317945_127318390:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127318322_127318390:MCM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 56 53 109 26.0104723279981 28.3829458324304 -2.37247350443229 T:C C T 10 0.535527279857177 0.701132902840874 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 127800071 A/G 1 63 77 140 29.2617813689979 41.2356005490026 -11.9738191800048 A:T:G A G 10 0.535527279857177 0.0509319096706274 ENSG00000175792:ENST00000322623:exon_127799803_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000417360:exon_127799807_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000478892:exon_127800025_127800252:RUVBL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 127872506 C/T 1 13 7 20 6.0381453618567 3.74869095900024 2.28945440285646 T:C C T 10 0.535527279857177 0.373042117571353 ENSG00000175792:ENST00000464873:exon_127872046_127872757:RUVBL1;ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_127872297_127872666:EEFSEC;ENSG00000132394:ENST00000483457:exon_127872344_127872666:EEFSEC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 127983495 T/C 1 11 16 27 5.10919992157105 8.56843647771483 -3.45923655614378 T:C T C 10 0.535527279857177 0.246559677217583 ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_127983460_127983624:EEFSEC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 166 175 341 77.1024715437086 93.717273975006 -16.6148024312973 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0732978539678468 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 128890350 G/A 1 265 211 476 123.085270837848 112.996256049864 10.0890147879838 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.358482313711192 ENSG00000169714:ENST00000502976:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000422453:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000451728:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000446936:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000307433:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000393290:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000500450:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000504813:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000441626:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000502372:exon_128889922_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000512338:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000507573:exon_128890095_128890614:CNBP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 128976396 T/C 1 49 42 91 22.7591632869983 22.4921457540014 0.267017532996899 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 129034758 A/G 1 49 37 86 22.7591632869983 19.8145093547155 2.94465393228278 A:G A G 10 0.535527279857177 0.589152174949275 ENSG00000184897:ENST00000333762:exon_129033615_129035117:H1FX HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 130449222 A/G 1 4 10 14 1.85789088057129 5.35527279857177 -3.49738191800048 A:G A G 10 0.535527279857177 0.104526436185540 ENSG00000196455:ENST00000356763:exon_130449152_130449286:PIK3R4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 132221139 C/T 1 2 7 9 0.928945440285646 3.74869095900024 -2.81974551871459 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0914963800425486 ENSG00000138246:ENST00000260818:exon_132221133_132221312:DNAJC13 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 133524717 G/C 1 18 15 33 8.36050896257082 8.03290919785765 0.327599764713161 C:G G C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000144867:ENST00000466490:exon_133524520_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000484684:exon_133524459_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000273406:exon_133524665_133524846:SRPRB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 134851605 C/T 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 T:C C T 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000154928:ENST00000398015:exon_134851556_134851891:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000482618:exon_134851556_134851608:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000360935:exon_134851556_134851891:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000425716:exon_134851556_134851891:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000488154:exon_134851556_134851657:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000493838:exon_134851556_134851891:EPHB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 138218994 T/C 1 3 12 15 1.39341816042847 6.42632735828612 -5.03290919785765 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0165864780945403 ENSG00000114107:ENST00000264982:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000489254:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000484888:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000474781:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000459695:exon_138218952_138219022:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000481834:exon_138218726_138219066:CEP70 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 138244400 C/T 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:C C T 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000114107:ENST00000264982:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000489254:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000484888:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000474781:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000481834:exon_138244332_138244406:CEP70 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 138289221 C/T 1 13 7 20 6.0381453618567 3.74869095900024 2.28945440285646 T:C C T 10 0.535527279857177 0.373042117571353 ENSG00000114107:ENST00000264982:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000484888:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000474781:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000481834:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000468900:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000462419:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000478673:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000464035:exon_138289160_138289340:CEP70 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 138347957 G/A 1 35 18 53 16.2565452049988 9.63949103742918 6.61705416756962 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0739990939132073 ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 138347988 T/C 1 34 23 57 15.792072484856 12.3171274367151 3.47494504814091 T:C T C 10 0.535527279857177 0.425901455789071 ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 141162128 C/G 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 C:G C G 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 141162185 T/G 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 T:G T G 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 141464146 G/A 1 125 90 215 58.0590900178529 48.1974551871459 9.86163483070695 A:G G A 10 0.535527279857177 0.193895240269908 ENSG00000114125:ENST00000273480:exon_141464001_141466402:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000480908:exon_141464001_141464542:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000393000:exon_141464001_141464544:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000477012:exon_141464001_141464511:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000477393:exon_141464001_141464359:RNF7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 146234909 G/A 1 68 55 123 31.584144969712 29.4540003921447 2.13014457756724 A:G G A 10 0.535527279857177 0.718538080150414 ENSG00000188313:ENST00000342435:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000493432:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000448205:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000463777:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000487389:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000468985:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000448787:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000488253:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000489775:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000483300:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000484560:exon_146234810_146235181:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000478267:exon_146234690_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000470496:exon_146234799_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000462666:exon_146234876_146234954:PLSCR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 148786108 C/T 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:C C T 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392913:exon_148786027_148786122:HLTF HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 148872987 G/A 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 A:G G A 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148872894_148873002:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148872894_148873002:HPS3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 149459413 C/T 1 40 21 61 18.5789088057129 11.2460728770007 7.33283592871221 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.0716961151756474 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149459362_149459505:COMMD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 21 25 46 9.75392712299928 13.3881819964294 -3.63425487343014 T:G T G 10 0.535527279857177 0.303211262724653 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 39 32 71 18.1144360855701 17.1368729554297 0.977563130140435 C:G C G 10 0.535527279857177 0.90541005643601 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 158362441 T/C 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:C T C 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158362067_158362504:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158362317_158362504:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158362317_158362504:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158362317_158362504:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158362317_158362504:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158362386_158362504:GFM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 158366900 G/A 1 15 12 27 6.96709080214235 6.42632735828612 0.540763443856222 A:G G A 10 0.535527279857177 0.850128429900867 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478251:exon_158366830_158368809:GFM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 158386891 G/A 1 16 11 27 7.43156352228517 5.89080007842895 1.54076344385622 A:G G A 10 0.535527279857177 0.570383110559636 ENSG00000079257:ENST00000482640:exon_158386785_158386921:LXN;ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158386785_158386921:LXN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 14 14 28 6.50261808199952 7.49738191800048 -0.994763836000955 T:C T C 10 0.535527279857177 0.709830757062613 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 18 16 34 8.36050896257082 8.56843647771483 -0.207927515144016 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 159997061 T/A 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 A:T T A 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000248710:ENST00000483754:exon_159996981_159997152:RP11-432B6.3;ENSG00000068885:ENST00000326448:exon_159996981_159997152:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000483465:exon_159996981_159997152:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000496589:exon_159996981_159997152:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000487943:exon_159996981_159997152:IFT80 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 160156318 A/G 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 A:G A G 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000248710:ENST00000483754:exon_160156020_160156974:RP11-432B6.3;ENSG00000213186:ENST00000309784:exon_160153291_160156974:TRIM59 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 170078232 C/T 1 11 1 12 5.10919992157105 0.535527279857177 4.57367264171388 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00784285311130818 ENSG00000136603:ENST00000476188:exon_170078109_170078488:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000259119:exon_170077487_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000426052:exon_170078156_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000413427:exon_170077411_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000458537:exon_170077411_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000431185:exon_170078120_170079217:SKIL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 178978103 A/G 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:G A G 10 0.535527279857177 1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 182681740 C/T 1 12 9 21 5.57367264171388 4.81974551871459 0.753927122999285 T:C C T 10 0.535527279857177 0.828752253980847 ENSG00000043093:ENST00000292782:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000469954:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000492563:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000497606:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000460412:exon_182681719_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000487822:exon_182681736_182681837:DCUN1D1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 182755209 T/G 1 46 39 85 21.3657451265699 20.8855639144299 0.480181212139957 T:G T G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182755202_182755222:MCCC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 28 16 44 13.005236163999 8.56843647771483 4.43679968628421 T:C T C 10 0.535527279857177 0.226358448788067 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 75 41 116 34.8354540107117 21.9566184741443 12.8788355365675 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0195806761450996 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 183476685 G/A 1 1 7 8 0.464472720142823 3.74869095900024 -3.28421823885742 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0289107709309061 ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183476650_183476753:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183476650_183476753:YEATS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 101 72 173 46.9117447344251 38.5579641497167 8.35378058470839 C:G C G 10 0.535527279857177 0.222671440997211 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 183560195 A/G 1 34 23 57 15.792072484856 12.3171274367151 3.47494504814091 A:G A G 10 0.535527279857177 0.425901455789071 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 184020542 G/T 1 17 26 43 7.89603624242799 13.9237092762866 -6.02767303385861 T:G G T 10 0.535527279857177 0.068209210597755 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000445558:exon_184020467_184020563:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000485937:exon_184020467_184020560:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000491149:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000460628:exon_184020528_184020611:PSMD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 184039666 A/G 1 111 98 209 51.5564719358534 52.4816734260033 -0.925201490149981 A:G A G 10 0.535527279857177 0.944736054870868 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000457456:exon_184039070_184039815:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 184046470 C/T 1 84 71 155 39.0157084919971 38.0224368698596 0.993271622137577 T:C C T 10 0.535527279857177 0.935854651658635 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382362:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000422614:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000460829:exon_184045905_184046923:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000475721:exon_184046404_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000464548:exon_184046457_184046544:EIF4G1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 0 2335 18 2353 1084.54380153349 9.63949103742918 1074.90431049606 T:C:G G T 10 0.535527279857177 0 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 185331165 C/A 1 6 15 21 2.78683632085694 8.03290919785765 -5.24607287700072 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0273786700201172 ENSG00000163904:ENST00000296257:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000427465:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000437107:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000413407:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000473760:exon_185331133_185331299:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000478001:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000476011:exon_185331133_185331432:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000444509:exon_185331143_185331196:SENP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 186507757 G/A 1 210 185 395 97.5392712299928 99.0725467735777 -1.53327554358491 A:G G A 10 0.535527279857177 0.879853283414941 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186507669_186507853:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186507681_186508195:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186507684_186507853:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186507689_186507853:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186507692_186507849:RFC4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 187088812 C/T 1 34 30 64 15.792072484856 16.0658183957153 -0.273745910859324 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 187088903 C/A 1 54 35 89 25.0815268877124 18.7434547950012 6.33807209271125 A:C C A 10 0.535527279857177 0.202284753685787 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 187089031 C/A 1 33 24 57 15.3275997647132 12.8526547165722 2.47494504814091 A:C C A 10 0.535527279857177 0.59574253745059 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 187 103 290 86.8563986667079 55.1593098252892 31.6970888414187 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.000197671773546235 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 191093080 A/G 1 13 12 25 6.0381453618567 6.42632735828612 -0.388181996429424 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 193334991 G/A 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000419435:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392436:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000487986:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000434811:exon_193334967_193335074:OPA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 26 26 52 12.0762907237134 13.9237092762866 -1.8474185525732 T:C T C 10 0.535527279857177 0.677191733564713 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 194325058 G/A 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000145014:ENST00000392432:exon_194325016_194325174:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000273580:exon_194325016_194325174:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000432352:exon_194325016_194325174:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000347147:exon_194325016_194325174:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000477651:exon_194325016_194325174:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000381975:exon_194325016_194325170:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000392431:exon_194325016_194325174:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000473092:exon_194325016_194325174:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000452358:exon_194325016_194325174:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000429560:exon_194325043_194325170:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000419280:exon_194325016_194325174:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000467284:exon_194325016_194325174:TMEM44 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 194790434 C/G 1 7 1 8 3.25130904099976 0.535527279857177 2.71578176114258 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0758484261005442 ENSG00000173950:ENST00000310380:exon_194789008_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000437101:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000355729:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000458652:exon_194790020_194790677:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000460582:exon_194790322_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000473200:exon_194790360_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000429994:exon_194790406_194790840:C3orf21 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 195027339 G/A 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000114331:ENST00000326793:exon_195027240_195027345:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000484296:exon_195027240_195027594:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000439758:exon_195027240_195027345:ACAP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 195594985 C/T 1 31 35 66 14.3986543244275 18.7434547950012 -4.34480047057368 T:C C T 10 0.535527279857177 0.323796127428130 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000495247:exon_195594955_195595168:TNK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 196199204 G/T 1 32 24 56 14.8631270445703 12.8526547165722 2.01047232799809 T:G G T 10 0.535527279857177 0.688129180246803 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 196199582 G/A 1 13 13 26 6.0381453618567 6.9618546381433 -0.923709276286601 A:G G A 10 0.535527279857177 0.844640207112493 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 27 27 54 12.5407634438562 14.4592365561438 -1.91847311228756 A:T:C T C 10 0.535527279857177 0.682745837825282 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 196388099 G/C 1 76 71 147 35.2999267308546 38.0224368698596 -2.72251013900501 T:C:G G C 10 0.535527279857177 0.679671253248687 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 196742290 T/C 1 11 5 16 5.10919992157105 2.67763639928588 2.43156352228517 T:C T C 10 0.535527279857177 0.316751505566711 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196742236_196742387:MFI2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 196743130 T/C 1 9 8 17 4.18025448128541 4.28421823885742 -0.103963757572008 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196743060_196743240:MFI2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 196746629 T/C 1 14 3 17 6.50261808199952 1.60658183957153 4.89603624242799 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0256420277318128 ENSG00000163975:ENST00000296351:exon_196745824_196746672:MFI2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 3 197579466 C/T 1 11 10 21 5.10919992157105 5.35527279857177 -0.246072877000716 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000481048:exon_197579199_197579491:LRCH3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 A:G A G 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 844781 G/A 1 67 70 137 31.1196722495691 37.4869095900024 -6.36723734043325 A:G G A 10 0.535527279857177 0.304095369667109 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_844724_844805:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_844724_845762:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_844724_847616:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_844724_844872:GAK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 870941 T/C 1 38 31 69 17.6499633654273 16.6013456755725 1.04861768985479 T:C T C 10 0.535527279857177 0.810743906658869 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_870878_870995:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_870878_870995:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_870878_870995:GAK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 944210 A/C 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 A:C A C 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513682:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504505:exon_944209_944279:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514546:exon_944209_944306:TMEM175 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 1244879 A/G 1 10 12 22 4.64472720142823 6.42632735828612 -1.78160015685789 A:G A G 10 0.535527279857177 0.523672568666477 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 1305802 C/T 1 37 50 87 17.1854906452845 26.7763639928588 -9.59087334757439 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0413511490572652 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000513301:exon_1305767_1306026:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512308:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509254:exon_1305767_1306026:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000502558:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000508634:exon_1305767_1306374:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503693:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512842:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1305767_1305949:MAEA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 1330759 T/C 1 32 34 66 14.8631270445703 18.207927515144 -3.34480047057368 T:C T C 10 0.535527279857177 0.459516165662625 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1330649_1330778:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512289:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000506530:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503162:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 1332175 A/G 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 A:G A G 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 2743999 A/G 1 132 96 228 61.3103990588526 51.410618866289 9.89978019256365 A:G A G 10 0.535527279857177 0.207083884308894 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 2822467 G/T 1 9 13 22 4.18025448128541 6.9618546381433 -2.78160015685789 T:G G T 10 0.535527279857177 0.286672118812446 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 2826400 T/C 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2826340_2826644:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2826340_2826641:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2826340_2826429:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2826340_2826828:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826392_2826486:SH3BP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 23 12 35 10.6828725632849 6.42632735828612 4.25654520499881 T:G T G 10 0.535527279857177 0.175991512534223 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 2933271 G/A 1 10 8 18 4.64472720142823 4.28421823885742 0.360508962570814 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000109736:ENST00000508276:exon_2933102_2933663:MFSD10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 65 50 115 30.1907268092835 26.7763639928588 3.41436281642465 T:C T C 10 0.535527279857177 0.575131256775382 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 78 67 145 36.2288721711402 35.8803277504309 0.348544420709338 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 3516560 G/A 1 51 55 106 23.688108727284 29.4540003921447 -5.76589166486076 A:G G A 10 0.535527279857177 0.284463864866388 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3516479_3516655:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3516479_3516655:LRPAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 6602378 G/A 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6602350_6602483:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6602350_6602483:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6602350_6602483:MAN2B2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 6606864 A/G 1 7 12 19 3.25130904099976 6.42632735828612 -3.17501831728636 A:G A G 10 0.535527279857177 0.170306763434808 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6606782_6607056:MAN2B2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 6612964 C/T 1 14 7 21 6.50261808199952 3.74869095900024 2.75392712299928 T:C C T 10 0.535527279857177 0.277002137235975 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6612813_6613005:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6612813_6613005:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6612813_6613005:MAN2B2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 9 9 18 4.18025448128541 4.81974551871459 -0.639491037429185 A:G A G 10 0.535527279857177 0.816111256590493 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 18 12 30 8.36050896257082 6.42632735828612 1.93418160428469 T:C T C 10 0.535527279857177 0.583930457533564 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 10669522 A/C 1 7 24 31 3.25130904099976 12.8526547165722 -9.60134567557249 A:C A C 10 0.535527279857177 0.000847654124253829 ENSG00000109684:ENST00000226951:exon_10669483_10669535:CLNK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 15835844 A/C 1 52 36 88 24.1525814474268 19.2789820748584 4.87359937256843 A:C A C 10 0.535527279857177 0.336415219167626 ENSG00000004468:ENST00000502843:exon_15835840_15835925:CD38;ENSG00000004468:ENST00000226279:exon_15835840_15835925:CD38;ENSG00000004468:ENST00000510674:exon_15835840_15835925:CD38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 17503382 C/T 1 10 12 22 4.64472720142823 6.42632735828612 -1.78160015685789 T:C C T 10 0.535527279857177 0.523672568666477 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 17818885 T/C 1 15 13 28 6.96709080214235 6.9618546381433 0.00523616399904459 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000509719:exon_17818855_17819076:NCAPG HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 26407878 T/C 1 4 13 17 1.85789088057129 6.9618546381433 -5.10396375757201 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0147694647888842 ENSG00000168214:ENST00000512351:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000510778:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000506956:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000512671:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000345843:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000342295:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000361572:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000514380:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000514807:exon_26407797_26407885:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000348160:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000521677:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000532341:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000509158:exon_26407797_26407887:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000355476:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000513182:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000511401:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000509991:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000515023:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000507561:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000514730:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000507574:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000514675:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000515573:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000511546:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000504907:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000342320:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000511451:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000504938:exon_26407797_26407892:RBPJ HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 38016395 T/G 1 5 17 22 2.32236360071412 9.10396375757201 -6.78160015685789 T:G T G 10 0.535527279857177 0.00455755566383679 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 38829163 A/C 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 A:C A C 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 14 9 23 6.50261808199952 4.81974551871459 1.68287256328493 T:C T C 10 0.535527279857177 0.535797684122808 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 39122697 C/T 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 T:C C T 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39122630_39123829:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39122630_39123828:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39122630_39122825:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39122630_39123826:KLHL5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 9 2 11 4.18025448128541 1.07105455971435 3.10919992157105 A:G A G 10 0.535527279857177 0.072775715286889 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 39463903 C/A 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:C C A 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000121897:ENST00000340169:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000261434:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000424936:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000381846:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000515061:exon_39463816_39463909:LIAS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 16 26 42 7.43156352228517 13.9237092762866 -6.49214575400143 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0620928743524166 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 44682465 T/C 1 12 11 23 5.57367264171388 5.89080007842895 -0.31712743671507 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000151806:ENST00000281543:exon_44682458_44682569:GUF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 47560015 A/G 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 A:G A G 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47559681_47560290:ATP10D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 47560163 C/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47559681_47560290:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47560098_47560290:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47560105_47560290:ATP10D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 47578971 G/A 1 8 3 11 3.71578176114258 1.60658183957153 2.10919992157105 A:G G A 10 0.535527279857177 0.23951309450586 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47578790_47578990:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47578790_47578990:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47578790_47578990:ATP10D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 47593283 G/C 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 C:G G C 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47593059_47595503:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47593059_47595503:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47593059_47594892:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000505277:exon_47593059_47593312:ATP10D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 48147309 T/C 1 20 15 35 9.28945440285646 8.03290919785765 1.25654520499881 T:C T C 10 0.535527279857177 0.736332608702484 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000511471:exon_48147095_48147312:TEC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 48172266 G/A 1 9 12 21 4.18025448128541 6.42632735828612 -2.24607287700072 A:G G A 10 0.535527279857177 0.384351839373372 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48172265_48172393:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48172262_48172395:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48172265_48172393:TEC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 54011526 A/G 1 25 25 50 11.6118180035706 13.3881819964294 -1.77636399285885 A:G A G 10 0.535527279857177 0.671460015084407 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 56291528 T/C 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:C T C 10 0.535527279857177 0.732042892054444 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 8 10 18 3.71578176114258 5.35527279857177 -1.63949103742919 T:C T C 10 0.535527279857177 0.484703765251006 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 57204777 A/C 1 24 10 34 11.1473452834278 5.35527279857177 5.79207248485598 A:C A C 10 0.535527279857177 0.057563830686649 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57204771_57204957:AASDH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 57211352 T/C 1 8 5 13 3.71578176114258 2.67763639928588 1.0381453618567 T:C T C 10 0.535527279857177 0.593586480755975 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57211293_57211456:AASDH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 57333822 G/T 1 21 13 34 9.75392712299928 6.9618546381433 2.79207248485598 T:G G T 10 0.535527279857177 0.391835287567263 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57333081_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57333783_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000504757:exon_57333784_57333910:SRP72 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 134 78 212 62.2393444991383 41.7711278288598 20.4682166702785 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00472995577682946 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 68380070 C/T 1 9 8 17 4.18025448128541 4.28421823885742 -0.103963757572008 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68379792_68380405:CENPC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 68442968 A/G 1 90 90 180 41.8025448128541 48.1974551871459 -6.39491037429185 A:G A G 10 0.535527279857177 0.369955695036005 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68442921_68442977:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68442921_68442977:STAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 68447040 C/T 1 98 98 196 45.5183265739967 52.4816734260033 -6.96334685200668 T:C C T 10 0.535527279857177 0.351917269376378 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68447023_68447189:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68447023_68447189:STAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 73930552 G/A 1 9 5 14 4.18025448128541 2.67763639928588 1.50261808199952 A:G G A 10 0.535527279857177 0.593847726273405 ENSG00000163626:ENST00000295890:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000449739:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000520291:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000533586:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000507544:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000510031:exon_73930495_73930616:COX18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 73942678 C/T 1 66 60 126 30.6551995294263 32.1316367914306 -1.4764372620043 T:C C T 10 0.535527279857177 0.789652340420177 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 73956736 G/A 1 43 36 79 19.9723269661414 19.2789820748584 0.693344891283022 A:G G A 10 0.535527279857177 0.91055055967904 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 74451073 A/G 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000169435:ENST00000307439:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000342081:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000395777:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000335049:exon_74450897_74451081:RASSF6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 75937971 C/T 1 27 18 45 12.5407634438562 9.63949103742918 2.90127240642704 T:C C T 10 0.535527279857177 0.455621122773107 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 75938179 G/A 1 22 29 51 10.2183998431421 15.5302911158581 -5.31189127271603 A:G G A 10 0.535527279857177 0.160205987359261 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 75938236 A/G 1 19 22 41 8.82498168271364 11.7816001568579 -2.95661847414426 A:G A G 10 0.535527279857177 0.434095258451122 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 76836137 A/G 1 13 5 18 6.0381453618567 2.67763639928588 3.36050896257081 A:G A G 10 0.535527279857177 0.155412508782781 ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76836021_76836138:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000513045:exon_76836021_76836138:NAAA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 76878716 G/C 1 59 59 118 27.4038904884266 31.5961095115734 -4.19221902314688 C:G G C 10 0.535527279857177 0.461047807792899 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 76881233 G/T 1 43 50 93 19.9723269661414 26.7763639928588 -6.80403702671746 T:G G T 10 0.535527279857177 0.176532400552840 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76881219_76881345:SDAD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 77926832 A/G 1 24 19 43 11.1473452834278 10.1750183172864 0.972326966141392 A:G A G 10 0.535527279857177 0.878742494186702 ENSG00000138758:ENST00000264893:exon_77926754_77926949:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000502584:exon_77926754_77926949:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000510641:exon_77926754_77926949:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000505788:exon_77926754_77926949:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000510515:exon_77926754_77926949:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000504637:exon_77926754_77926949:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000512778:exon_77926754_77926949:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000512333:exon_77926754_77926949:SEPT11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 77977235 T/C 1 152 144 296 70.5998534617091 77.1159282994335 -6.51607483772437 T:C T C 10 0.535527279857177 0.449424960575848 ENSG00000118816:ENST00000237654:exon_77977115_77977255:CCNI;ENSG00000118816:ENST00000506614:exon_77977115_77977255:CCNI;ENSG00000118816:ENST00000511943:exon_77977115_77977253:CCNI;ENSG00000118816:ENST00000505609:exon_77977197_77977255:CCNI;ENSG00000118816:ENST00000504697:exon_77977218_77977255:CCNI HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 80828555 G/A 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 A:G G A 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000163297:ENST00000403729:exon_80822303_80828621:ANTXR2;ENSG00000163297:ENST00000482406:exon_80827916_80828621:ANTXR2;ENSG00000163297:ENST00000491345:exon_80828324_80828621:ANTXR2;ENSG00000163297:ENST00000404191:exon_80828507_80828621:ANTXR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 83347266 A/G 1 257 282 539 119.369489076706 151.018692919724 -31.6492038430184 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0064977282706361 ENSG00000152795:ENST00000295470:exon_83347190_83347282:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000502762:exon_83347190_83347282:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000349655:exon_83347190_83347282:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000507721:exon_83345784_83347282:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000514511:exon_83346736_83347282:HNRPDL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 83348652 T/C 1 319 259 578 148.166797725561 138.701565483009 9.46523224255171 T:C T C 10 0.535527279857177 0.452927857712271 ENSG00000152795:ENST00000295470:exon_83348586_83348717:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000502762:exon_83348586_83348717:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000349655:exon_83348586_83348717:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000514511:exon_83348586_83348717:HNRPDL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 83795806 T/C 1 9 7 16 4.18025448128541 3.74869095900024 0.431563522285169 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000436790:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503058:exon_83795764_83795904:SEC31A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 84191031 A/G 1 12 12 24 5.57367264171388 6.42632735828612 -0.852654716572246 A:G A G 10 0.535527279857177 0.838566839920317 ENSG00000173085:ENST00000311469:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000503915:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000439031:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000311461:exon_84191013_84191146:COQ2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 13 15 28 6.0381453618567 8.03290919785765 -1.99476383600095 T:C C T 10 0.535527279857177 0.456381948739043 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 89319296 T/C 1 8 8 16 3.71578176114258 4.28421823885742 -0.568436477714831 T:C T C 10 0.535527279857177 0.806722234902998 ENSG00000138642:ENST00000511939:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000380265:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000438983:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000264346:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000506714:exon_89319260_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000515365:exon_89319294_89319361:HERC6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 89352413 T/C 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 T:C T C 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000138642:ENST00000511939:exon_89352314_89352457:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000380265:exon_89352314_89352457:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000438983:exon_89352314_89352457:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000264346:exon_89352314_89352457:HERC6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 95197520 C/T 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 T:C C T 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95197490_95197625:SMARCAD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 95561459 A/G 1 4 11 15 1.85789088057129 5.89080007842895 -4.03290919785765 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0409545616380073 ENSG00000163110:ENST00000437932:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000503974:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000514743:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000380176:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000506632:exon_95561427_95561601:PDLIM5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 99997615 C/T 1 103 122 225 47.8406901747108 65.3343281425756 -17.4936379678648 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0228488729290729 ENSG00000197894:ENST00000296412:exon_99997443_99997703:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000512621:exon_99997443_99997703:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000512659:exon_99997443_99997703:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000508511:exon_99996376_99997703:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000503130:exon_99997443_99997703:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000502590:exon_99997543_99997703:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000512991:exon_99997586_99997703:ADH5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 103505961 C/T 1 38 43 81 17.6499633654273 23.0276730338586 -5.37770966843133 T:C C T 10 0.535527279857177 0.265308584346429 ENSG00000109320:ENST00000226574:exon_103505839_103505977:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000394820:exon_103505839_103505977:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000505458:exon_103505839_103505977:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000508584:exon_103505839_103505977:NFKB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 103789810 C/A 1 7 1 8 3.25130904099976 0.535527279857177 2.71578176114258 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0758484261005442 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 104055000 A/G 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 A:G A G 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104054852_104055049:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104054852_104055049:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104054852_104055049:CENPE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 104061993 C/G 1 45 34 79 20.901272406427 18.207927515144 2.69334489128302 C:G C G 10 0.535527279857177 0.574160954822468 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 104062223 C/T 1 23 32 55 10.6828725632849 17.1368729554297 -6.45400039214473 T:C C T 10 0.535527279857177 0.103911372260179 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 104082349 C/T 1 15 8 23 6.96709080214235 4.28421823885742 2.68287256328493 T:C C T 10 0.535527279857177 0.300673562790689 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 110384790 A/G 1 11 14 25 5.10919992157105 7.49738191800048 -2.38818199642942 A:G A G 10 0.535527279857177 0.423396273780819 ENSG00000138802:ENST00000504968:exon_110384057_110384800:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000399100:exon_110384057_110384800:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000265175:exon_110384057_110384800:SEC24B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 110638810 C/T 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 T:C C T 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000123739:ENST00000243501:exon_110638704_110638869:PLA2G12A;ENSG00000123739:ENST00000502283:exon_110638704_110638869:PLA2G12A;ENSG00000123739:ENST00000507961:exon_110638704_110638869:PLA2G12A;ENSG00000123739:ENST00000502772:exon_110638704_110638869:PLA2G12A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 113353052 C/T 1 14 14 28 6.50261808199952 7.49738191800048 -0.994763836000955 T:C C T 10 0.535527279857177 0.709830757062613 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 113362316 A/G 1 11 18 29 5.10919992157105 9.63949103742918 -4.53029111585813 A:G A G 10 0.535527279857177 0.097130117980667 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 113436044 T/G 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 T:G T G 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000178403:ENST00000313341:exon_113434672_113436632:NEUROG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 113482146 G/A 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:G G A 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000138658:ENST00000505019:exon_113481889_113482151:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000445413:exon_113481889_113482151:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000313239:exon_113481889_113482151:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000506675:exon_113481889_113482694:C4orf21 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 119610606 A/G 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000145388:ENST00000388822:exon_119610525_119610612:METTL14;ENSG00000145388:ENST00000506780:exon_119610525_119610623:METTL14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 119652606 G/T 1 48 39 87 22.2946905668555 20.8855639144299 1.40912665242561 T:G G T 10 0.535527279857177 0.830007522056322 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119652471_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119652471_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119652471_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000505134:exon_119652471_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000511481:exon_119652471_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000511715:exon_119650277_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119652435_119652662:SEC24D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 119659518 G/A 1 39 27 66 18.1144360855701 14.4592365561438 3.65519952942632 A:G G A 10 0.535527279857177 0.389822036450335 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119659416_119659534:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119659416_119659534:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119659416_119659534:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000505134:exon_119659416_119659534:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000511481:exon_119659416_119659534:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119659416_119659534:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119659416_119659534:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000502526:exon_119659259_119659534:SEC24D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 119736701 G/A 1 14 17 31 6.50261808199952 9.10396375757201 -2.60134567557249 A:G G A 10 0.535527279857177 0.372478400047806 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 123268859 A/G 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 A:G A G 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000438707:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000306802:exon_123268677_123268934:KIAA1109 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 123276961 G/A 1 16 6 22 7.43156352228517 3.21316367914306 4.21839984314211 A:G G A 10 0.535527279857177 0.08728031897682 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123276951_123277145:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123276951_123277145:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123276951_123277145:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000438707:exon_123276951_123277145:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000306802:exon_123276951_123277145:KIAA1109 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 129867228 C/T 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 T:C C T 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129867162_129867307:SCLT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 139966253 C/A 1 36 35 71 16.7210179251416 18.7434547950012 -2.02243686985956 A:C C A 10 0.535527279857177 0.63631790073287 ENSG00000151014:ENST00000280614:exon_139965793_139966906:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000515616:exon_139965793_139966259:CCRN4L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 140036029 G/A 1 772 6 778 358.572939950259 3.21316367914306 355.359776271116 A:G G A 10 0.535527279857177 1.60514297654837e-197 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 140213698 A/G 1 104 101 205 48.3051628948536 54.0882552655749 -5.78309237072128 A:G A G 10 0.535527279857177 0.441400523739098 ENSG00000109390:ENST00000503997:exon_140213684_140213763:NDUFC1;ENSG00000109390:ENST00000394228:exon_140213684_140213763:NDUFC1;ENSG00000109390:ENST00000505036:exon_140213684_140213763:NDUFC1;ENSG00000109390:ENST00000265500:exon_140213684_140213763:NDUFC1;ENSG00000109390:ENST00000394225:exon_140213684_140213763:NDUFC1;ENSG00000109390:ENST00000503453:exon_140213684_140213763:NDUFC1;ENSG00000109390:ENST00000394223:exon_140213684_140213763:NDUFC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 15 10 25 6.96709080214235 5.35527279857177 1.61181800357058 A:G G A 10 0.535527279857177 0.55392591166511 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 10 21 31 4.64472720142823 11.2460728770007 -6.60134567557249 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0192056645122655 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 11 19 30 5.10919992157105 10.1750183172864 -5.06581839571531 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0689406884761131 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 148944533 C/T 1 22 20 42 10.2183998431421 10.7105455971435 -0.492145754001433 T:C C T 10 0.535527279857177 0.878574483565324 ENSG00000071205:ENST00000336498:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000414545:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506054:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000507661:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506020:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000513548:exon_148944205_148944564:ARHGAP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 151207127 C/T 1 14 17 31 6.50261808199952 9.10396375757201 -2.60134567557249 T:C C T 10 0.535527279857177 0.372478400047806 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000508606:exon_151207085_151207186:LRBA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 154513627 A/G 1 21 17 38 9.75392712299928 9.10396375757201 0.649963365427276 A:G A G 10 0.535527279857177 0.87207052479811 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 154513722 C/T 1 16 7 23 7.43156352228517 3.74869095900024 3.68287256328493 T:C C T 10 0.535527279857177 0.145529269824070 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 154514965 T/C 1 16 8 24 7.43156352228517 4.28421823885742 3.14734528342775 T:C T C 10 0.535527279857177 0.224038257851187 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154514951_154515023:KIAA0922 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 159631991 G/T 1 49 52 101 22.7591632869983 27.8474185525732 -5.08825526557487 T:G G T 10 0.535527279857177 0.319935597784898 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159631914_159632000:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159631914_159632000:PPID HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 58 78 136 26.9394177682837 41.7711278288598 -14.8317100605761 A:C:G A C 10 0.535527279857177 0.0124340541199972 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 53 68 121 24.6170541675696 36.415855030288 -11.7988008627184 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0357694722721461 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 169299528 T/C 1 3 8 11 1.39341816042847 4.28421823885742 -2.89080007842895 T:C T C 10 0.535527279857177 0.127667889620419 ENSG00000181381:ENST00000510590:exon_169299505_169299626:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000511577:exon_169299505_169299626:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000260184:exon_169299505_169299626:DDX60L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 170017669 C/T 1 11 5 16 5.10919992157105 2.67763639928588 2.43156352228517 T:C C T 10 0.535527279857177 0.316751505566711 ENSG00000154447:ENST00000284637:exon_170015407_170017838:SH3RF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 170634390 C/T 1 11 5 16 5.10919992157105 2.67763639928588 2.43156352228517 T:C C T 10 0.535527279857177 0.316751505566711 ENSG00000109572:ENST00000504131:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000513761:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000347613:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000360642:exon_170634230_170634446:CLCN3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 170663235 C/T 1 52 31 83 24.1525814474268 16.6013456755725 7.55123577185431 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0998971911370054 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170663108_170663258:C4orf27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 170678993 T/C 1 70 41 111 32.5130904099976 21.9566184741443 10.5564719358534 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0459265887815557 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170678981_170679104:C4orf27;ENSG00000056050:ENST00000506125:exon_170678981_170679055:C4orf27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 184600601 A/G 1 9 3 12 4.18025448128541 1.60658183957153 2.57367264171388 A:G A G 10 0.535527279857177 0.158167791151507 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184600506_184600639:C4orf41 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 118 99 217 54.8077809768531 53.0172007058605 1.7905802709926 T:C C T 10 0.535527279857177 0.838367124256225 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 185701549 G/T 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:G G T 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504900:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000509038:exon_185701486_185701587:ACSL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 186084055 G/A 1 8 18 26 3.71578176114258 9.63949103742918 -5.9237092762866 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0286443565268179 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186080819_186084079:KIAA1430 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 186097045 C/T 1 11 12 23 5.10919992157105 6.42632735828612 -1.31712743671507 T:C C T 10 0.535527279857177 0.677416798105031 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 33 20 53 15.3275997647132 10.7105455971435 4.61705416756962 T:C T C 10 0.535527279857177 0.217607458899813 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 186112208 G/T 1 12 5 17 5.57367264171388 2.67763639928588 2.89603624242799 T:G G T 10 0.535527279857177 0.223914163527513 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 186299260 A/G 1 8 29 37 3.71578176114258 15.5302911158581 -11.8145093547155 A:G A G 10 0.535527279857177 9.74345128659066e-05 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 190862155 T/G 1 117 88 205 54.3433082567103 47.1264006274316 7.21690762927872 T:G T G 10 0.535527279857177 0.327399720605219 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 4 190862182 C/T 1 109 75 184 50.6275264955677 40.1645459892883 10.4629805062794 T:C C T 10 0.535527279857177 0.139158652178889 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000514482:exon_190862179_190862226:FRG1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 870619 A/G 1 32 21 53 14.8631270445703 11.2460728770007 3.61705416756962 A:G A G 10 0.535527279857177 0.338152086100235 ENSG00000028310:ENST00000483234:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495794:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000490814:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495265:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000388890:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323510:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323547:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000489816:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000433367:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000415990:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000435709:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483173:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000467963:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000519112:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000518250:exon_870588_870668:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000523139:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000518251:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000475706:exon_870403_870690:BRD9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 1344498 C/G 1 29 35 64 13.4697088841419 18.7434547950012 -5.27374591085933 C:G C G 10 0.535527279857177 0.210425617936772 ENSG00000049656:ENST00000320895:exon_1344466_1344566:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000320927:exon_1344466_1344566:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000513491:exon_1344466_1344527:CLPTM1L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 35 37 72 16.2565452049988 19.8145093547155 -3.55796414971674 A:G G A 10 0.535527279857177 0.410611587655774 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 31 20 51 14.3986543244275 10.7105455971435 3.68810872728397 T:C C T 10 0.535527279857177 0.327941203021676 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 5464237 A/C 1 10 15 25 4.64472720142823 8.03290919785765 -3.38818199642942 A:C A C 10 0.535527279857177 0.228613574956332 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 6600061 G/A 1 157 175 332 72.9222170624232 93.717273975006 -20.7950569125828 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0239773539526185 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 6600064 G/T 1 178 168 346 82.6761441854225 89.9685830160057 -7.29243883058322 T:G G T 10 0.535527279857177 0.450646862088636 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 7878192 T/C 1 7 13 20 3.25130904099976 6.9618546381433 -3.71054559714354 T:C T C 10 0.535527279857177 0.117313042346182 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7878057_7878262:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514220:exon_7878057_7878348:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 7885959 A/G 1 6 12 18 2.78683632085694 6.42632735828612 -3.63949103742918 A:G A G 10 0.535527279857177 0.100224935165788 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7885898_7885967:MTRR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 7897191 C/T 1 11 25 36 5.10919992157105 13.3881819964294 -8.27898207485837 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00688197734903385 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508354:exon_7897178_7897213:MTRR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 7897283 G/A 1 16 27 43 7.43156352228517 14.4592365561438 -7.02767303385861 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0330712554626782 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 10239278 C/T 1 12 3 15 5.57367264171388 1.60658183957153 3.96709080214235 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0663216847685012 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 10250430 G/A 1 12 13 25 5.57367264171388 6.9618546381433 -1.38818199642942 A:G G A 10 0.535527279857177 0.689410637065013 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 10250443 T/C 1 18 23 41 8.36050896257082 12.3171274367151 -3.95661847414426 T:C T C 10 0.535527279857177 0.272904314717144 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000423695:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000510326:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000512975:exon_10250431_10250557:CCT5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 10254817 A/G 1 131 146 277 60.8459263387098 78.1869828591478 -17.341056520438 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0404045607527506 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10254786_10254835:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10254786_10255142:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10254786_10254950:CCT5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 10256161 T/C 1 110 141 251 51.0919992157105 75.5093464598619 -24.4173472441514 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00232481210208423 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503454:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000506600:exon_10256067_10256265:CCT5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 14681593 G/T 1 12 4 16 5.57367264171388 2.14210911942871 3.43156352228517 T:G G T 10 0.535527279857177 0.130378196506160 ENSG00000154124:ENST00000503023:exon_14681573_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000284274:exon_14681573_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000514913:exon_14681573_14681733:FAM105B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 41862819 G/A 1 23 13 36 10.6828725632849 6.9618546381433 3.72101792514163 A:G G A 10 0.535527279857177 0.244104528667508 ENSG00000083720:ENST00000196371:exon_41862744_41862852:OXCT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 41929895 G/A 1 10 10 20 4.64472720142823 5.35527279857177 -0.71054559714354 A:G G A 10 0.535527279857177 0.824432001736655 ENSG00000151876:ENST00000281623:exon_41929799_41930019:FBXO4;ENSG00000151876:ENST00000296812:exon_41929799_41930019:FBXO4;ENSG00000151876:ENST00000513496:exon_41929799_41930019:FBXO4;ENSG00000151876:ENST00000504463:exon_41929799_41930019:FBXO4;ENSG00000151876:ENST00000509134:exon_41929799_41930019:FBXO4;ENSG00000151876:ENST00000506496:exon_41929799_41930257:FBXO4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 43039793 T/C 1 17 15 32 7.89603624242799 8.03290919785765 -0.136872955429662 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 43294192 C/T 1 61 51 112 28.3328359287122 27.311891272716 1.02094465599618 T:C C T 10 0.535527279857177 0.924584200700192 ENSG00000112972:ENST00000325110:exon_43294158_43294264:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000433297:exon_43294158_43294264:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000508319:exon_43293836_43294264:HMGCS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 43609272 T/C 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C T C 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000112992:ENST00000505678:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512422:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43609245_43609448:NNT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 14 7 21 6.50261808199952 3.74869095900024 2.75392712299928 C:G G C 10 0.535527279857177 0.277002137235975 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 56526783 G/A 1 78 65 143 36.2288721711402 34.8092731907165 1.41959898042369 A:G G A 10 0.535527279857177 0.866939803567786 ENSG00000062194:ENST00000424459:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000454432:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000514387:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000506184:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000511209:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000264779:exon_56526673_56526796:GPBP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 60241142 G/A 1 84 59 143 39.0157084919971 31.5961095115734 7.4195989804237 A:G G A 10 0.535527279857177 0.240470576735775 ENSG00000164182:ENST00000296597:exon_60240956_60241209:NDUFAF2;ENSG00000164182:ENST00000511107:exon_60241034_60241255:NDUFAF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 14 14 28 6.50261808199952 7.49738191800048 -0.994763836000955 A:G G A 10 0.535527279857177 0.709830757062613 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 56 35 91 26.0104723279981 18.7434547950012 7.2670175329969 A:G G A 10 0.535527279857177 0.141293164481083 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 65084101 A/G 1 9 17 26 4.18025448128541 9.10396375757201 -4.9237092762866 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0748738537647927 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506539:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65083945_65084311:NLN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 65108215 A/G 1 9 29 38 4.18025448128541 15.5302911158581 -11.3500366345727 A:G A G 10 0.535527279857177 0.000245335058503158 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000509935:exon_65108082_65108218:NLN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 65118738 C/T 1 35 17 52 16.2565452049988 9.10396375757201 7.1525814474268 T:C C T 10 0.535527279857177 0.051586850164876 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65118609_65119153:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65118609_65119156:NLN;ENSG00000123213:ENST00000515595:exon_65118609_65119065:NLN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 65344532 T/C 1 8 26 34 3.71578176114258 13.9237092762866 -10.207927515144 T:C T C 10 0.535527279857177 0.000457042422673575 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65344495_65344609:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65344495_65344609:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65344495_65344609:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65344495_65344609:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65344495_65344609:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65344495_65344609:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65344495_65344609:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65344495_65344609:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65344495_65344609:ERBB2IP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 68417643 C/T 1 11 12 23 5.10919992157105 6.42632735828612 -1.31712743671507 T:C C T 10 0.535527279857177 0.677416798105031 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68417580_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68417574_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000512367:exon_68417521_68417722:SLC30A5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 18 20 38 8.36050896257082 10.7105455971435 -2.35003663457272 A:T A T 10 0.535527279857177 0.516206535659463 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 39 45 84 18.1144360855701 24.098727593573 -5.98429150800287 T:G G T 10 0.535527279857177 0.228670886278451 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 23 10 33 10.6828725632849 5.35527279857177 5.32759976471316 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0799007821616742 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 70754567 C/T 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70754406_70754682:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70754406_70754682:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70754406_70754682:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70754406_70754682:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70754406_70754682:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70754406_70754682:BDP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 17 9 26 7.89603624242799 4.81974551871459 3.0762907237134 A:G G A 10 0.535527279857177 0.244678832895932 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 11 21 32 5.10919992157105 11.2460728770007 -6.13687295542966 A:T T A 10 0.535527279857177 0.0334184048285338 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 70840233 C/T 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70840184_70840334:BDP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 70945075 A/G 1 25 33 58 11.6118180035706 17.6724002352868 -6.06058223171626 A:G A G 10 0.535527279857177 0.115757696499762 ENSG00000131844:ENST00000512218:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000323375:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000340941:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000509539:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000505435:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000508703:exon_70944924_70945080:MCCC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 70952573 A/G 1 31 40 71 14.3986543244275 21.4210911942871 -7.02243686985956 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0971977228103223 ENSG00000131844:ENST00000512218:exon_70952570_70953042:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000323375:exon_70952570_70954528:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000340941:exon_70952570_70954531:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000508703:exon_70952570_70952861:MCCC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 72184098 C/T 1 14 9 23 6.50261808199952 4.81974551871459 1.68287256328493 T:C C T 10 0.535527279857177 0.535797684122808 ENSG00000083312:ENST00000337273:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000454282:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000415341:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000523768:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000396346:exon_72183954_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000447967:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000506351:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000519220:exon_72184065_72184130:TNPO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 72798845 A/G 1 731 744 1475 339.529558424404 398.43229621374 -58.902737789336 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00224711631134852 ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 72874907 A/C 1 15 17 32 6.96709080214235 9.10396375757201 -2.13687295542966 A:C A C 10 0.535527279857177 0.481995912757542 ENSG00000164338:ENST00000296792:exon_72874842_72874975:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000509005:exon_72874842_72874975:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000508491:exon_72874842_72874975:UTP15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 73985215 A/G 1 18 13 31 8.36050896257082 6.9618546381433 1.39865432442751 A:G A G 10 0.535527279857177 0.719721870124635 ENSG00000049860:ENST00000511181:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000515528:exon_73985153_73985674:HEXB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 74877266 C/T 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000122008:ENST00000241436:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000352007:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000380481:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000425306:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000503479:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000506928:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000510815:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000515295:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508867:exon_74877034_74878790:POLK;ENSG00000122008:ENST00000514141:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000504026:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000511527:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000505975:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508526:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000509126:exon_74877034_74877273:POLK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 75001582 A/G 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 A:G A G 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75001064_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75001398_75001612:POC5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 75003678 T/C 1 22 13 35 10.2183998431421 6.9618546381433 3.25654520499881 T:C T C 10 0.535527279857177 0.311221891782477 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000507421:exon_75003309_75003700:POC5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 75469889 A/G 0 141 0 141 65.4906535401381 0 65.4906535401381 A A 10 0.535527279857177 6.04522059397406e-39 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 76359024 C/A 1 24 29 53 11.1473452834278 15.5302911158581 -4.38294583243038 A:C C A 10 0.535527279857177 0.270608485366989 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76358877_76361059:AGGF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 76734084 C/T 1 18 19 37 8.36050896257082 10.1750183172864 -1.81450935471555 T:C C T 10 0.535527279857177 0.622031610977959 ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000502528:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511630:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507654:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511791:exon_76734083_76734186:WDR41 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 77784738 A/G 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000145685:ENST00000274345:exon_77781038_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000380345:exon_77781040_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000515007:exon_77781054_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000502722:exon_77784635_77784976:LHFPL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 78135201 C/T 1 8 7 15 3.71578176114258 3.74869095900024 -0.0329091978576543 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000113273:ENST00000264914:exon_78135179_78135249:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000341088:exon_78135179_78135249:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000396151:exon_78135179_78135249:ARSB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 78181477 C/T 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 T:C C T 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000113273:ENST00000264914:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000341088:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000396151:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000521800:exon_78181407_78181653:ARSB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 80168937 G/A 1 29 17 46 13.4697088841419 9.10396375757201 4.36574512656986 A:G G A 10 0.535527279857177 0.237142074843509 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 80600619 C/G 1 61 67 128 28.3328359287122 35.8803277504309 -7.54749182171865 T:C:G C G 10 0.535527279857177 0.184882474757426 ENSG00000131732:ENST00000254037:exon_80597422_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000407610:exon_80600560_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000380199:exon_80600560_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000438268:exon_80600560_80600960:ZCCHC9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 80736444 A/G 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 A:G A G 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000145687:ENST00000320672:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000509053:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000514493:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504985:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000512923:exon_80736357_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000510060:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000505980:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000515395:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000380182:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504136:exon_80736377_80736455:SSBP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 81549240 C/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000152348:ENST00000282185:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000458350:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000504770:exon_81549133_81549250:ATG10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 81572184 G/C 1 9 3 12 4.18025448128541 1.60658183957153 2.57367264171388 C:G G C 10 0.535527279857177 0.158167791151507 ENSG00000152348:ENST00000514253:exon_81571964_81572241:ATG10;ENSG00000186468:ENST00000507980:exon_81571697_81572337:RPS23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 81574182 C/T 1 19 12 31 8.82498168271364 6.42632735828612 2.39865432442751 T:C C T 10 0.535527279857177 0.472469903930714 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81574139_81574396:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81574139_81574215:RPS23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 89703641 C/G 1 45 31 76 20.901272406427 16.6013456755725 4.29992673085455 C:G C G 10 0.535527279857177 0.35830362326572 ENSG00000153140:ENST00000283122:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522083:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522864:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000518458:exon_89703516_89703647:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522565:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522842:exon_89703516_89703651:CETN3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 94826655 C/A 1 12 24 36 5.57367264171388 12.8526547165722 -7.27898207485837 A:C C A 10 0.535527279857177 0.018463415230233 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94826612_94826740:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000502768:exon_94826612_94826740:TTC37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 138 178 316 64.0972353797096 95.3238558145775 -31.2266204348679 A:T:G A G 10 0.535527279857177 0.000458604228474281 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 95234350 A/G 1 63 23 86 29.2617813689979 12.3171274367151 16.9446539322828 A:G A G 10 0.535527279857177 0.000210103063769469 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 95234377 C/T 1 57 20 77 26.4749450481409 10.7105455971435 15.7643994509974 T:C C T 10 0.535527279857177 0.000333594220628461 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 95234392 A/C 1 53 14 67 24.6170541675696 7.49738191800048 17.1196722495691 A:C A C 10 0.535527279857177 2.1089606624877e-05 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 95236415 G/A 1 64 51 115 29.7262540891407 27.311891272716 2.41436281642465 A:G G A 10 0.535527279857177 0.70868475697614 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 95236459 C/T 1 33 26 59 15.3275997647132 13.9237092762866 1.40389048842656 T:C C T 10 0.535527279857177 0.794446236188385 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96086334 G/C 1 102 97 199 47.3762174545679 51.9461461461462 -4.56992869157821 C:G G C 10 0.535527279857177 0.523194519365391 ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509903:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000348386:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510500:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000437034:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508579:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515663:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000283095:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000484552:exon_96086291_96086386:CAST HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96098003 C/T 1 161 213 374 74.7801079429945 114.067310609579 -39.2872026665842 A:T:C C T 10 0.535527279857177 5.02312918232152e-05 ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509903:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000348386:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510500:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000437034:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508579:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515663:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000283095:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000484552:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510098:exon_96097978_96098076:CAST;ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96096521_96098932:ERAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96112083 T/G 1 37 30 67 17.1854906452845 16.0658183957153 1.11967224956915 T:G T G 10 0.535527279857177 0.807679970894946 ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96110188_96112255:ERAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96118852 G/C 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 C:G G C 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96118755_96118939:ERAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96118866 C/T 1 10 6 16 4.64472720142823 3.21316367914306 1.43156352228517 T:C C T 10 0.535527279857177 0.618134679686612 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96118755_96118939:ERAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96121524 C/T 1 40 19 59 18.5789088057129 10.1750183172864 8.40389048842656 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0358977796772849 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96121343_96121675:ERAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96122210 C/T 1 21 17 38 9.75392712299928 9.10396375757201 0.649963365427276 T:C C T 10 0.535527279857177 0.87207052479811 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96122174_96122253:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96122174_96122253:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96122174_96122253:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96122174_96122253:ERAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96124330 T/C 1 20 10 30 9.28945440285646 5.35527279857177 3.93418160428469 T:C T C 10 0.535527279857177 0.199513097202572 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96124234_96124388:ERAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96126308 A/G 1 13 9 22 6.0381453618567 4.81974551871459 1.21839984314211 A:C:G A G 10 0.535527279857177 0.672789147896244 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96126215_96126329:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503311:exon_96126288_96126346:ERAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96129512 A/G 1 4 8 12 1.85789088057129 4.28421823885742 -2.42632735828612 A:G A G 10 0.535527279857177 0.24635656157035 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96129506_96129660:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96129506_96129660:ERAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96129535 T/C 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 T:C T C 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96129506_96129660:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96129506_96129660:ERAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96139250 C/G 1 10 4 14 4.64472720142823 2.14210911942871 2.50261808199952 C:G C G 10 0.535527279857177 0.283628757254846 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 27 3 30 12.5407634438562 1.60658183957153 10.9341816042847 T:G G T 10 0.535527279857177 2.75689996869467e-05 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 1 47 1 48 21.8302178467127 0.535527279857177 21.2946905668555 A:T T A 10 0.535527279857177 6.98463621255402e-12 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96237326 G/A 0 13 0 13 6.0381453618567 0 6.0381453618567 G G 10 0.535527279857177 0.000344787469072749 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96237210_96237385:ERAP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 47 4 51 21.8302178467127 2.14210911942871 19.688108727284 T:C:G C T 10 0.535527279857177 2.7884831808553e-09 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 55 6 61 25.5459996078553 3.21316367914306 22.3328359287122 T:C C T 10 0.535527279857177 1.12034858889341e-09 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 71 12 83 32.9775631301404 6.42632735828612 26.5512357718543 T:C C T 10 0.535527279857177 1.33204040397071e-09 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 96350710 G/A 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 A:G G A 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000113441:ENST00000231368:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000489981:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000417755:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000379870:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000395770:exon_96350643_96350799:LNPEP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 102345546 A/C 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 A:C A C 10 0.535527279857177 0.809233970242324 ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000346918:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379787:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379799:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000510006:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000515456:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504691:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504456:exon_102345455_102345570:PAM HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 102433409 G/A 1 12 8 20 5.57367264171388 4.28421823885742 1.28945440285646 A:G G A 10 0.535527279857177 0.656931290438306 ENSG00000145723:ENST00000512248:exon_102433294_102433485:GIN1;ENSG00000145723:ENST00000399004:exon_102433294_102433485:GIN1;ENSG00000145723:ENST00000274384:exon_102433294_102433485:GIN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 102520400 A/C 1 8 22 30 3.71578176114258 11.7816001568579 -8.06581839571531 A:C A C 10 0.535527279857177 0.00509714020827702 ENSG00000145725:ENST00000321521:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000358359:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000451606:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000513500:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000414217:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000509597:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000507966:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000511724:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000511022:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000510672:exon_102519944_102520445:PPIP5K2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 102611821 C/T 1 12 9 21 5.57367264171388 4.81974551871459 0.753927122999285 T:C C T 10 0.535527279857177 0.828752253980847 ENSG00000181751:ENST00000319933:exon_102611598_102614361:C5orf30;ENSG00000181751:ENST00000515669:exon_102611598_102612929:C5orf30;ENSG00000181751:ENST00000510890:exon_102611598_102614072:C5orf30 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 108713982 T/C 1 6 17 23 2.78683632085694 9.10396375757201 -6.31712743671507 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0107859013976102 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 108714298 T/C 1 31 36 67 14.3986543244275 19.2789820748584 -4.88032775043085 T:C T C 10 0.535527279857177 0.270332658729382 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 108719151 G/A 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 A:G G A 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000511624:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000512822:exon_108719097_108719221:PJA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 110456263 C/G 1 39 17 56 18.1144360855701 9.10396375757201 9.01047232799809 C:G C G 10 0.535527279857177 0.015909694972544 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456194_110456291:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456194_110456291:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456194_110456294:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456194_110456291:WDR36 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 110462626 C/G 1 30 7 37 13.9341816042847 3.74869095900024 10.1854906452845 C:G C G 10 0.535527279857177 0.000752500491147106 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110462432_110466200:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110462432_110466200:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110462432_110462662:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110462432_110465409:WDR36 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 32 28 60 14.8631270445703 14.994763836001 -0.131636791430617 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 112349070 T/C 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 T:C T C 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000172795:ENST00000515408:exon_112349018_112355820:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000513585:exon_112349018_112349546:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000389063:exon_112349018_112356667:DCP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 25 18 43 11.6118180035706 9.63949103742918 1.97232696614139 A:T T A 10 0.535527279857177 0.647051402978065 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 118691784 T/C 1 109 92 201 50.6275264955677 49.2685097468603 1.35901674870743 T:C T C 10 0.535527279857177 0.887612359462624 ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118690009_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118691718_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118691730_118691816:TNFAIP8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 121356189 T/A 1 16 11 27 7.43156352228517 5.89080007842895 1.54076344385622 A:T T A 10 0.535527279857177 0.570383110559636 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 122359640 T/C 1 9 5 14 4.18025448128541 2.67763639928588 1.50261808199952 T:C T C 10 0.535527279857177 0.593847726273405 ENSG00000168938:ENST00000306442:exon_122358945_122359698:PPIC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 122361517 C/T 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000168938:ENST00000306442:exon_122361479_122361663:PPIC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 122685727 C/G 1 15 15 30 6.96709080214235 8.03290919785765 -1.06581839571531 C:G C G 10 0.535527279857177 0.717832749087862 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122685638_122685783:CEP120 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 125936672 C/T 1 14 19 33 6.50261808199952 10.1750183172864 -3.67240023528684 T:C C T 10 0.535527279857177 0.223967864022598 ENSG00000164902:ENST00000297540:exon_125935960_125936750:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000514725:exon_125936617_125936750:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000456348:exon_125936633_125936750:PHAX HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 125944131 G/C 1 25 22 47 11.6118180035706 11.7816001568579 -0.169782153287317 C:G G C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000164902:ENST00000297540:exon_125944056_125944176:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000505674:exon_125944056_125944176:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000511371:exon_125944049_125944176:PHAX HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 127469859 A/G 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 A:G A G 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000064651:ENST00000262461:exon_127469857_127469967:SLC12A2;ENSG00000064651:ENST00000509205:exon_127469857_127469967:SLC12A2;ENSG00000064651:ENST00000343225:exon_127469857_127469967:SLC12A2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 130498364 A/G 1 831 847 1678 385.976830438686 453.591606039029 -67.6147756003429 A:T:C:G A G 10 0.535527279857177 0.000950761540660574 ENSG00000169567:ENST00000304043:exon_130498265_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000511475:exon_130498265_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508495:exon_130498265_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513345:exon_130498265_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000506207:exon_130498265_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000504202:exon_130498265_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508488:exon_130498265_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000506908:exon_130497936_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513012:exon_130497984_130498369:HINT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 130515811 G/A 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 A:G G A 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000186687:ENST00000379380:exon_130515788_130515860:LYRM7;ENSG00000186687:ENST00000334031:exon_130515788_130515860:LYRM7;ENSG00000186687:ENST00000510516:exon_130515788_130515860:LYRM7;ENSG00000186687:ENST00000507584:exon_130515788_130515860:LYRM7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 67 73 140 31.1196722495691 39.0934914295739 -7.97381918000477 T:C T C 10 0.535527279857177 0.203578402503598 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 132099999 A/G 1 17 11 28 7.89603624242799 5.89080007842895 2.00523616399905 A:G A G 10 0.535527279857177 0.570608245390574 ENSG00000164402:ENST00000378719:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378721:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000296873:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000412572:exon_132099951_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000448933:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378706:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378699:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378701:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000458488:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371478:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000453480:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000414594:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371493:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000481794:exon_132099653_132100111:SEPT8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 132334252 A/G 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000155329:ENST00000324170:exon_132332677_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000355372:exon_132332688_132334524:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509437:exon_132333792_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513848:exon_132333904_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513541:exon_132334100_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000508080:exon_132334105_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509008:exon_132334220_132334542:ZCCHC10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 132408967 G/A 1 44 33 77 20.4367996862842 17.6724002352868 2.76439945099737 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.568831572936355 ENSG00000170606:ENST00000304858:exon_132408922_132409021:HSPA4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 132437531 C/T 1 150 122 272 69.6709080214235 65.3343281425756 4.33657987884787 T:C C T 10 0.535527279857177 0.626931053284552 ENSG00000170606:ENST00000304858:exon_132437451_132437570:HSPA4;ENSG00000170606:ENST00000514825:exon_132437288_132437570:HSPA4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 133895605 G/A 1 12 15 27 5.57367264171388 8.03290919785765 -2.45923655614378 A:G G A 10 0.535527279857177 0.440881434887102 ENSG00000043143:ENST00000512386:exon_133895520_133895657:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000282605:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000361895:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000432594:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000413974:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000433412:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000458562:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000448712:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000402835:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000395003:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000431355:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000453515:exon_133895520_133895680:PHF15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 134223657 G/A 1 21 36 57 9.75392712299928 19.2789820748584 -9.52505495185908 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0160670529185807 ENSG00000113621:ENST00000441965:exon_134223465_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000358387:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000506916:exon_134223391_134223752:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000507024:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508810:exon_134223385_134223870:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508779:exon_134223385_134223872:TXNDC15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 134364518 C/G 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 C:G C G 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000069011:ENST00000265340:exon_134363424_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000506438:exon_134364243_134365011:PITX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 18 13 31 8.36050896257082 6.9618546381433 1.39865432442751 A:G G A 10 0.535527279857177 0.719721870124635 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 137754695 T/C 1 14 10 24 6.50261808199952 5.35527279857177 1.14734528342775 T:C T C 10 0.535527279857177 0.686885042146951 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000394866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000507996:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000508386:exon_137754642_137754921:KDM3B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 137892170 G/A 1 575 569 1144 267.071814082123 304.715022238734 -37.6432081566105 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.0262076169247421 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000524109:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000512328:exon_137892141_137892262:HSPA9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 137902339 T/C 1 121 191 312 56.2011991372816 102.285710452721 -46.0845113154392 T:C T C 10 0.535527279857177 1.99061888813375e-07 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000501917:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000523929:exon_137902315_137902400:HSPA9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 138266546 G/A 1 77 81 158 35.7643994509974 43.3777096684313 -7.61331021743396 A:G G A 10 0.535527279857177 0.232249157846602 ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 138463538 G/C 1 11 21 32 5.10919992157105 11.2460728770007 -6.13687295542966 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0334184048285338 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138463428_138463542:SIL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 139936760 G/T 1 83 62 145 38.5512357718543 33.202691351145 5.34854442070934 T:G G T 10 0.535527279857177 0.405380776028485 ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 139940233 G/A 1 9 12 21 4.18025448128541 6.42632735828612 -2.24607287700072 A:G G A 10 0.535527279857177 0.384351839373372 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 139941318 A/G 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 A:G A G 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139941172_139941434:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511463:exon_139941228_139941580:APBB3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 145499996 C/T 1 115 113 228 53.4143628164246 60.514582623861 -7.10021980743635 T:C C T 10 0.535527279857177 0.353233617149358 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145499934_145500066:LARS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 145506100 G/A 1 37 35 72 17.1854906452845 18.7434547950012 -1.55796414971674 A:G G A 10 0.535527279857177 0.724489624881522 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145505998_145506108:LARS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 145508340 A/G 1 83 66 149 38.5512357718543 35.3448004705737 3.20643530128063 A:G A G 10 0.535527279857177 0.622808048230776 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145508235_145508345:LARS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 145519821 G/A 1 22 24 46 10.2183998431421 12.8526547165722 -2.63425487343014 A:G G A 10 0.535527279857177 0.462428816700698 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000512412:exon_145519767_145519824:LARS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 145523105 G/A 1 40 26 66 18.5789088057129 13.9237092762866 4.65519952942632 A:G G A 10 0.535527279857177 0.268530291536486 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000514104:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000504323:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508667:exon_145522807_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000507095:exon_145523050_145523113:LARS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 145539996 T/G 1 5 14 19 2.32236360071412 7.49738191800048 -5.17501831728636 T:G T G 10 0.535527279857177 0.0206458730982075 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145539937_145540049:LARS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 145543972 G/A 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 A:G G A 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000505223:exon_145543961_145544034:LARS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 145650597 A/G 1 25 19 44 11.6118180035706 10.1750183172864 1.43679968628421 A:G A G 10 0.535527279857177 0.762943886028215 ENSG00000091009:ENST00000506502:exon_145650517_145650621:RBM27;ENSG00000091009:ENST00000265271:exon_145650517_145650621:RBM27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 145887453 G/A 1 40 37 77 18.5789088057129 19.8145093547155 -1.23560054900263 A:G G A 10 0.535527279857177 0.819681621653495 ENSG00000113649:ENST00000296702:exon_145887436_145887519:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000394421:exon_145887436_145887519:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000506524:exon_145887436_145887519:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000503741:exon_145887436_145887519:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000511077:exon_145886934_145887519:TCERG1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 149374932 T/C 1 10 4 14 4.64472720142823 2.14210911942871 2.50261808199952 T:C T C 10 0.535527279857177 0.283628757254846 ENSG00000164296:ENST00000296736:exon_149372681_149375992:TIGD6;ENSG00000164296:ENST00000515406:exon_149374291_149375992:TIGD6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 149754991 C/T 1 23 32 55 10.6828725632849 17.1368729554297 -6.45400039214473 T:C C T 10 0.535527279857177 0.103911372260179 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149754946_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149754180_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149754902_149755117:TCOF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 149755421 A/G 1 50 34 84 23.2236360071412 18.207927515144 5.01570849199713 A:G A G 10 0.535527279857177 0.324896934260881 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755284_149755472:TCOF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 149755744 G/C 1 49 38 87 22.7591632869983 20.3500366345727 2.40912665242561 C:G G C 10 0.535527279857177 0.667599468332144 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755645_149755893:TCOF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 149759096 T/C 1 59 61 120 27.4038904884266 32.6671640712878 -5.26327358286123 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.360502402513719 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149759095_149760422:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506063:exon_149759095_149759207:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506767:exon_149759095_149759295:TCOF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 149826526 C/T 1 4124 3716 7840 1915.485497869 1990.01937194927 -74.5338740802672 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.0916056610770313 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 149827098 G/A 1 18 11 29 8.36050896257082 5.89080007842895 2.46970888414187 A:G G A 10 0.535527279857177 0.457199191884996 ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 150578574 A/G 1 48 23 71 22.2946905668555 12.3171274367151 9.97756313014044 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0174767554646150 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 150646888 T/C 1 49 48 97 22.7591632869983 25.7053094331445 -2.94614614614616 T:C T C 10 0.535527279857177 0.611009161353274 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 150647012 A/G 1 54 53 107 25.0815268877124 28.3829458324304 -3.30141894471794 A:G A G 10 0.535527279857177 0.561299070907382 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 153783753 C/T 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000164574:ENST00000297107:exon_153783664_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000520647:exon_153783664_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377661:exon_153783664_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000519544:exon_153783664_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000519235:exon_153783664_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000517958:exon_153783337_153783776:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000427235:exon_153783337_153783771:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377657:exon_153783595_153783776:GALNT10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 154275786 G/A 1 14 23 37 6.50261808199952 12.3171274367151 -5.81450935471555 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0689082410419552 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154275652_154275903:GEMIN5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 154282235 T/C 1 9 6 15 4.18025448128541 3.21316367914306 0.967090802142346 T:C T C 10 0.535527279857177 0.796987479524744 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154282099_154282236:GEMIN5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 154291409 C/T 1 9 7 16 4.18025448128541 3.74869095900024 0.431563522285169 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 154300940 A/C 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 A:C A C 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154300903_154300985:GEMIN5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 154346259 A/G 1 170 140 310 78.9603624242799 74.9738191800048 3.98654324427514 A:T:G A G 10 0.535527279857177 0.690271544315592 ENSG00000082515:ENST00000523037:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000265229:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000439747:exon_154346246_154346526:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000522038:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000342738:exon_154346246_154346528:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000519059:exon_154346246_154346453:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000520040:exon_154346246_154346505:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000518364:exon_154346246_154346531:MRPL22 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 39 56 95 18.1144360855701 29.9895276720019 -11.8750915864318 A:G A G 10 0.535527279857177 0.017582658248416 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 156753257 C/T 1 42 28 70 19.5078542459986 14.994763836001 4.51309040999761 T:C C T 10 0.535527279857177 0.337803527577994 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520960:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000518555:exon_156752608_156753275:CYFIP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 157164962 T/C 1 38 37 75 17.6499633654273 19.8145093547155 -2.16454598928827 T:C T C 10 0.535527279857177 0.644422097074127 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157164918_157165002:THG1L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 24 26 50 11.1473452834278 13.9237092762866 -2.77636399285885 A:G A G 10 0.535527279857177 0.479414132257426 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 159912418 C/G 1 12 11 23 5.57367264171388 5.89080007842895 -0.31712743671507 C:G C G 10 0.535527279857177 1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 162868910 T/G 1 55 67 122 25.5459996078553 35.8803277504309 -10.3343281425756 T:G T G 10 0.535527279857177 0.069164592453214 ENSG00000113328:ENST00000512163:exon_162868892_162868970:CCNG1;ENSG00000113328:ENST00000393929:exon_162868892_162868970:CCNG1;ENSG00000113328:ENST00000340828:exon_162868892_162868970:CCNG1;ENSG00000113328:ENST00000511683:exon_162868892_162868970:CCNG1;ENSG00000113328:ENST00000514590:exon_162868892_162868970:CCNG1;ENSG00000113328:ENST00000510664:exon_162868892_162868970:CCNG1;ENSG00000113328:ENST00000504553:exon_162868892_162868970:CCNG1;ENSG00000113328:ENST00000514367:exon_162868662_162868970:CCNG1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 167943827 G/A 1 62 58 120 28.797308648855 31.0605822317163 -2.26327358286123 A:G G A 10 0.535527279857177 0.714659489362036 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167943783_167943955:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167943783_167943955:RARS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 169021610 C/T 1 21 17 38 9.75392712299928 9.10396375757201 0.649963365427276 T:C C T 10 0.535527279857177 0.87207052479811 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021575_169021685:CCDC99 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 169028481 T/C 1 23 32 55 10.6828725632849 17.1368729554297 -6.45400039214473 T:C T C 10 0.535527279857177 0.103911372260179 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 169031150 T/C 1 31 55 86 14.3986543244275 29.4540003921447 -15.0553460677172 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00156060256295850 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 169031218 G/T 1 35 23 58 16.2565452049988 12.3171274367151 3.93941776828373 T:G G T 10 0.535527279857177 0.357031676064618 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 169129422 A/G 1 13 12 25 6.0381453618567 6.42632735828612 -0.388181996429424 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 40 34 74 18.5789088057129 18.207927515144 0.370981290568903 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 82 70 152 38.0867630517115 37.4869095900024 0.599853461709095 T:C C T 10 0.535527279857177 0.93538663636817 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 171523436 G/A 1 57 50 107 26.4749450481409 26.7763639928588 -0.301418944717934 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171523430_171523564:STK10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 171533629 A/G 1 44 32 76 20.4367996862842 17.1368729554297 3.29992673085455 A:G A G 10 0.535527279857177 0.491052305233887 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 171533656 C/T 1 36 35 71 16.7210179251416 18.7434547950012 -2.02243686985956 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.63631790073287 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 171533782 T/C 1 47 26 73 21.8302178467127 13.9237092762866 7.90650857042608 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0777386512876833 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519710:exon_171533666_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171533714_171534038:STK10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 172362285 G/A 1 43 48 91 19.9723269661414 25.7053094331445 -5.7329824670031 A:G G A 10 0.535527279857177 0.248152812227444 ENSG00000113719:ENST00000393784:exon_172362191_172362313:ERGIC1;ENSG00000113719:ENST00000520399:exon_172359439_172365010:ERGIC1;ENSG00000113719:ENST00000523215:exon_172360665_172362313:ERGIC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 176314459 G/A 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:G G A 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000160883:ENST00000506834:exon_176314452_176314747:HK3;ENSG00000160883:ENST00000292432:exon_176314452_176314747:HK3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 176370402 A/G 1 24 47 71 11.1473452834278 25.1697821532873 -14.0224368698596 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00115681945011270 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176370328_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176370336_176370489:UIMC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 15 25 40 6.96709080214235 13.3881819964294 -6.42109119428708 T:G G T 10 0.535527279857177 0.0558507879550108 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 40 23 63 18.5789088057129 12.3171274367151 6.26178136899785 A:G G A 10 0.535527279857177 0.129676878106932 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 176894756 C/T 1 30 20 50 13.9341816042847 10.7105455971435 3.22363600714115 T:C C T 10 0.535527279857177 0.396910313695782 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176894482_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000477391:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000506117:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000514833:exon_176894744_176894818:DBN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 176936590 T/C 1 19 14 33 8.82498168271364 7.49738191800048 1.32759976471316 T:C T C 10 0.535527279857177 0.7283277168968 ENSG00000146094:ENST00000377112:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000501403:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510898:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000509310:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000502380:exon_176935785_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000512660:exon_176936167_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510389:exon_176936503_176936658:DOK3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 60 64 124 27.8683632085694 34.2737459108593 -6.40538270228994 A:G G A 10 0.535527279857177 0.279963265205327 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 177022428 C/T 1 201 219 420 93.3590167487074 117.280474288722 -23.9214575400143 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.0213897211519931 ENSG00000184840:ENST00000332598:exon_177022268_177023125:TMED9;ENSG00000184840:ENST00000513799:exon_177022268_177022578:TMED9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 177031348 T/C 1 15 9 24 6.96709080214235 4.81974551871459 2.14734528342775 T:C T C 10 0.535527279857177 0.419204092334723 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000502420:exon_177031280_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000510761:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505468:exon_177031067_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000507061:exon_177031313_177031542:B4GALT7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 0 2952 0 2952 1371.12346986161 0 1371.12346986161 T T 10 0.535527279857177 0 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 177483154 T/A 1 6 12 18 2.78683632085694 6.42632735828612 -3.63949103742918 A:T T A 10 0.535527279857177 0.100224935165788 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 177483184 A/G 0 23 0 23 10.6828725632849 0 10.6828725632849 A A 10 0.535527279857177 5.99947020661387e-07 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 179020622 T/C 1 40 52 92 18.5789088057129 27.8474185525732 -9.26850974686028 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0596385282257465 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393448:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508609:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502434:exon_179020479_179020646:RUFY1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 179025789 G/A 1 41 29 70 19.0433815258557 15.5302911158581 3.51309040999761 A:G G A 10 0.535527279857177 0.472426721026191 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393448:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502434:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502531:exon_179025693_179025822:RUFY1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 179036433 G/A 1 34 33 67 15.792072484856 17.6724002352868 -1.88032775043086 A:G G A 10 0.535527279857177 0.713647564785655 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 179048205 T/C 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 T:C T C 10 0.535527279857177 0.809233970242324 ENSG00000169045:ENST00000514332:exon_179047893_179048398:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000505087:exon_179048012_179048398:HNRNPH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 179260153 C/T 1 170 180 350 78.9603624242799 96.3949103742919 -17.4345479500119 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.0683104306109256 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 179260213 G/A 1 255 233 488 118.44054363642 124.777856206722 -6.33731257030236 A:G G A 10 0.535527279857177 0.586105000009967 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 179264731 T/C 1 33 65 98 15.3275997647132 34.8092731907165 -19.4816734260033 T:C T C 10 0.535527279857177 9.85623056415085e-05 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179264266_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179264274_179264879:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179264277_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179264527_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179264693_179264811:C5orf45 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 179264915 G/T 1 12 32 44 5.57367264171388 17.1368729554297 -11.5632003137158 T:G G T 10 0.535527279857177 0.00068608702375194 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000518950:exon_179264760_179265255:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 41 38 79 19.0433815258557 20.3500366345727 -1.30665510871698 T:G T G 10 0.535527279857177 0.821807932191592 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 180219304 C/T 1 36 29 65 16.7210179251416 15.5302911158581 1.1907268092835 T:C C T 10 0.535527279857177 0.804522746497878 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 5 180661256 G/C 1 10 10 20 4.64472720142823 5.35527279857177 -0.71054559714354 C:G G C 10 0.535527279857177 0.824432001736655 ENSG00000146063:ENST00000515499:exon_180661174_180661326:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180661174_180661349:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180661174_180662809:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180661174_180662806:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180661174_180661775:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180661174_180661349:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180657744_180662803:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000514219:exon_180661174_180661349:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000510072:exon_180661125_180661818:TRIM41 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 102 76 178 47.3762174545679 40.7000732691454 6.6761441854225 A:G G A 10 0.535527279857177 0.329306325495260 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 13 21 34 6.0381453618567 11.2460728770007 -5.20792751514402 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0856094868468478 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 6174866 G/A 0 0 15 15 0 8.03290919785765 -8.03290919785765 A G A 10 0.535527279857177 1.01019025614483e-05 ENSG00000124491:ENST00000264870:exon_6174813_6175100:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000441301:exon_6174813_6175100:F13A1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 6222382 T/G 0 8 0 8 3.71578176114258 0 3.71578176114258 T T 10 0.535527279857177 0.00893088209752 ENSG00000124491:ENST00000264870:exon_6222266_6222404:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000441301:exon_6222266_6222404:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000445223:exon_6222266_6222404:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000379960:exon_6222266_6222404:F13A1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 7246994 C/T 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C C T 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 7602857 C/T 1 8 11 19 3.71578176114258 5.89080007842895 -2.17501831728636 T:C C T 10 0.535527279857177 0.362455450147038 ENSG00000168566:ENST00000342415:exon_7602856_7602977:SNRNP48;ENSG00000168566:ENST00000496946:exon_7602856_7602977:SNRNP48 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 7609117 T/C 1 12 25 37 5.57367264171388 13.3881819964294 -7.81450935471555 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0125812218953062 ENSG00000168566:ENST00000342415:exon_7609058_7612091:SNRNP48;ENSG00000168566:ENST00000496946:exon_7609058_7609439:SNRNP48 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 8413890 A/G 1 8 20 28 3.71578176114258 10.7105455971435 -6.99476383600096 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0123102681719508 ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8413301_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8413303_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8413303_8413932:SLC35B3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 8430338 T/C 1 8 19 27 3.71578176114258 10.1750183172864 -6.45923655614378 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0188741511761996 ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8430097_8430390:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8430097_8430390:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8430097_8430390:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000339306:exon_8430097_8430390:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000426876:exon_8430097_8430390:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000415841:exon_8430097_8430390:SLC35B3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 11190859 G/A 1 18 18 36 8.36050896257082 9.63949103742918 -1.27898207485837 A:G G A 10 0.535527279857177 0.739253657716502 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11190197_11191438:NEDD9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 12296255 G/T 1 19 26 45 8.82498168271364 13.9237092762866 -5.09872759357296 T:G G T 10 0.535527279857177 0.136833460044393 ENSG00000078401:ENST00000379375:exon_12296195_12297427:EDN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 13487174 C/T 1 5 5 10 2.32236360071412 2.67763639928588 -0.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000145990:ENST00000379287:exon_13486870_13487787:GFOD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 13599303 C/T 1 2 10 12 0.928945440285646 5.35527279857177 -4.42632735828612 T:C C T 10 0.535527279857177 0.016688085548077 ENSG00000124523:ENST00000379262:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000397350:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13599264_13599387:SIRT5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 16145473 C/T 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 T:C C T 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000007944:ENST00000356840:exon_16145128_16145548:MYLIP;ENSG00000007944:ENST00000349606:exon_16145128_16145548:MYLIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 16290761 T/A 1 5 19 24 2.32236360071412 10.1750183172864 -7.85265471657225 A:T T A 10 0.535527279857177 0.00158642477206778 ENSG00000137198:ENST00000259727:exon_16290693_16290852:GMPR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 16306751 G/A 1 8 15 23 3.71578176114258 8.03290919785765 -4.31712743671507 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0932088331135184 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 17637958 G/A 1 6 24 30 2.78683632085694 12.8526547165722 -10.0658183957153 A:G G A 10 0.535527279857177 0.000312787724638112 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17637384_17638001:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17637384_17638001:NUP153 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 17637979 A/C 1 14 22 36 6.50261808199952 11.7816001568579 -5.27898207485837 A:C A C 10 0.535527279857177 0.0942326952420247 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17637384_17638001:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17637384_17638001:NUP153 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 17688798 G/A 1 8 3 11 3.71578176114258 1.60658183957153 2.10919992157105 A:G G A 10 0.535527279857177 0.23951309450586 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17688627_17688849:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17688627_17688849:NUP153 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 24403411 T/C 1 10 8 18 4.64472720142823 4.28421823885742 0.360508962570814 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24403182_24403464:MRS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 24653273 G/C 1 24 13 37 11.1473452834278 6.9618546381433 4.18549064528445 C:G G C 10 0.535527279857177 0.189208139895819 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 24666739 C/T 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:C C T 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24666347_24666819:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000480495:exon_24666215_24666839:TDP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 24781719 G/C 1 60 31 91 27.8683632085694 16.6013456755725 11.2670175329969 C:G G C 10 0.535527279857177 0.020376439345248 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24781705_24781772:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24781705_24781849:GMNN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 24781735 C/T 1 50 28 78 23.2236360071412 14.994763836001 8.2288721711402 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0691552131618986 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24781705_24781772:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24781705_24781849:GMNN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 25538188 C/A 1 9 3 12 4.18025448128541 1.60658183957153 2.57367264171388 A:C C A 10 0.535527279857177 0.158167791151507 ENSG00000079691:ENST00000399313:exon_25538083_25538211:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25538083_25538211:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25538083_25538211:LRRC16A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 25600602 A/G 1 20 8 28 9.28945440285646 4.28421823885742 5.00523616399904 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0605447664268705 ENSG00000079691:ENST00000399313:exon_25600542_25600948:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25600542_25600974:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25600542_25600974:LRRC16A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 25600772 A/G 1 31 14 45 14.3986543244275 7.49738191800048 6.90127240642704 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0508838167766501 ENSG00000079691:ENST00000399313:exon_25600542_25600948:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25600542_25600974:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25600542_25600974:LRRC16A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 25605091 G/A 1 27 13 40 12.5407634438562 6.9618546381433 5.57890880571292 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0826404897557058 ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25605040_25605121:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25605040_25605121:LRRC16A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26027433 G/A 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 A:G G A 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000124529:ENST00000377364:exon_26027124_26027480:HIST1H4B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26031962 G/A 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 A:G G A 10 0.535527279857177 0.782354473542065 ENSG00000124693:ENST00000244661:exon_26031878_26032288:HIST1H3B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26032105 G/A 1 8 13 21 3.71578176114258 6.9618546381433 -3.24607287700072 A:G G A 10 0.535527279857177 0.190471702102025 ENSG00000124693:ENST00000244661:exon_26031878_26032288:HIST1H3B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26045737 C/G 1 21 7 28 9.75392712299928 3.74869095900024 6.00523616399905 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0234404287532799 ENSG00000196532:ENST00000360577:exon_26045612_26047022:HIST1H3C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26104382 C/T 1 70 72 142 32.5130904099976 38.5579641497167 -6.04487373971913 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.313965041635606 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26184082 C/G 1 39 42 81 18.1144360855701 22.4921457540014 -4.37770966843133 A:C:G C G 10 0.535527279857177 0.373060391975615 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26189312 C/G 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 C:G C G 10 0.535527279857177 0.529514337684375 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26197493 C/A 1 9 7 16 4.18025448128541 3.74869095900024 0.431563522285169 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26197012_26197497:HIST1H3D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26199222 G/A 1 15 8 23 6.96709080214235 4.28421823885742 2.68287256328493 A:G G A 10 0.535527279857177 0.300673562790689 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26199087_26199464:HIST1H3D;ENSG00000196866:ENST00000341023:exon_26199079_26199471:HIST1H2AD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26216656 T/C 1 20 13 33 9.28945440285646 6.9618546381433 2.32759976471316 T:C T C 10 0.535527279857177 0.486798516630557 ENSG00000187990:ENST00000339812:exon_26216491_26216871:HIST1H2BG HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26234883 A/G 1 7 9 16 3.25130904099976 4.81974551871459 -1.56843647771483 A:G A G 10 0.535527279857177 0.462143040312805 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26234952 A/G 1 4 8 12 1.85789088057129 4.28421823885742 -2.42632735828612 A:G A G 10 0.535527279857177 0.24635656157035 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26240649 C/T 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 T:C C T 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000198327:ENST00000377745:exon_26240561_26240976:HIST1H4F HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26252148 C/T 1 21 36 57 9.75392712299928 19.2789820748584 -9.52505495185908 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0160670529185807 ENSG00000197459:ENST00000356350:exon_26251879_26252303:HIST1H2BH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 32 2 34 14.8631270445703 1.07105455971435 13.792072484856 T:C T C 10 0.535527279857177 3.19056865205102e-07 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26370660 G/A 1 29 3 32 13.4697088841419 1.60658183957153 11.8631270445703 A:G G A 10 0.535527279857177 9.20020111850537e-06 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26374571 G/A 1 29 50 79 13.4697088841419 26.7763639928588 -13.306655108717 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00315829520480005 ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26374555_26374601:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26374555_26374601:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26374555_26374601:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26374555_26374601:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26374555_26374601:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26374555_26374601:BTN3A2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 151 195 346 70.1353807415663 104.42781957215 -34.2924388305832 A:G G A 10 0.535527279857177 0.000239006021156468 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 23 35 58 10.6828725632849 18.7434547950012 -8.06058223171627 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0355973201146334 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 60 49 109 27.8683632085694 26.2408367130017 1.62752649556771 A:G A G 10 0.535527279857177 0.77411083287002 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 27775674 A/G 1 7 10 17 3.25130904099976 5.35527279857177 -2.10396375757201 A:G A G 10 0.535527279857177 0.338715846297251 ENSG00000185130:ENST00000377401:exon_27775257_27775709:HIST1H2BL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 27833174 A/G 1 21 16 37 9.75392712299928 8.56843647771483 1.18549064528445 A:G A G 10 0.535527279857177 0.743804421265413 ENSG00000198374:ENST00000357320:exon_27833034_27833606:HIST1H2AL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 27835131 G/C 1 14 7 21 6.50261808199952 3.74869095900024 2.75392712299928 C:G G C 10 0.535527279857177 0.277002137235975 ENSG00000184357:ENST00000331442:exon_27834570_27835359:HIST1H1B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 27835272 T/C 1 13 6 19 6.0381453618567 3.21316367914306 2.82498168271364 T:C T C 10 0.535527279857177 0.251478317815371 ENSG00000184357:ENST00000331442:exon_27834570_27835359:HIST1H1B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 27840049 T/C 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 T:C T C 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000182572:ENST00000328488:exon_27839683_27840093:HIST1H3I HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 27858421 A/G 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000197153:ENST00000359303:exon_27858160_27858570:HIST1H3J;ENSG00000197153:ENST00000479986:exon_27858413_27858588:HIST1H3J HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 28093263 G/A 1 14 13 27 6.50261808199952 6.9618546381433 -0.459236556143778 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000196812:ENST00000340487:exon_28093191_28093608:ZSCAN16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 28264717 C/T 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:C C T 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28264593_28264722:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28264593_28264722:PGBD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 29523670 C/A 1 25 5 30 11.6118180035706 2.67763639928588 8.93418160428469 A:C C A 10 0.535527279857177 0.000823497508313214 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 29523859 G/C 1 33 28 61 15.3275997647132 14.994763836001 0.332835928712205 C:G G C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 29523872 A/G 1 40 31 71 18.5789088057129 16.6013456755725 1.97756313014044 A:G A G 10 0.535527279857177 0.721437008059548 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 29524003 A/G 1 33 27 60 15.3275997647132 14.4592365561438 0.868363208569381 A:G A G 10 0.535527279857177 0.89725531436354 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 37 24 61 17.1854906452845 12.8526547165722 4.33283592871221 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.305011437657646 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 29695713 C/T 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 T:C C T 10 0.535527279857177 0.298960436382335 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 29695854 G/A 1 11 6 17 5.10919992157105 3.21316367914306 1.89603624242799 A:G G A 10 0.535527279857177 0.467819685510286 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29695734_29695883:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000475996:exon_29695734_29697128:HLA-F HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 29910330 G/A 1 160 77 237 74.3156352228517 41.2356005490026 33.0800346738491 A:G G A 10 0.535527279857177 1.53721653736738e-05 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29910325_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910326_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910329_29910403:HLA-A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 29910663 G/A 1 606 1550 2156 281.470468406551 830.067283778624 -548.596815372073 A:G G A 10 0.535527279857177 1.58750587204395e-126 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 29911003 G/A 1 16 6 22 7.43156352228517 3.21316367914306 4.21839984314211 A:G G A 10 0.535527279857177 0.08728031897682 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 29911356 G/A 1 12 20 32 5.57367264171388 10.7105455971435 -5.13687295542966 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0771656531600189 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 33 38 71 15.3275997647132 20.3500366345727 -5.02243686985956 T:C T C 10 0.535527279857177 0.236675960416332 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30166266 C/T 1 34 42 76 15.792072484856 22.4921457540014 -6.70007326914545 T:C C T 10 0.535527279857177 0.135255849857900 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166206_30166301:TRIM26 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30166886 C/T 1 34 29 63 15.792072484856 15.5302911158581 0.261781368997852 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166443_30167041:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000426696:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000418026:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000434785:exon_30166515_30166924:TRIM26 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30313340 G/C 1 128 137 265 59.4525081782813 73.3672373404332 -13.9147291621519 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0961817053736333 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30457283 G/T 1 7 9 16 3.25130904099976 4.81974551871459 -1.56843647771483 T:G G T 10 0.535527279857177 0.462143040312805 ENSG00000204592:ENST00000427226:exon_30457231_30457372:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457231_30457372:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457244_30457372:HLA-E HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30529816 G/A 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 A:G G A 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30527808_30529901:PRR3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30530203 A/G 1 13 7 20 6.0381453618567 3.74869095900024 2.28945440285646 A:G A G 10 0.535527279857177 0.373042117571353 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30647005 C/G 1 126 106 232 58.5235627379957 56.7658916648608 1.75767107313494 C:G C G 10 0.535527279857177 0.84362383588396 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30646956_30647166:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30646956_30647166:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000488324:exon_30646956_30647166:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000467662:exon_30646956_30647166:KIAA1949 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30671989 G/C 1 39 44 83 18.1144360855701 23.5632003137158 -5.44876422814569 C:G G C 10 0.535527279857177 0.271051346998430 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30695920 C/T 1 526 467 993 244.312650795125 250.091239693302 -5.77858889817674 T:C C T 10 0.535527279857177 0.726407030169057 ENSG00000137312:ENST00000376389:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000376385:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000456573:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000432446:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000422641:exon_30695513_30695922:FLOT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30698541 A/G 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30698459_30698877:FLOT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30708944 T/A 1 8 3 11 3.71578176114258 1.60658183957153 2.10919992157105 A:T T A 10 0.535527279857177 0.23951309450586 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30864829 T/C 1 9 5 14 4.18025448128541 2.67763639928588 1.50261808199952 T:C T C 10 0.535527279857177 0.593847726273405 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000514434:exon_30864791_30864918:DDR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30865204 A/C 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 A:C A C 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30865138_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30865156_30865374:DDR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 20 14 34 9.28945440285646 7.49738191800048 1.79207248485598 T:C C T 10 0.535527279857177 0.607875644967397 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 18 22 40 8.36050896257082 11.7816001568579 -3.42109119428708 A:C A C 10 0.535527279857177 0.341735714745905 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30882634 C/T 1 13 9 22 6.0381453618567 4.81974551871459 1.21839984314211 T:C C T 10 0.535527279857177 0.672789147896244 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30882781 G/T 1 12 8 20 5.57367264171388 4.28421823885742 1.28945440285646 T:G G T 10 0.535527279857177 0.656931290438306 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30887972 C/T 1 4 11 15 1.85789088057129 5.89080007842895 -4.03290919785765 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0409545616380073 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30887988 C/T 1 13 3 16 6.0381453618567 1.60658183957153 4.43156352228517 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0414895745905174 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30888169 G/A 1 9 2 11 4.18025448128541 1.07105455971435 3.10919992157105 A:G G A 10 0.535527279857177 0.072775715286889 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30889389 T/C 1 9 9 18 4.18025448128541 4.81974551871459 -0.639491037429185 T:C T C 10 0.535527279857177 0.816111256590493 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30889366_30889468:VARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30890483 G/T 1 13 17 30 6.0381453618567 9.10396375757201 -3.06581839571531 T:G G T 10 0.535527279857177 0.277280147402981 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000477052:exon_30890360_30890551:VARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30892322 C/T 1 25 18 43 11.6118180035706 9.63949103742918 1.97232696614139 T:C C T 10 0.535527279857177 0.647051402978065 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30892131_30892341:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 26 32 58 12.0762907237134 17.1368729554297 -5.06058223171626 A:G G A 10 0.535527279857177 0.190325190080046 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 30893428 G/A 1 37 32 69 17.1854906452845 17.1368729554297 0.0486176898547903 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30893321_30893451:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893321_30893496:VARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31129310 C/T 1 28 31 59 13.005236163999 16.6013456755725 -3.59610951157344 T:C C T 10 0.535527279857177 0.363344888929878 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129261_31129354:TCF19 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 3486 2964 6450 1619.15190241788 1587.30285749667 31.8490449212086 A:T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.431622657210544 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 3770 1927 5697 1751.06215493844 1031.96106828478 719.101086653663 A:T:C:G C G 10 0.535527279857177 3.3465899407671e-83 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31237333 T/A 0 11 0 11 5.10919992157105 0 5.10919992157105 T T 10 0.535527279857177 0.00125600829965403 ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 1801 952 2753 836.515368977224 509.821970424032 326.693398553192 A:T:C C T 10 0.535527279857177 1.80172794089950e-36 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31239449 C/G 1 1431 1772 3203 664.66046252438 948.954339906918 -284.293877382538 A:C:G C G 10 0.535527279857177 9.03023158006213e-24 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31239506 C/G 1 1422 783 2205 660.480208043094 419.31786012817 241.162347914925 A:T:C:G C G 10 0.535527279857177 3.20704963941037e-25 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 1 772 73 845 358.572939950259 39.0934914295739 319.479448520685 T:G G T 10 0.535527279857177 1.77102222532345e-127 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 28 15 43 13.005236163999 8.03290919785765 4.97232696614139 T:C C T 10 0.535527279857177 0.168119510191600 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 15 3 18 6.96709080214235 1.60658183957153 5.36050896257081 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0156833051461095 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 1035 835 1870 480.729265347822 447.165278680743 33.5639866670791 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.120407830258805 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 1161 362 1523 539.252828085818 193.860875308298 345.391952777519 A:G G A 10 0.535527279857177 1.34743838843903e-74 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31431813 A/G 1 61 56 117 28.3328359287122 29.9895276720019 -1.6566917432897 A:G A G 10 0.535527279857177 0.78145750207443 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31473546 A/G 1 13 13 26 6.0381453618567 6.9618546381433 -0.923709276286601 A:G A G 10 0.535527279857177 0.844640207112493 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31473561 A/G 1 14 13 27 6.50261808199952 6.9618546381433 -0.459236556143778 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31473957 C/G 1 17 23 40 7.89603624242799 12.3171274367151 -4.42109119428708 C:G C G 10 0.535527279857177 0.204267301663680 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31474000 G/A 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 A:G G A 10 0.535527279857177 0.782354473542065 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31477681 A/G 1 10 5 15 4.64472720142823 2.67763639928588 1.96709080214235 A:G A G 10 0.535527279857177 0.438857166783305 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31477559_31478901:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31477559_31478901:MICB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31525448 C/T 1 24 23 47 11.1473452834278 12.3171274367151 -1.16978215328732 T:C C T 10 0.535527279857177 0.771114440369414 ENSG00000204498:ENST00000376146:exon_31525405_31525626:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376148:exon_31525405_31525626:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376145:exon_31525405_31525581:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000496233:exon_31525405_31525482:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000473655:exon_31525405_31525736:NFKBIL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 132 146 278 61.3103990588526 78.1869828591478 -16.8765838002952 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0470625641092327 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31557381 G/A 1 22 23 45 10.2183998431421 12.3171274367151 -2.09872759357296 A:G G A 10 0.535527279857177 0.552857972870736 ENSG00000204475:ENST00000495600:exon_31557303_31557410:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31557303_31557410:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31557303_31557410:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31557303_31557410:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376072:exon_31557303_31557410:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376071:exon_31557303_31557410:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000478506:exon_31557303_31557410:NCR3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31583312 G/A 1 10 4 14 4.64472720142823 2.14210911942871 2.50261808199952 A:G G A 10 0.535527279857177 0.283628757254846 ENSG00000204472:ENST00000376059:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000497362:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000337917:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000376063:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000466820:exon_31583298_31583359:AIF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31595795 C/T 1 36 43 79 16.7210179251416 23.0276730338586 -6.30665510871698 T:C C T 10 0.535527279857177 0.17585421313868 ENSG00000204469:ENST00000414096:exon_31595542_31595821:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31595542_31596016:BAT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31598489 A/G 1 17 18 35 7.89603624242799 9.63949103742918 -1.74345479500119 A:G A G 10 0.535527279857177 0.612839258964269 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598368_31598578:BAT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31600304 G/C 1 72 76 148 33.4420358502833 40.7000732691454 -7.25803741886219 C:G G C 10 0.535527279857177 0.248843439056816 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31599982_31600769:BAT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 287 290 577 133.30367068099 155.302911158581 -21.9992404775911 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0726164456807491 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 193 201 394 89.6432349875649 107.640983251293 -17.9977482637277 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0769690235522537 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31605167 G/A 1 26 23 49 12.0762907237134 12.3171274367151 -0.240836713001672 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 55 56 111 25.5459996078553 29.9895276720019 -4.44352806414664 T:C C T 10 0.535527279857177 0.446654072220342 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 67 35 102 31.1196722495691 18.7434547950012 12.3762174545679 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0167876510053312 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 258 292 550 119.833961796848 156.373965718296 -36.5400039214473 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00205715062692619 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31639757 G/A 1 30 18 48 13.9341816042847 9.63949103742918 4.29469056685551 A:G G A 10 0.535527279857177 0.247741321899707 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31727897 C/T 1 17 10 27 7.89603624242799 5.35527279857177 2.54076344385622 T:C C T 10 0.535527279857177 0.343173783053281 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000494646:exon_31727867_31727950:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31727867_31727993:MSH5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31732207 C/T 1 33 15 48 15.3275997647132 8.03290919785765 7.29469056685551 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0419580475432054 ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31732043_31732628:MSH5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31860337 T/C 1 9 3 12 4.18025448128541 1.60658183957153 2.57367264171388 T:C T C 10 0.535527279857177 0.158167791151507 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000463484:exon_31860195_31860339:EHMT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31929014 A/C 1 8 12 20 3.71578176114258 6.42632735828612 -2.71054559714354 A:C A C 10 0.535527279857177 0.265322195681750 ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31928973_31929163:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31928818_31929452:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31928973_31929163:SKIV2L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31936668 T/C 1 33 36 69 15.3275997647132 19.2789820748584 -3.95138231014521 T:C T C 10 0.535527279857177 0.398370227413153 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 31936679 C/T 1 31 34 65 14.3986543244275 18.207927515144 -3.8092731907165 T:C C T 10 0.535527279857177 0.38459781952499 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000471818:exon_31936678_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32097475 T/C 1 15 11 26 6.96709080214235 5.89080007842895 1.0762907237134 T:C T C 10 0.535527279857177 0.69952867420128 ENSG00000204315:ENST00000375156:exon_32096484_32097631:FKBPL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32147696 G/A 0 32 0 32 14.8631270445703 0 14.8631270445703 G G 10 0.535527279857177 2.92844742793486e-09 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147654_32147708:RNF5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32148031 A/G 1 79 31 110 36.693344891283 16.6013456755725 20.0919992157105 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00011339896821776 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32148006_32148570:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375085:exon_32148006_32148541:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32148006_32148541:RNF5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32151934 A/G 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000204305:ENST00000484849:exon_32151658_32152023:AGER HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 216 267 483 100.32610755085 142.985783721866 -42.6596761710165 T:C T C 10 0.535527279857177 0.000103109361378460 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 332 344 676 154.204943087417 184.221384270869 -30.0164411834516 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0228361398305244 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32410210 T/C 1 8 5 13 3.71578176114258 2.67763639928588 1.0381453618567 T:C T C 10 0.535527279857177 0.593586480755975 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32410215 T/C 1 8 5 13 3.71578176114258 2.67763639928588 1.0381453618567 T:C T C 10 0.535527279857177 0.593586480755975 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 2059 2241 4300 956.349330774073 1200.11663415993 -243.767303385861 A:T:C A C 10 0.535527279857177 1.02494235819483e-13 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32411523 T/C 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C T C 10 0.535527279857177 0.560102972031953 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 1825 2189 4014 847.662714260652 1172.26921560736 -324.606501346708 A:T:C:G T G 10 0.535527279857177 1.25448772080657e-24 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 75 75 150 34.8354540107117 40.1645459892883 -5.32909197857654 T:C T C 10 0.535527279857177 0.413244572610998 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32798548 G/A 1 56 66 122 26.0104723279981 35.3448004705737 -9.33432814257559 A:G G A 10 0.535527279857177 0.102056222200454 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32798395_32798583:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32798395_32798583:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32798395_32798583:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32798395_32798583:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32798395_32798583:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32818678 G/A 1 12 5 17 5.57367264171388 2.67763639928588 2.89603624242799 A:G G A 10 0.535527279857177 0.223914163527513 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 285 276 561 132.374725240705 147.805529240581 -15.4308039998763 A:G G A 10 0.535527279857177 0.204113853949065 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32916555 G/A 1 226 286 512 104.970834752278 153.160802039153 -48.1899672868746 A:G G A 10 0.535527279857177 2.03180964869292e-05 ENSG00000204257:ENST00000480785:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32916391_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000473725:exon_32916518_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32916548_32916645:HLA-DMA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32917042 A/C 1 7 15 22 3.25130904099976 8.03290919785765 -4.78160015685789 A:C A C 10 0.535527279857177 0.0529971189475910 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32940621 C/T 1 19 18 37 8.82498168271364 9.63949103742918 -0.814509354715547 T:C C T 10 0.535527279857177 0.869533408882615 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32940507_32940704:BRD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 11 16 27 5.10919992157105 8.56843647771483 -3.45923655614378 A:G G A 10 0.535527279857177 0.246559677217583 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 218 239 457 101.255052991135 127.991019885865 -26.7359668947299 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0128864110317125 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 32974551 G/T 1 32 28 60 14.8631270445703 14.994763836001 -0.131636791430617 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32971955_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32971959_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32973372_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974384_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974523_32974618:HLA-DOA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 0 232 0 232 107.757671073135 0 107.757671073135 A A 10 0.535527279857177 1.29388996799005e-63 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 33053609 G/A 1 315 234 549 146.308906844989 125.313383486579 20.9955233584098 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.0792878199365187 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 33179689 C/T 1 33 29 62 15.3275997647132 15.5302911158581 -0.202691351144972 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000204227:ENST00000374656:exon_33179506_33179779:RING1;ENSG00000204227:ENST00000478431:exon_33179506_33179779:RING1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 33232521 C/T 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 T:C C T 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000223501:ENST00000493379:exon_33232151_33232677:VPS52 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 18 16 34 8.36050896257082 8.56843647771483 -0.207927515144016 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 33254665 A/G 1 55 46 101 25.5459996078553 24.6342548734301 0.911744734425127 A:G A G 10 0.535527279857177 0.920626462056172 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33254572_33254671:WDR46 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 33256397 G/A 1 72 56 128 33.4420358502833 29.9895276720019 3.45250817828135 A:G G A 10 0.535527279857177 0.595158246643395 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256341_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256391_33256471:WDR46 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 14 9 23 6.50261808199952 4.81974551871459 1.68287256328493 A:G G A 10 0.535527279857177 0.535797684122808 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 33271953 G/A 1 57 38 95 26.4749450481409 20.3500366345727 6.12490841356819 A:G G A 10 0.535527279857177 0.218377256342305 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33271905_33271994:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33271905_33271994:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33271905_33271994:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33271905_33271994:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33271905_33271994:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33271905_33271994:TAPBP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 33272712 C/A 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 193 167 360 89.6432349875649 89.4330557361485 0.210179251416307 C:G G C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 33371778 C/A 1 74 67 141 34.3709812905689 35.8803277504309 -1.50934645986195 A:C C A 10 0.535527279857177 0.800730349803443 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33371506_33371906:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33371506_33371906:KIFC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 33653448 C/T 1 5 13 18 2.32236360071412 6.9618546381433 -4.63949103742919 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0333546744685474 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33653420_33653604:ITPR3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 33659472 C/G 1 18 23 41 8.36050896257082 12.3171274367151 -3.95661847414426 C:G C G 10 0.535527279857177 0.272904314717144 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 35260503 C/T 1 16 9 25 7.43156352228517 4.81974551871459 2.61181800357058 T:C C T 10 0.535527279857177 0.322674779852583 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000417184:exon_35260331_35260504:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 35260530 C/T 1 16 10 26 7.43156352228517 5.35527279857177 2.0762907237134 T:C C T 10 0.535527279857177 0.439359348031197 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 35287755 G/A 1 103 77 180 47.8406901747108 41.2356005490026 6.60508962570815 A:G G A 10 0.535527279857177 0.332297215159955 ENSG00000023892:ENST00000316637:exon_35287596_35287794:DEF6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 35288696 C/T 1 85 94 179 39.48018121214 50.3395643065746 -10.8593830944347 T:C C T 10 0.535527279857177 0.115400913004203 ENSG00000023892:ENST00000316637:exon_35288661_35288751:DEF6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 35430686 G/A 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000112039:ENST00000229769:exon_35430566_35430691:FANCE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 35436195 G/A 1 22 10 32 10.2183998431421 5.35527279857177 4.86312704457034 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.109707291305461 ENSG00000198755:ENST00000322203:exon_35436185_35436216:RPL10A;ENSG00000198755:ENST00000467020:exon_35436185_35436216:RPL10A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 35436571 C/T 1 14 13 27 6.50261808199952 6.9618546381433 -0.459236556143778 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000198755:ENST00000464112:exon_35436197_35436650:RPL10A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 36867376 C/T 1 15 13 28 6.96709080214235 6.9618546381433 0.00523616399904459 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36867202_36867409:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36867202_36867409:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36867202_36867409:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36867202_36867409:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000416621:exon_36867202_36867409:C6orf89 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 11 14 25 5.10919992157105 7.49738191800048 -2.38818199642942 A:G A G 10 0.535527279857177 0.423396273780819 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 17 14 31 7.89603624242799 7.49738191800048 0.398654324427515 A:G A G 10 0.535527279857177 1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 36979583 C/T 1 16 15 31 7.43156352228517 8.03290919785765 -0.601345675572485 T:C C T 10 0.535527279857177 0.858656759427397 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36979482_36979630:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36979482_36979809:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36979482_36979630:FGD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 37349066 G/A 1 9 14 23 4.18025448128541 7.49738191800048 -3.31712743671507 A:G G A 10 0.535527279857177 0.209916596816924 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 37619830 G/A 1 7 1 8 3.25130904099976 0.535527279857177 2.71578176114258 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0758484261005442 ENSG00000112139:ENST00000434837:exon_37619787_37620116:MDGA1;ENSG00000112139:ENST00000297153:exon_37619787_37620116:MDGA1;ENSG00000112139:ENST00000505425:exon_37619787_37620116:MDGA1;ENSG00000112139:ENST00000478143:exon_37619787_37620116:MDGA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 35 25 60 16.2565452049988 13.3881819964294 2.86836320856938 A:G G A 10 0.535527279857177 0.518253465293186 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 39082831 C/T 1 1 7 8 0.464472720142823 3.74869095900024 -3.28421823885742 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0289107709309061 ENSG00000112167:ENST00000229903:exon_39082659_39082965:C6orf64;ENSG00000112167:ENST00000481599:exon_39082659_39082847:C6orf64 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 41162518 T/C 1 1 8 9 0.464472720142823 4.28421823885742 -3.81974551871459 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0150689460626302 ENSG00000112195:ENST00000373108:exon_41162163_41162571:TREML2;ENSG00000112195:ENST00000483722:exon_41162163_41162571:TREML2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 204 185 389 94.7524349091359 99.0725467735777 -4.32011186444184 T:C C T 10 0.535527279857177 0.684354813130023 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 265 270 535 123.085270837848 144.592365561438 -21.5070947235897 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0624974634462712 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 63 49 112 29.2617813689979 26.2408367130017 3.02094465599618 A:C A C 10 0.535527279857177 0.635941398209069 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 42532102 C/T 1 6 6 12 2.78683632085694 3.21316367914306 -0.426327358286123 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000024048:ENST00000372903:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372883:exon_42532058_42532135:UBR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 42627434 G/A 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42627394_42627593:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42627394_42627593:UBR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 42658949 T/A 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 A:T T A 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42658770_42661242:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42658770_42661242:UBR2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 42832683 G/A 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 A:G G A 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000112624:ENST00000394167:exon_42832397_42836128:KIAA0240;ENSG00000112624:ENST00000314073:exon_42832397_42836128:KIAA0240;ENSG00000112624:ENST00000394168:exon_42832397_42836296:KIAA0240 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 42906384 G/T 1 207 193 400 96.1458530695644 103.356765012435 -7.21091194287078 A:T:C:G G T 10 0.535527279857177 0.483012621646875 ENSG00000137161:ENST00000372836:exon_42906306_42907025:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000394142:exon_42906306_42907007:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000336842:exon_42906306_42906445:CNPY3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 42932200 G/T 1 37 29 66 17.1854906452845 15.5302911158581 1.65519952942632 T:G G T 10 0.535527279857177 0.712718869138349 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 42932202 C/T 1 39 28 67 18.1144360855701 14.994763836001 3.11967224956914 T:C C T 10 0.535527279857177 0.464908133544068 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 42946036 G/C 1 7 8 15 3.25130904099976 4.28421823885742 -1.03290919785765 C:G G C 10 0.535527279857177 0.614933682686176 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42946007_42946958:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42946007_42946888:PEX6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 43020188 G/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43019947_43020534:CUL7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 43322907 A/G 1 33 32 65 15.3275997647132 17.1368729554297 -1.8092731907165 A:G A G 10 0.535527279857177 0.709628478706811 ENSG00000171467:ENST00000318149:exon_43322402_43323883:ZNF318;ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43322402_43323883:ZNF318 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 43492578 G/A 1 79 73 152 36.693344891283 39.0934914295739 -2.4001465382909 A:G G A 10 0.535527279857177 0.745113592361597 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 52 53 105 24.1525814474268 28.3829458324304 -4.23036438500358 A:C A C 10 0.535527279857177 0.434452192770475 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 43535018 C/T 1 7 7 14 3.25130904099976 3.74869095900024 -0.497381918000477 T:C C T 10 0.535527279857177 0.796028545675074 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43534906_43535091:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43534906_43535091:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43534906_43535091:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372252:exon_43534906_43535091:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43534906_43535091:XPO5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 43604167 A/G 1 45 43 88 20.901272406427 23.0276730338586 -2.12640062743157 A:G A G 10 0.535527279857177 0.670083219289045 ENSG00000124688:ENST00000451025:exon_43604118_43604383:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000372173:exon_43604118_43604383:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000372171:exon_43604118_43604383:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000426254:exon_43604118_43604383:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000508232:exon_43604118_43604610:MAD2L1BP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 44081510 C/T 1 120 57 177 55.7367264171388 30.5250549518591 25.2116714652797 T:C C T 10 0.535527279857177 0.000150066521345650 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 44081718 G/A 1 439 327 766 203.903524142699 175.117420513297 28.7861036294024 A:T:G G A 10 0.535527279857177 0.0389003396731369 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 44268371 T/C 1 13 19 32 6.0381453618567 10.1750183172864 -4.13687295542966 T:C T C 10 0.535527279857177 0.158370597920366 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44267391_44268448:AARS2;ENSG00000124608:ENST00000491573:exon_44268309_44269003:AARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 44269193 C/T 1 9 4 13 4.18025448128541 2.14210911942871 2.0381453618567 T:C C T 10 0.535527279857177 0.282589464001187 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 44270175 C/T 1 11 6 17 5.10919992157105 3.21316367914306 1.89603624242799 T:C C T 10 0.535527279857177 0.467819685510286 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44270128_44270250:AARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 44270189 A/T 1 11 6 17 5.10919992157105 3.21316367914306 1.89603624242799 A:T A T 10 0.535527279857177 0.467819685510286 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44270128_44270250:AARS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 44371714 C/T 1 49 44 93 22.7591632869983 23.5632003137158 -0.804037026717456 T:C C T 10 0.535527279857177 0.917320954223687 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 44387305 T/C 1 22 17 39 10.2183998431421 9.10396375757201 1.1144360855701 T:C T C 10 0.535527279857177 0.750800797672654 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44387186_44387334:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44387186_44387334:CDC5L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 44413463 T/A 1 52 32 84 24.1525814474268 17.1368729554297 7.01570849199713 A:T T A 10 0.535527279857177 0.127358797220055 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44413392_44413604:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44413392_44413604:CDC5L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 46107752 C/G 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 C:G C G 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000001561:ENST00000321037:exon_46107288_46108146:ENPP4;ENSG00000001561:ENST00000371401:exon_46107287_46108146:ENPP4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 49403282 T/C 1 19 13 32 8.82498168271364 6.9618546381433 1.86312704457034 T:C T C 10 0.535527279857177 0.596317945495181 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 49425521 C/T 0 0 10 10 0 5.35527279857177 -5.35527279857177 T C T 10 0.535527279857177 0.000467306817318255 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49425404_49425771:MUT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 52144221 C/T 1 39 47 86 18.1144360855701 25.1697821532873 -7.05534606771722 T:C C T 10 0.535527279857177 0.131379700298173 ENSG00000112118:ENST00000229854:exon_52144159_52144397:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000419835:exon_52144159_52144397:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000340349:exon_52144159_52144397:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000476448:exon_52144159_52144250:MCM3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 56327849 C/T 1 13 13 26 6.0381453618567 6.9618546381433 -0.923709276286601 T:C C T 10 0.535527279857177 0.844640207112493 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56327844_56327954:DST HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 56417282 C/T 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56416982_56418453:DST HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 56463410 T/C 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C T C 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56463274_56463507:DST HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 12 0 12 5.57367264171388 0 5.57367264171388 G G 10 0.535527279857177 0.000657204225867289 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 57246884 A/G 0 10 0 10 4.64472720142823 0 4.64472720142823 A A 10 0.535527279857177 0.00240737050809797 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 57393125 A/G 0 0 12 12 0 6.42632735828612 -6.42632735828612 G A G 10 0.535527279857177 0.000100814393128312 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 57467175 A/G 0 0 14 14 0 7.49738191800048 -7.49738191800048 C:G A G 10 0.535527279857177 2.17491838021015e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57467101_57467206:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57467080_57467206:PRIM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 23 23 0 12.3171274367151 -12.3171274367151 A G A 10 0.535527279857177 2.18818919197333e-08 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 12 12 0 6.42632735828612 -6.42632735828612 G T G 10 0.535527279857177 0.000100814393128312 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 9 0 9 4.18025448128541 0 4.18025448128541 C C 10 0.535527279857177 0.00462881858371194 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 13 13 0 6.9618546381433 -6.9618546381433 C T C 10 0.535527279857177 4.68255354058548e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 74161740 C/T 1 15 17 32 6.96709080214235 9.10396375757201 -2.13687295542966 T:C C T 10 0.535527279857177 0.481995912757542 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74161248_74161982:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74161248_74161999:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74161248_74161999:C6orf150 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 79657391 G/A 1 15 12 27 6.96709080214235 6.42632735828612 0.540763443856222 A:G G A 10 0.535527279857177 0.850128429900867 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79657340_79657492:PHIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 5 12 17 2.32236360071412 6.42632735828612 -4.10396375757201 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0531197569251145 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 25 12 37 11.6118180035706 6.42632735828612 5.18549064528445 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0998693665354762 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 83881740 T/C 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 T:C T C 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83881639_83881778:PGM3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 83905997 G/A 1 4 7 11 1.85789088057129 3.74869095900024 -1.89080007842895 A:G G A 10 0.535527279857177 0.366092140083572 ENSG00000013392:ENST00000369724:exon_83905314_83906256:RWDD2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 89793894 G/C 1 80 62 142 37.1578176114258 33.202691351145 3.95512626028087 C:G G C 10 0.535527279857177 0.55609943013932 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 96034844 C/T 1 5 13 18 2.32236360071412 6.9618546381433 -4.63949103742919 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0333546744685474 ENSG00000172469:ENST00000358812:exon_96034278_96034859:MANEA;ENSG00000172469:ENST00000369293:exon_96034278_96035257:MANEA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 96054262 G/A 1 3 10 13 1.39341816042847 5.35527279857177 -3.9618546381433 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0472708235212517 ENSG00000172469:ENST00000358812:exon_96053624_96057333:MANEA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 62 53 115 28.797308648855 28.3829458324304 0.414362816424649 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 97613163 T/C 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 T:C T C 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000146263:ENST00000275053:exon_97613122_97613333:MMS22L;ENSG00000146263:ENST00000369251:exon_97613122_97613333:MMS22L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 11 8 19 5.10919992157105 4.28421823885742 0.824981682713638 T:C T C 10 0.535527279857177 0.819687245305986 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 99930627 A/G 1 5 27 32 2.32236360071412 14.4592365561438 -12.1368729554297 A:G A G 10 0.535527279857177 1.82333968211521e-05 ENSG00000123552:ENST00000329966:exon_99930137_99930759:USP45;ENSG00000123552:ENST00000472914:exon_99930390_99930759:USP45 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 105776792 G/A 1 13 15 28 6.0381453618567 8.03290919785765 -1.99476383600095 A:G G A 10 0.535527279857177 0.456381948739043 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 105776866 A/C 1 26 17 43 12.0762907237134 9.10396375757201 2.97232696614139 A:C A C 10 0.535527279857177 0.445059224783229 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 106555025 G/A 1 21 18 39 9.75392712299928 9.63949103742918 0.1144360855701 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106554786_106555383:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106554786_106557813:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106554786_106557814:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106554786_106556965:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106554786_106557814:PRDM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 106555347 C/A 1 10 14 24 4.64472720142823 7.49738191800048 -2.85265471657225 A:C C A 10 0.535527279857177 0.306793066047406 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106554786_106555383:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106554786_106557813:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106554786_106557814:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106554786_106556965:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106554786_106557814:PRDM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 107076696 G/A 1 2 8 10 0.928945440285646 4.28421823885742 -3.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0525767166149741 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 107077550 G/A 1 13 9 22 6.0381453618567 4.81974551871459 1.21839984314211 A:G G A 10 0.535527279857177 0.672789147896244 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107077453_107077580:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000467262:exon_107077474_107077580:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107077489_107077580:QRSL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 107103510 G/T 1 10 34 44 4.64472720142823 18.207927515144 -13.5632003137158 T:G G T 10 0.535527279857177 5.07368151698892e-05 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107103490_107103607:QRSL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 109762332 C/T 1 19 19 38 8.82498168271364 10.1750183172864 -1.35003663457272 T:C C T 10 0.535527279857177 0.745641957711129 ENSG00000185250:ENST00000440797:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000521072:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000368958:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109761966_109762374:SMPD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 28 36 64 13.005236163999 19.2789820748584 -6.27374591085932 T:G G T 10 0.535527279857177 0.132561325639626 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 70 13 83 32.5130904099976 6.9618546381433 25.5512357718543 A:T:G G T 10 0.535527279857177 6.10182359316177e-09 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 71 13 84 32.9775631301404 6.9618546381433 26.0157084919971 T:C C T 10 0.535527279857177 3.72953097714146e-09 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 52 24 76 24.1525814474268 12.8526547165722 11.2999267308546 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0109663750643730 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 109775436 T/C 1 9 8 17 4.18025448128541 4.28421823885742 -0.103963757572008 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 13 14 27 6.0381453618567 7.49738191800048 -1.45923655614378 T:C T C 10 0.535527279857177 0.700369496789269 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 51 27 78 23.688108727284 14.4592365561438 9.2288721711402 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0406742893232932 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 110146497 G/A 1 20 13 33 9.28945440285646 6.9618546381433 2.32759976471316 A:G G A 10 0.535527279857177 0.486798516630557 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 111288941 T/C 1 273 227 500 126.801052598991 121.564692527579 5.23636007141153 T:C T C 10 0.535527279857177 0.654059459482311 ENSG00000155115:ENST00000329970:exon_111288713_111289093:GTF3C6;ENSG00000155115:ENST00000480191:exon_111288713_111289093:GTF3C6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 126210395 T/G 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 T:G T G 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000413085:exon_126210118_126211127:NCOA7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 126329602 C/T 1 8 12 20 3.71578176114258 6.42632735828612 -2.71054559714354 T:C C T 10 0.535527279857177 0.265322195681750 ENSG00000066651:ENST00000334379:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000450358:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000368333:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000461129:exon_126329538_126329626:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000479748:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000368332:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000481529:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000468097:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000453993:exon_126329538_126329618:TRMT11;ENSG00000066651:ENST00000466316:exon_126329538_126329618:TRMT11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 133072650 A/G 1 10 9 19 4.64472720142823 4.81974551871459 -0.175018317286362 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 133077063 T/C 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:C T C 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525289:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532053:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000531279:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526157:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526192:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000524919:exon_133077021_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000530536:exon_133077053_133077174:VNN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 1668 761 2429 774.740497198229 407.536259971312 367.204237226917 A:C:G A G 10 0.535527279857177 7.24973888487689e-52 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 10 9 19 4.64472720142823 4.81974551871459 -0.175018317286362 T:C T C 10 0.535527279857177 1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 135606755 C/G 1 8 3 11 3.71578176114258 1.60658183957153 2.10919992157105 C:G C G 10 0.535527279857177 0.23951309450586 ENSG00000135541:ENST00000367800:exon_135604670_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367801:exon_135605110_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000457866:exon_135605124_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000475846:exon_135606034_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000498558:exon_135606323_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367799:exon_135606430_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000527681:exon_135606433_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000265602:exon_135606434_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000487135:exon_135606519_135606785:AHI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 1 189 1 190 87.7853441069935 0.535527279857177 87.2498168271364 T:C T C 10 0.535527279857177 5.11040640416089e-50 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 207 0 207 96.1458530695644 0 96.1458530695644 A A 10 0.535527279857177 7.4892560377429e-57 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 207 0 207 96.1458530695644 0 96.1458530695644 A A 10 0.535527279857177 7.4892560377429e-57 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 103 0 103 47.8406901747108 0 47.8406901747108 G G 10 0.535527279857177 1.29854732388443e-28 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 99 0 99 45.9827992941395 0 45.9827992941395 T T 10 0.535527279857177 1.67457861976957e-27 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 137519127 C/T 1 52 46 98 24.1525814474268 24.6342548734301 -0.481673426003344 T:C C T 10 0.535527279857177 0.919782966445854 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 138734029 A/C 0 50 0 50 23.2236360071412 0 23.2236360071412 A A 10 0.535527279857177 2.87909855555293e-14 ENSG00000051620:ENST00000448741:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000058691:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000367697:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000453452:exon_138734017_138734291:HEBP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 16 17 33 7.43156352228517 9.10396375757201 -1.67240023528684 T:C T C 10 0.535527279857177 0.603164691033159 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 144869785 A/G 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 A:G A G 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000152818:ENST00000367545:exon_144869776_144869990:UTRN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 145051594 G/A 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 A:G G A 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000152818:ENST00000367545:exon_145051493_145051622:UTRN;ENSG00000152818:ENST00000367526:exon_145051493_145051622:UTRN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 150005615 T/C 1 2 7 9 0.928945440285646 3.74869095900024 -2.81974551871459 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0914963800425486 ENSG00000131023:ENST00000253339:exon_150004215_150005728:LATS1;ENSG00000131023:ENST00000441107:exon_150004215_150005728:LATS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 151247439 A/G 1 1 7 8 0.464472720142823 3.74869095900024 -3.28421823885742 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0289107709309061 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 151336739 C/G 1 19 7 26 8.82498168271364 3.74869095900024 5.0762907237134 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0502051990490533 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336652_151336829:MTHFD1L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 151766822 C/A 1 7 14 21 3.25130904099976 7.49738191800048 -4.24607287700072 A:C C A 10 0.535527279857177 0.079455143067082 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 151789868 G/A 1 18 11 29 8.36050896257082 5.89080007842895 2.46970888414187 A:G G A 10 0.535527279857177 0.457199191884996 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 155153492 C/T 1 37 32 69 17.1854906452845 17.1368729554297 0.0486176898547903 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000213079:ENST00000367178:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000367186:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000417268:exon_155153073_155155190:RBM16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 160174456 T/G 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 T:G T G 10 0.535527279857177 0.529514337684375 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 165 163 328 76.6379988235658 87.2909466167199 -10.6529477931541 A:G A G 10 0.535527279857177 0.245310279421293 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 76 137 213 35.2999267308546 73.3672373404332 -38.0673106095787 A:G G A 10 0.535527279857177 1.95477272724112e-07 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 160199687 T/C 1 57 46 103 26.4749450481409 24.6342548734301 1.84069017471077 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.767295353113104 ENSG00000120438:ENST00000321394:exon_160199530_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000392168:exon_160199531_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000420894:exon_160199531_160200293:TCP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 161557662 G/A 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:G G A 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000026652:ENST00000320285:exon_161551057_161557666:AGPAT4;ENSG00000026652:ENST00000457520:exon_161557107_161557666:AGPAT4;ENSG00000026652:ENST00000366911:exon_161557107_161557666:AGPAT4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 166739646 T/C 1 17 32 49 7.89603624242799 17.1368729554297 -9.24083671300167 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00949232269467507 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000494682:exon_166739361_166739655:SFT2D1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 167344583 A/G 1 923 985 1908 428.708320691826 527.494370659319 -98.7860499674936 A:C:G A G 10 0.535527279857177 6.0550688927119e-06 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167344532_167346537:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167344532_167344606:RNASET2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 167352104 C/A 1 4 9 13 1.85789088057129 4.81974551871459 -2.9618546381433 A:C C A 10 0.535527279857177 0.162035560448580 ENSG00000026297:ENST00000358165:exon_167352084_167352496:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000477674:exon_167351486_167352475:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000310843:exon_167352100_167352141:RNASET2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 167550042 C/T 1 9 12 21 4.18025448128541 6.42632735828612 -2.24607287700072 T:C C T 10 0.535527279857177 0.384351839373372 ENSG00000112486:ENST00000400926:exon_167549728_167552629:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000341935:exon_167549728_167553184:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000349984:exon_167549728_167552434:CCR6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 168281191 C/T 1 10 8 18 4.64472720142823 4.28421823885742 0.360508962570814 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000423229:exon_168281161_168281197:MLLT4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 170176647 C/T 1 12 10 22 5.57367264171388 5.35527279857177 0.218399843142107 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 170176648 A/G 1 11 9 20 5.10919992157105 4.81974551871459 0.289454402856461 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 5 9 14 2.32236360071412 4.81974551871459 -2.49738191800048 T:C T C 10 0.535527279857177 0.193244891590877 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 881668 C/T 1 9 1 10 4.18025448128541 0.535527279857177 3.64472720142823 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0246218512642377 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000427969:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450538:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000407944:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457378:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000435699:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000439679:exon_881583_881723:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457598:exon_881583_881672:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000340926:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000403868:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000467483:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000469755:exon_881583_881710:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450881:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000493681:exon_881453_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000477950:exon_881549_881767:SUN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 883105 C/T 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 T:C C T 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000407944:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457378:exon_882978_883273:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000340926:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000403868:exon_882978_883455:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000467483:exon_882978_883471:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000493681:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000477950:exon_882978_883306:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000471349:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000419312:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_883007_883157:SUN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 931960 G/A 1 48 36 84 22.2946905668555 19.2789820748584 3.01570849199714 A:G G A 10 0.535527279857177 0.584691136806107 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_931915_932055:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_931915_932111:GET4;ENSG00000239857:ENST00000464468:exon_931937_932055:GET4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 933595 C/T 1 75 50 125 34.8354540107117 26.7763639928588 8.05909001785288 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.152422233535174 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_933536_933608:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_933536_933608:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_933536_933608:GET4;ENSG00000239857:ENST00000464468:exon_933377_933608:GET4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 1131356 T/C 1 11 9 20 5.10919992157105 4.81974551871459 0.289454402856461 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 1538147 G/A 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 A:G G A 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1538048_1538189:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1538048_1538189:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1538048_1538189:INTS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 2020094 G/A 1 22 19 41 10.2183998431421 10.1750183172864 0.0433815258557448 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2020088_2020176:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2020088_2020176:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2020088_2020176:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2020088_2020176:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2020088_2020176:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2020088_2020176:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_2020088_2020176:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000438959:exon_2020088_2020176:MAD1L1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 90 125 215 41.8025448128541 66.9409099821471 -25.138365169293 T:C T C 10 0.535527279857177 0.000612399579346622 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 32 29 61 14.8631270445703 15.5302911158581 -0.667164071287795 T:C T C 10 0.535527279857177 0.89829159081397 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 2581447 C/T 1 20 16 36 9.28945440285646 8.56843647771483 0.721017925141629 T:C C T 10 0.535527279857177 0.868312064879531 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2581352_2581470:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581352_2581470:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2581352_2581470:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2581352_2581470:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2581352_2581470:C7orf27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 23 12 35 10.6828725632849 6.42632735828612 4.25654520499881 T:C T C 10 0.535527279857177 0.175991512534223 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 2976752 C/T 1 13 8 21 6.0381453618567 4.28421823885742 1.75392712299928 T:C C T 10 0.535527279857177 0.515688372849167 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2976671_2976868:CARD11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 2985586 C/G 1 17 9 26 7.89603624242799 4.81974551871459 3.0762907237134 C:G C G 10 0.535527279857177 0.244678832895932 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2985453_2985590:CARD11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 4794885 G/A 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 A:G G A 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4794868_4795014:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4794868_4795014:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4794868_4795014:KIAA0415 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 4799141 A/T 1 5 8 13 2.32236360071412 4.28421823885742 -1.9618546381433 A:T A T 10 0.535527279857177 0.405380944075703 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4798942_4799226:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4798942_4799226:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000496023:exon_4798942_4799660:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4798942_4799226:KIAA0415 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 5257573 G/A 1 19 13 32 8.82498168271364 6.9618546381433 1.86312704457034 A:G G A 10 0.535527279857177 0.596317945495181 ENSG00000157954:ENST00000288828:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000401525:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000404704:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000466014:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000382384:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000496867:exon_5257553_5257644:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000475309:exon_5256721_5258662:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000484262:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000315176:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000465102:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000480238:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000488359:exon_5257553_5257645:WIPI2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 5270480 C/T 1 120 91 211 55.7367264171388 48.7329824670031 7.00374395013566 T:C C T 10 0.535527279857177 0.369635052946654 ENSG00000157954:ENST00000288828:exon_5270466_5273457:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000401525:exon_5270466_5271155:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000404704:exon_5270466_5270735:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000466014:exon_5270466_5270578:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000382384:exon_5270466_5271101:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000484262:exon_5270466_5270695:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000315176:exon_5270466_5270578:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000471851:exon_5270466_5271354:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000479690:exon_5270466_5270958:WIPI2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 13 11 24 6.0381453618567 5.89080007842895 0.147345283427753 C:G G C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 5643145 T/C 1 230 228 458 106.828725632849 122.100219807436 -15.271494174587 T:C T C 10 0.535527279857177 0.159923998402267 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000444748:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000447103:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000405801:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5643127_5643248:FSCN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 6026942 G/T 1 20 27 47 9.28945440285646 14.4592365561438 -5.16978215328732 T:G G T 10 0.535527279857177 0.144583908962273 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 6026988 G/A 1 31 18 49 14.3986543244275 9.63949103742918 4.75916328699833 A:G G A 10 0.535527279857177 0.198115294417792 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 6043386 G/A 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 A:G G A 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382321:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000413462:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000380416:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000415839:exon_6042941_6043689:PMS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 6063283 C/T 1 118 71 189 54.8077809768531 38.0224368698596 16.7853441069936 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0159172916320340 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6062934_6063465:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6062934_6063326:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6062934_6063378:AIMP2;ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6061881_6064432:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000422786:exon_6062807_6063377:EIF2AK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 6098685 C/T 1 12 8 20 5.57367264171388 4.28421823885742 1.28945440285646 T:C C T 10 0.535527279857177 0.656931290438306 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6098597_6098861:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000431744:exon_6098597_6098795:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000463213:exon_6098597_6098687:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000446699:exon_6098597_6098795:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000461493:exon_6098597_6098806:EIF2AK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 6193521 G/C 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 C:G G C 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193518_6193612:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 6193752 G/A 1 7 12 19 3.25130904099976 6.42632735828612 -3.17501831728636 A:G G A 10 0.535527279857177 0.170306763434808 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 6449496 T/C 1 23 13 36 10.6828725632849 6.9618546381433 3.72101792514163 T:C T C 10 0.535527279857177 0.244104528667508 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6448757_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6448760_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6448761_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6449148_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6449231_6449666:DAGLB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 6449591 A/G 1 18 24 42 8.36050896257082 12.8526547165722 -4.49214575400143 A:G A G 10 0.535527279857177 0.168005416485685 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6448757_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6448760_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6448761_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6449148_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6449231_6449666:DAGLB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 6456347 G/T 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:G G T 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6456299_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000454738:exon_6455890_6456385:DAGLB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 7613039 C/T 1 26 22 48 12.0762907237134 11.7816001568579 0.294690566855506 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7612067_7613400:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7612067_7613400:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000434746:exon_7612067_7613400:MIOS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 8153521 G/A 1 3 14 17 1.39341816042847 7.49738191800048 -6.10396375757201 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00309616556511941 ENSG00000003147:ENST00000402384:exon_8152814_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000406470:exon_8152817_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000265577:exon_8152885_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000396675:exon_8152939_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000339809:exon_8153402_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000455539:exon_8153402_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000401396:exon_8153409_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000404556:exon_8153414_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000422063:exon_8153414_8153674:ICA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 17379110 G/A 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 A:G G A 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000106546:ENST00000242057:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000463496:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000401808:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000492120:exon_17378610_17379151:AHR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 19744417 T/C 1 18 14 32 8.36050896257082 7.49738191800048 0.863127044570338 T:C T C 10 0.535527279857177 0.859946497231876 ENSG00000105849:ENST00000222567:exon_19744402_19744543:TWISTNB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 22999934 C/T 1 6 12 18 2.78683632085694 6.42632735828612 -3.63949103742918 T:C C T 10 0.535527279857177 0.100224935165788 ENSG00000122591:ENST00000432176:exon_22999875_23000034:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000440481:exon_22999875_23000034:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000242158:exon_22999875_23000034:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000409923:exon_22999875_23000034:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000457703:exon_22999875_23000034:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000498833:exon_22999875_23000034:FAM126A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 23221870 T/C 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 T:C T C 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23221460_23222108:NUPL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 23240268 A/T 1 68 52 120 31.584144969712 27.8474185525732 3.73672641713877 A:T A T 10 0.535527279857177 0.522532032399323 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23239787_23240628:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23239787_23240574:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23239787_23240625:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23239787_23240324:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23239787_23240586:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23239787_23240630:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000489145:exon_23239787_23240443:NUPL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 30544346 T/G 1 56 42 98 26.0104723279981 22.4921457540014 3.51832657399666 T:G T G 10 0.535527279857177 0.543650058382089 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 45 61 106 20.901272406427 32.6671640712878 -11.7658916648608 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0248336038645349 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 30634661 C/G 1 132 103 235 61.3103990588526 55.1593098252892 6.15108923356341 C:G C G 10 0.535527279857177 0.43320324495409 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 30915262 C/T 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 T:C C T 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000254959:ENST00000458257:exon_30915110_30915271:RP4-740D2.1;ENSG00000240583:ENST00000434909:exon_30915110_30915271:AQP1;ENSG00000106125:ENST00000265299:exon_30915110_30915271:FAM188B;ENSG00000106125:ENST00000409881:exon_30915110_30915271:FAM188B;ENSG00000250424:ENST00000509504:exon_30915110_30915271:RP5-877J2.1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 32613020 A/G 1 17 25 42 7.89603624242799 13.3881819964294 -5.49214575400143 A:G A G 10 0.535527279857177 0.120826780230311 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32612811_32613030:AVL9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 32908945 T/C 1 11 17 28 5.10919992157105 9.10396375757201 -3.99476383600096 T:C T C 10 0.535527279857177 0.134938635465867 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 35709842 C/T 1 8 5 13 3.71578176114258 2.67763639928588 1.0381453618567 T:C C T 10 0.535527279857177 0.593586480755975 ENSG00000122557:ENST00000396081:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000311350:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000413517:exon_35709825_35709938:HERPUD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 36459076 G/A 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 A:G G A 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36458853_36459088:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36458853_36459088:ANLN HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 36895342 C/T 1 85 76 161 39.48018121214 40.7000732691454 -1.21989205700549 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.87459463713265 ENSG00000155849:ENST00000341056:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396042:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_36893966_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396045:exon_36893966_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396040:exon_36894067_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_36894600_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_36894896_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000497024:exon_36894972_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000487843:exon_36895103_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_36895128_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_36895156_36895356:ELMO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 38393403 G/A 1 8 5 13 3.71578176114258 2.67763639928588 1.0381453618567 A:G G A 10 0.535527279857177 0.593586480755975 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 421 385 806 195.543015180128 206.178002745013 -10.6349875648846 A:G G A 10 0.535527279857177 0.45849564415698 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 64 102 166 29.7262540891407 54.6237825454321 -24.8975284562914 T:C T C 10 0.535527279857177 0.000124625657706435 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 43830888 T/C 1 57 63 120 26.4749450481409 33.7382186310021 -7.26327358286123 T:C T C 10 0.535527279857177 0.200263421101536 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43830848_43831446:BLVRA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 43843423 G/A 1 88 75 163 40.8735993725684 40.1645459892883 0.709053383280157 A:G G A 10 0.535527279857177 0.93752388750571 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000486984:exon_43843275_43843434:BLVRA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 139 145 284 64.5617080998524 77.6514555792907 -13.0897474794383 A:G A G 10 0.535527279857177 0.122203318579591 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 44608785 G/A 1 58 61 119 26.9394177682837 32.6671640712878 -5.72774630300406 A:G G A 10 0.535527279857177 0.312545664350964 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000448192:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44608729_44608802:DDX56 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 44685048 A/G 1 11 17 28 5.10919992157105 9.10396375757201 -3.99476383600096 A:G A G 10 0.535527279857177 0.134938635465867 ENSG00000105953:ENST00000443864:exon_44684926_44685117:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44684926_44685117:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44684926_44685117:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000419661:exon_44684926_44685117:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44684926_44685117:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44684926_44685117:OGDH HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 44836314 A/G 1 28 25 53 13.005236163999 13.3881819964294 -0.382945832430378 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 14 10 24 6.50261808199952 5.35527279857177 1.14734528342775 A:G G A 10 0.535527279857177 0.686885042146951 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 45077978 G/A 1 43 37 80 19.9723269661414 19.8145093547155 0.157817611425845 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45077852_45078025:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45077852_45078025:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000478582:exon_45077852_45078025:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45077852_45078025:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000478169:exon_45077852_45078025:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45077852_45078025:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45077852_45078025:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000480658:exon_45077852_45078025:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000492883:exon_45077852_45078025:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45077852_45078025:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000472223:exon_45077852_45078025:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000476594:exon_45077860_45078025:CCM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 55433880 G/C 1 6 8 14 2.78683632085694 4.28421823885742 -1.49738191800048 C:G G C 10 0.535527279857177 0.437064527654044 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55433141_55433922:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55433815_55433922:LANCL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 219 202 421 101.719525711278 108.17651053115 -6.45698481987149 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.557706350091194 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 64152353 A/G 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:G A G 10 0.535527279857177 0.517677205697999 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 64168806 T/C 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 T:C T C 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 64292354 G/A 1 2 7 9 0.928945440285646 3.74869095900024 -2.81974551871459 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0914963800425486 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 64389089 A/C 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:C A C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000198039:ENST00000527278:exon_64388032_64389502:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000476120:exon_64388032_64389635:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000319636:exon_64388032_64389416:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000395375:exon_64388032_64391344:ZNF273 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 64451558 G/A 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 A:G G A 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000213462:ENST00000394323:exon_64451187_64453792:ERV3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 64864607 G/A 1 11 23 34 5.10919992157105 12.3171274367151 -7.20792751514402 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0154721466561132 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 65551762 C/A 1 12 11 23 5.57367264171388 5.89080007842895 -0.31712743671507 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000126522:ENST00000304874:exon_65551731_65551808:ASL;ENSG00000126522:ENST00000487982:exon_65551731_65552147:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395332:exon_65551731_65551808:ASL;ENSG00000126522:ENST00000362000:exon_65551731_65551808:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395331:exon_65551731_65551808:ASL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 66774604 G/C 1 15 22 37 6.96709080214235 11.7816001568579 -4.81450935471555 C:G G C 10 0.535527279857177 0.137567453167498 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 72300332 G/A 1 19 6 25 8.82498168271364 3.21316367914306 5.61181800357058 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0270430361782817 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 73249165 T/A 1 7 1 8 3.25130904099976 0.535527279857177 2.71578176114258 A:T T A 10 0.535527279857177 0.0758484261005442 ENSG00000165171:ENST00000297873:exon_73248920_73249332:WBSCR27;ENSG00000165171:ENST00000434654:exon_73248926_73249332:WBSCR27 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 73753250 T/C 1 7 6 13 3.25130904099976 3.21316367914306 0.0381453618566998 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 75614953 T/C 1 39 26 65 18.1144360855701 13.9237092762866 4.1907268092835 T:C T C 10 0.535527279857177 0.321499086328009 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 75615287 G/A 1 34 50 84 15.792072484856 26.7763639928588 -10.9842915080029 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0210531246481234 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75615241_75615386:POR HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 59 26 85 27.4038904884266 13.9237092762866 13.48018121214 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.00323774303345833 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 75634687 G/A 1 52 41 93 24.1525814474268 21.9566184741443 2.19596297328254 A:G G A 10 0.535527279857177 0.67850149883522 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75634577_75634722:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75634577_75634722:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75634577_75634722:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75634577_75634722:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75634577_75634722:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000430497:exon_75634577_75634722:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75634577_75634722:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75634577_75634722:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000454618:exon_75634577_75634722:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000492053:exon_75634577_75634726:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75634577_75634722:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75634577_75634722:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75634577_75634722:STYXL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 19 20 39 8.82498168271364 10.7105455971435 -1.8855639144299 T:C T C 10 0.535527279857177 0.630776619558793 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 76111994 C/G 1 31 29 60 14.3986543244275 15.5302911158581 -1.13163679143062 C:G C G 10 0.535527279857177 0.79674171013507 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 28 22 50 13.005236163999 11.7816001568579 1.22363600714115 T:C C T 10 0.535527279857177 0.77791766634817 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 76131695 A/G 1 26 9 35 12.0762907237134 4.81974551871459 7.25654520499881 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0166740512552257 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000434948:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000467729:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000435251:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000479915:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000468546:exon_76131206_76131773:DTX2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 77256713 A/G 1 39 39 78 18.1144360855701 20.8855639144299 -2.7711278288598 A:G A G 10 0.535527279857177 0.570985193936515 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77256473_77256992:PTPN12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 89984515 A/C 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 A:C A C 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000474503:exon_89984400_89984544:GTPBP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 90014408 G/A 1 27 36 63 12.5407634438562 19.2789820748584 -6.73821863100215 A:G G A 10 0.535527279857177 0.100539783358474 ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90014206_90015204:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90014206_90020769:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90014206_90020327:GTPBP10;ENSG00000157224:ENST00000422604:exon_90014206_90014552:CLDN12;ENSG00000157224:ENST00000416322:exon_90014206_90014552:CLDN12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 56 49 105 26.0104723279981 26.2408367130017 -0.230364385003579 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 91691601 C/T 1 11 6 17 5.10919992157105 3.21316367914306 1.89603624242799 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.467819685510286 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 91712698 A/G 1 20 9 29 9.28945440285646 4.81974551871459 4.46970888414187 A:G A G 10 0.535527279857177 0.135055070958431 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91712484_91713009:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91712484_91712969:AKAP9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 91713972 C/T 1 14 12 26 6.50261808199952 6.42632735828612 0.0762907237133996 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 91715662 C/T 1 10 16 26 4.64472720142823 8.56843647771483 -3.9237092762866 T:C C T 10 0.535527279857177 0.167638781651660 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91715542_91715730:AKAP9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 26 20 46 12.0762907237134 10.7105455971435 1.36574512656986 A:C A C 10 0.535527279857177 0.76816771206416 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 51 41 92 23.688108727284 21.9566184741443 1.73149025313972 A:G A G 10 0.535527279857177 0.754519635887886 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 14 14 28 6.50261808199952 7.49738191800048 -0.994763836000955 T:C T C 10 0.535527279857177 0.709830757062613 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 92027537 C/G 1 11 19 30 5.10919992157105 10.1750183172864 -5.06581839571531 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0689406884761131 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 92028005 C/G 1 23 24 47 10.6828725632849 12.8526547165722 -2.16978215328732 C:G C G 10 0.535527279857177 0.560532078191251 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 92244422 C/T 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:C C T 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000105810:ENST00000265734:exon_92234235_92244600:CDK6;ENSG00000105810:ENST00000467166:exon_92244028_92244600:CDK6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 93551428 C/T 1 7 14 21 3.25130904099976 7.49738191800048 -4.24607287700072 T:C C T 10 0.535527279857177 0.079455143067082 ENSG00000127920:ENST00000248564:exon_93551011_93551545:GNG11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 97488569 A/T 1 93 102 195 43.1959629732825 54.6237825454321 -11.4278195721495 A:T A T 10 0.535527279857177 0.114014693163064 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000442734:exon_97488554_97488710:ASNS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 98984399 C/T 1 549 464 1013 254.99552335841 248.48465785373 6.51086550467974 T:C C T 10 0.535527279857177 0.705460700697914 ENSG00000241685:ENST00000441989:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000432884:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000508211:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000130429:ENST00000443222:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000414376:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000252725:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484600:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000455009:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484375:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000418347:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000417330:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000431816:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000427217:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000458033:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451682:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451694:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000474880:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000445924:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000432343:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000493403:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000461486:exon_98984375_98984437:ARPC1B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 99032593 G/T 1 8 7 15 3.71578176114258 3.74869095900024 -0.0329091978576543 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000485746:exon_99032413_99032642:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430982:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430029:exon_99032433_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000419981:exon_99032548_99032891:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99032413_99032891:RP5-900K19.1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 99047978 T/C 1 15 18 33 6.96709080214235 9.63949103742918 -2.67240023528684 T:C T C 10 0.535527279857177 0.385781280718001 ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99047948_99047994:CPSF4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 99081730 A/G 1 8 9 17 3.71578176114258 4.81974551871459 -1.10396375757201 A:G A G 10 0.535527279857177 0.633274593383561 ENSG00000198556:ENST00000331410:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481472:exon_99081653_99081769:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000448667:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000447047:exon_99081653_99081787:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481108:exon_99081278_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000494186:exon_99081653_99081766:ZNF789 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 99702947 G/A 1 6 11 17 2.78683632085694 5.89080007842895 -3.10396375757201 A:G G A 10 0.535527279857177 0.149487157554358 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000438383:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000445208:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000439416:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000446007:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000421755:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000463195:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000422582:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000479916:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000450807:exon_99702880_99702969:AP4M1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 100033416 G/A 1 16 10 26 7.43156352228517 5.35527279857177 2.0762907237134 A:G G A 10 0.535527279857177 0.439359348031197 ENSG00000160813:ENST00000470295:exon_100033254_100033759:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000491407:exon_100033254_100033687:C7orf47 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 100160264 T/C 1 13 13 26 6.0381453618567 6.9618546381433 -0.923709276286601 T:C T C 10 0.535527279857177 0.844640207112493 ENSG00000106351:ENST00000430857:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000300176:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000262935:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000474713:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000429987:exon_100160217_100160305:AGFG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 100172858 C/T 0 20 0 20 9.28945440285646 0 9.28945440285646 C C 10 0.535527279857177 3.98222278579391e-06 ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100170920_100173405:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100172283_100172927:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100172283_100172927:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100172283_100172927:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100172283_100172927:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000476881:exon_100172332_100172927:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100172686_100172927:LRCH4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 100176362 C/T 1 63 50 113 29.2617813689979 26.7763639928588 2.485417376139 T:C C T 10 0.535527279857177 0.706181300386195 ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100176273_100176409:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100175445_100178496:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100176273_100176409:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100176273_100176409:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100176273_100176409:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000487697:exon_100176273_100176362:LRCH4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 100458795 T/C 1 8 6 14 3.71578176114258 3.21316367914306 0.502618081999523 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000146828:ENST00000448342:exon_100458634_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000418037:exon_100458760_100458802:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000416675:exon_100458760_100458852:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100457772_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100456358_100459206:SLC12A9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 100468284 A/G 1 40 38 78 18.5789088057129 20.3500366345727 -1.7711278288598 A:G A G 10 0.535527279857177 0.733936156082718 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 100482026 T/C 1 125 136 261 58.0590900178529 72.8317100605761 -14.7726200427232 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0718331229024145 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 100486035 C/A 1 39 24 63 18.1144360855701 12.8526547165722 5.26178136899785 A:C C A 10 0.535527279857177 0.207142696872864 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 100486110 C/T 1 249 222 471 115.653707315563 118.887056128293 -3.23334881273034 T:C C T 10 0.535527279857177 0.781735579379995 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000448764:exon_100486095_100486277:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000342198:exon_100486095_100486120:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000445337:exon_100486095_100486281:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000477529:exon_100486095_100486285:SRRT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 100486656 T/G 1 6 4 10 2.78683632085694 2.14210911942871 0.644727201428231 T:G T G 10 0.535527279857177 0.760056166562883 ENSG00000176125:ENST00000388761:exon_100486346_100487339:UFSP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 100488658 G/C 1 14 11 25 6.50261808199952 5.89080007842895 0.611818003570576 C:G G C 10 0.535527279857177 0.84378896045112 ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100487616_100488709:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100488337_100488709:ACHE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 100490077 G/A 1 11 2 13 5.10919992157105 1.07105455971435 4.0381453618567 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0267444160327934 ENSG00000087085:ENST00000241069:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000419336:exon_100489955_100490175:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000428317:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000447483:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000412389:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000357451:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000442452:exon_100489955_100490264:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000422451:exon_100489955_100490439:ACHE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 100490797 G/T 1 15 6 21 6.96709080214235 3.21316367914306 3.75392712299928 T:G G T 10 0.535527279857177 0.126013436776309 ENSG00000087085:ENST00000241069:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000419336:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000428317:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000447483:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000412389:exon_100490786_100492009:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000357451:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000426415:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000454485:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000440755:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000430554:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000442452:exon_100490786_100491525:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100490786_100491876:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000422451:exon_100490786_100491873:ACHE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 101837149 G/A 1 8 5 13 3.71578176114258 2.67763639928588 1.0381453618567 A:G G A 10 0.535527279857177 0.593586480755975 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000360264:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000425244:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000393824:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000338990:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000292535:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000412016:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000415720:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000436903:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000431850:exon_101837122_101837170:CUX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 101917521 G/A 1 11 7 18 5.10919992157105 3.74869095900024 1.36050896257081 A:G G A 10 0.535527279857177 0.638900023085703 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101917445_101917581:CUX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 102036877 T/G 1 7 13 20 3.25130904099976 6.9618546381433 -3.71054559714354 T:G T G 10 0.535527279857177 0.117313042346182 ENSG00000128563:ENST00000496391:exon_102036424_102036984:PRKRIP1;ENSG00000128563:ENST00000397912:exon_102036810_102036984:PRKRIP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 107002504 T/C 1 7 9 16 3.25130904099976 4.81974551871459 -1.56843647771483 T:C T C 10 0.535527279857177 0.462143040312805 ENSG00000164597:ENST00000347053:exon_107002478_107002555:COG5;ENSG00000164597:ENST00000297135:exon_107002478_107002555:COG5;ENSG00000164597:ENST00000393603:exon_107002478_107002555:COG5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 107002806 A/G 1 4 9 13 1.85789088057129 4.81974551871459 -2.9618546381433 A:G A G 10 0.535527279857177 0.162035560448580 ENSG00000164597:ENST00000347053:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000297135:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000393603:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000484237:exon_107002753_107002865:COG5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 107217020 G/A 1 15 22 37 6.96709080214235 11.7816001568579 -4.81450935471555 A:G G A 10 0.535527279857177 0.137567453167498 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107216854_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000471763:exon_107216811_107217636:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107216811_107217037:DUS4L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 24 21 45 11.1473452834278 11.2460728770007 -0.0987275935729617 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 107559722 A/T 1 63 46 109 29.2617813689979 24.6342548734301 4.62752649556771 A:T A T 10 0.535527279857177 0.388941547030833 ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107559639_107560360:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107559639_107560038:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107559639_107559828:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107559639_107560158:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107559639_107560100:DLD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 107569517 A/G 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 A:G A G 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000091136:ENST00000472714:exon_107569509_107570422:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000393561:exon_107569509_107569650:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000412968:exon_107569509_107569650:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000222399:exon_107569509_107569650:LAMB1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 111981007 G/A 1 25 25 50 11.6118180035706 13.3881819964294 -1.77636399285885 A:G G A 10 0.535527279857177 0.671460015084407 ENSG00000198839:ENST00000361822:exon_111980927_111981101:ZNF277;ENSG00000198839:ENST00000361946:exon_111980927_111981101:ZNF277 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 43 56 99 19.9723269661414 29.9895276720019 -10.0172007058605 C:G G C 10 0.535527279857177 0.0443920065827979 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 10 12 22 4.64472720142823 6.42632735828612 -1.78160015685789 A:G G A 10 0.535527279857177 0.523672568666477 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 127224286 A/G 1 5 10 15 2.32236360071412 5.35527279857177 -3.03290919785765 A:G A G 10 0.535527279857177 0.128132638231981 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127224205_127225661:GCC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 127721507 T/C 1 126 135 261 58.5235627379957 72.2961827807189 -13.7726200427232 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0937730817953083 ENSG00000197157:ENST00000438400:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000354725:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000486037:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000470463:exon_127721412_127721553:SND1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 128038555 C/G 1 15 12 27 6.96709080214235 6.42632735828612 0.540763443856222 C:G C G 10 0.535527279857177 0.850128429900867 ENSG00000106348:ENST00000469328:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000484496:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000419067:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000338791:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000496200:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000354269:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000348127:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000378717:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000416064:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000343214:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000470772:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000480861:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000497868:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000468842:exon_128038544_128038667:IMPDH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 128409225 A/G 1 13 13 26 6.0381453618567 6.9618546381433 -0.923709276286601 A:G A G 10 0.535527279857177 0.844640207112493 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128409117_128411528:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128409117_128409990:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000493278:exon_128409117_128409250:CALU HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 128587524 C/T 1 90 89 179 41.8025448128541 47.6619279072887 -5.85938309443468 T:C C T 10 0.535527279857177 0.40992442431993 ENSG00000128604:ENST00000357234:exon_128587284_128587589:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000342930:exon_128587391_128587589:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000419641:exon_128587391_128587589:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000430204:exon_128587332_128587589:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000461416:exon_128587077_128587589:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000402030:exon_128587332_128587589:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000249375:exon_128587332_128587589:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473745:exon_128587332_128587589:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000412326:exon_128587391_128587589:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000465603:exon_128587332_128587589:IRF5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 129297332 T/G 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 T:G T G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000106459:ENST00000353868:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393232:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393231:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000454688:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000223190:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000311967:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393230:exon_129297183_129297414:NRF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 129664304 C/T 1 15 15 30 6.96709080214235 8.03290919785765 -1.06581839571531 T:C C T 10 0.535527279857177 0.717832749087862 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 11 16 27 5.10919992157105 8.56843647771483 -3.45923655614378 T:C T C 10 0.535527279857177 0.246559677217583 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 131084035 A/G 1 11 4 15 5.10919992157105 2.14210911942871 2.96709080214235 A:G A G 10 0.535527279857177 0.194136764216528 ENSG00000128585:ENST00000421797:exon_131084000_131084192:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000416992:exon_131084000_131084143:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000429546:exon_131083997_131084116:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000446815:exon_131084000_131084056:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000494286:exon_131084000_131084192:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000352689:exon_131084000_131084192:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000388758:exon_131084000_131084192:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000494785:exon_131084000_131084192:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000458153:exon_131083997_131084192:MKLN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 131128450 T/C 1 15 17 32 6.96709080214235 9.10396375757201 -2.13687295542966 T:C T C 10 0.535527279857177 0.481995912757542 ENSG00000128585:ENST00000421797:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000352689:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000388758:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000494785:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000458153:exon_131128240_131128461:MKLN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 133580447 G/A 1 12 6 18 5.57367264171388 3.21316367914306 2.36050896257082 A:G G A 10 0.535527279857177 0.346375041233422 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000469115:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000482089:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000460346:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000472020:exon_133580352_133580488:EXOC4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 133749164 G/A 1 18 22 40 8.36050896257082 11.7816001568579 -3.42109119428708 A:G G A 10 0.535527279857177 0.341735714745905 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 134143836 C/T 1 9 8 17 4.18025448128541 4.28421823885742 -0.103963757572008 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000085662:ENST00000285930:exon_134143749_134143894:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000434222:exon_134143749_134143854:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000465351:exon_134143749_134143854:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000458165:exon_134143749_134143888:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000489022:exon_134143749_134143881:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000484592:exon_134143749_134143882:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000426422:exon_134143749_134143850:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000462784:exon_134143749_134143886:AKR1B1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 134849280 T/A 1 46 30 76 21.3657451265699 16.0658183957153 5.29992673085455 A:T:C T A 10 0.535527279857177 0.250584572120276 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 134851390 T/C 1 50 47 97 23.2236360071412 25.1697821532873 -1.94614614614617 T:C T C 10 0.535527279857177 0.760261820698474 ENSG00000122783:ENST00000435834:exon_134850005_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000450949:exon_134850534_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000413261:exon_134850534_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000422189:exon_134850534_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000424142:exon_134850537_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000393114:exon_134850537_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000430372:exon_134850581_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000481410:exon_134851096_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000483029:exon_134851312_134851565:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000472428:exon_134851327_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000477820:exon_134851352_134851623:C7orf49 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 134878064 T/C 1 29 48 77 13.4697088841419 25.7053094331445 -12.2356005490026 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.00587710363722577 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000497853:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000462707:exon_134877983_134878310:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134877967_134878229:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000474411:exon_134877967_134878151:WDR91 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 137590543 G/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000182158:ENST00000330387:exon_137590448_137590594:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000456390:exon_137590448_137590594:CREB3L2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 139026152 T/G 1 46 38 84 21.3657451265699 20.3500366345727 1.01570849199713 A:T:G T G 10 0.535527279857177 0.912982373264668 ENSG00000164898:ENST00000297534:exon_139025878_139026268:C7orf55 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 139102490 A/G 1 12 9 21 5.57367264171388 4.81974551871459 0.753927122999285 A:G A G 10 0.535527279857177 0.828752253980847 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 139757712 C/A 1 14 19 33 6.50261808199952 10.1750183172864 -3.67240023528684 A:C C A 10 0.535527279857177 0.223967864022598 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139757699_139757834:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139757699_139757834:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000467638:exon_139757699_139757834:PARP12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 140373326 A/G 1 13 4 17 6.0381453618567 2.14210911942871 3.89603624242799 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0861246695829819 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140372953_140374063:ADCK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 140374049 T/C 1 5 15 20 2.32236360071412 8.03290919785765 -5.71054559714354 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0126166881050140 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000483369:exon_140373619_140374063:ADCK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 142495126 G/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G G A 10 0.535527279857177 1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 142495127 G/T 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:G G T 10 0.535527279857177 1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 1 37 27 64 17.1854906452845 14.4592365561438 2.72625408914067 A:G G A 10 0.535527279857177 0.532446928347297 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 46 33 79 21.3657451265699 17.6724002352868 3.69334489128302 T:C T C 10 0.535527279857177 0.431277807000955 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 142997069 G/A 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000106144:ENST00000310447:exon_142997016_142997144:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000392923:exon_142997016_142997144:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000350623:exon_142997016_142997144:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000493642:exon_142997016_142997144:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000472067:exon_142997016_142997144:CASP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 143884103 G/A 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 A:G G A 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000213214:ENST00000378115:exon_143883176_143885488:ARHGEF35 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 148700849 C/T 1 160 284 444 74.3156352228517 152.089747479438 -77.7741122565866 T:C:G C T 10 0.535527279857177 1.37296415917240e-13 ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148700154_148701301:PDIA4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 149152828 G/C 1 14 14 28 6.50261808199952 7.49738191800048 -0.994763836000955 C:G G C 10 0.535527279857177 0.709830757062613 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 149152860 G/A 1 17 17 34 7.89603624242799 9.10396375757201 -1.20792751514402 A:G G A 10 0.535527279857177 0.732510166657819 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 149152906 G/A 1 15 8 23 6.96709080214235 4.28421823885742 2.68287256328493 A:G G A 10 0.535527279857177 0.300673562790689 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 150217248 A/G 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 A:G A G 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 150324976 T/C 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 T:C T C 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 150325177 C/T 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C C T 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 35 34 69 16.2565452049988 18.207927515144 -1.95138231014521 C:G G C 10 0.535527279857177 0.717583350522665 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 10 7 17 4.64472720142823 3.74869095900024 0.896036242427992 T:C C T 10 0.535527279857177 0.809233970242324 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 150439554 G/A 1 13 7 20 6.0381453618567 3.74869095900024 2.28945440285646 A:G G A 10 0.535527279857177 0.373042117571353 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 18 3 21 8.36050896257082 1.60658183957153 6.75392712299928 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00341661378450199 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 150733025 T/A 1 5 9 14 2.32236360071412 4.81974551871459 -2.49738191800048 A:T T A 10 0.535527279857177 0.193244891590877 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150732668_150733257:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000491920:exon_150732969_150733054:ABCB8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 150761314 G/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000488420:exon_150761289_150761448:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761289_150761454:SLC4A2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 150761680 C/A 1 8 7 15 3.71578176114258 3.74869095900024 -0.0329091978576543 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761613_150761831:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761613_150761778:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761613_150761847:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761613_150761854:SLC4A2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 150774836 G/A 1 43 60 103 19.9723269661414 32.1316367914306 -12.1593098252892 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0176269977953070 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150774708_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150774708_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150774397_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150774708_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150774708_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150774708_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150774708_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150774708_150775179:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150774000_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150774708_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150774708_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150774000_150775179:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000478477:exon_150774786_150775179:FASTK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 150921950 A/G 1 27 36 63 12.5407634438562 19.2789820748584 -6.73821863100215 A:G A G 10 0.535527279857177 0.100539783358474 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000468073:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000441774:exon_150921862_150922074:ABCF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 151873853 C/T 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:C C T 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151873276_151875053:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151873276_151875095:MLL3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 155534687 C/T 1 10 9 19 4.64472720142823 4.81974551871459 -0.175018317286362 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000184863:ENST00000401878:exon_155534513_155534800:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000307403:exon_155534513_155534800:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000392761:exon_155534513_155534800:RBM33 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 158449304 C/T 1 20 20 40 9.28945440285646 10.7105455971435 -1.42109119428708 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.751703119483862 ENSG00000146918:ENST00000432615:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000275830:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000356309:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409423:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000441982:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000467785:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409339:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000449727:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000474940:exon_158449294_158449397:NCAPG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 158476043 G/A 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000146918:ENST00000432615:exon_158475992_158476078:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000275830:exon_158475992_158476078:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000356309:exon_158475992_158476078:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409423:exon_158475992_158476078:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000441982:exon_158475992_158476078:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000467785:exon_158475992_158476078:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409339:exon_158475992_158476078:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000449727:exon_158475992_158476078:NCAPG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 158528254 G/A 1 28 14 42 13.005236163999 7.49738191800048 5.50785424599857 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0913651691347858 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 158528269 C/G 1 23 13 36 10.6828725632849 6.9618546381433 3.72101792514163 C:G C G 10 0.535527279857177 0.244104528667508 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 158534372 G/A 1 18 21 39 8.36050896257082 11.2460728770007 -2.8855639144299 A:G G A 10 0.535527279857177 0.422707679943069 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 158534381 G/C 1 22 22 44 10.2183998431421 11.7816001568579 -1.56320031371579 C:G G C 10 0.535527279857177 0.653133596031045 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 158536267 T/C 1 22 13 35 10.2183998431421 6.9618546381433 3.25654520499881 T:C T C 10 0.535527279857177 0.311221891782477 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 158536345 A/G 1 24 13 37 11.1473452834278 6.9618546381433 4.18549064528445 A:G A G 10 0.535527279857177 0.189208139895819 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 158552234 G/A 1 14 12 26 6.50261808199952 6.42632735828612 0.0762907237133996 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158552177_158552272:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158552177_158552272:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158552177_158552272:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158552177_158552272:ESYT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 158555848 C/T 1 15 11 26 6.96709080214235 5.89080007842895 1.0762907237134 T:C C T 10 0.535527279857177 0.69952867420128 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158555774_158555856:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158555774_158555856:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158555774_158555856:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158555774_158555856:ESYT2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 7 158672515 G/T 1 17 12 29 7.89603624242799 6.42632735828612 1.46970888414187 T:G G T 10 0.535527279857177 0.710434552275237 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 381344 C/G 1 8 16 24 3.71578176114258 8.56843647771483 -4.85265471657225 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0637278949628729 ENSG00000147364:ENST00000518240:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000524125:exon_381341_381444:FBXO25 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 6272399 G/T 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 T:G G T 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6272286_6272404:MCPH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 6296550 G/T 1 9 11 20 4.18025448128541 5.89080007842895 -1.71054559714354 T:G G T 10 0.535527279857177 0.505111632691192 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6296474_6296617:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6296474_6296617:MCPH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 6302154 G/T 1 20 15 35 9.28945440285646 8.03290919785765 1.25654520499881 T:G G T 10 0.535527279857177 0.736332608702484 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 6338306 C/A 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 A:C C A 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6338235_6338397:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6338235_6338397:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6338235_6338397:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6338235_6338397:MCPH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 9 8 17 4.18025448128541 4.28421823885742 -0.103963757572008 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 6590126 A/G 1 13 15 28 6.0381453618567 8.03290919785765 -1.99476383600095 A:G A G 10 0.535527279857177 0.456381948739043 ENSG00000155189:ENST00000285518:exon_6590082_6590171:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000523234:exon_6590082_6590171:AGPAT5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 8869199 T/G 1 9 8 17 4.18025448128541 4.28421823885742 -0.103963757572008 T:G T G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000104626:ENST00000523898:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000250263:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000519292:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000520684:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000520332:exon_8869173_8869262:ERI1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 10623138 T/A 1 105 101 206 48.7696356149964 54.0882552655749 -5.31861965057846 A:T T A 10 0.535527279857177 0.485050925851173 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 11414237 T/C 1 51 58 109 23.688108727284 31.0605822317163 -7.37247350443229 T:C T C 10 0.535527279857177 0.178661789398949 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000526778:exon_11414167_11414297:BLK;ENSG00000136573:ENST00000525206:exon_11414166_11414346:BLK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 11640784 A/G 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 A:G A G 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528113:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11640121_11640908:NEIL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 11643459 C/T 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 T:C C T 10 0.535527279857177 0.732042892054444 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 11643803 C/T 1 23 17 40 10.6828725632849 9.10396375757201 1.57890880571292 T:C C T 10 0.535527279857177 0.638402562878541 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 11660362 T/C 1 188 142 330 87.3208713868507 76.0448737397191 11.2759976471316 T:C T C 10 0.535527279857177 0.224805958329138 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11660268_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11660120_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11660152_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11660248_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11660255_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11660275_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525571:exon_11660277_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000527045:exon_11660293_11660440:FDFT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 11704617 T/G 1 11 11 22 5.10919992157105 5.89080007842895 -0.781600156857893 T:G T G 10 0.535527279857177 0.831868960719931 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000420692:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526481:exon_11704615_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530624:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11704602_11704677:CTSB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 17796382 A/G 1 10 8 18 4.64472720142823 4.28421823885742 0.360508962570814 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 17796383 C/T 1 10 8 18 4.64472720142823 4.28421823885742 0.360508962570814 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 17814915 A/G 1 9 5 14 4.18025448128541 2.67763639928588 1.50261808199952 A:G A G 10 0.535527279857177 0.593847726273405 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17814773_17814930:PCM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 17819572 C/T 1 38 29 67 17.6499633654273 15.5302911158581 2.11967224956914 T:C C T 10 0.535527279857177 0.626278025644802 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17819543_17819722:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17819543_17819683:PCM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 26 43 69 12.0762907237134 23.0276730338586 -10.9513823101452 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0107361642994978 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 23 19 42 10.6828725632849 10.1750183172864 0.507854245998567 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 21955116 C/T 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 T:C C T 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000158863:ENST00000427751:exon_21955027_21955131:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000450006:exon_21955027_21955131:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000289921:exon_21955027_21955131:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000464226:exon_21955077_21955350:FAM160B2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 11 12 23 5.10919992157105 6.42632735828612 -1.31712743671507 T:C T C 10 0.535527279857177 0.677416798105031 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 21997738 A/T 1 13 12 25 6.0381453618567 6.42632735828612 -0.388181996429424 A:T A T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000168476:ENST00000334530:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000306306:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000523293:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000518664:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000519074:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000519875:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000521744:exon_21997719_21997761:REEP4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 22442661 A/G 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 A:G A G 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000120913:ENST00000456545:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000308354:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000397760:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000339162:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000381194:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000452226:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000397761:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000436754:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000426493:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000429812:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000409141:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000265810:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000409417:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000416159:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000448520:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000491330:exon_22442530_22442675:PDLIM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 22481483 T/C 1 26 33 59 12.0762907237134 17.6724002352868 -5.59610951157344 T:C T C 10 0.535527279857177 0.152614377177027 ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520489:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000399977:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519863:exon_22481428_22481562:BIN3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 22548790 G/T 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 T:G G T 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000179388:ENST00000317216:exon_22545172_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000522910:exon_22547556_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000519492:exon_22547937_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000524088:exon_22547985_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000518773:exon_22548678_22548995:EGR3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 22864475 G/A 1 5 8 13 2.32236360071412 4.28421823885742 -1.9618546381433 A:G G A 10 0.535527279857177 0.405380944075703 ENSG00000008853:ENST00000519685:exon_22864241_22865259:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000522948:exon_22864241_22865259:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000251822:exon_22864241_22865259:RHOBTB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 22874892 A/G 1 13 17 30 6.0381453618567 9.10396375757201 -3.06581839571531 A:G A G 10 0.535527279857177 0.277280147402981 ENSG00000008853:ENST00000519685:exon_22874765_22875954:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000522948:exon_22874765_22877705:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000251822:exon_22874765_22877712:RHOBTB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 48 37 85 22.2946905668555 19.8145093547155 2.48018121213996 C:G G C 10 0.535527279857177 0.663862208450161 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 22886002 G/A 1 12 10 22 5.57367264171388 5.35527279857177 0.218399843142107 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22885844_22886115:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000518531:exon_22885778_22886115:TNFRSF10B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 22900701 G/A 1 20 22 42 9.28945440285646 11.7816001568579 -2.49214575400143 A:G G A 10 0.535527279857177 0.444575577074634 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519910:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519028:exon_22900417_22900756:TNFRSF10B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 23423758 G/A 1 6 11 17 2.78683632085694 5.89080007842895 -3.10396375757201 A:G G A 10 0.535527279857177 0.149487157554358 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000417331:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518300:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520654:exon_23423621_23426478:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000517923:exon_23423621_23423898:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520949:exon_23423621_23423891:SLC25A37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 23429329 T/C 1 18 18 36 8.36050896257082 9.63949103742918 -1.27898207485837 T:C T C 10 0.535527279857177 0.739253657716502 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 25364331 G/A 1 36 25 61 16.7210179251416 13.3881819964294 3.33283592871221 A:G G A 10 0.535527279857177 0.442029742684914 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 26240637 C/G 1 23 21 44 10.6828725632849 11.2460728770007 -0.563200313715786 C:G C G 10 0.535527279857177 0.880949379207489 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 27168654 A/G 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:G A G 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000104228:ENST00000305364:exon_27168318_27168836:TRIM35;ENSG00000104228:ENST00000380544:exon_27168318_27168778:TRIM35;ENSG00000104228:ENST00000521253:exon_27168318_27168755:TRIM35 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 43 17 60 19.9723269661414 9.10396375757201 10.8683632085694 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00609222481058598 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 42 17 59 19.5078542459986 9.10396375757201 10.4038904884266 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00847184052418274 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 41 20 61 19.0433815258557 10.7105455971435 8.3328359287122 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0392571189170874 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 57 36 93 26.4749450481409 19.2789820748584 7.19596297328254 A:C:G A G 10 0.535527279857177 0.146008098250238 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 27277537 G/A 1 22 31 53 10.2183998431421 16.6013456755725 -6.38294583243038 A:G G A 10 0.535527279857177 0.097663610412519 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27277412_27277590:PTK2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 76 73 149 35.2999267308546 39.0934914295739 -3.79356469871936 T:C C T 10 0.535527279857177 0.565650979908111 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 207 174 381 96.1458530695644 93.1817466951488 2.96410637441558 A:T:C A C 10 0.535527279857177 0.797372874478113 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 27364442 A/C 1 7 6 13 3.25130904099976 3.21316367914306 0.0381453618566998 A:C A C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27364389_27364511:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000520623:exon_27364389_27364511:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27364389_27364511:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27364389_27364511:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27364389_27364511:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27364389_27364511:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27364389_27364511:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521924:exon_27364389_27364511:EPHX2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 A:C A C 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 27685642 T/C 1 3 6 9 1.39341816042847 3.21316367914306 -1.81974551871459 T:C T C 10 0.535527279857177 0.319136521708965 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27685622_27685715:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27685622_27685715:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27685622_27685715:PBK;ENSG00000168078:ENST00000521226:exon_27685622_27685715:PBK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 24 13 37 11.1473452834278 6.9618546381433 4.18549064528445 C:G G C 10 0.535527279857177 0.189208139895819 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 28304767 G/T 1 8 3 11 3.71578176114258 1.60658183957153 2.10919992157105 T:G G T 10 0.535527279857177 0.23951309450586 ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000380254:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000346498:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000518734:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000520481:exon_28304480_28304790:FBXO16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 28304769 C/T 1 8 3 11 3.71578176114258 1.60658183957153 2.10919992157105 T:C C T 10 0.535527279857177 0.23951309450586 ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000380254:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000346498:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000518734:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000520481:exon_28304480_28304790:FBXO16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 28384712 A/G 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 A:G A G 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000104290:ENST00000240093:exon_28384664_28385681:FZD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 29197672 A/G 1 83 106 189 38.5512357718543 56.7658916648608 -18.2146558930065 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00856137336829632 ENSG00000120875:ENST00000240100:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000404690:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000462477:exon_29197615_29197760:DUSP4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 17 15 32 7.89603624242799 8.03290919785765 -0.136872955429662 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 15 14 29 6.96709080214235 7.49738191800048 -0.530291115858132 T:C T C 10 0.535527279857177 0.854578961351753 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 24 20 44 11.1473452834278 10.7105455971435 0.436799686284214 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 33416189 G/A 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000133874:ENST00000256257:exon_33416133_33416289:RNF122 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 33416222 C/T 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000133874:ENST00000256257:exon_33416133_33416289:RNF122 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 38704374 C/T 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 T:C C T 10 0.535527279857177 0.484883763152571 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 41792161 C/T 1 10 3 13 4.64472720142823 1.60658183957153 3.0381453618567 T:C C T 10 0.535527279857177 0.102869269884982 ENSG00000083168:ENST00000265713:exon_41786997_41792385:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000406337:exon_41786997_41792385:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000396930:exon_41786997_41792385:MYST3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 42146211 A/G 1 7 1 8 3.25130904099976 0.535527279857177 2.71578176114258 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0758484261005442 ENSG00000104365:ENST00000520810:exon_42146152_42146246:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000416505:exon_42146152_42146246:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000519735:exon_42146152_42146246:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000520835:exon_42146152_42146246:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000342222:exon_42146152_42146246:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000518647:exon_42146152_42146246:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000521661:exon_42146152_42146246:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000520655:exon_42146152_42146246:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000523517:exon_42146152_42146246:IKBKB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 48885436 T/A 1 60 76 136 27.8683632085694 40.7000732691454 -12.8317100605761 A:T T A 10 0.535527279857177 0.0313268634701836 ENSG00000104738:ENST00000523944:exon_48885417_48885624:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000429229:exon_48885417_48885624:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000262105:exon_48885417_48885624:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000396826:exon_48885417_48885624:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000523853:exon_48885417_48885625:MCM4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 61765560 G/A 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 A:G G A 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61765388_61766059:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61765388_61766059:CHD7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 66692011 C/T 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 T:C C T 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000205268:ENST00000401827:exon_66691955_66692038:PDE7A;ENSG00000205268:ENST00000379419:exon_66691955_66692038:PDE7A;ENSG00000205268:ENST00000396642:exon_66691955_66692038:PDE7A;ENSG00000205268:ENST00000519231:exon_66691955_66692038:PDE7A;ENSG00000205268:ENST00000523253:exon_66691955_66692038:PDE7A;ENSG00000205268:ENST00000519626:exon_66691955_66692038:PDE7A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 67341743 A/G 1 44 23 67 20.4367996862842 12.3171274367151 8.11967224956914 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0501609299928963 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 67971452 T/C 1 79 75 154 36.693344891283 40.1645459892883 -3.47120109800525 T:C T C 10 0.535527279857177 0.57310257622472 ENSG00000121022:ENST00000357849:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521509:exon_67971446_67974259:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517736:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521386:exon_67971446_67973864:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518374:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000523890:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518747:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517793:exon_67971446_67971680:COPS5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 68074137 G/A 1 14 6 20 6.50261808199952 3.21316367914306 3.28945440285646 A:G G A 10 0.535527279857177 0.179412444802184 ENSG00000104218:ENST00000262210:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000389042:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000412460:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519668:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521168:exon_68074046_68074150:CSPP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 68102977 T/C 1 9 6 15 4.18025448128541 3.21316367914306 0.967090802142346 T:C T C 10 0.535527279857177 0.796987479524744 ENSG00000104218:ENST00000262210:exon_68102885_68102994:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000389042:exon_68102885_68102994:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000412460:exon_68102885_68102994:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519668:exon_68102885_68102994:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521168:exon_68102885_68102994:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521324:exon_68102885_68102994:CSPP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 70588878 T/C 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 T:C T C 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000137571:ENST00000260126:exon_70588844_70588908:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000526750:exon_70588844_70588908:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000530307:exon_70588844_70588908:SLCO5A1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 70744812 G/A 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 A:G G A 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000137571:ENST00000260126:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000524945:exon_70744002_70745625:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000526750:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000530307:exon_70744002_70744950:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000532388:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000528658:exon_70744002_70745404:SLCO5A1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 72948588 C/T 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 T:C C T 10 0.535527279857177 0.782354473542065 ENSG00000104321:ENST00000523582:exon_72948523_72948692:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000262209:exon_72948523_72948692:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000519720:exon_72948523_72948692:TRPA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 72966002 G/A 1 14 7 21 6.50261808199952 3.74869095900024 2.75392712299928 A:G G A 10 0.535527279857177 0.277002137235975 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000523582:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000262209:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 87439926 C/T 1 8 7 15 3.71578176114258 3.74869095900024 -0.0329091978576543 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000123124:ENST00000517970:exon_87439872_87440046:WWP1;ENSG00000123124:ENST00000349423:exon_87439872_87440046:WWP1;ENSG00000123124:ENST00000341922:exon_87439872_87440046:WWP1;ENSG00000123124:ENST00000265428:exon_87439872_87440046:WWP1;ENSG00000123124:ENST00000436619:exon_87439872_87440046:WWP1;ENSG00000123124:ENST00000518683:exon_87439872_87440046:WWP1;ENSG00000123124:ENST00000520374:exon_87439872_87440046:WWP1;ENSG00000123124:ENST00000521079:exon_87439872_87440046:WWP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 87497176 G/A 1 24 19 43 11.1473452834278 10.1750183172864 0.972326966141392 A:G G A 10 0.535527279857177 0.878742494186702 ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 87520894 C/A 1 9 17 26 4.18025448128541 9.10396375757201 -4.9237092762866 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0748738537647927 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87520721_87520910:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87520721_87520904:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87520721_87520913:FAM82B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 87540872 G/A 1 7 13 20 3.25130904099976 6.9618546381433 -3.71054559714354 A:G G A 10 0.535527279857177 0.117313042346182 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87540754_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523072:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523001:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517771:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523469:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000522240:exon_87540764_87540905:CPNE3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 95470511 C/G 1 7 3 10 3.25130904099976 1.60658183957153 1.64472720142823 C:G C G 10 0.535527279857177 0.356091231788076 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95470496_95470664:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95470496_95470664:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000523839:exon_95470496_95470664:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000297592:exon_95470496_95470664:RAD54B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 95531419 T/C 1 17 15 32 7.89603624242799 8.03290919785765 -0.136872955429662 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95531213_95531704:KIAA1429 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 95538468 T/C 1 11 13 24 5.10919992157105 6.9618546381433 -1.85265471657225 T:C T C 10 0.535527279857177 0.540640797126488 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95538451_95538530:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95538451_95539591:KIAA1429 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 10 5 15 4.64472720142823 2.67763639928588 1.96709080214235 T:C T C 10 0.535527279857177 0.438857166783305 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 47 47 94 21.8302178467127 25.1697821532873 -3.33956430657464 T:C C T 10 0.535527279857177 0.535346231972604 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 97299350 C/T 1 17 20 37 7.89603624242799 10.7105455971435 -2.81450935471555 T:C C T 10 0.535527279857177 0.410874358951243 ENSG00000156471:ENST00000517309:exon_97299250_97299374:PTDSS1;ENSG00000156471:ENST00000455950:exon_97299250_97299374:PTDSS1;ENSG00000156471:ENST00000517557:exon_97299250_97299616:PTDSS1;ENSG00000156471:ENST00000518776:exon_97299250_97299374:PTDSS1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 99057150 C/A 1 13 20 33 6.0381453618567 10.7105455971435 -4.67240023528684 A:C C A 10 0.535527279857177 0.117195366512713 ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057055_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99056661_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 99057526 G/A 1 14 7 21 6.50261808199952 3.74869095900024 2.75392712299928 A:G G A 10 0.535527279857177 0.277002137235975 ENSG00000156482:ENST00000517489:exon_99057171_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 99101507 G/A 1 20 24 44 9.28945440285646 12.8526547165722 -3.56320031371579 A:G G A 10 0.535527279857177 0.293725279448287 ENSG00000177459:ENST00000318528:exon_99101304_99102257:C8orf47 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 99153088 A/C 1 11 20 31 5.10919992157105 10.7105455971435 -5.60134567557249 A:C A C 10 0.535527279857177 0.0482942822791167 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99152997_99153116:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99152997_99153116:POP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 103292690 C/T 1 39 36 75 18.1144360855701 19.2789820748584 -1.16454598928827 T:C C T 10 0.535527279857177 0.817525647529149 ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103292622_103292695:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103292622_103292695:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103292622_103292695:UBR5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 117783914 A/C 1 66 45 111 30.6551995294263 24.098727593573 6.55647193585336 A:C A C 10 0.535527279857177 0.217654582994032 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 117783975 C/T 1 57 38 95 26.4749450481409 20.3500366345727 6.12490841356819 T:C C T 10 0.535527279857177 0.218377256342305 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 61 60 121 28.3328359287122 32.1316367914306 -3.79880086271841 A:G A G 10 0.535527279857177 0.523855315772953 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 123964011 G/A 1 21 21 42 9.75392712299928 11.2460728770007 -1.49214575400143 A:G G A 10 0.535527279857177 0.64662851824544 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000534247:exon_123963532_123964249:ZHX2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 123965193 C/T 1 17 18 35 7.89603624242799 9.63949103742918 -1.74345479500119 T:C C T 10 0.535527279857177 0.612839258964269 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 124027628 T/C 1 103 77 180 47.8406901747108 41.2356005490026 6.60508962570815 T:C T C 10 0.535527279857177 0.332297215159955 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 124031541 T/C 1 29 18 47 13.4697088841419 9.63949103742918 3.83021784671268 T:C T C 10 0.535527279857177 0.306737331204143 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000519018:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000523036:exon_124031435_124031545:DERL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 125463250 T/C 1 4 9 13 1.85789088057129 4.81974551871459 -2.9618546381433 T:C T C 10 0.535527279857177 0.162035560448580 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 125498547 C/T 1 12 12 24 5.57367264171388 6.42632735828612 -0.852654716572246 T:C C T 10 0.535527279857177 0.838566839920317 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 126033096 T/C 1 50 44 94 23.2236360071412 23.5632003137158 -0.339564306574633 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000104549:ENST00000523430:exon_126033026_126033113:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126033026_126033113:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000518931:exon_126033026_126033179:SQLE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 126034052 C/T 1 44 34 78 20.4367996862842 18.207927515144 2.2288721711402 T:C C T 10 0.535527279857177 0.65083690670148 ENSG00000104549:ENST00000523430:exon_126033995_126034523:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126033995_126034525:SQLE HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 128098838 G/A 0 25 0 25 11.6118180035706 0 11.6118180035706 G G 10 0.535527279857177 3.06575026544861e-07 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 135602581 A/G 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 A:G A G 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 135612745 A/G 1 12 8 20 5.57367264171388 4.28421823885742 1.28945440285646 A:G A G 10 0.535527279857177 0.656931290438306 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 141461062 G/A 1 3 11 14 1.39341816042847 5.89080007842895 -4.49738191800048 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0281580583322303 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 141461185 A/G 1 5 19 24 2.32236360071412 10.1750183172864 -7.85265471657225 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00158642477206778 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 141461266 A/G 1 6 9 15 2.78683632085694 4.81974551871459 -2.03290919785765 A:G A G 10 0.535527279857177 0.312914646957404 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 141525327 A/G 1 56 39 95 26.0104723279981 20.8855639144299 5.12490841356819 A:G A G 10 0.535527279857177 0.305268182055085 ENSG00000104472:ENST00000220913:exon_141525225_141527236:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519533:exon_141525225_141526566:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519618:exon_141525225_141525864:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000523569:exon_141525225_141525640:CHRAC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 141559358 G/A 1 12 9 21 5.57367264171388 4.81974551871459 0.753927122999285 A:G G A 10 0.535527279857177 0.828752253980847 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141559213_141559397:EIF2C2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 22 9 31 10.2183998431421 4.81974551871459 5.39865432442751 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0701884893647852 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 22 19 41 10.2183998431421 10.1750183172864 0.0433815258557448 C:G C G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144358302 C/T 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000522479:exon_144358067_144358351:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000522033:exon_144358067_144358340:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144403485 G/C 1 19 10 29 8.82498168271364 5.35527279857177 3.46970888414187 C:G G C 10 0.535527279857177 0.263767967240706 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144406705 C/T 1 18 21 39 8.36050896257082 11.2460728770007 -2.8855639144299 T:C C T 10 0.535527279857177 0.422707679943069 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144406655_144406799:TOP1MT HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144620342 T/C 1 25 15 40 11.6118180035706 8.03290919785765 3.57890880571292 T:C T C 10 0.535527279857177 0.27163363697965 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144620855 C/A 1 11 9 20 5.10919992157105 4.81974551871459 0.289454402856461 A:C C A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144621084 T/G 1 14 7 21 6.50261808199952 3.74869095900024 2.75392712299928 T:G T G 10 0.535527279857177 0.277002137235975 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144642854 G/A 1 36 36 72 16.7210179251416 19.2789820748584 -2.55796414971674 A:G G A 10 0.535527279857177 0.556830521916871 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533348:exon_144642773_144642856:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534018:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144642210_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144642931 C/T 1 65 55 120 30.1907268092835 29.4540003921447 0.736726417138765 T:C C T 10 0.535527279857177 0.927238375427856 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534018:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144642210_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144644405 G/A 1 29 35 64 13.4697088841419 18.7434547950012 -5.27374591085933 A:G G A 10 0.535527279857177 0.210425617936772 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144644129_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144643912_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534602:exon_144644379_144644532:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531173:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000525208:exon_144644379_144644520:GSDMD HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144657801 G/A 1 28 1 29 13.005236163999 0.535527279857177 12.4697088841419 A:G G A 10 0.535527279857177 4.82741872029382e-07 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144657770_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144657793_144657872:NAPRT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 0 0 25 25 0 13.3881819964294 -13.3881819964294 A G A 10 0.535527279857177 4.72068793484952e-09 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 884 980 1864 410.593884606256 524.816734260033 -114.222849653778 A:T:C:G G A 10 0.535527279857177 1.30991853567767e-07 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144687092 T/C 1 35 18 53 16.2565452049988 9.63949103742918 6.61705416756962 T:C:G T C 10 0.535527279857177 0.0739990939132073 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144687077_144687127:PYCRL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144689146 C/T 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144697041 A/G 1 54 54 108 25.0815268877124 28.9184731122876 -3.83694622457512 A:G A G 10 0.535527279857177 0.499813828459539 ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000526290:exon_144696991_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527006:exon_144697033_144697085:TSTA3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144893084 G/A 1 19 9 28 8.82498168271364 4.81974551871459 4.00523616399905 A:G G A 10 0.535527279857177 0.183778612379164 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144893076_144893242:SCRIB HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144994212 A/T 1 3 10 13 1.39341816042847 5.35527279857177 -3.9618546381433 A:T A T 10 0.535527279857177 0.0472708235212517 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 144995720 C/T 1 7 7 14 3.25130904099976 3.74869095900024 -0.497381918000477 T:C C T 10 0.535527279857177 0.796028545675074 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 145057868 A/G 1 51 63 114 23.688108727284 33.7382186310021 -10.0501099037182 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0608567924655413 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 145058037 A/G 1 21 6 27 9.75392712299928 3.21316367914306 6.54076344385622 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0118131796792387 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058010_145058272:PARP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 44 30 74 20.4367996862842 16.0658183957153 4.37098129056891 A:G A G 10 0.535527279857177 0.351541965645429 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 40 24 64 18.5789088057129 12.8526547165722 5.72625408914067 A:G G A 10 0.535527279857177 0.168650354052627 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 145151144 G/C 1 299 295 594 138.877343322704 157.980547557867 -19.1032042351631 A:T:C:G G C 10 0.535527279857177 0.118140368698348 ENSG00000179091:ENST00000318911:exon_145151027_145151153:CYC1;ENSG00000179091:ENST00000533444:exon_145151027_145151153:CYC1;ENSG00000179091:ENST00000528618:exon_145151046_145151153:CYC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 22 8 30 10.2183998431421 4.28421823885742 5.93418160428469 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0422566631571478 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 145665407 C/T 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665404_145665456:NFKBIL2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 145737286 G/A 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737285_145737450:RECQL4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 17 16 33 7.89603624242799 8.56843647771483 -0.672400235286839 T:C C T 10 0.535527279857177 0.862495469151548 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 8 8 16 3.71578176114258 4.28421823885742 -0.568436477714831 C:G C G 10 0.535527279857177 0.806722234902998 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 13 13 26 6.0381453618567 6.9618546381433 -0.923709276286601 A:G G A 10 0.535527279857177 0.844640207112493 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 146068594 T/C 1 5 9 14 2.32236360071412 4.81974551871459 -2.49738191800048 T:C T C 10 0.535527279857177 0.193244891590877 ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 146115367 A/G 1 5 8 13 2.32236360071412 4.28421823885742 -1.9618546381433 A:G A G 10 0.535527279857177 0.405380944075703 ENSG00000196150:ENST00000342660:exon_146115318_146115459:ZNF250;ENSG00000196150:ENST00000528258:exon_146115318_146115444:ZNF250;ENSG00000196150:ENST00000529780:exon_146115318_146115444:ZNF250;ENSG00000196150:ENST00000533543:exon_146115318_146115459:ZNF250;ENSG00000196150:ENST00000292579:exon_146115318_146115459:ZNF250;ENSG00000196150:ENST00000417550:exon_146115318_146115444:ZNF250;ENSG00000196150:ENST00000394912:exon_146115318_146115444:ZNF250;ENSG00000196150:ENST00000533221:exon_146115318_146115444:ZNF250;ENSG00000196150:ENST00000533622:exon_146115318_146115444:ZNF250;ENSG00000196150:ENST00000525694:exon_146115318_146115444:ZNF250;ENSG00000196150:ENST00000527208:exon_146115318_146115459:ZNF250;ENSG00000196150:ENST00000528028:exon_146115072_146115444:ZNF250;ENSG00000196150:ENST00000527049:exon_146115351_146115444:ZNF250 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 8 146157339 T/C 1 11 8 19 5.10919992157105 4.28421823885742 0.824981682713638 T:C T C 10 0.535527279857177 0.819687245305986 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 312124 T/C 1 10 9 19 4.64472720142823 4.81974551871459 -0.175018317286362 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_311954_312941:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000474772:exon_311958_312166:DOCK8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 377066 C/T 1 13 11 24 6.0381453618567 5.89080007842895 0.147345283427753 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_376977_377211:DOCK8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 377111 G/C 1 8 11 19 3.71578176114258 5.89080007842895 -2.17501831728636 C:G G C 10 0.535527279857177 0.362455450147038 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_376977_377211:DOCK8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 390512 C/T 1 6 7 13 2.78683632085694 3.74869095900024 -0.9618546381433 T:C C T 10 0.535527279857177 0.782354473542065 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_390471_390566:DOCK8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 439376 G/A 1 23 23 46 10.6828725632849 12.3171274367151 -1.63425487343014 A:G G A 10 0.535527279857177 0.659437095497773 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_439245_439388:DOCK8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 2110399 C/T 1 32 19 51 14.8631270445703 10.1750183172864 4.68810872728397 T:C C T 10 0.535527279857177 0.207918673015511 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2110254_2110417:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2110254_2110417:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2110254_2110417:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2110254_2110417:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2110254_2110417:SMARCA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 5081780 G/A 1 7 2 9 3.25130904099976 1.07105455971435 2.18025448128541 A:G G A 10 0.535527279857177 0.189602051724503 ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5081725_5081861:JAK2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 5335470 C/T 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000107018:ENST00000223862:exon_5334969_5335597:RLN1;ENSG00000107018:ENST00000487557:exon_5334969_5335597:RLN1;ENSG00000107018:ENST00000223858:exon_5334969_5335597:RLN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 6533010 C/G 1 52 43 95 24.1525814474268 23.0276730338586 1.12490841356819 C:G C G 10 0.535527279857177 0.837714379897945 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6532464_6533160:GLDC;ENSG00000178445:ENST00000477960:exon_6532899_6533160:GLDC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 6606645 G/A 1 13 8 21 6.0381453618567 4.28421823885742 1.75392712299928 A:G G A 10 0.535527279857177 0.515688372849167 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6606592_6606669:GLDC HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 26 23 49 12.0762907237134 12.3171274367151 -0.240836713001672 A:T:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 7798518 G/C 1 195 131 326 90.5721804278505 70.1540736612902 20.4181067665603 A:C:G G C 10 0.535527279857177 0.0262005681284100 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7796490_7798637:C9orf123;ENSG00000137038:ENST00000484082:exon_7798199_7798637:C9orf123;ENSG00000137038:ENST00000469050:exon_7798344_7798637:C9orf123 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 20953049 A/G 1 13 12 25 6.0381453618567 6.42632735828612 -0.388181996429424 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20952984_20953064:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20952984_20953064:KIAA1797 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 21029330 T/C 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C T C 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000188921:ENST00000495827:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000513293:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000521505:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000531631:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000380233:exon_21029294_21029397:PTPLAD2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 21816758 G/A 1 7 8 15 3.25130904099976 4.28421823885742 -1.03290919785765 A:G G A 10 0.535527279857177 0.614933682686176 ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000404796:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000460874:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21816713_21816771:MTAP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 21854740 C/T 1 10 9 19 4.64472720142823 4.81974551871459 -0.175018317286362 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21854630_21854869:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21854630_21854869:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21854630_21854869:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21854630_21854869:MTAP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 32425910 A/G 1 7 9 16 3.25130904099976 4.81974551871459 -1.56843647771483 A:G A G 10 0.535527279857177 0.462143040312805 ENSG00000122729:ENST00000432017:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379921:exon_32425836_32425943:ACO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 32450187 T/C 1 12 17 29 5.57367264171388 9.10396375757201 -3.53029111585813 T:C T C 10 0.535527279857177 0.197981940147675 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 32480251 A/T 1 10 24 34 4.64472720142823 12.8526547165722 -8.20792751514402 A:T A T 10 0.535527279857177 0.00547627054842897 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32480217_32480352:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32480217_32480352:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32480217_32480352:DDX58 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 32541532 A/G 1 38 32 70 17.6499633654273 17.1368729554297 0.513090409997613 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 275 253 528 127.729998039276 135.488401803866 -7.75840376458943 T:C T C 10 0.535527279857177 0.512933127341295 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 33466219 A/C 1 11 9 20 5.10919992157105 4.81974551871459 0.289454402856461 A:C A C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33466069_33466223:NOL6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 33971740 A/G 1 5 6 11 2.32236360071412 3.21316367914306 -0.890800078428946 A:G A G 10 0.535527279857177 0.764423141195016 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33971649_33971752:UBAP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 8 12 20 3.71578176114258 6.42632735828612 -2.71054559714354 T:C C T 10 0.535527279857177 0.265322195681750 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 35079502 G/A 1 8 4 12 3.71578176114258 2.14210911942871 1.57367264171388 A:G G A 10 0.535527279857177 0.402203701214567 ENSG00000221829:ENST00000425676:exon_35079438_35079690:FANCG;ENSG00000221829:ENST00000378643:exon_35079438_35080013:FANCG;ENSG00000221829:ENST00000448890:exon_35079438_35079532:FANCG;ENSG00000221829:ENST00000462124:exon_35079148_35079666:FANCG HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 35606884 G/A 1 2 7 9 0.928945440285646 3.74869095900024 -2.81974551871459 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0914963800425486 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35606834_35606980:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35606834_35606980:TESK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 35662251 T/C 1 12 7 19 5.57367264171388 3.74869095900024 1.82498168271364 T:C T C 10 0.535527279857177 0.493201262474126 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 35714272 G/A 1 28 33 61 13.005236163999 17.6724002352868 -4.66716407128779 A:G G A 10 0.535527279857177 0.249289478721209 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35714236_35714370:TLN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 36191149 T/C 1 263 300 563 122.156325397562 160.658183957153 -38.5018585595906 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00130202950798294 ENSG00000122705:ENST00000433436:exon_36190892_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000345519:exon_36190920_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000464497:exon_36190928_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000470744:exon_36190929_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000242285:exon_36190934_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000396603:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000466396:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000462562:exon_36190990_36191270:CLTA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 36840623 G/A 1 26 20 46 12.0762907237134 10.7105455971435 1.36574512656986 A:G G A 10 0.535527279857177 0.76816771206416 ENSG00000196092:ENST00000358127:exon_36833272_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377853:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377840:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377852:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523241:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000520154:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000520281:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000446742:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000522003:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523145:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523493:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000414447:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377847:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377849:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000524340:exon_36840555_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000522932:exon_36840555_36840633:PAX5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 37002806 A/G 1 8 59 67 3.71578176114258 31.5961095115734 -27.8803277504309 A:G A G 10 0.535527279857177 1.43041675476252e-12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 37521777 G/A 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000147912:ENST00000276960:exon_37521566_37521835:FBXO10;ENSG00000147912:ENST00000432825:exon_37521566_37521835:FBXO10 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 37592452 G/A 1 234 223 457 108.686616513421 119.42258340815 -10.7359668947299 A:G G A 10 0.535527279857177 0.324831961366423 ENSG00000175768:ENST00000321301:exon_37592409_37592568:TOMM5;ENSG00000175768:ENST00000377773:exon_37592307_37592594:TOMM5;ENSG00000175768:ENST00000401811:exon_37592250_37592636:TOMM5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 71549957 A/G 1 33 35 68 15.3275997647132 18.7434547950012 -3.41585503028804 A:G A G 10 0.535527279857177 0.46602050355787 ENSG00000107242:ENST00000377290:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000265382:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000419747:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000478500:exon_71549806_71549961:PIP5K1B HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 71835842 C/A 1 7 15 22 3.25130904099976 8.03290919785765 -4.78160015685789 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0529971189475910 ENSG00000119139:ENST00000423935:exon_71835803_71836012:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71835803_71836412:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71835803_71836412:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71835803_71836412:TJP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 72897440 T/C 1 4 5 9 1.85789088057129 2.67763639928588 -0.819745518714593 T:C T C 10 0.535527279857177 0.741702985954337 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72897338_72897499:SMC5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 10 20 30 4.64472720142823 10.7105455971435 -6.06581839571531 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0285715048547694 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 18 8 26 8.36050896257082 4.28421823885742 4.0762907237134 A:C A C 10 0.535527279857177 0.119286633346569 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 77693316 C/T 1 2 8 10 0.928945440285646 4.28421823885742 -3.35527279857177 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0525767166149741 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77693242_77693498:C9orf95 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 6 3 9 2.78683632085694 1.60658183957153 1.18025448128541 A:G A G 10 0.535527279857177 0.517677205697999 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 80879149 C/T 1 9 6 15 4.18025448128541 3.21316367914306 0.967090802142346 T:C C T 10 0.535527279857177 0.796987479524744 ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80879066_80879232:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80879066_80879232:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80879066_80879232:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80879066_80879232:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80879066_80879232:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000487108:exon_80879066_80879149:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000459817:exon_80879066_80879232:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000498582:exon_80878967_80879232:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000424347:exon_80879123_80879232:CEP78 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 80919756 T/G 1 24 14 38 11.1473452834278 7.49738191800048 3.64996336542728 T:G T G 10 0.535527279857177 0.258085452473595 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80919651_80919856:PSAT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 88937371 C/T 1 22 12 34 10.2183998431421 6.42632735828612 3.79207248485598 T:C C T 10 0.535527279857177 0.229683306688434 ENSG00000083223:ENST00000277141:exon_88937240_88937390:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375961:exon_88937240_88937390:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375963:exon_88937240_88937390:ZCCHC6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 90321583 C/T 1 22 12 34 10.2183998431421 6.42632735828612 3.79207248485598 T:C C T 10 0.535527279857177 0.229683306688434 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 90322023 G/A 1 54 8 62 25.0815268877124 4.28421823885742 20.797308648855 A:G G A 10 0.535527279857177 2.64460117092322e-08 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 90322200 G/T 1 33 10 43 15.3275997647132 5.35527279857177 9.97232696614139 T:G G T 10 0.535527279857177 0.00206581478506505 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 91993724 C/T 1 86 54 140 39.9446539322828 28.9184731122876 11.0261808199952 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0627503330215364 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 91994524 G/A 1 41 29 70 19.0433815258557 15.5302911158581 3.51309040999761 A:G G A 10 0.535527279857177 0.472426721026191 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000486935:exon_91994458_91994544:SEMA4D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 92006275 G/A 1 8 10 18 3.71578176114258 5.35527279857177 -1.63949103742919 A:G G A 10 0.535527279857177 0.484703765251006 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92006179_92006330:SEMA4D HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 93641151 T/C 1 23 17 40 10.6828725632849 9.10396375757201 1.57890880571292 T:C T C 10 0.535527279857177 0.638402562878541 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 95077691 A/G 1 10 12 22 4.64472720142823 6.42632735828612 -1.78160015685789 A:T:G A G 10 0.535527279857177 0.523672568666477 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95076549_95078420:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000434228:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000433029:exon_95077625_95078418:NOL8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 95094587 C/T 1 30 19 49 13.9341816042847 10.1750183172864 3.75916328699833 T:C C T 10 0.535527279857177 0.31747152067797 ENSG00000188312:ENST00000375587:exon_95094452_95094633:CENPP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 10 16 26 4.64472720142823 8.56843647771483 -3.9237092762866 A:C C A 10 0.535527279857177 0.167638781651660 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 96238578 C/T 1 22 21 43 10.2183998431421 11.2460728770007 -1.02767303385861 T:C C T 10 0.535527279857177 0.762236365418988 ENSG00000048828:ENST00000437660:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000375389:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000277165:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000340893:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000333936:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000446420:exon_96238538_96238620:FAM120A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 97221463 G/A 1 15 19 34 6.96709080214235 10.1750183172864 -3.20792751514402 A:G G A 10 0.535527279857177 0.304248882363643 ENSG00000148110:ENST00000375344:exon_97221443_97223324:HIATL1;ENSG00000148110:ENST00000277183:exon_97221443_97223324:HIATL1;ENSG00000148110:ENST00000428393:exon_97221443_97223201:HIATL1;ENSG00000148110:ENST00000447692:exon_97221442_97221525:HIATL1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 98766902 C/A 1 5 3 8 2.32236360071412 1.60658183957153 0.715781761142584 A:C C A 10 0.535527279857177 0.732042892054444 ENSG00000182150:ENST00000479391:exon_98766802_98767137:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000407474:exon_98766802_98766983:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000320486:exon_98766802_98766983:C9orf102 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 99525909 T/C 1 7 5 12 3.25130904099976 2.67763639928588 0.573672641713876 T:C T C 10 0.535527279857177 0.781161951176294 ENSG00000081386:ENST00000375231:exon_99525788_99525914:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000223428:exon_99525788_99525914:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000449952:exon_99525788_99525914:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000472201:exon_99525788_99525975:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000374641:exon_99525788_99525914:ZNF510 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 100819192 C/T 1 66 55 121 30.6551995294263 29.4540003921447 1.20119913728159 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.855721660164337 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 100823135 G/C 1 91 62 153 42.2670175329969 33.202691351145 9.06432618185192 C:G G C 10 0.535527279857177 0.14539184881101 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 101980411 G/C 1 49 39 88 22.7591632869983 20.8855639144299 1.87359937256843 T:C:G G C 10 0.535527279857177 0.748853052200006 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101978708_101981118:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000319033:exon_101978708_101981118:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101979649_101981118:ALG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 101980412 G/A 1 50 41 91 23.2236360071412 21.9566184741443 1.2670175329969 A:C:G G A 10 0.535527279857177 0.8339220744503 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101978708_101981118:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000319033:exon_101978708_101981118:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101979649_101981118:ALG2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 104309445 T/C 1 11 13 24 5.10919992157105 6.9618546381433 -1.85265471657225 T:C T C 10 0.535527279857177 0.540640797126488 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104309419_104309496:RNF20 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 104323199 T/C 1 26 27 53 12.0762907237134 14.4592365561438 -2.38294583243038 T:C T C 10 0.535527279857177 0.582266160295617 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104323083_104323208:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000478072:exon_104322963_104323208:RNF20 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 104323459 G/A 1 22 23 45 10.2183998431421 12.3171274367151 -2.09872759357296 A:G G A 10 0.535527279857177 0.552857972870736 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104323372_104323512:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000478072:exon_104323372_104323734:RNF20 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 106896799 A/G 1 11 4 15 5.10919992157105 2.14210911942871 2.96709080214235 A:G A G 10 0.535527279857177 0.194136764216528 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106896696_106896856:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106896696_106896856:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106896696_106896856:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106896696_106896856:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000493955:exon_106896696_106896856:SMC2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 111659439 T/C 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 T:C T C 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111659428_111659565:IKBKAP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 111659483 T/G 1 2 13 15 0.928945440285646 6.9618546381433 -6.03290919785765 T:G T G 10 0.535527279857177 0.00279203184689865 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111659428_111659565:IKBKAP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 111660851 C/T 1 4 8 12 1.85789088057129 4.28421823885742 -2.42632735828612 T:C C T 10 0.535527279857177 0.24635656157035 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111660782_111660861:IKBKAP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 112900199 T/C 1 7 14 21 3.25130904099976 7.49738191800048 -4.24607287700072 T:C T C 10 0.535527279857177 0.079455143067082 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 22 16 38 10.2183998431421 8.56843647771483 1.64996336542728 T:C T C 10 0.535527279857177 0.628846587952398 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 114359624 C/A 1 8 12 20 3.71578176114258 6.42632735828612 -2.71054559714354 A:C C A 10 0.535527279857177 0.265322195681750 ENSG00000106853:ENST00000309195:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374324:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000407693:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000333580:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000238248:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000422125:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374313:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374308:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000485319:exon_114359597_114359693:PTGR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 114694486 A/G 1 13 12 25 6.0381453618567 6.42632735828612 -0.388181996429424 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000148154:ENST00000374279:exon_114694450_114694639:UGCG HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 91 102 193 42.2670175329969 54.6237825454321 -12.3567650124352 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0830803234704954 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 110 95 205 51.0919992157105 50.8750915864318 0.216907629278722 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 44 42 86 20.4367996862842 22.4921457540014 -2.05534606771722 A:G G A 10 0.535527279857177 0.666909806359279 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 115938951 G/T 1 35 48 83 16.2565452049988 25.7053094331445 -9.44876422814569 T:G G T 10 0.535527279857177 0.0469740402449974 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115938817_115938953:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115938817_115938953:FKBP15 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 116044998 A/G 1 16 14 30 7.43156352228517 7.49738191800048 -0.0658183957153087 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000136875:ENST00000374199:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000374198:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000488937:exon_116044926_116045456:PRPF4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 116279880 T/C 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000413285:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317613:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000394646:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374136:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000496113:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000460000:exon_116279648_116279904:RGS3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 116285212 G/A 1 9 5 14 4.18025448128541 2.67763639928588 1.50261808199952 A:G G A 10 0.535527279857177 0.593847726273405 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116285210_116285321:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116285210_116285321:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116285210_116285321:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000413285:exon_116285210_116285321:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116285210_116285321:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116285210_116285321:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317613:exon_116285210_116285321:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116285210_116285321:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000394646:exon_116285210_116285321:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374136:exon_116285210_116285321:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000496113:exon_116285210_116285321:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000460000:exon_116285210_116285321:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000470775:exon_116285210_116285321:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000496264:exon_116285210_116285321:RGS3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 117103900 T/C 1 36 32 68 16.7210179251416 17.1368729554297 -0.415855030288032 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 117108971 C/T 1 50 41 91 23.2236360071412 21.9566184741443 1.2670175329969 T:C C T 10 0.535527279857177 0.8339220744503 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117108949_117109054:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117108949_117109064:AKNA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 17 20 37 7.89603624242799 10.7105455971435 -2.81450935471555 T:C C T 10 0.535527279857177 0.410874358951243 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 13 11 24 6.0381453618567 5.89080007842895 0.147345283427753 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 117139244 C/T 1 35 40 75 16.2565452049988 21.4210911942871 -5.16454598928827 T:C C T 10 0.535527279857177 0.248092333081309 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117138746_117139340:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117138746_117139244:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117138746_117139915:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394574:exon_117138387_117139812:AKNA HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 119187839 C/T 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000148219:ENST00000288520:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000341734:exon_119187507_119187905:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373986:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000361209:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000313400:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373996:exon_119187507_119188367:ASTN2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 123239643 A/G 1 3 5 8 1.39341816042847 2.67763639928588 -1.28421823885742 A:G A G 10 0.535527279857177 0.484883763152571 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123239628_123239728:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123239628_123239728:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123239628_123239728:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123239628_123239728:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123239628_123239728:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123239628_123239728:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123239628_123239728:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123239628_123239728:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123239628_123239728:CDK5RAP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 123583192 A/G 1 4 6 10 1.85789088057129 3.21316367914306 -1.35527279857177 A:G A G 10 0.535527279857177 0.529514337684375 ENSG00000095261:ENST00000373920:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123583117_123583257:PSMD5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 37 49 86 17.1854906452845 26.2408367130017 -9.05534606771722 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0521567355438138 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 125895238 C/T 1 27 37 64 12.5407634438562 19.8145093547155 -7.27374591085933 T:C:G C T 10 0.535527279857177 0.0790170573226913 ENSG00000165209:ENST00000478973:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000471564:exon_125895124_125895246:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000496533:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125895124_125895247:STRBP HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 126146138 T/C 1 7 11 18 3.25130904099976 5.89080007842895 -2.63949103742919 T:C T C 10 0.535527279857177 0.242667099484109 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126145934_126146192:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126145934_126146192:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126145934_126146192:DENND1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 126520068 T/C 1 4 8 12 1.85789088057129 4.28421823885742 -2.42632735828612 T:C T C 10 0.535527279857177 0.24635656157035 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126519982_126520101:DENND1A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 130191186 C/T 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130191111_130191199:ZNF79 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 130206762 C/T 1 28 15 43 13.005236163999 8.03290919785765 4.97232696614139 T:C C T 10 0.535527279857177 0.168119510191600 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 130219669 C/T 1 15 9 24 6.96709080214235 4.81974551871459 2.14734528342775 T:C C T 10 0.535527279857177 0.419204092334723 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000485704:exon_130219595_130219692:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130219595_130219672:LRSAM1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 130494478 G/A 1 13 11 24 6.0381453618567 5.89080007842895 0.147345283427753 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000160404:ENST00000336067:exon_130493803_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000373284:exon_130493803_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000373281:exon_130493804_130495839:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000463577:exon_130493804_130495839:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000472723:exon_130493806_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000463256:exon_130494059_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000496460:exon_130494123_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000494135:exon_130494191_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000493439:exon_130494448_130494970:TOR2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 130494791 C/T 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 T:C C T 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000160404:ENST00000373281:exon_130493804_130495839:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000463577:exon_130493804_130495839:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000493439:exon_130494448_130494970:TOR2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 130494875 A/T 1 11 9 20 5.10919992157105 4.81974551871459 0.289454402856461 A:T A T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000160404:ENST00000373284:exon_130494843_130494970:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000373281:exon_130493804_130495839:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000463577:exon_130493804_130495839:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000472723:exon_130494843_130497586:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000496460:exon_130494843_130494970:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000494135:exon_130494843_130495153:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000493439:exon_130494448_130494970:TOR2A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 21 27 48 9.75392712299928 14.4592365561438 -4.70530943314449 A:G G A 10 0.535527279857177 0.19371076221448 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 130605385 C/T 1 11 6 17 5.10919992157105 3.21316367914306 1.89603624242799 T:C C T 10 0.535527279857177 0.467819685510286 ENSG00000106991:ENST00000373203:exon_130605373_130605524:ENG;ENSG00000106991:ENST00000344849:exon_130605373_130605524:ENG HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 130630233 G/T 1 13 11 24 6.0381453618567 5.89080007842895 0.147345283427753 T:G G T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130628759_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630118_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630169_130630355:AK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 130635041 G/A 1 4 9 13 1.85789088057129 4.81974551871459 -2.9618546381433 A:G G A 10 0.535527279857177 0.162035560448580 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130634969_130635132:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130634969_130636719:AK1;ENSG00000106992:ENST00000373156:exon_130634969_130635132:AK1;ENSG00000106992:ENST00000223836:exon_130634969_130635132:AK1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 93 73 166 43.1959629732825 39.0934914295739 4.10247154370862 C:G G C 10 0.535527279857177 0.534646928327299 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 99 64 163 45.9827992941395 34.2737459108593 11.7090533832802 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0708660649075904 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 130884753 C/T 1 51 45 96 23.688108727284 24.098727593573 -0.410618866288988 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000148334:ENST00000338961:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000277462:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000423319:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000492057:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000496594:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000476811:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000476655:exon_130884641_130884925:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000493205:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000487063:exon_130884725_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000474124:exon_130884727_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000449878:exon_130884745_130884758:PTGES2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 130938661 C/T 1 45 31 76 20.901272406427 16.6013456755725 4.29992673085455 T:C C T 10 0.535527279857177 0.35830362326572 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000465583:exon_130938630_130938707:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000471839:exon_130938630_130938754:CIZ1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 131020422 C/T 1 17 19 36 7.89603624242799 10.1750183172864 -2.27898207485837 T:C C T 10 0.535527279857177 0.505320305259396 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131020259_131020477:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131020259_131020477:GOLGA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 131027963 A/G 1 23 16 39 10.6828725632849 8.56843647771483 2.1144360855701 A:G A G 10 0.535527279857177 0.524992506529540 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 131085113 C/T 1 12 37 49 5.57367264171388 19.8145093547155 -14.2408367130017 T:C C T 10 0.535527279857177 4.25935469464175e-05 ENSG00000167113:ENST00000300452:exon_131084815_131085207:COQ4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 131395653 C/T 1 379 318 697 176.03516093413 170.297674994582 5.73748593954764 A:T:C C T 10 0.535527279857177 0.67626535681816 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131395488_131395941:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131395488_131395941:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131395488_131395937:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131395488_131395937:SPTAN1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 131670919 T/C 1 3 9 12 1.39341816042847 4.81974551871459 -3.42632735828612 T:C T C 10 0.535527279857177 0.0783062467016812 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 52 61 113 24.1525814474268 32.6671640712878 -8.514582623861 A:C A C 10 0.535527279857177 0.109911686987098 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 131771505 C/T 1 14 18 32 6.50261808199952 9.63949103742918 -3.13687295542966 T:C C T 10 0.535527279857177 0.290964786174482 ENSG00000148341:ENST00000372564:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000479237:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372559:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372554:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000461811:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000417224:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000416629:exon_131771385_131771625:SH3GLB2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 131846957 T/C 1 7 6 13 3.25130904099976 3.21316367914306 0.0381453618566998 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000167130:ENST00000372546:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000406974:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000327812:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000412363:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000480255:exon_131846878_131847047:DOLPP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 18 17 35 8.36050896257082 9.10396375757201 -0.743454795001194 A:G G A 10 0.535527279857177 0.866114915546985 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 132636920 C/T 1 7 8 15 3.25130904099976 4.28421823885742 -1.03290919785765 T:C C T 10 0.535527279857177 0.614933682686176 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132636855_132637035:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132636855_132637035:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132636855_132637035:USP20 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 182 162 344 84.5340350659938 86.7554193368627 -2.22138427086888 T:C C T 10 0.535527279857177 0.828919021585642 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 134020092 C/T 1 9 7 16 4.18025448128541 3.74869095900024 0.431563522285169 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000530863:exon_134019955_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134020089_134020141:NUP214 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 134021630 A/G 1 10 8 18 4.64472720142823 4.28421823885742 0.360508962570814 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134021549_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134021516_134021691:NUP214 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 134357886 C/T 1 7 10 17 3.25130904099976 5.35527279857177 -2.10396375757201 T:C C T 10 0.535527279857177 0.338715846297251 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134357758_134357949:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134357758_134357949:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134357758_134357949:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134357758_134357949:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134357758_134357949:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134357761_134357949:BAT2L1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 134473655 C/T 1 12 7 19 5.57367264171388 3.74869095900024 1.82498168271364 T:C C T 10 0.535527279857177 0.493201262474126 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000414781:exon_134473586_134473697:RAPGEF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 135139901 T/C 1 47 50 97 21.8302178467127 26.7763639928588 -4.94614614614617 T:C T C 10 0.535527279857177 0.359670646337555 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 135172412 A/G 1 9 10 19 4.18025448128541 5.35527279857177 -1.17501831728636 A:G A G 10 0.535527279857177 0.649589851439212 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135172274_135172441:SETX HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 135173685 T/C 1 17 11 28 7.89603624242799 5.89080007842895 2.00523616399905 T:C T C 10 0.535527279857177 0.570608245390574 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135173467_135173699:SETX HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 135202829 T/C 1 7 10 17 3.25130904099976 5.35527279857177 -2.10396375757201 T:C T C 10 0.535527279857177 0.338715846297251 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 135203231 C/T 1 12 16 28 5.57367264171388 8.56843647771483 -2.99476383600095 T:C C T 10 0.535527279857177 0.263198055324704 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 135203409 A/C 1 16 15 31 7.43156352228517 8.03290919785765 -0.601345675572485 A:C A C 10 0.535527279857177 0.858656759427397 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 135203838 G/A 1 12 12 24 5.57367264171388 6.42632735828612 -0.852654716572246 A:G G A 10 0.535527279857177 0.838566839920317 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 135273607 C/G 1 21 38 59 9.75392712299928 20.3500366345727 -10.5961095115734 C:G C G 10 0.535527279857177 0.00601471346001166 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135273528_135273713:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135273528_135273713:TTF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 135277341 C/A 1 61 40 101 28.3328359287122 21.4210911942871 6.91174473442513 A:C C A 10 0.535527279857177 0.194529758298994 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 135470176 C/G 1 38 18 56 17.6499633654273 9.63949103742918 8.01047232799809 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0325148829029053 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 135470414 T/C 1 27 32 59 12.5407634438562 17.1368729554297 -4.59610951157344 T:C T C 10 0.535527279857177 0.242233387971222 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 135470473 C/T 1 33 33 66 15.3275997647132 17.6724002352868 -2.34480047057368 T:C C T 10 0.535527279857177 0.622069708033582 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 135786904 A/G 1 7 7 14 3.25130904099976 3.74869095900024 -0.497381918000477 A:G A G 10 0.535527279857177 0.796028545675074 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135786840_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135786840_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000493467:exon_135786840_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000424271:exon_135786387_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000403810:exon_135786596_135786955:TSC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 135974079 G/C 1 50 42 92 23.2236360071412 22.4921457540014 0.731490253139722 C:G G C 10 0.535527279857177 0.916995638594558 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 54 46 100 25.0815268877124 24.6342548734301 0.447272014282301 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 136337168 G/A 1 25 35 60 11.6118180035706 18.7434547950012 -7.13163679143062 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0703909524415281 ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136336217_136337298:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136336217_136337298:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136336217_136337298:SLC2A6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 136662928 A/G 1 6 5 11 2.78683632085694 2.67763639928588 0.109199921571054 A:G A G 10 0.535527279857177 1 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136662832_136662931:VAV2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 136915508 C/T 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 T:C C T 10 0.535527279857177 1 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136915496_136915710:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136915496_136915710:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136915496_136915710:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000494743:exon_136915496_136915549:BRD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 136915690 C/T 1 8 2 10 3.71578176114258 1.07105455971435 2.64472720142823 T:C C T 10 0.535527279857177 0.118249545982972 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136915496_136915710:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136915496_136915710:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136915496_136915710:BRD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 137017126 A/G 1 9 12 21 4.18025448128541 6.42632735828612 -2.24607287700072 A:G A G 10 0.535527279857177 0.384351839373372 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137017105_137017151:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137017105_137017151:WDR5 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 138378760 G/A 1 6 10 16 2.78683632085694 5.35527279857177 -2.56843647771483 A:G G A 10 0.535527279857177 0.218648734569296 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 138392889 C/A 1 71 52 123 32.9775631301404 27.8474185525732 5.13014457756724 A:C C A 10 0.535527279857177 0.367299094432605 ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138392844_138392969:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138392844_138392969:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000488610:exon_138392844_138392969:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000485333:exon_138392844_138392969:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000462948:exon_138392844_138393172:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000472852:exon_138392844_138392969:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000453385:exon_138392759_138392969:MRPS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139100805 T/C 1 11 8 19 5.10919992157105 4.28421823885742 0.824981682713638 T:C T C 10 0.535527279857177 0.819687245305986 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139098179_139101121:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139098185_139101121:QSOX2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139270901 G/A 1 62 51 113 28.797308648855 27.311891272716 1.485417376139 A:G G A 10 0.535527279857177 0.85050075483124 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139270801_139270933:SNAPC4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139272045 C/A 1 50 46 96 23.2236360071412 24.6342548734301 -1.41061886628899 A:C C A 10 0.535527279857177 0.83799428017881 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139324737 C/A 1 14 11 25 6.50261808199952 5.89080007842895 0.611818003570576 A:T:C C A 10 0.535527279857177 0.84378896045112 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139324729_139324865:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139324729_139324865:INPP5E HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139336261 G/A 1 31 21 52 14.3986543244275 11.2460728770007 3.1525814474268 A:G G A 10 0.535527279857177 0.406959276258042 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139334549_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139334549_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139334549_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139334549_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139334553_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000277537:exon_139334553_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000453963:exon_139334553_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000467838:exon_139334553_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313084:exon_139334555_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000433860:exon_139334557_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000404925:exon_139336131_139336275:SEC16A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139368883 A/G 1 5 13 18 2.32236360071412 6.9618546381433 -4.63949103742919 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0333546744685474 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000404925:exon_139368501_139368938:SEC16A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139369200 A/G 1 8 2 10 3.71578176114258 1.07105455971435 2.64472720142823 A:G A G 10 0.535527279857177 0.118249545982972 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139371106 G/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G G A 10 0.535527279857177 1 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139390676 A/C 1 21 29 50 9.75392712299928 15.5302911158581 -5.77636399285885 A:C A C 10 0.535527279857177 0.118663523887446 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139391636 G/A 1 16 11 27 7.43156352228517 5.89080007842895 1.54076344385622 A:G G A 10 0.535527279857177 0.570383110559636 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139395259 G/A 1 16 11 27 7.43156352228517 5.89080007842895 1.54076344385622 A:G G A 10 0.535527279857177 0.570383110559636 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139395004_139395299:NOTCH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139621120 A/G 1 5 4 9 2.32236360071412 2.14210911942871 0.180254481285407 A:G A G 10 0.535527279857177 1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139621168 G/A 1 4 4 8 1.85789088057129 2.14210911942871 -0.284218238857416 A:G G A 10 0.535527279857177 1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139731969 C/T 1 74 91 165 34.3709812905689 48.7329824670031 -14.3620011764342 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0286052467010743 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139731798_139732067:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139731798_139732042:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139729623_139732114:C9orf86 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139732462 C/T 1 111 91 202 51.5564719358534 48.7329824670031 2.82348946885025 T:C C T 10 0.535527279857177 0.724531128318389 ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139732314_139732467:C9orf86 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 139820421 G/A 1 35 29 64 16.2565452049988 15.5302911158581 0.726254089140673 A:G G A 10 0.535527279857177 0.900694585840444 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 140008750 G/C 1 27 21 48 12.5407634438562 11.2460728770007 1.29469056685551 C:G G C 10 0.535527279857177 0.773153219616852 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008695_140008830:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 140167022 G/A 1 52 72 124 24.1525814474268 38.5579641497167 -14.4053827022899 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0114260669245947 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166959_140167067:COBRA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 140267455 C/A 1 7 8 15 3.25130904099976 4.28421823885742 -1.03290919785765 A:C C A 10 0.535527279857177 0.614933682686176 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140267357_140267524:EXD3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 140611120 C/G 1 12 5 17 5.57367264171388 2.67763639928588 2.89603624242799 C:G C G 10 0.535527279857177 0.223914163527513 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 140611121 A/T 1 12 4 16 5.57367264171388 2.14210911942871 3.43156352228517 A:T A T 10 0.535527279857177 0.130378196506160 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 39 34 73 18.1144360855701 18.207927515144 -0.0934914295739198 T:C T C 10 0.535527279857177 1 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . 9 140707889 G/A 1 53 69 122 24.6170541675696 36.9513823101452 -12.3343281425756 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0290511051364259 ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140707838_140707982:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140707838_140707982:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140707838_140707982:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140707838_140707982:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000462942:exon_140707838_140707982:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000486164:exon_140707838_140707896:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000488242:exon_140707838_140707982:EHMT1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 207362 C/T 1 7 13 20 3.25130904099976 6.9618546381433 -3.71054559714354 T:C C T 10 0.535527279857177 0.117313042346182 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_207315_207459:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_207315_207424:PLCXD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 215944 G/T 1 12 22 34 5.57367264171388 11.7816001568579 -6.20792751514402 T:G G T 10 0.535527279857177 0.0385943086550436 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_215764_220020:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_215764_216059:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_215764_220023:PLCXD1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 221705 G/A 1 137 98 235 63.6327626595668 52.4816734260033 11.1510892335634 A:G G A 10 0.535527279857177 0.150513153121062 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 229425 G/A 1 6 2 8 2.78683632085694 1.07105455971435 1.71578176114258 A:G G A 10 0.535527279857177 0.298960436382335 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 229493 G/A 1 27 27 54 12.5407634438562 14.4592365561438 -1.91847311228756 A:G G A 10 0.535527279857177 0.682745837825282 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 229542 G/A 1 17 20 37 7.89603624242799 10.7105455971435 -2.81450935471555 A:G G A 10 0.535527279857177 0.410874358951243 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 33 20 53 15.3275997647132 10.7105455971435 4.61705416756962 T:C T C 10 0.535527279857177 0.217607458899813 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 35 18 53 16.2565452049988 9.63949103742918 6.61705416756962 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0739990939132073 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 1467404 A/C 1 12 17 29 5.57367264171388 9.10396375757201 -3.53029111585813 A:C A C 10 0.535527279857177 0.197981940147675 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1467324_1467438:IL3RA HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 1497644 G/C 1 10 30 40 4.64472720142823 16.0658183957153 -11.4210911942871 C:G G C 10 0.535527279857177 0.000355199704437509 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1497552_1497657:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1497552_1497657:IL3RA HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 24 29 53 11.1473452834278 15.5302911158581 -4.38294583243038 T:C C T 10 0.535527279857177 0.270608485366989 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 21 49 70 9.75392712299928 26.2408367130017 -16.4869095900024 T:C C T 10 0.535527279857177 9.64054579661303e-05 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 1718360 G/A 1 10 6 16 4.64472720142823 3.21316367914306 1.43156352228517 A:G G A 10 0.535527279857177 0.618134679686612 ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1718085_1719196:AKAP17A HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 37 39 76 17.1854906452845 20.8855639144299 -3.70007326914545 C:G C G 10 0.535527279857177 0.421905623831145 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 2139186 C/T 1 16 16 32 7.43156352228517 8.56843647771483 -1.13687295542966 T:C C T 10 0.535527279857177 0.725380877409574 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 2161129 C/G 1 16 11 27 7.43156352228517 5.89080007842895 1.54076344385622 C:G C G 10 0.535527279857177 0.570383110559636 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2161103_2161271:DHRSX HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 2184897 G/T 1 22 24 46 10.2183998431421 12.8526547165722 -2.63425487343014 T:G G T 10 0.535527279857177 0.462428816700698 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2184781_2184988:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2184781_2184988:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2184781_2184988:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2184781_2184988:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000464935:exon_2184781_2184978:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000444280:exon_2184811_2184988:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000441131:exon_2184895_2184988:DHRSX HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 2343343 A/G 1 15 12 27 6.96709080214235 6.42632735828612 0.540763443856222 A:G A G 10 0.535527279857177 0.850128429900867 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2343238_2343345:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2343238_2343345:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2343238_2343345:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2343238_2343345:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000444280:exon_2343238_2343345:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000441131:exon_2343238_2343345:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000478825:exon_2343238_2343345:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000430536:exon_2343238_2343345:DHRSX HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 2656261 A/G 1 155 127 282 71.9932716221376 68.0119645418615 3.9813070802761 A:C:G A G 10 0.535527279857177 0.676099122333901 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381177:exon_2655922_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000417575:exon_2656071_2656297:CD99 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 2656283 A/T 1 223 170 393 103.57741659185 91.0396375757201 12.5377790161295 A:T A T 10 0.535527279857177 0.206602268788339 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381177:exon_2655922_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000417575:exon_2656071_2656297:CD99 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 12809661 G/A 1 27 5 32 12.5407634438562 2.67763639928588 9.86312704457034 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00051539814048447 ENSG00000101911:ENST00000380663:exon_12809474_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000380668:exon_12809489_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000398491:exon_12809525_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000489404:exon_12809607_12809738:PRPS2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 13397397 C/T 0 130 0 130 60.381453618567 0 60.381453618567 C C 10 0.535527279857177 6.56145261903462e-36 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 16859628 G/A 1 20 36 56 9.28945440285646 19.2789820748584 -9.98952767200191 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0102600507877635 ENSG00000086712:ENST00000380122:exon_16859551_16862642:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000398155:exon_16859551_16860296:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000485153:exon_16859551_16862642:TXLNG HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 19373839 A/G 1 49 108 157 22.7591632869983 57.8369462245751 -35.0777829375768 A:G A G 10 0.535527279857177 2.03845834898258e-08 ENSG00000131828:ENST00000422285:exon_19373804_19373875:PDHA1;ENSG00000131828:ENST00000379806:exon_19373804_19373875:PDHA1;ENSG00000131828:ENST00000379815:exon_19373804_19373875:PDHA1;ENSG00000131828:ENST00000481733:exon_19373804_19373875:PDHA1;ENSG00000131828:ENST00000379804:exon_19373700_19373875:PDHA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 20071046 T/C 1 3 8 11 1.39341816042847 4.28421823885742 -2.89080007842895 T:C T C 10 0.535527279857177 0.127667889620419 ENSG00000184368:ENST00000379651:exon_20070996_20071106:MAP7D2;ENSG00000184368:ENST00000485173:exon_20070996_20071106:MAP7D2;ENSG00000184368:ENST00000379643:exon_20070992_20071106:MAP7D2;ENSG00000184368:ENST00000443379:exon_20070992_20071106:MAP7D2;ENSG00000184368:ENST00000452324:exon_20070996_20071106:MAP7D2;ENSG00000184368:ENST00000330274:exon_20070992_20071106:MAP7D2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 23723711 C/G 1 7 15 22 3.25130904099976 8.03290919785765 -4.78160015685789 C:G C G 10 0.535527279857177 0.0529971189475910 ENSG00000123130:ENST00000379303:exon_23723626_23723711:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000336430:exon_23723626_23723711:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000379297:exon_23723626_23723711:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000379295:exon_23723626_23723711:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000494361:exon_23723626_23723711:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000473710:exon_23723626_23723711:ACOT9 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 23858452 G/A 1 12 41 53 5.57367264171388 21.9566184741443 -16.3829458324304 A:G G A 10 0.535527279857177 5.81233628946695e-06 ENSG00000184831:ENST00000379226:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000476598:exon_23858430_23858522:APOO;ENSG00000184831:ENST00000439528:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000379220:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000490078:exon_23858430_23858494:APOO HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 38158290 C/T 1 10 3 13 4.64472720142823 1.60658183957153 3.0381453618567 T:C C T 10 0.535527279857177 0.102869269884982 ENSG00000156313:ENST00000339363:exon_38158209_38158394:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000338898:exon_38158209_38158394:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000482855:exon_38158209_38158394:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000318842:exon_38158209_38158394:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000474584:exon_38158209_38158394:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000342811:exon_38158209_38158394:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000378505:exon_38158209_38158394:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000494841:exon_38158209_38158394:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000464437:exon_38158209_38158394:RPGR HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 39932907 T/C 1 3 7 10 1.39341816042847 3.74869095900024 -2.35527279857177 T:C T C 10 0.535527279857177 0.204199871162889 ENSG00000183337:ENST00000417733:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000378455:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000397354:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000378444:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000342274:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000406200:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000490976:exon_39931159_39934433:BCOR HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 41055609 G/A 1 5 8 13 2.32236360071412 4.28421823885742 -1.9618546381433 A:G G A 10 0.535527279857177 0.405380944075703 ENSG00000124486:ENST00000378308:exon_41055504_41055612:USP9X;ENSG00000124486:ENST00000324545:exon_41055504_41055612:USP9X;ENSG00000124486:ENST00000453805:exon_41055504_41055612:USP9X;ENSG00000124486:ENST00000462850:exon_41055504_41055612:USP9X HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 44401328 G/A 1 8 18 26 3.71578176114258 9.63949103742918 -5.9237092762866 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0286443565268179 ENSG00000069509:ENST00000378045:exon_44401191_44401347:FUNDC1;ENSG00000069509:ENST00000483115:exon_44401191_44401550:FUNDC1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 44929077 C/A 1 9 5 14 4.18025448128541 2.67763639928588 1.50261808199952 A:C C A 10 0.535527279857177 0.593847726273405 ENSG00000147050:ENST00000382899:exon_44928824_44929602:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000334516:exon_44928824_44929602:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000377967:exon_44928824_44929602:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000414389:exon_44928824_44929602:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000433797:exon_44928824_44929602:KDM6A HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 47058461 C/T 1 167 81 248 77.5669442638515 43.3777096684313 34.1892345954201 T:C C T 10 0.535527279857177 1.3301425481102e-05 ENSG00000130985:ENST00000377351:exon_47058447_47058505:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000412206:exon_47058447_47058505:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000427561:exon_47058447_47058505:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000442035:exon_47058447_47058505:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000457753:exon_47058447_47058505:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000335972:exon_47058447_47058505:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000431324:exon_47058447_47058474:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000451702:exon_47058447_47058505:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000424033:exon_47058447_47058505:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000377271:exon_47058447_47058505:UBA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 47106763 C/T 1 61 116 177 28.3328359287122 62.1211644634325 -33.7883285347203 A:T:C C T 10 0.535527279857177 3.4684002921201e-07 ENSG00000102226:ENST00000377107:exon_47106703_47106818:USP11;ENSG00000102226:ENST00000218348:exon_47106703_47106818:USP11;ENSG00000102226:ENST00000469080:exon_47106471_47107098:USP11;ENSG00000102226:ENST00000497179:exon_47106471_47106818:USP11;ENSG00000102226:ENST00000467378:exon_47106703_47107098:USP11 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 47444985 T/C 1 85 65 150 39.48018121214 34.8092731907165 4.67090802142346 T:C T C 10 0.535527279857177 0.462178482029551 ENSG00000102265:ENST00000218388:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377018:exon_47444335_47445482:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000456754:exon_47444604_47445422:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377017:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377013:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000445623:exon_47444741_47445066:TIMP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 47483800 G/A 1 16 9 25 7.43156352228517 4.81974551871459 2.61181800357058 A:G G A 10 0.535527279857177 0.322674779852583 ENSG00000126759:ENST00000478222:exon_47483612_47483839:CFP;ENSG00000126759:ENST00000396992:exon_47483613_47483839:CFP;ENSG00000126759:ENST00000247153:exon_47483625_47483839:CFP HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 48888074 T/C 1 9 27 36 4.18025448128541 14.4592365561438 -10.2789820748584 T:C T C 10 0.535527279857177 0.000654235482091686 ENSG00000068323:ENST00000315869:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000493583:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000478476:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000336239:exon_48887729_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000495940:exon_48888024_48888110:TFE3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 49103224 G/A 1 30 4 34 13.9341816042847 2.14210911942871 11.792072484856 A:G G A 10 0.535527279857177 3.65128528558664e-05 ENSG00000101997:ENST00000376227:exon_49103192_49103386:CCDC22 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 51644748 C/A 1 161 82 243 74.7801079429945 43.9132369482885 30.866870994706 A:C C A 10 0.535527279857177 6.31718522962826e-05 ENSG00000179222:ENST00000375772:exon_51644649_51645034:MAGED1;ENSG00000179222:ENST00000375722:exon_51644649_51645034:MAGED1;ENSG00000179222:ENST00000326587:exon_51644649_51645034:MAGED1;ENSG00000179222:ENST00000375695:exon_51644649_51645034:MAGED1;ENSG00000179222:ENST00000494718:exon_51644649_51645450:MAGED1;ENSG00000179222:ENST00000485420:exon_51644649_51645034:MAGED1;ENSG00000179222:ENST00000473931:exon_51644649_51645450:MAGED1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 54836361 A/G 1 32 108 140 14.8631270445703 57.8369462245751 -42.9738191800048 A:G A G 10 0.535527279857177 1.84458886214482e-13 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 54836505 A/G 1 19 52 71 8.82498168271364 27.8474185525732 -19.0224368698596 A:C:G A G 10 0.535527279857177 6.68507149408129e-06 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 54837340 C/T 1 27 73 100 12.5407634438562 39.0934914295739 -26.5527279857177 T:C:G C T 10 0.535527279857177 9.693521886106e-08 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54837254_54837563:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54837254_54837562:MAGED2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 54838077 C/T 1 20 36 56 9.28945440285646 19.2789820748584 -9.98952767200191 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0102600507877635 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54838007_54838077:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000487482:exon_54837965_54838086:MAGED2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 55479299 G/A 1 10 38 48 4.64472720142823 20.3500366345727 -15.7053094331445 A:G G A 10 0.535527279857177 6.77238542481154e-06 ENSG00000187601:ENST00000342972:exon_55478538_55479998:MAGEH1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 68381264 C/A 1 5 31 36 2.32236360071412 16.6013456755725 -14.2789820748584 A:C C A 10 0.535527279857177 9.9301122213933e-07 ENSG00000181191:ENST00000374584:exon_68380697_68382224:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000374583:exon_68380697_68383388:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000361478:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000396010:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000374571:exon_68380734_68382983:PJA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 68381787 C/T 1 13 31 44 6.0381453618567 16.6013456755725 -10.5632003137158 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00211567369665678 ENSG00000181191:ENST00000374584:exon_68380697_68382224:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000374583:exon_68380697_68383388:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000361478:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000396010:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000374571:exon_68380734_68382983:PJA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 68382836 G/A 1 9 21 30 4.18025448128541 11.2460728770007 -7.06581839571531 A:G G A 10 0.535527279857177 0.0103543095267433 ENSG00000181191:ENST00000374584:exon_68382789_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000374583:exon_68380697_68383388:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000361478:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000396010:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000374571:exon_68380734_68382983:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000477231:exon_68382169_68382977:PJA1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 69550098 T/C 1 2 6 8 0.928945440285646 3.21316367914306 -2.28421823885742 T:C T C 10 0.535527279857177 0.156475797077803 ENSG00000090889:ENST00000374388:exon_69550007_69550182:KIF4A;ENSG00000090889:ENST00000374403:exon_69550007_69550182:KIF4A HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 69561780 T/G 1 12 6 18 5.57367264171388 3.21316367914306 2.36050896257082 T:G T G 10 0.535527279857177 0.346375041233422 ENSG00000090889:ENST00000374388:exon_69561649_69561781:KIF4A;ENSG00000090889:ENST00000374403:exon_69561649_69561781:KIF4A HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 69573639 C/T 1 9 6 15 4.18025448128541 3.21316367914306 0.967090802142346 T:C C T 10 0.535527279857177 0.796987479524744 ENSG00000090889:ENST00000374388:exon_69573472_69573657:KIF4A;ENSG00000090889:ENST00000374403:exon_69573472_69573657:KIF4A HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 70324157 C/T 1 11 1 12 5.10919992157105 0.535527279857177 4.57367264171388 T:C C T 10 0.535527279857177 0.00784285311130818 ENSG00000204165:ENST00000374251:exon_70324148_70324254:CXorf65;ENSG00000204165:ENST00000485951:exon_70324088_70324254:CXorf65;ENSG00000204165:ENST00000466160:exon_70324148_70324298:CXorf65;ENSG00000204165:ENST00000438526:exon_70324088_70324254:CXorf65 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 70349947 A/C 1 15 10 25 6.96709080214235 5.35527279857177 1.61181800357058 A:C A C 10 0.535527279857177 0.55392591166511 ENSG00000184634:ENST00000333646:exon_70349885_70350064:MED12;ENSG00000184634:ENST00000374102:exon_70349885_70350064:MED12;ENSG00000184634:ENST00000374080:exon_70349885_70350064:MED12;ENSG00000184634:ENST00000430072:exon_70349885_70350064:MED12;ENSG00000184634:ENST00000439750:exon_70349885_70350064:MED12 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 71493691 C/T 1 1271 2823 4094 590.344827301528 1511.79351103681 -921.448683735282 A:T:C:G C T 10 0.535527279857177 1.16170165793776e-185 ENSG00000198034:ENST00000316084:exon_71493651_71493822:RPS4X;ENSG00000198034:ENST00000486733:exon_71493651_71495000:RPS4X HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 73044356 G/C 1 3 24 27 1.39341816042847 12.8526547165722 -11.4592365561438 C:G G C 10 0.535527279857177 6.2346396011716e-06 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 73063911 T/C 1 9 3 12 4.18025448128541 1.60658183957153 2.57367264171388 T:C T C 10 0.535527279857177 0.158167791151507 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 77387125 A/G 1 7 23 30 3.25130904099976 12.3171274367151 -9.06581839571531 A:G A G 10 0.535527279857177 0.00138621597816732 ENSG00000187325:ENST00000341864:exon_77385245_77387270:TAF9B HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 100265552 T/A 1 7 4 11 3.25130904099976 2.14210911942871 1.10919992157105 A:T T A 10 0.535527279857177 0.560102972031953 ENSG00000188917:ENST00000490509:exon_100265374_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000372939:exon_100264339_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000372935:exon_100264531_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000372936:exon_100264531_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000338687:exon_100264548_100265696:TRMT2B HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 100880857 G/A 1 16 36 52 7.43156352228517 19.2789820748584 -11.8474185525732 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00119192299237260 ENSG00000102401:ENST00000341189:exon_100879824_100882833:ARMCX3;ENSG00000102401:ENST00000471229:exon_100879824_100881474:ARMCX3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 100911066 C/T 1 12 12 24 5.57367264171388 6.42632735828612 -0.852654716572246 T:C C T 10 0.535527279857177 0.838566839920317 ENSG00000184867:ENST00000328766:exon_100910267_100912701:ARMCX2;ENSG00000184867:ENST00000330154:exon_100910267_100912701:ARMCX2;ENSG00000184867:ENST00000356824:exon_100910453_100912701:ARMCX2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 102842041 T/C 1 283 132 415 131.445779800419 70.6896009411474 60.7561788592716 T:C T C 10 0.535527279857177 1.50174770008265e-09 ENSG00000133142:ENST00000372629:exon_102841577_102842446:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000414064:exon_102841578_102842653:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000468024:exon_102841577_102842446:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000472484:exon_102841577_102842657:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000415568:exon_102841582_102842430:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000472745:exon_102841577_102842622:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000494801:exon_102841582_102842454:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000452632:exon_102841878_102842251:TCEAL4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 105905356 A/G 1 4 13 17 1.85789088057129 6.9618546381433 -5.10396375757201 A:G A G 10 0.535527279857177 0.0147694647888842 ENSG00000147231:ENST00000372544:exon_105905245_105905535:CXorf57;ENSG00000147231:ENST00000372548:exon_105905245_105905535:CXorf57;ENSG00000147231:ENST00000421550:exon_105905245_105905535:CXorf57;ENSG00000147231:ENST00000497124:exon_105905245_105905535:CXorf57 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 119576455 G/A 1 10 33 43 4.64472720142823 17.6724002352868 -13.0276730338586 A:T:G G A 10 0.535527279857177 8.31290670442725e-05 ENSG00000005893:ENST00000434600:exon_119576454_119576517:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000200639:exon_119576454_119576517:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000486593:exon_119576454_119576517:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371335:exon_119576454_119576517:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371345:exon_119576454_119576517:LAMP2 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 119760629 A/T 1 61 21 82 28.3328359287122 11.2460728770007 17.0867630517115 A:T A T 10 0.535527279857177 0.000138549754432903 ENSG00000171155:ENST00000304661:exon_119759648_119761026:C1GALT1C1;ENSG00000171155:ENST00000371313:exon_119759786_119761026:C1GALT1C1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 129201179 C/T 1 24 8 32 11.1473452834278 4.28421823885742 6.86312704457034 T:C C T 10 0.535527279857177 0.0198216849836699 ENSG00000102034:ENST00000335997:exon_129198849_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000455513:exon_129198849_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000308167:exon_129198903_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000527455:exon_129198903_129201500:ELF4 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 135310785 T/C 1 53 24 77 24.6170541675696 12.8526547165722 11.7643994509974 T:C T C 10 0.535527279857177 0.00822541632584684 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000495432:exon_135310782_135311154:MAP7D3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 135313034 T/G 1 17 12 29 7.89603624242799 6.42632735828612 1.46970888414187 T:G T G 10 0.535527279857177 0.710434552275237 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000477124:exon_135312998_135313314:MAP7D3 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 149931106 C/T 1 5 7 12 2.32236360071412 3.74869095900024 -1.42632735828612 T:C C T 10 0.535527279857177 0.564891377930926 ENSG00000063601:ENST00000485376:exon_149931038_149931210:MTMR1;ENSG00000063601:ENST00000370390:exon_149931038_149931210:MTMR1;ENSG00000063601:ENST00000445323:exon_149931038_149933575:MTMR1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 153176561 G/A 1 2 10 12 0.928945440285646 5.35527279857177 -4.42632735828612 A:G G A 10 0.535527279857177 0.016688085548077 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 153760654 G/A 1 74 35 109 34.3709812905689 18.7434547950012 15.6275264955677 A:G G A 10 0.535527279857177 0.00278828824505412 ENSG00000160211:ENST00000393562:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000291567:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000442162:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000434882:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000393564:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000369620:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000490651:exon_153760601_153760677:G6PD HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 154020114 C/A 1 11 19 30 5.10919992157105 10.1750183172864 -5.06581839571531 A:C C A 10 0.535527279857177 0.0689406884761131 ENSG00000130830:ENST00000369534:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000413259:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000439370:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000393531:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000393529:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000417435:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000488694:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000369531:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000471821:exon_154019906_154020122:MPP1 HGDP01277_parsed_pileup.txt . X 154507173 T/G 1 3 8 11 1.39341816042847 4.28421823885742 -2.89080007842895 T:G T G 10 0.535527279857177 0.127667889620419 ENSG00000155962:ENST00000369449:exon_154505500_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000422096:exon_154505526_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000360485:exon_154505526_154507353:CLIC2